MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_006448	ATG	2	6	510517	510522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820619
10503	NC_006448	TGA	2	6	510674	510679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820619
10504	NC_006448	TTG	2	6	510685	510690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820619
10505	NC_006448	AGC	2	6	510692	510697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820619
10506	NC_006448	TGG	2	6	510737	510742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820619
10507	NC_006448	ACA	2	6	510745	510750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820619
10508	NC_006448	TCA	2	6	510861	510866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820619
10509	NC_006448	CAA	2	6	510955	510960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820619
10510	NC_006448	AAG	2	6	510964	510969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820619
10511	NC_006448	ATC	2	6	511002	511007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820619
10512	NC_006448	CCT	2	6	511028	511033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820619
10513	NC_006448	AAT	2	6	511093	511098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10514	NC_006448	TGG	2	6	511114	511119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10515	NC_006448	T	6	6	511121	511126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10516	NC_006448	ATGTG	2	10	511131	511140	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
10517	NC_006448	AG	3	6	511146	511151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10518	NC_006448	TATT	2	8	511183	511190	25 %	75 %	0 %	0 %	55820620
10519	NC_006448	GAA	2	6	511231	511236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820620
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10521	NC_006448	CAT	2	6	511425	511430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820620
10522	NC_006448	ATTT	2	8	511431	511438	25 %	75 %	0 %	0 %	55820620
10523	NC_006448	CAA	2	6	511479	511484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820620
10524	NC_006448	CAG	2	6	511494	511499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820620
10525	NC_006448	CTT	2	6	511527	511532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820620
10526	NC_006448	TCG	2	6	511568	511573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820620
10527	NC_006448	T	6	6	511656	511661	0 %	100 %	0 %	0 %	55820620
10528	NC_006448	AGC	2	6	511699	511704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820620
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10533	NC_006448	T	6	6	512013	512018	0 %	100 %	0 %	0 %	55820620
10534	NC_006448	CG	3	6	512043	512048	0 %	0 %	50 %	50 %	55820620
10535	NC_006448	ATG	2	6	512090	512095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820620
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10537	NC_006448	TTC	2	6	512191	512196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820620
10538	NC_006448	TCAAAA	2	12	512204	512215	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	55820620
10539	NC_006448	TAT	2	6	512262	512267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10540	NC_006448	A	6	6	512328	512333	100 %	0 %	0 %	0 %	55820621
10541	NC_006448	ATA	2	6	512337	512342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820621
10542	NC_006448	TA	3	6	512353	512358	50 %	50 %	0 %	0 %	55820621
10543	NC_006448	GAGG	2	8	512409	512416	25 %	0 %	75 %	0 %	55820621
10544	NC_006448	AG	3	6	512441	512446	50 %	0 %	50 %	0 %	55820621
10545	NC_006448	CTT	2	6	512654	512659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820621
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10551	NC_006448	ATC	2	6	513028	513033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820621
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10554	NC_006448	A	7	7	513131	513137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10555	NC_006448	TTA	2	6	513166	513171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10556	NC_006448	ATA	2	6	513182	513187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10557	NC_006448	ATT	2	6	513220	513225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10558	NC_006448	TCA	2	6	513235	513240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10564	NC_006448	CAAT	2	8	513598	513605	50 %	25 %	0 %	25 %	55820622
10565	NC_006448	ATG	2	6	513630	513635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820622
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10573	NC_006448	GA	3	6	513934	513939	50 %	0 %	50 %	0 %	55820622
10574	NC_006448	GA	3	6	513951	513956	50 %	0 %	50 %	0 %	55820622
10575	NC_006448	GA	4	8	513958	513965	50 %	0 %	50 %	0 %	55820622
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10581	NC_006448	A	7	7	514423	514429	100 %	0 %	0 %	0 %	55820622
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10589	NC_006448	AATAA	2	10	514712	514721	80 %	20 %	0 %	0 %	55820623
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10593	NC_006448	AAT	2	6	514843	514848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820623
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10595	NC_006448	ATA	2	6	515016	515021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820623
10596	NC_006448	AAT	2	6	515191	515196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820623
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10600	NC_006448	TTA	2	6	515351	515356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10601	NC_006448	TAT	2	6	515431	515436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10602	NC_006448	TAAA	2	8	515455	515462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10603	NC_006448	TAC	2	6	515515	515520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820624
10604	NC_006448	TCTT	3	12	515554	515565	0 %	75 %	0 %	25 %	55820624
10605	NC_006448	A	6	6	515583	515588	100 %	0 %	0 %	0 %	55820624
10606	NC_006448	AT	3	6	515618	515623	50 %	50 %	0 %	0 %	55820624
10607	NC_006448	ACT	2	6	515678	515683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820624
10608	NC_006448	TGA	2	6	515692	515697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820624
10609	NC_006448	ATA	2	6	515801	515806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820624
10610	NC_006448	AGG	2	6	515829	515834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820624
10611	NC_006448	GAA	2	6	515843	515848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820624
10612	NC_006448	CTA	2	6	515893	515898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820624
10613	NC_006448	TTA	2	6	515972	515977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820624
10614	NC_006448	GGA	2	6	515987	515992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820624
10615	NC_006448	TCTGG	2	10	516017	516026	0 %	40 %	40 %	20 %	55820624
10616	NC_006448	A	7	7	516032	516038	100 %	0 %	0 %	0 %	55820624
10617	NC_006448	A	6	6	516066	516071	100 %	0 %	0 %	0 %	55820624
10618	NC_006448	TAGG	2	8	516078	516085	25 %	25 %	50 %	0 %	55820624
10619	NC_006448	TA	3	6	516093	516098	50 %	50 %	0 %	0 %	55820624
10620	NC_006448	AGG	2	6	516099	516104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820624
10621	NC_006448	AAG	2	6	516141	516146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820624
10622	NC_006448	TTG	2	6	516212	516217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820624
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10624	NC_006448	TGA	2	6	516256	516261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820624
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