MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus thermophilus LMG 18311 chromosome

Total Repeats: 36995

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_006448	GAGAC	2	10	312898	312907	40 %	0 %	40 %	20 %	55820416
6502	NC_006448	TAA	2	6	312995	313000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_006448	TGG	2	6	313030	313035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_006448	GAA	2	6	313053	313058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_006448	AT	3	6	313088	313093	50 %	50 %	0 %	0 %	55820417
6506	NC_006448	TCG	2	6	313180	313185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820417
6507	NC_006448	CTG	2	6	313225	313230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820417
6508	NC_006448	TTGA	2	8	313254	313261	25 %	50 %	25 %	0 %	55820417
6509	NC_006448	GGT	2	6	313266	313271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	55820417
6510	NC_006448	GAT	2	6	313275	313280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820417
6511	NC_006448	AAGG	2	8	313368	313375	50 %	0 %	50 %	0 %	55820417
6512	NC_006448	ACAA	2	8	313419	313426	75 %	0 %	0 %	25 %	55820417
6513	NC_006448	TAAA	2	8	313444	313451	75 %	25 %	0 %	0 %	55820417
6514	NC_006448	GAA	3	9	313593	313601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820417
6515	NC_006448	ATC	2	6	313611	313616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820417
6516	NC_006448	TAT	2	6	313832	313837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820417
6517	NC_006448	TGT	2	6	313868	313873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820417
6518	NC_006448	GAA	2	6	313893	313898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820417
6519	NC_006448	ATC	2	6	313959	313964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820417
6520	NC_006448	AAG	2	6	313989	313994	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820417
6521	NC_006448	AAC	2	6	314089	314094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820417
6522	NC_006448	GAT	2	6	314114	314119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820417
6523	NC_006448	CGT	2	6	314145	314150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820417
6524	NC_006448	ATG	2	6	314170	314175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820417
6525	NC_006448	GCCATC	2	12	314187	314198	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	55820417
6526	NC_006448	ACC	2	6	314264	314269	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820417
6527	NC_006448	GAA	2	6	314292	314297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820417
6528	NC_006448	CGTAAA	2	12	314388	314399	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	55820417
6529	NC_006448	A	6	6	314401	314406	100 %	0 %	0 %	0 %	55820417
6530	NC_006448	ACCA	2	8	314410	314417	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6531	NC_006448	CCTTG	2	10	314575	314584	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6532	NC_006448	CTT	2	6	314690	314695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_006448	TCT	2	6	314703	314708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_006448	T	6	6	314728	314733	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6535	NC_006448	TTG	3	9	314741	314749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6536	NC_006448	TGT	2	6	314767	314772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_006448	T	7	7	314781	314787	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_006448	ACA	2	6	314810	314815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_006448	A	7	7	314815	314821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_006448	CT	3	6	314842	314847	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6541	NC_006448	GAA	2	6	314870	314875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_006448	GAA	2	6	314908	314913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6543	NC_006448	GAG	2	6	315008	315013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6544	NC_006448	ACA	3	9	315031	315039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6545	NC_006448	ATA	2	6	315098	315103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_006448	T	6	6	315132	315137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6547	NC_006448	T	6	6	315141	315146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_006448	T	6	6	315150	315155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_006448	AAC	2	6	315177	315182	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_006448	A	6	6	315231	315236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_006448	TAC	2	6	315259	315264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6552	NC_006448	TTTA	2	8	315329	315336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6553	NC_006448	T	6	6	315357	315362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_006448	TATCT	2	10	315408	315417	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
6555	NC_006448	ATA	2	6	315433	315438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_006448	T	7	7	315460	315466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6557	NC_006448	TTC	2	6	315507	315512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_006448	TAT	2	6	315616	315621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820418
6559	NC_006448	TCA	2	6	315623	315628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820418
6560	NC_006448	TTG	2	6	315631	315636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820418
6561	NC_006448	TG	3	6	315659	315664	0 %	50 %	50 %	0 %	55820418
6562	NC_006448	TAAT	2	8	315672	315679	50 %	50 %	0 %	0 %	55820418
6563	NC_006448	AGA	2	6	315736	315741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820418
6564	NC_006448	CAA	2	6	315775	315780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820418
6565	NC_006448	CAT	2	6	315831	315836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820418
6566	NC_006448	CT	3	6	315859	315864	0 %	50 %	0 %	50 %	55820418
6567	NC_006448	TTC	3	9	315910	315918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820418
6568	NC_006448	TAC	2	6	316011	316016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820418
6569	NC_006448	CTT	2	6	316141	316146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820418
6570	NC_006448	ATT	2	6	316186	316191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820418
6571	NC_006448	TAA	2	6	316302	316307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820418
6572	NC_006448	AGA	2	6	316324	316329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	55820418
6573	NC_006448	AT	3	6	316333	316338	50 %	50 %	0 %	0 %	55820418
6574	NC_006448	TAA	2	6	316357	316362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820418
6575	NC_006448	AAT	2	6	316423	316428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820418
6576	NC_006448	ACA	3	9	316475	316483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820418
6577	NC_006448	TTTG	2	8	316502	316509	0 %	75 %	25 %	0 %	55820418
6578	NC_006448	TTG	2	6	316565	316570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	55820418
6579	NC_006448	TAG	2	6	316629	316634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820418
6580	NC_006448	CTT	2	6	316647	316652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820418
6581	NC_006448	TTTCT	2	10	316654	316663	0 %	80 %	0 %	20 %	55820418
6582	NC_006448	GCT	2	6	316724	316729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	55820418
6583	NC_006448	AG	3	6	316746	316751	50 %	0 %	50 %	0 %	55820418
6584	NC_006448	AAT	2	6	316765	316770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820418
6585	NC_006448	ACC	2	6	316789	316794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	55820418
6586	NC_006448	AAT	2	6	316812	316817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	55820418
6587	NC_006448	AGT	2	6	316840	316845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820418
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6589	NC_006448	TAG	2	6	316982	316987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	55820418
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6592	NC_006448	TAGT	2	8	317121	317128	25 %	50 %	25 %	0 %	55820418
6593	NC_006448	T	6	6	317149	317154	0 %	100 %	0 %	0 %	55820418
6594	NC_006448	AAC	2	6	317155	317160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	55820418
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6597	NC_006448	T	6	6	317238	317243	0 %	100 %	0 %	0 %	55820419
6598	NC_006448	TAT	2	6	317251	317256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820419
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6602	NC_006448	TCT	2	6	317413	317418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820419
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6605	NC_006448	T	6	6	317510	317515	0 %	100 %	0 %	0 %	55820419
6606	NC_006448	ATT	3	9	317519	317527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820419
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6612	NC_006448	TAT	2	6	317771	317776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	55820419
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6614	NC_006448	TCT	2	6	317808	317813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	55820419
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6617	NC_006448	T	6	6	317987	317992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_006448	TGT	2	6	318030	318035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_006448	TAG	2	6	318114	318119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6623	NC_006448	ATC	2	6	318512	318517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	55820420
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6626	NC_006448	ATCA	2	8	318863	318870	50 %	25 %	0 %	25 %	55820420
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