MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 40295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_006086	T	6	6	709461	709466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15002	NC_006086	AAAT	2	8	709494	709501	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_006086	TAAT	2	8	709522	709529	50 %	50 %	0 %	0 %	50914052
15004	NC_006086	ATT	2	6	709540	709545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914052
15005	NC_006086	GAAT	2	8	709682	709689	50 %	25 %	25 %	0 %	50914052
15006	NC_006086	TGG	2	6	709827	709832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50914052
15007	NC_006086	CAT	2	6	709891	709896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914052
15008	NC_006086	TACC	2	8	709911	709918	25 %	25 %	0 %	50 %	50914052
15009	NC_006086	GAG	2	6	710029	710034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15010	NC_006086	GTA	2	6	710052	710057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914053
15011	NC_006086	T	6	6	710077	710082	0 %	100 %	0 %	0 %	50914053
15012	NC_006086	TTA	2	6	710153	710158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914053
15013	NC_006086	CAAG	2	8	710257	710264	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15014	NC_006086	ACA	2	6	710282	710287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15015	NC_006086	A	7	7	710414	710420	100 %	0 %	0 %	0 %	50914054
15016	NC_006086	AAT	2	6	710432	710437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914054
15017	NC_006086	AATG	2	8	710450	710457	50 %	25 %	25 %	0 %	50914054
15018	NC_006086	AGA	2	6	710485	710490	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50914054
15019	NC_006086	CCAAAA	2	12	710528	710539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50914054
15020	NC_006086	TGGT	2	8	710568	710575	0 %	50 %	50 %	0 %	50914054
15021	NC_006086	TGA	2	6	710650	710655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914054
15022	NC_006086	GAT	2	6	710657	710662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914054
15023	NC_006086	TGA	2	6	710688	710693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914054
15024	NC_006086	CTT	2	6	710719	710724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914054
15025	NC_006086	CTT	2	6	710778	710783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914054
15026	NC_006086	GCT	2	6	710843	710848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914054
15027	NC_006086	TAT	2	6	710878	710883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914054
15028	NC_006086	TGA	2	6	710890	710895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914054
15029	NC_006086	A	6	6	710912	710917	100 %	0 %	0 %	0 %	50914054
15030	NC_006086	TATC	2	8	710928	710935	25 %	50 %	0 %	25 %	50914054
15031	NC_006086	CTT	2	6	710972	710977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914054
15032	NC_006086	ATT	2	6	710981	710986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914054
15033	NC_006086	A	6	6	711061	711066	100 %	0 %	0 %	0 %	50914054
15034	NC_006086	TTG	2	6	711078	711083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50914054
15035	NC_006086	GAG	2	6	711104	711109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50914054
15036	NC_006086	AAC	2	6	711117	711122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50914054
15037	NC_006086	TGA	2	6	711169	711174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914054
15038	NC_006086	CTT	2	6	711180	711185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914054
15039	NC_006086	ATT	2	6	711197	711202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914054
15040	NC_006086	AGA	2	6	711205	711210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50914054
15041	NC_006086	AAC	2	6	711273	711278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50914054
15042	NC_006086	CTT	2	6	711347	711352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914054
15043	NC_006086	ATG	2	6	711357	711362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914054
15044	NC_006086	AGC	2	6	711385	711390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914054
15045	NC_006086	TAT	2	6	711451	711456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914054
15046	NC_006086	GAA	2	6	711458	711463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50914054
15047	NC_006086	CAT	2	6	711475	711480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914054
15048	NC_006086	CCAAG	2	10	711491	711500	40 %	0 %	20 %	40 %	50914054
15049	NC_006086	GCT	2	6	711530	711535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914054
15050	NC_006086	AAT	2	6	711580	711585	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914055
15051	NC_006086	GAA	2	6	711590	711595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50914055
15052	NC_006086	GAT	2	6	711662	711667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914055
15053	NC_006086	TTA	2	6	711717	711722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914055
15054	NC_006086	CAAG	2	8	711759	711766	50 %	0 %	25 %	25 %	50914055
15055	NC_006086	T	6	6	711790	711795	0 %	100 %	0 %	0 %	50914055
15056	NC_006086	GAT	2	6	711883	711888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914055
15057	NC_006086	GAA	2	6	711890	711895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50914055
15058	NC_006086	CAG	2	6	711904	711909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914055
15059	NC_006086	AGA	2	6	711964	711969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50914055
15060	NC_006086	TTG	2	6	712014	712019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50914055
15061	NC_006086	AACA	2	8	712058	712065	75 %	0 %	0 %	25 %	50914055
