MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Symbiobacterium thermophilum IAM 14863 chromosome

Total Repeats: 93114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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59002	NC_006177	ACCA	2	8	2242566	2242573	50 %	0 %	0 %	50 %	51893240
59003	NC_006177	CCT	2	6	2242577	2242582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51893240
59004	NC_006177	TTC	2	6	2242647	2242652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51893240
59005	NC_006177	CCA	2	6	2242693	2242698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51893240
59006	NC_006177	GGCC	2	8	2242838	2242845	0 %	0 %	50 %	50 %	51893240
59007	NC_006177	GTG	2	6	2242851	2242856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51893240
59008	NC_006177	GCC	2	6	2242879	2242884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51893240
59009	NC_006177	CGGG	2	8	2242937	2242944	0 %	0 %	75 %	25 %	51893240
59010	NC_006177	TCC	2	6	2242963	2242968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51893240
59011	NC_006177	AGG	2	6	2242984	2242989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51893240
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59013	NC_006177	CTG	2	6	2243004	2243009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893240
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59015	NC_006177	GCT	2	6	2243180	2243185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893240
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59017	NC_006177	CGG	2	6	2243195	2243200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51893240
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59032	NC_006177	AGG	2	6	2243857	2243862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51893240
59033	NC_006177	CGC	2	6	2243886	2243891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59034	NC_006177	CG	3	6	2243947	2243952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59035	NC_006177	TGT	2	6	2243953	2243958	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59036	NC_006177	TCA	2	6	2244034	2244039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51893241
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59057	NC_006177	GAC	2	6	2245079	2245084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51893242
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59101	NC_006177	CCG	2	6	2246950	2246955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59102	NC_006177	CGGC	2	8	2247056	2247063	0 %	0 %	50 %	50 %	51893244
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59236	NC_006177	GCG	2	6	2252101	2252106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51893247
59237	NC_006177	GCC	2	6	2252189	2252194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51893247
59238	NC_006177	CAG	3	9	2252198	2252206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51893247
59239	NC_006177	CCA	3	9	2252281	2252289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51893247
59240	NC_006177	CCG	2	6	2252335	2252340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51893247
59241	NC_006177	GAC	2	6	2252348	2252353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51893247
59242	NC_006177	CGC	2	6	2252365	2252370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51893247
59243	NC_006177	GTC	3	9	2252399	2252407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893247
59244	NC_006177	GGC	2	6	2252408	2252413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51893247
59245	NC_006177	GCTCAC	2	12	2252498	2252509	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	51893247
59246	NC_006177	ACGGC	2	10	2252575	2252584	20 %	0 %	40 %	40 %	51893247
59247	NC_006177	GCG	2	6	2252617	2252622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51893247
59248	NC_006177	CAC	3	9	2252633	2252641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51893247
59249	NC_006177	GGC	2	6	2252651	2252656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51893247
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59251	NC_006177	CCAC	2	8	2252677	2252684	25 %	0 %	0 %	75 %	51893247
59252	NC_006177	CCT	2	6	2252701	2252706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51893247
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59254	NC_006177	CAA	2	6	2252780	2252785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51893247
59255	NC_006177	TCT	2	6	2252817	2252822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59256	NC_006177	CCT	2	6	2252823	2252828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59257	NC_006177	TCA	2	6	2252855	2252860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59258	NC_006177	CCCGTC	2	12	2252890	2252901	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
59259	NC_006177	CCG	2	6	2252948	2252953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59260	NC_006177	CGG	2	6	2252985	2252990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59261	NC_006177	GCC	2	6	2253109	2253114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51893248
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59263	NC_006177	TCG	2	6	2253162	2253167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893248
59264	NC_006177	CGCC	2	8	2253216	2253223	0 %	0 %	25 %	75 %	51893248
59265	NC_006177	GCT	2	6	2253262	2253267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893248
59266	NC_006177	CGG	2	6	2253305	2253310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51893248
59267	NC_006177	CGGG	2	8	2253316	2253323	0 %	0 %	75 %	25 %	51893248
59268	NC_006177	GCT	2	6	2253328	2253333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893248
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59274	NC_006177	GCCG	2	8	2253629	2253636	0 %	0 %	50 %	50 %	51893248
59275	NC_006177	AGA	2	6	2253648	2253653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51893248
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59284	NC_006177	CTG	2	6	2253950	2253955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893248
59285	NC_006177	GGA	2	6	2254029	2254034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59286	NC_006177	CGG	2	6	2254069	2254074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51893249
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59296	NC_006177	GCGG	2	8	2254579	2254586	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59297	NC_006177	GGCC	2	8	2254656	2254663	0 %	0 %	50 %	50 %	51893250
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59300	NC_006177	CCGC	2	8	2254785	2254792	0 %	0 %	25 %	75 %	51893250
