MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 40295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006086	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006086	T	6	6	15	20	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006086	T	6	6	22	27	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006086	A	6	6	40	45	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006086	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006086	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006086	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	50913347
8	NC_006086	T	6	6	280	285	0 %	100 %	0 %	0 %	50913347
9	NC_006086	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913347
10	NC_006086	A	7	7	365	371	100 %	0 %	0 %	0 %	50913347
11	NC_006086	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913347
12	NC_006086	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913347
13	NC_006086	ATCA	2	8	478	485	50 %	25 %	0 %	25 %	50913347
14	NC_006086	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913347
15	NC_006086	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913347
16	NC_006086	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913347
17	NC_006086	AT	3	6	738	743	50 %	50 %	0 %	0 %	50913347
18	NC_006086	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913347
19	NC_006086	GAAA	2	8	807	814	75 %	0 %	25 %	0 %	50913347
20	NC_006086	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913347
21	NC_006086	A	7	7	865	871	100 %	0 %	0 %	0 %	50913347
22	NC_006086	CT	3	6	874	879	0 %	50 %	0 %	50 %	50913347
23	NC_006086	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913347
24	NC_006086	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913347
25	NC_006086	ACAA	2	8	929	936	75 %	0 %	0 %	25 %	50913347
26	NC_006086	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913347
27	NC_006086	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913347
28	NC_006086	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50913347
29	NC_006086	CAAA	2	8	1194	1201	75 %	0 %	0 %	25 %	50913347
30	NC_006086	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913347
31	NC_006086	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913347
32	NC_006086	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913347
33	NC_006086	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913347
34	NC_006086	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913347
35	NC_006086	A	6	6	1539	1544	100 %	0 %	0 %	0 %	50913347
36	NC_006086	AAC	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_006086	TC	3	6	1626	1631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_006086	TTTA	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006086	TA	3	6	1652	1657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006086	CTA	4	12	1666	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_006086	TTA	3	9	1679	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006086	TTA	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006086	ATT	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913348
44	NC_006086	CTATTC	2	12	1791	1802	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	50913348
45	NC_006086	TCA	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913348
46	NC_006086	GTAA	2	8	1889	1896	50 %	25 %	25 %	0 %	50913348
47	NC_006086	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913348
48	NC_006086	T	7	7	1951	1957	0 %	100 %	0 %	0 %	50913348
49	NC_006086	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913348
50	NC_006086	AAC	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913348
51	NC_006086	GTT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913348
52	NC_006086	AAG	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913348
53	NC_006086	ATT	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913348
54	NC_006086	TAT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913348
55	NC_006086	GTC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913348
56	NC_006086	GACT	2	8	2248	2255	25 %	25 %	25 %	25 %	50913348
57	NC_006086	CAG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913348
58	NC_006086	GA	3	6	2335	2340	50 %	0 %	50 %	0 %	50913348
59	NC_006086	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913348
60	NC_006086	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913348
61	NC_006086	TTA	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913348
62	NC_006086	GTT	2	6	2501	2506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913348
63	NC_006086	CTT	2	6	2545	2550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913348
64	NC_006086	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	50913348
65	NC_006086	AGTC	2	8	2666	2673	25 %	25 %	25 %	25 %	50913348
66	NC_006086	GAA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913348
67	NC_006086	AATT	2	8	2820	2827	50 %	50 %	0 %	0 %	50913348
68	NC_006086	TAAG	2	8	2846	2853	50 %	25 %	25 %	0 %	50913348
69	NC_006086	T	7	7	2874	2880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006086	TTA	2	6	2882	2887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006086	ATA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006086	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	50913349
73	NC_006086	A	6	6	2953	2958	100 %	0 %	0 %	0 %	50913349
74	NC_006086	ATG	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913349
75	NC_006086	A	7	7	3099	3105	100 %	0 %	0 %	0 %	50913349
76	NC_006086	TAAA	2	8	3130	3137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006086	A	6	6	3172	3177	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006086	AGA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006086	AAT	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006086	TCT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_006086	TCT	2	6	3395	3400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_006086	T	6	6	3402	3407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006086	TAA	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006086	TTGA	2	8	3420	3427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006086	CAG	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913350
86	NC_006086	GCT	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913350
87	NC_006086	TGGTA	2	10	3572	3581	20 %	40 %	40 %	0 %	50913350
