MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Symbiobacterium thermophilum IAM 14863 chromosome

Total Repeats: 93114

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_006177	CGG	2	6	198779	198784	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891308
5002	NC_006177	GACC	2	8	198786	198793	25 %	0 %	25 %	50 %	51891308
5003	NC_006177	CTC	2	6	198820	198825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51891308
5004	NC_006177	GCG	2	6	198853	198858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5005	NC_006177	GGA	2	6	198893	198898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_006177	GGA	2	6	198918	198923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891309
5007	NC_006177	CTG	2	6	198934	198939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891309
5008	NC_006177	CCGG	2	8	198945	198952	0 %	0 %	50 %	50 %	51891309
5009	NC_006177	GCT	2	6	198953	198958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891309
5010	NC_006177	CAT	2	6	198984	198989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891309
5011	NC_006177	GAA	2	6	199014	199019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51891309
5012	NC_006177	TCC	2	6	199042	199047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51891309
5013	NC_006177	AAG	2	6	199156	199161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51891309
5014	NC_006177	ACA	2	6	199175	199180	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	51891309
5015	NC_006177	GAC	2	6	199192	199197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891309
5016	NC_006177	TGG	3	9	199247	199255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891309
5017	NC_006177	GAA	2	6	199266	199271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51891309
5018	NC_006177	CAG	2	6	199302	199307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891309
5019	NC_006177	CGG	2	6	199339	199344	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891309
5020	NC_006177	CTGC	2	8	199392	199399	0 %	25 %	25 %	50 %	51891309
5021	NC_006177	TCGG	2	8	199409	199416	0 %	25 %	50 %	25 %	51891309
5022	NC_006177	CTGC	2	8	199428	199435	0 %	25 %	25 %	50 %	51891309
5023	NC_006177	CGAC	2	8	199443	199450	25 %	0 %	25 %	50 %	51891309
5024	NC_006177	CGCA	2	8	199501	199508	25 %	0 %	25 %	50 %	51891309
5025	NC_006177	GC	3	6	199527	199532	0 %	0 %	50 %	50 %	51891309
5026	NC_006177	GGC	2	6	199545	199550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891309
5027	NC_006177	GCC	2	6	199573	199578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891309
5028	NC_006177	AGA	2	6	199625	199630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51891309
5029	NC_006177	TGG	2	6	199646	199651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891309
5030	NC_006177	ACG	2	6	199682	199687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891309
5031	NC_006177	TCT	2	6	199703	199708	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51891309
5032	NC_006177	TGG	2	6	199727	199732	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891309
5033	NC_006177	G	6	6	199773	199778	0 %	0 %	100 %	0 %	51891309
5034	NC_006177	GCC	2	6	199789	199794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891309
5035	NC_006177	CAG	2	6	199801	199806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891309
5036	NC_006177	TGG	2	6	199952	199957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891309
5037	NC_006177	TGG	2	6	199961	199966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891309
5038	NC_006177	AGG	2	6	199979	199984	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891309
5039	NC_006177	GCA	2	6	200001	200006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891309
5040	NC_006177	CCGCA	2	10	200080	200089	20 %	0 %	20 %	60 %	51891309
5041	NC_006177	TGG	2	6	200141	200146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891309
5042	NC_006177	AAG	2	6	200167	200172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51891309
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5045	NC_006177	GCC	2	6	200275	200280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891309
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5047	NC_006177	GGCGG	2	10	200329	200338	0 %	0 %	80 %	20 %	51891309
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5051	NC_006177	GCT	2	6	200478	200483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891309
5052	NC_006177	GGA	2	6	200490	200495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891309
5053	NC_006177	CCGG	2	8	200496	200503	0 %	0 %	50 %	50 %	51891309
5054	NC_006177	CTG	2	6	200542	200547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891309
5055	NC_006177	ACC	2	6	200588	200593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	51891309
5056	NC_006177	GCC	2	6	200624	200629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891309
5057	NC_006177	CGA	2	6	200631	200636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891309
5058	NC_006177	GAA	2	6	200661	200666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51891309
5059	NC_006177	CTG	2	6	200671	200676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891309
5060	NC_006177	GGA	2	6	200718	200723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891309
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5062	NC_006177	TGT	2	6	200824	200829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_006177	AGT	2	6	200834	200839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5064	NC_006177	GAA	2	6	200874	200879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_006177	CTG	2	6	200899	200904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_006177	GCG	3	9	200927	200935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_006177	GAC	2	6	200961	200966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5070	NC_006177	CGG	2	6	200987	200992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5071	NC_006177	CGG	2	6	201033	201038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5074	NC_006177	GGC	2	6	201097	201102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_006177	GTCG	2	8	201180	201187	0 %	25 %	50 %	25 %	51891310
5076	NC_006177	GAC	2	6	201214	201219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891310
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5078	NC_006177	GAGG	2	8	201258	201265	25 %	0 %	75 %	0 %	51891310
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5081	NC_006177	CGGCG	2	10	201300	201309	0 %	0 %	60 %	40 %	51891310