59301	NC_006177	GCC	2	6	2254818	2254823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51893250
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59303	NC_006177	CAG	2	6	2254960	2254965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51893250
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59305	NC_006177	GCG	2	6	2255156	2255161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51893250
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59327	NC_006177	TCGC	2	8	2256373	2256380	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59328	NC_006177	TCG	2	6	2256466	2256471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893252
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59333	NC_006177	TGC	2	6	2256661	2256666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893252
59334	NC_006177	CCA	2	6	2256725	2256730	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51893252
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59336	NC_006177	CTC	3	9	2256822	2256830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51893252
59337	NC_006177	GCC	2	6	2256836	2256841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51893252
59338	NC_006177	TCC	2	6	2256844	2256849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51893252
59339	NC_006177	TCC	2	6	2256853	2256858	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51893252
59340	NC_006177	GGAC	2	8	2256863	2256870	25 %	0 %	50 %	25 %	51893252
59341	NC_006177	CCG	3	9	2256895	2256903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51893252
59342	NC_006177	CGC	2	6	2256972	2256977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51893252
59343	NC_006177	ACC	2	6	2256991	2256996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51893252
59344	NC_006177	GTC	2	6	2256997	2257002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893252
59345	NC_006177	C	7	7	2257044	2257050	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59346	NC_006177	CCT	2	6	2257114	2257119	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59347	NC_006177	AGC	2	6	2257179	2257184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59348	NC_006177	ATC	2	6	2257202	2257207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59349	NC_006177	CGG	2	6	2257254	2257259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59350	NC_006177	CGC	2	6	2257353	2257358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59351	NC_006177	CGGCAC	2	12	2257428	2257439	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
59352	NC_006177	GTC	2	6	2257454	2257459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893253
59353	NC_006177	CGC	2	6	2257489	2257494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51893253
59354	NC_006177	GTC	2	6	2257528	2257533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893253
59355	NC_006177	GCA	2	6	2257542	2257547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51893253
59356	NC_006177	TCC	2	6	2257601	2257606	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51893253
59357	NC_006177	CGC	2	6	2257658	2257663	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51893253
59358	NC_006177	CCT	2	6	2257680	2257685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51893253
59359	NC_006177	GCA	2	6	2257689	2257694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51893253
59360	NC_006177	AGG	2	6	2257703	2257708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51893253
59361	NC_006177	AGA	2	6	2257731	2257736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51893253
59362	NC_006177	ACG	2	6	2257746	2257751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51893253
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59364	NC_006177	CG	3	6	2257762	2257767	0 %	0 %	50 %	50 %	51893253
59365	NC_006177	CCGG	2	8	2257828	2257835	0 %	0 %	50 %	50 %	51893253
59366	NC_006177	GAT	2	6	2257978	2257983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51893253
59367	NC_006177	CACG	2	8	2258081	2258088	25 %	0 %	25 %	50 %	51893254
59368	NC_006177	CGA	2	6	2258090	2258095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51893254
59369	NC_006177	GGCCGC	2	12	2258109	2258120	0 %	0 %	50 %	50 %	51893254
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59372	NC_006177	GAC	2	6	2258343	2258348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51893254
59373	NC_006177	CAC	2	6	2258385	2258390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51893254
59374	NC_006177	CGC	2	6	2258391	2258396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51893254
59375	NC_006177	GGC	2	6	2258397	2258402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51893254
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59378	NC_006177	CCGG	2	8	2258562	2258569	0 %	0 %	50 %	50 %	51893254
59379	NC_006177	CAC	2	6	2258577	2258582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51893254
59380	NC_006177	GAC	2	6	2258607	2258612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51893254
59381	NC_006177	CCA	2	6	2258639	2258644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51893254
59382	NC_006177	CCG	2	6	2258696	2258701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51893254
59383	NC_006177	G	6	6	2258720	2258725	0 %	0 %	100 %	0 %	51893254
59384	NC_006177	GGCC	2	8	2258731	2258738	0 %	0 %	50 %	50 %	51893254
59385	NC_006177	GGT	2	6	2258754	2258759	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51893254
59386	NC_006177	ATC	2	6	2258773	2258778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51893254
59387	NC_006177	CCCG	2	8	2258779	2258786	0 %	0 %	25 %	75 %	51893254
59388	NC_006177	TCGCC	2	10	2258849	2258858	0 %	20 %	20 %	60 %	51893254
59389	NC_006177	GAT	2	6	2258907	2258912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51893254
59390	NC_006177	CGT	2	6	2258934	2258939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893254
59391	NC_006177	GGC	2	6	2258944	2258949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51893254
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59393	NC_006177	TGCCGA	2	12	2259035	2259046	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	51893254
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59400	NC_006177	TGG	2	6	2259290	2259295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51893254
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59407	NC_006177	ATG	3	9	2259537	2259545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59408	NC_006177	CAC	2	6	2259582	2259587	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59409	NC_006177	TCG	2	6	2259598	2259603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59410	NC_006177	GCC	2	6	2259633	2259638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59411	NC_006177	CAGC	2	8	2259668	2259675	25 %	0 %	25 %	50 %	51893255
