MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10004	NC_006448	TTA	2	6	484871	484876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820590
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10006	NC_006448	TCT	2	6	485054	485059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820590
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10010	NC_006448	GTC	2	6	485237	485242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820590
10011	NC_006448	CAT	2	6	485337	485342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820590
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10013	NC_006448	GT	3	6	485393	485398	0 %	50 %	50 %	0 %	55820590
10014	NC_006448	CTTTG	2	10	485406	485415	0 %	60 %	20 %	20 %	55820590
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10019	NC_006448	TCT	2	6	485585	485590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820590
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10022	NC_006448	T	6	6	485707	485712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_006448	A	7	7	485718	485724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10029	NC_006448	CCTG	2	8	485930	485937	0 %	25 %	25 %	50 %	55820591
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10040	NC_006448	AAT	2	6	486475	486480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10041	NC_006448	ATT	2	6	486499	486504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10059	NC_006448	GCA	2	6	487138	487143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820593
10060	NC_006448	CGT	2	6	487195	487200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820593
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10103	NC_006448	T	7	7	489557	489563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10104	NC_006448	A	6	6	489662	489667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10105	NC_006448	AGC	2	6	489761	489766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820597
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10108	NC_006448	CAAG	2	8	489897	489904	50 %	0 %	25 %	25 %	55820597
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10110	NC_006448	AT	3	6	489994	489999	50 %	50 %	0 %	0 %	55820597
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10117	NC_006448	GAT	3	9	490355	490363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820598
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10124	NC_006448	TGA	2	6	490686	490691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820599
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10248	NC_006448	AC	3	6	498058	498063	50 %	0 %	0 %	50 %	55820607
10249	NC_006448	TGA	2	6	498203	498208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820607
10250	NC_006448	ATTG	2	8	498218	498225	25 %	50 %	25 %	0 %	55820607
10251	NC_006448	CGT	2	6	498249	498254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820607
10252	NC_006448	CTA	2	6	498308	498313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10253	NC_006448	AG	3	6	498332	498337	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10254	NC_006448	TGCT	2	8	498418	498425	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10255	NC_006448	ACGG	2	8	498498	498505	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10256	NC_006448	GTC	2	6	498581	498586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10257	NC_006448	A	7	7	498623	498629	100 %	0 %	0 %	0 %	55820608
10258	NC_006448	TAT	2	6	498652	498657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820608
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10269	NC_006448	TGG	2	6	499123	499128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820608
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10272	NC_006448	GAA	3	9	499154	499162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820608
10273	NC_006448	TTGA	2	8	499214	499221	25 %	50 %	25 %	0 %	55820608
10274	NC_006448	CA	3	6	499328	499333	50 %	0 %	0 %	50 %	55820608
10275	NC_006448	TCA	2	6	499517	499522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820608
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10282	NC_006448	TCG	2	6	499918	499923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820608
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10290	NC_006448	GCT	2	6	500348	500353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820608
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10346	NC_006448	AG	3	6	503529	503534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10347	NC_006448	CAGT	2	8	503711	503718	25 %	25 %	25 %	25 %	55820611
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10349	NC_006448	GTCA	2	8	503747	503754	25 %	25 %	25 %	25 %	55820611
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10361	NC_006448	A	6	6	504204	504209	100 %	0 %	0 %	0 %	55820613
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10363	NC_006448	GTCATT	2	12	504323	504334	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	55820613
10364	NC_006448	A	6	6	504350	504355	100 %	0 %	0 %	0 %	55820613
10365	NC_006448	AGT	2	6	504388	504393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820613
10366	NC_006448	TAG	2	6	504503	504508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820614
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10368	NC_006448	TGC	2	6	504588	504593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820614
10369	NC_006448	GCA	2	6	504640	504645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820614
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10497	NC_006448	GATG	2	8	510302	510309	25 %	25 %	50 %	0 %	55820619
10498	NC_006448	ATG	2	6	510325	510330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820619
10499	NC_006448	TGG	2	6	510451	510456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820619
10500	NC_006448	TAT	2	6	510491	510496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820619

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