88	NC_006086	A	7	7	3630	3636	100 %	0 %	0 %	0 %	50913350
89	NC_006086	AAAT	2	8	3710	3717	75 %	25 %	0 %	0 %	50913350
90	NC_006086	TGA	3	9	3770	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913350
91	NC_006086	TCAA	2	8	3876	3883	50 %	25 %	0 %	25 %	50913350
92	NC_006086	A	6	6	3904	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	50913350
93	NC_006086	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913350
94	NC_006086	GTT	2	6	4032	4037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913350
95	NC_006086	AAC	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913350
96	NC_006086	CAAA	2	8	4130	4137	75 %	0 %	0 %	25 %	50913350
97	NC_006086	AGT	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913350
98	NC_006086	AGA	3	9	4193	4201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913350
99	NC_006086	AGA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913350
100	NC_006086	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913350
101	NC_006086	ATC	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913350
102	NC_006086	CAG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913350
103	NC_006086	GCT	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913350
104	NC_006086	TAT	2	6	4391	4396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913350
105	NC_006086	ATG	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913350
106	NC_006086	AAG	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913350
107	NC_006086	GAA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913350
108	NC_006086	GTT	2	6	4521	4526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913350
109	NC_006086	CAT	2	6	4538	4543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913350
110	NC_006086	GAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913351
111	NC_006086	TTG	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913351
112	NC_006086	A	6	6	4681	4686	100 %	0 %	0 %	0 %	50913351
113	NC_006086	GAT	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913351
114	NC_006086	TTA	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913351
115	NC_006086	CTA	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913351
116	NC_006086	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913351
117	NC_006086	CTA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913351
118	NC_006086	ATG	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913351
119	NC_006086	TTACGT	2	12	4938	4949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50913351
120	NC_006086	CAG	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913351
121	NC_006086	GAC	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913351
122	NC_006086	TTA	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913351
123	NC_006086	ATA	2	6	5101	5106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913351
124	NC_006086	TTTA	2	8	5152	5159	25 %	75 %	0 %	0 %	50913351
125	NC_006086	A	6	6	5176	5181	100 %	0 %	0 %	0 %	50913351
126	NC_006086	ATT	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913352
127	NC_006086	ACC	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50913352
128	NC_006086	GAT	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
129	NC_006086	A	9	9	5349	5357	100 %	0 %	0 %	0 %	50913352
130	NC_006086	TGA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
131	NC_006086	T	6	6	5444	5449	0 %	100 %	0 %	0 %	50913352
132	NC_006086	TGA	2	6	5673	5678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
133	NC_006086	T	6	6	5789	5794	0 %	100 %	0 %	0 %	50913352
134	NC_006086	GAT	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
135	NC_006086	AAC	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913352
136	NC_006086	TTA	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913352
137	NC_006086	GAT	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
138	NC_006086	A	6	6	5963	5968	100 %	0 %	0 %	0 %	50913352
139	NC_006086	AGA	2	6	5977	5982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913352
140	NC_006086	A	6	6	5998	6003	100 %	0 %	0 %	0 %	50913352
141	NC_006086	ATT	2	6	6040	6045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913352
142	NC_006086	ATT	2	6	6064	6069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913352
143	NC_006086	T	6	6	6098	6103	0 %	100 %	0 %	0 %	50913352
144	NC_006086	GAT	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
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151	NC_006086	A	7	7	6384	6390	100 %	0 %	0 %	0 %	50913352
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154	NC_006086	CCTT	2	8	6472	6479	0 %	50 %	0 %	50 %	50913352
155	NC_006086	AGTG	2	8	6481	6488	25 %	25 %	50 %	0 %	50913352
156	NC_006086	TGA	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
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172	NC_006086	GTA	2	6	7299	7304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
173	NC_006086	A	6	6	7304	7309	100 %	0 %	0 %	0 %	50913352
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176	NC_006086	AAC	2	6	7431	7436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913352
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182	NC_006086	AAAG	2	8	7708	7715	75 %	0 %	25 %	0 %	50913352
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270	NC_006086	A	6	6	11145	11150	100 %	0 %	0 %	0 %	50913357
271	NC_006086	AGC	2	6	11201	11206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913357
272	NC_006086	T	7	7	11225	11231	0 %	100 %	0 %	0 %	50913357
273	NC_006086	TAT	2	6	11237	11242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913357
274	NC_006086	A	6	6	11246	11251	100 %	0 %	0 %	0 %	50913357
275	NC_006086	GAT	2	6	11286	11291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913357
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289	NC_006086	TAT	2	6	11778	11783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913357
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402	NC_006086	TA	3	6	16968	16973	50 %	50 %	0 %	0 %	50913361
403	NC_006086	CAC	2	6	16979	16984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50913361
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405	NC_006086	TAAAT	2	10	17012	17021	60 %	40 %	0 %	0 %	50913361
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