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59427	NC_006177	CCGC	2	8	2260406	2260413	0 %	0 %	25 %	75 %	51893255
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59429	NC_006177	TCGT	2	8	2260508	2260515	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
59430	NC_006177	CAT	2	6	2260602	2260607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51893256
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59432	NC_006177	CTG	2	6	2260639	2260644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893256
59433	NC_006177	TGC	2	6	2260667	2260672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893256
59434	NC_006177	TGGTC	2	10	2260694	2260703	0 %	40 %	40 %	20 %	51893256
59435	NC_006177	CGGC	2	8	2260715	2260722	0 %	0 %	50 %	50 %	51893256
59436	NC_006177	GCG	2	6	2260791	2260796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51893256
59437	NC_006177	AGGGG	2	10	2260905	2260914	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
59438	NC_006177	TAC	2	6	2260956	2260961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51893257
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59442	NC_006177	CTG	2	6	2261193	2261198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893257
59443	NC_006177	GCTG	2	8	2261233	2261240	0 %	25 %	50 %	25 %	51893257
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59447	NC_006177	CGGTGG	2	12	2261440	2261451	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	51893257
59448	NC_006177	CTG	2	6	2261499	2261504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893257
59449	NC_006177	GCCG	2	8	2261596	2261603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59450	NC_006177	GCG	2	6	2261604	2261609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59451	NC_006177	GCC	2	6	2261643	2261648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59452	NC_006177	GT	3	6	2261667	2261672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59453	NC_006177	CGC	2	6	2261685	2261690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59454	NC_006177	CAC	2	6	2261692	2261697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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59456	NC_006177	TTG	2	6	2261742	2261747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59457	NC_006177	GCC	2	6	2261856	2261861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59458	NC_006177	ATC	2	6	2261865	2261870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51893258
59459	NC_006177	GCGGA	2	10	2261910	2261919	20 %	0 %	60 %	20 %	51893258
59460	NC_006177	TCGG	2	8	2261926	2261933	0 %	25 %	50 %	25 %	51893258
59461	NC_006177	GCTC	2	8	2261944	2261951	0 %	25 %	25 %	50 %	51893258
59462	NC_006177	CTC	3	9	2261949	2261957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51893258
59463	NC_006177	GCA	2	6	2262046	2262051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51893258
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59466	NC_006177	CAC	2	6	2262134	2262139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51893258
59467	NC_006177	TGC	2	6	2262154	2262159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893258
59468	NC_006177	TCA	2	6	2262256	2262261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51893258
59469	NC_006177	TGC	2	6	2262268	2262273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893258
59470	NC_006177	CAC	2	6	2262332	2262337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51893258
59471	NC_006177	CCG	2	6	2262373	2262378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51893258
59472	NC_006177	TGG	2	6	2262388	2262393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51893258
59473	NC_006177	TCA	2	6	2262433	2262438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51893258
59474	NC_006177	GCA	2	6	2262463	2262468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51893258
59475	NC_006177	CGC	2	6	2262476	2262481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51893258
59476	NC_006177	CCGC	2	8	2262520	2262527	0 %	0 %	25 %	75 %	51893258
59477	NC_006177	CTG	2	6	2262543	2262548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51893258
59478	NC_006177	GCA	2	6	2262565	2262570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51893258
59479	NC_006177	GCA	2	6	2262619	2262624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51893258
59480	NC_006177	CAC	2	6	2262644	2262649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51893258
59481	NC_006177	TGG	2	6	2262670	2262675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51893258
59482	NC_006177	CGG	2	6	2262720	2262725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51893258
59483	NC_006177	CAAGTT	2	12	2262731	2262742	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	51893258
59484	NC_006177	CAGG	2	8	2262801	2262808	25 %	0 %	50 %	25 %	51893258
59485	NC_006177	ACC	2	6	2262812	2262817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51893258
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59487	NC_006177	GTTTC	2	10	2262853	2262862	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59488	NC_006177	CGG	2	6	2262878	2262883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59489	NC_006177	GTCG	2	8	2262939	2262946	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59490	NC_006177	C	6	6	2262960	2262965	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59491	NC_006177	GC	3	6	2262982	2262987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59492	NC_006177	GCA	2	6	2263002	2263007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59493	NC_006177	GTACTC	2	12	2263048	2263059	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59494	NC_006177	GCAG	2	8	2263082	2263089	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59495	NC_006177	GAG	2	6	2263123	2263128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59496	NC_006177	GGC	2	6	2263145	2263150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59497	NC_006177	CCA	2	6	2263207	2263212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51893259
59498	NC_006177	CGC	2	6	2263217	2263222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51893259
59499	NC_006177	CGG	2	6	2263264	2263269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51893259
59500	NC_006177	GAT	2	6	2263319	2263324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51893259

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