15062	NC_006086	TTC	2	6	712123	712128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914055
15063	NC_006086	GAT	2	6	712148	712153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914055
15064	NC_006086	A	6	6	712250	712255	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_006086	ATG	2	6	712292	712297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15066	NC_006086	CAATG	2	10	712382	712391	40 %	20 %	20 %	20 %	50914056
15067	NC_006086	TATT	2	8	712401	712408	25 %	75 %	0 %	0 %	50914056
15068	NC_006086	CTTG	2	8	712420	712427	0 %	50 %	25 %	25 %	50914056
15069	NC_006086	AAC	2	6	712480	712485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50914056
15070	NC_006086	GAT	2	6	712508	712513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914056
15071	NC_006086	TGA	2	6	712555	712560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914056
15072	NC_006086	TTA	2	6	712565	712570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914056
15073	NC_006086	GAT	2	6	712582	712587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914056
15074	NC_006086	AAC	2	6	712604	712609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50914056
15075	NC_006086	GCT	2	6	712664	712669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914056
15076	NC_006086	ATT	2	6	712684	712689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914056
15077	NC_006086	GTT	2	6	712715	712720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50914056
15078	NC_006086	AGT	2	6	712730	712735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914056
15079	NC_006086	ATT	2	6	712748	712753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914056
15080	NC_006086	A	6	6	712845	712850	100 %	0 %	0 %	0 %	50914056
15081	NC_006086	CTG	2	6	712863	712868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914056
15082	NC_006086	AGA	2	6	712918	712923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50914056
15083	NC_006086	AGC	2	6	712927	712932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914056
15084	NC_006086	CTT	2	6	712941	712946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914056
15085	NC_006086	GAAA	2	8	712998	713005	75 %	0 %	25 %	0 %	50914056
15086	NC_006086	TTA	2	6	713012	713017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914056
15087	NC_006086	A	6	6	713025	713030	100 %	0 %	0 %	0 %	50914056
15088	NC_006086	A	6	6	713039	713044	100 %	0 %	0 %	0 %	50914056
15089	NC_006086	A	8	8	713050	713057	100 %	0 %	0 %	0 %	50914056
15090	NC_006086	T	6	6	713092	713097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15091	NC_006086	ATT	2	6	713110	713115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_006086	GAA	2	6	713121	713126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_006086	TTA	2	6	713129	713134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914057
15094	NC_006086	CTT	2	6	713164	713169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914057
15095	NC_006086	T	6	6	713186	713191	0 %	100 %	0 %	0 %	50914057
15096	NC_006086	ATA	2	6	713210	713215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914057
15097	NC_006086	ATA	2	6	713247	713252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914057
15098	NC_006086	CGT	2	6	713253	713258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914057
15099	NC_006086	TCA	2	6	713316	713321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914057
15100	NC_006086	T	7	7	713342	713348	0 %	100 %	0 %	0 %	50914057
15101	NC_006086	GGT	2	6	713351	713356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50914057
15102	NC_006086	CAA	2	6	713383	713388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50914057
15103	NC_006086	TCT	2	6	713391	713396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914057
15104	NC_006086	GAT	2	6	713413	713418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914057
15105	NC_006086	TTG	2	6	713513	713518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50914057
15106	NC_006086	AAT	2	6	713543	713548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914057
15107	NC_006086	CAT	2	6	713599	713604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914057
15108	NC_006086	AGA	2	6	713616	713621	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50914057
15109	NC_006086	ACG	2	6	713684	713689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914057
15110	NC_006086	TAT	4	12	713707	713718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914057
15111	NC_006086	CAAT	2	8	713749	713756	50 %	25 %	0 %	25 %	50914057
15112	NC_006086	CAG	2	6	713764	713769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914057
15113	NC_006086	AAT	2	6	713801	713806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914057
15114	NC_006086	AAAT	2	8	713822	713829	75 %	25 %	0 %	0 %	50914057
15115	NC_006086	CAT	2	6	713911	713916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914057
15116	NC_006086	TCG	2	6	713933	713938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914057
15117	NC_006086	CTG	2	6	713953	713958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914057
15118	NC_006086	GCT	2	6	713999	714004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914057
15119	NC_006086	TGC	2	6	714164	714169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914057
15120	NC_006086	TCT	2	6	714186	714191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914057
15121	NC_006086	CT	3	6	714213	714218	0 %	50 %	0 %	50 %	50914057
15122	NC_006086	AGC	2	6	714284	714289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914057
15123	NC_006086	GAATA	2	10	714346	714355	60 %	20 %	20 %	0 %	50914057
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15247	NC_006086	A	6	6	720474	720479	100 %	0 %	0 %	0 %	50914063