5082	NC_006177	GCG	2	6	201327	201332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891310
5083	NC_006177	GAG	2	6	201340	201345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891310
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5091	NC_006177	CCG	2	6	201789	201794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_006177	CGG	2	6	201867	201872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891311
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5094	NC_006177	CGG	2	6	201982	201987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891311
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5105	NC_006177	GCCA	2	8	202436	202443	25 %	0 %	25 %	50 %	51891311
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5107	NC_006177	G	6	6	202532	202537	0 %	0 %	100 %	0 %	51891311
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5111	NC_006177	GCG	2	6	202731	202736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891311
5112	NC_006177	CCGG	2	8	202753	202760	0 %	0 %	50 %	50 %	51891311
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5115	NC_006177	CGC	3	9	203032	203040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891311
5116	NC_006177	CTGT	2	8	203078	203085	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5117	NC_006177	CTT	2	6	203087	203092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_006177	CGA	2	6	203101	203106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_006177	GTAT	2	8	203124	203131	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_006177	TCA	2	6	203152	203157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_006177	GACA	2	8	203277	203284	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5122	NC_006177	CGG	2	6	203390	203395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891312
5123	NC_006177	AGC	2	6	203441	203446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891312
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5125	NC_006177	GC	3	6	203529	203534	0 %	0 %	50 %	50 %	51891312
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5243	NC_006177	CAC	2	6	207982	207987	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5244	NC_006177	ACCC	2	8	208007	208014	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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5249	NC_006177	GCC	2	6	208260	208265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891319
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5251	NC_006177	GCC	3	9	208355	208363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891319
5252	NC_006177	GAG	3	9	208368	208376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891319
5253	NC_006177	GAG	2	6	208416	208421	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891319
5254	NC_006177	GCG	2	6	208439	208444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891319
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5261	NC_006177	GAAC	2	8	208818	208825	50 %	0 %	25 %	25 %	51891320
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5273	NC_006177	TGGAGG	2	12	209539	209550	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	51891321
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5289	NC_006177	ATC	2	6	210249	210254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891323
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5364	NC_006177	GGC	2	6	213327	213332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891325
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5369	NC_006177	TGGA	2	8	213581	213588	25 %	25 %	50 %	0 %	51891326
5370	NC_006177	G	6	6	213605	213610	0 %	0 %	100 %	0 %	51891326
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5372	NC_006177	GGC	2	6	213721	213726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891326
5373	NC_006177	TGG	2	6	213732	213737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891326
5374	NC_006177	CAT	2	6	213742	213747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891326
5375	NC_006177	GCGG	2	8	213772	213779	0 %	0 %	75 %	25 %	51891326
5376	NC_006177	CTC	2	6	213881	213886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51891326
5377	NC_006177	CGGC	2	8	213896	213903	0 %	0 %	50 %	50 %	51891326
5378	NC_006177	GCC	2	6	213911	213916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891326
5379	NC_006177	GGT	3	9	213925	213933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891326
5380	NC_006177	CGC	2	6	213942	213947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891326
5381	NC_006177	GGCC	2	8	213990	213997	0 %	0 %	50 %	50 %	51891326
5382	NC_006177	CGG	2	6	214006	214011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891326
5383	NC_006177	GAG	2	6	214028	214033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891326
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5385	NC_006177	CCT	2	6	214048	214053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51891326
5386	NC_006177	CG	3	6	214063	214068	0 %	0 %	50 %	50 %	51891326
5387	NC_006177	GCGG	2	8	214069	214076	0 %	0 %	75 %	25 %	51891326
5388	NC_006177	CGC	2	6	214091	214096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891326
5389	NC_006177	AGG	2	6	214125	214130	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891326
5390	NC_006177	CGG	2	6	214209	214214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891326
5391	NC_006177	CCTGGA	2	12	214225	214236	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	51891326
5392	NC_006177	GTG	2	6	214244	214249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891326
5393	NC_006177	CG	3	6	214252	214257	0 %	0 %	50 %	50 %	51891326
5394	NC_006177	GCG	3	9	214255	214263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891326
5395	NC_006177	CGG	2	6	214301	214306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891326
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5397	NC_006177	CTCC	2	8	214339	214346	0 %	25 %	0 %	75 %	51891326
5398	NC_006177	CGGG	2	8	214369	214376	0 %	0 %	75 %	25 %	51891326
5399	NC_006177	TGG	2	6	214410	214415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891326
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5402	NC_006177	CGA	2	6	214492	214497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891326
5403	NC_006177	GCC	2	6	214502	214507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891326
5404	NC_006177	GCT	2	6	214510	214515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891326
