MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_006448	TGGAA	2	10	336234	336243	40 %	20 %	40 %	0 %	55820438
7003	NC_006448	TTC	2	6	336266	336271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820438
7004	NC_006448	AAG	2	6	336274	336279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820438
7005	NC_006448	CGG	2	6	336341	336346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55820438
7006	NC_006448	TAA	2	6	336513	336518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820438
7007	NC_006448	TGA	2	6	336522	336527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820438
7008	NC_006448	AAG	2	6	336608	336613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_006448	AAG	2	6	336675	336680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820439
7010	NC_006448	A	6	6	336710	336715	100 %	0 %	0 %	0 %	55820439
7011	NC_006448	TAG	2	6	336867	336872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820439
7012	NC_006448	AGG	2	6	336935	336940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	55820440
7013	NC_006448	GAA	2	6	336954	336959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820440
7014	NC_006448	TGC	3	9	336974	336982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820440
7015	NC_006448	T	6	6	337080	337085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_006448	GAT	2	6	337120	337125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_006448	GAA	2	6	337197	337202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_006448	TTC	2	6	337206	337211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_006448	T	6	6	337230	337235	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_006448	A	6	6	337265	337270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_006448	TA	3	6	337305	337310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_006448	ATG	2	6	337311	337316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7023	NC_006448	TAA	2	6	337327	337332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_006448	CAT	2	6	337409	337414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_006448	GAT	2	6	337468	337473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820441
7026	NC_006448	TGA	2	6	337507	337512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820441
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7028	NC_006448	CTG	2	6	337560	337565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820441
7029	NC_006448	CTC	2	6	337729	337734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	55820441
7030	NC_006448	AG	3	6	337748	337753	50 %	0 %	50 %	0 %	55820441
7031	NC_006448	TTTA	2	8	337773	337780	25 %	75 %	0 %	0 %	55820441
7032	NC_006448	AGAA	2	8	337781	337788	75 %	0 %	25 %	0 %	55820441
7033	NC_006448	TTA	2	6	337830	337835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820441
7034	NC_006448	CT	3	6	337915	337920	0 %	50 %	0 %	50 %	55820441
7035	NC_006448	TGA	2	6	337987	337992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820441
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7037	NC_006448	CAT	2	6	338013	338018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820441
7038	NC_006448	A	6	6	338033	338038	100 %	0 %	0 %	0 %	55820441
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7040	NC_006448	TGA	2	6	338071	338076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820441
7041	NC_006448	CAG	2	6	338115	338120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820441
7042	NC_006448	AG	3	6	338119	338124	50 %	0 %	50 %	0 %	55820441
7043	NC_006448	A	7	7	338167	338173	100 %	0 %	0 %	0 %	55820441
7044	NC_006448	TGA	2	6	338239	338244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820441
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7046	NC_006448	A	6	6	338297	338302	100 %	0 %	0 %	0 %	55820441
7047	NC_006448	CTA	2	6	338347	338352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820441
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7050	NC_006448	TTG	2	6	338643	338648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820441
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7052	NC_006448	A	6	6	338726	338731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7053	NC_006448	ATC	3	9	338748	338756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7055	NC_006448	TCA	2	6	339014	339019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820442
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7057	NC_006448	GAC	2	6	339075	339080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820442
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7059	NC_006448	CGA	2	6	339192	339197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820442
7060	NC_006448	TGAG	2	8	339218	339225	25 %	25 %	50 %	0 %	55820442
7061	NC_006448	T	6	6	339265	339270	0 %	100 %	0 %	0 %	55820442
7062	NC_006448	AGGC	2	8	339299	339306	25 %	0 %	50 %	25 %	55820442
7063	NC_006448	CAG	2	6	339312	339317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820442
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7068	NC_006448	CAT	2	6	339715	339720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820442
7069	NC_006448	AGTTA	2	10	339748	339757	40 %	40 %	20 %	0 %	55820442
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7072	NC_006448	TAG	2	6	339886	339891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820442
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7074	NC_006448	A	6	6	340072	340077	100 %	0 %	0 %	0 %	55820442
7075	NC_006448	AAGA	2	8	340110	340117	75 %	0 %	25 %	0 %	55820442
7076	NC_006448	ATA	2	6	340166	340171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820442
7077	NC_006448	TAT	2	6	340302	340307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7078	NC_006448	CAG	2	6	340349	340354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820443
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7082	NC_006448	ATA	2	6	340491	340496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820443
7083	NC_006448	CCTTTT	2	12	340504	340515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820443
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7101	NC_006448	CA	3	6	341678	341683	50 %	0 %	0 %	50 %	55820443
7102	NC_006448	TAT	2	6	341734	341739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820443
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7119	NC_006448	TTA	2	6	342540	342545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_006448	GAA	2	6	342554	342559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_006448	AAGT	2	8	342584	342591	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_006448	A	7	7	342615	342621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_006448	TCTT	2	8	342634	342641	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7124	NC_006448	ATC	2	6	342725	342730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7126	NC_006448	ATG	2	6	342800	342805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7252	NC_006448	GGT	2	6	348393	348398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820452
7253	NC_006448	ATA	2	6	348433	348438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820452
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7255	NC_006448	A	6	6	348556	348561	100 %	0 %	0 %	0 %	55820452
7256	NC_006448	GGC	2	6	348680	348685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	55820452
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7261	NC_006448	ATG	2	6	348871	348876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820452
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7263	NC_006448	TGA	2	6	348977	348982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820452
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7270	NC_006448	T	6	6	349396	349401	0 %	100 %	0 %	0 %	55820453
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7279	NC_006448	CAT	2	6	349722	349727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820453
7280	NC_006448	CAAT	2	8	349765	349772	50 %	25 %	0 %	25 %	55820453
7281	NC_006448	ATC	2	6	349787	349792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820453
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7284	NC_006448	ATC	2	6	349986	349991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820453
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7292	NC_006448	TAC	2	6	350380	350385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820454
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7315	NC_006448	TTC	2	6	351202	351207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820454
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7331	NC_006448	ACGTC	2	10	352255	352264	20 %	20 %	20 %	40 %	55820456
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7334	NC_006448	AGA	2	6	352375	352380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820456
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7337	NC_006448	CTTTTG	2	12	352466	352477	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	55820456
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7340	NC_006448	CTT	2	6	352664	352669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820456
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7343	NC_006448	AAT	2	6	352776	352781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7344	NC_006448	GGA	2	6	352829	352834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7369	NC_006448	AGC	2	6	354019	354024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820459
7370	NC_006448	ACC	2	6	354055	354060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820459
7371	NC_006448	CAG	2	6	354195	354200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	55820459
7372	NC_006448	CTT	2	6	354204	354209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820459
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