15248	NC_006086	TAT	2	6	720486	720491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914063
15249	NC_006086	GTCAG	2	10	720499	720508	20 %	20 %	40 %	20 %	50914063
15250	NC_006086	GAC	2	6	720687	720692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914063
15251	NC_006086	GTTGAC	2	12	720711	720722	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	50914063
15252	NC_006086	T	7	7	720752	720758	0 %	100 %	0 %	0 %	50914063
15253	NC_006086	TGA	2	6	720816	720821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914063
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15256	NC_006086	T	6	6	720861	720866	0 %	100 %	0 %	0 %	50914063
15257	NC_006086	TGA	2	6	720930	720935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50914063
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15259	NC_006086	A	6	6	720999	721004	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15260	NC_006086	TAC	2	6	721031	721036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15261	NC_006086	T	7	7	721041	721047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15262	NC_006086	CTT	2	6	721084	721089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914064
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15271	NC_006086	CAT	2	6	721576	721581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914064
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15275	NC_006086	ATAA	2	8	721896	721903	75 %	25 %	0 %	0 %	50914064
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15278	NC_006086	CAA	2	6	721936	721941	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50914064
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15281	NC_006086	A	8	8	721992	721999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15282	NC_006086	TCA	2	6	722020	722025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15283	NC_006086	GTG	2	6	722186	722191	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15284	NC_006086	TCA	2	6	722220	722225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50914065
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15287	NC_006086	GCA	2	6	722391	722396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914065
15288	NC_006086	TTGA	2	8	722401	722408	25 %	50 %	25 %	0 %	50914065
15289	NC_006086	GAA	2	6	722425	722430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50914065
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15297	NC_006086	A	7	7	722776	722782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15298	NC_006086	TAG	2	6	722787	722792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15300	NC_006086	AG	3	6	722881	722886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15301	NC_006086	A	7	7	722907	722913	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15320	NC_006086	TACAGC	2	12	723975	723986	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50914067
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15332	NC_006086	ATGTT	2	10	724446	724455	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
15333	NC_006086	TGG	2	6	724511	724516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15334	NC_006086	TAA	2	6	724536	724541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15335	NC_006086	A	6	6	724540	724545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15336	NC_006086	GGCTAT	2	12	724606	724617	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	50914068
15337	NC_006086	ACCAC	2	10	724637	724646	40 %	0 %	0 %	60 %	50914068
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15341	NC_006086	TTC	2	6	724756	724761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50914068
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15350	NC_006086	GGT	2	6	725090	725095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50914068
15351	NC_006086	TCTAC	2	10	725242	725251	20 %	40 %	0 %	40 %	50914068
15352	NC_006086	CCCCTT	2	12	725278	725289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50914068
15353	NC_006086	ATT	2	6	725493	725498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914068
15354	NC_006086	GCT	2	6	725522	725527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914068
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15357	NC_006086	AC	3	6	725727	725732	50 %	0 %	0 %	50 %	50914068
15358	NC_006086	CAG	2	6	725803	725808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914068
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15360	NC_006086	CAATT	2	10	725816	725825	40 %	40 %	0 %	20 %	50914068
15361	NC_006086	GCCA	2	8	725892	725899	25 %	0 %	25 %	50 %	50914068
15362	NC_006086	AAGG	2	8	725927	725934	50 %	0 %	50 %	0 %	50914068
15363	NC_006086	AG	3	6	725972	725977	50 %	0 %	50 %	0 %	50914068
15364	NC_006086	TAT	2	6	725982	725987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914068
15365	NC_006086	GCA	2	6	726011	726016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50914068
15366	NC_006086	ATT	2	6	726019	726024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50914068
15367	NC_006086	AAT	3	9	726036	726044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50914068
15368	NC_006086	TAT	2	6	726063	726068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15369	NC_006086	TCTTA	2	10	726134	726143	20 %	60 %	0 %	20 %	50914069
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15496	NC_006086	TCG	2	6	731443	731448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50914074
15497	NC_006086	CAAGAC	2	12	731502	731513	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	50914074
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15499	NC_006086	ATGA	2	8	731643	731650	50 %	25 %	25 %	0 %	50914074
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