5405	NC_006177	CGGTGG	2	12	214572	214583	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	51891326
5406	NC_006177	CTG	2	6	214604	214609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891326
5407	NC_006177	TTC	2	6	214635	214640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51891326
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5410	NC_006177	CT	3	6	214724	214729	0 %	50 %	0 %	50 %	51891327
5411	NC_006177	GCT	2	6	214759	214764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891327
5412	NC_006177	TGC	2	6	214781	214786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891327
5413	NC_006177	CGG	2	6	214787	214792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891327
5414	NC_006177	CGGGG	2	10	214839	214848	0 %	0 %	80 %	20 %	51891327
5415	NC_006177	GCT	2	6	214906	214911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891327
5416	NC_006177	GGTCAT	2	12	214939	214950	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	51891327
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5418	NC_006177	GCT	2	6	215020	215025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891327
5419	NC_006177	CGA	2	6	215044	215049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891327
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5421	NC_006177	CCG	2	6	215061	215066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891327
5422	NC_006177	CGC	2	6	215105	215110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891327
5423	NC_006177	AGC	2	6	215163	215168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891327
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5428	NC_006177	CGCC	2	8	215257	215264	0 %	0 %	25 %	75 %	51891327
5429	NC_006177	AGG	2	6	215289	215294	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891327
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5431	NC_006177	TCG	2	6	215322	215327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891327
5432	NC_006177	GC	3	6	215328	215333	0 %	0 %	50 %	50 %	51891327
5433	NC_006177	CCT	2	6	215341	215346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51891327
5434	NC_006177	TCA	2	6	215367	215372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891327
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5436	NC_006177	CGG	2	6	215442	215447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891327
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5438	NC_006177	CGC	3	9	215505	215513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891327
5439	NC_006177	GCC	2	6	215580	215585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891327
5440	NC_006177	GCG	2	6	215606	215611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891327
5441	NC_006177	GCG	2	6	215734	215739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5442	NC_006177	CTC	2	6	215745	215750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5443	NC_006177	TCT	2	6	215840	215845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51891328
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5445	NC_006177	GCG	2	6	215890	215895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891328
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5447	NC_006177	GTGGCG	2	12	216028	216039	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	51891328
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5450	NC_006177	GCG	2	6	216099	216104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891328
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5462	NC_006177	CCT	2	6	216459	216464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	51891328
5463	NC_006177	CTT	2	6	216468	216473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51891328
5464	NC_006177	GAG	2	6	216481	216486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891328
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5466	NC_006177	TCGA	2	8	216604	216611	25 %	25 %	25 %	25 %	51891328
5467	NC_006177	CG	4	8	216624	216631	0 %	0 %	50 %	50 %	51891328
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5473	NC_006177	TCGTC	2	10	216923	216932	0 %	40 %	20 %	40 %	51891329
5474	NC_006177	GCC	2	6	217043	217048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891329
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5476	NC_006177	GCA	2	6	217224	217229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891329
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5478	NC_006177	CAT	2	6	217278	217283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891329
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5480	NC_006177	GCT	2	6	217320	217325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891329
5481	NC_006177	GGCG	2	8	217329	217336	0 %	0 %	75 %	25 %	51891329
5482	NC_006177	GAC	2	6	217456	217461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891329
5483	NC_006177	GAG	2	6	217468	217473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	51891329
5484	NC_006177	GCG	2	6	217491	217496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5485	NC_006177	GCC	2	6	217510	217515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5486	NC_006177	GATC	2	8	217551	217558	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5487	NC_006177	GTC	2	6	217628	217633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891330
5488	NC_006177	GGCC	2	8	217642	217649	0 %	0 %	50 %	50 %	51891330
5489	NC_006177	T	6	6	217713	217718	0 %	100 %	0 %	0 %	51891330
5490	NC_006177	TCA	2	6	217773	217778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891330
5491	NC_006177	TGG	2	6	217782	217787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51891330
5492	NC_006177	CGC	2	6	217855	217860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891330
5493	NC_006177	TTGCC	2	10	217866	217875	0 %	40 %	20 %	40 %	51891330
5494	NC_006177	CAT	2	6	217876	217881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51891330
5495	NC_006177	CCG	2	6	217897	217902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	51891330
5496	NC_006177	GGCCGG	2	12	217919	217930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891330
5497	NC_006177	CGA	2	6	217966	217971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51891330
5498	NC_006177	GC	3	6	218002	218007	0 %	0 %	50 %	50 %	51891330
5499	NC_006177	CGG	2	6	218115	218120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51891330
5500	NC_006177	GCT	2	6	218122	218127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51891330

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