MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 40295

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_006086	T	7	7	519136	519142	0 %	100 %	0 %	0 %	50913873
11002	NC_006086	CTATG	2	10	519193	519202	20 %	40 %	20 %	20 %	50913873
11003	NC_006086	TGG	2	6	519208	519213	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913873
11004	NC_006086	CAGA	2	8	519272	519279	50 %	0 %	25 %	25 %	50913873
11005	NC_006086	TCT	2	6	519348	519353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913873
11006	NC_006086	TAT	2	6	519364	519369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913873
11007	NC_006086	A	6	6	519388	519393	100 %	0 %	0 %	0 %	50913873
11008	NC_006086	ATG	2	6	519407	519412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913873
11009	NC_006086	ATG	2	6	519431	519436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913873
11010	NC_006086	TGG	2	6	519460	519465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913873
11011	NC_006086	T	6	6	519505	519510	0 %	100 %	0 %	0 %	50913873
11012	NC_006086	GAT	2	6	519590	519595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913873
11013	NC_006086	AT	3	6	519594	519599	50 %	50 %	0 %	0 %	50913873
11014	NC_006086	AAG	2	6	519603	519608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913873
11015	NC_006086	TTATC	2	10	519614	519623	20 %	60 %	0 %	20 %	50913873
11016	NC_006086	GAAAA	2	10	519636	519645	80 %	0 %	20 %	0 %	50913873
11017	NC_006086	AAT	2	6	519675	519680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913873
11018	NC_006086	A	6	6	519738	519743	100 %	0 %	0 %	0 %	50913874
11019	NC_006086	CTGCT	2	10	519750	519759	0 %	40 %	20 %	40 %	50913874
11020	NC_006086	GCT	2	6	519796	519801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913874
11021	NC_006086	GCT	2	6	519845	519850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11022	NC_006086	CAC	2	6	519856	519861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11023	NC_006086	A	6	6	519876	519881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11024	NC_006086	A	6	6	519899	519904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11025	NC_006086	A	6	6	519917	519922	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_006086	TCTA	2	8	519993	520000	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11027	NC_006086	AT	3	6	520005	520010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11028	NC_006086	GTA	2	6	520055	520060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161761319
11029	NC_006086	ACT	2	6	520108	520113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161761319
11030	NC_006086	TCA	2	6	520156	520161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161761319
11031	NC_006086	AACC	2	8	520165	520172	50 %	0 %	0 %	50 %	161761319
11032	NC_006086	TGC	2	6	520194	520199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161761319
11033	NC_006086	AGA	2	6	520203	520208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161761319
11034	NC_006086	CTT	2	6	520402	520407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161761319
11035	NC_006086	TTG	2	6	520460	520465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161761319
11036	NC_006086	CTT	2	6	520510	520515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161761319
11037	NC_006086	TGA	2	6	520536	520541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161761319
11038	NC_006086	CAT	3	9	520602	520610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161761319
11039	NC_006086	CCAGAA	2	12	520642	520653	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	161761319
11040	NC_006086	CTT	2	6	520675	520680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161761319
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11042	NC_006086	AAATCG	2	12	520766	520777	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	161761319
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11044	NC_006086	A	6	6	520798	520803	100 %	0 %	0 %	0 %	161761319
11045	NC_006086	TGT	2	6	520806	520811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	161761319
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11050	NC_006086	CA	3	6	520946	520951	50 %	0 %	0 %	50 %	161761319
11051	NC_006086	TA	3	6	520970	520975	50 %	50 %	0 %	0 %	161761319
11052	NC_006086	TTC	2	6	521011	521016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161761319
11053	NC_006086	AAC	2	6	521017	521022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161761319
11054	NC_006086	CAG	2	6	521078	521083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161761319
11055	NC_006086	GTTGA	2	10	521125	521134	20 %	40 %	40 %	0 %	161761319
11056	NC_006086	TAC	2	6	521160	521165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161761319
11057	NC_006086	TTAATT	2	12	521226	521237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	161761319
11058	NC_006086	GAA	2	6	521279	521284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11059	NC_006086	ATAA	2	8	521333	521340	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_006086	TCG	2	6	521412	521417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_006086	AGA	2	6	521435	521440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_006086	TAAA	2	8	521443	521450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11063	NC_006086	A	6	6	521448	521453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11064	NC_006086	ATT	2	6	521484	521489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913876
11065	NC_006086	AAG	2	6	521521	521526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913876
11066	NC_006086	AGCA	2	8	521549	521556	50 %	0 %	25 %	25 %	50913876
11067	NC_006086	TTG	2	6	521575	521580	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913876
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11070	NC_006086	TGC	2	6	521654	521659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913876
11071	NC_006086	TGCT	2	8	521716	521723	0 %	50 %	25 %	25 %	50913876
11072	NC_006086	TGT	2	6	521741	521746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913876
11073	NC_006086	TAA	2	6	521798	521803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913876
11074	NC_006086	A	6	6	521802	521807	100 %	0 %	0 %	0 %	50913876
11075	NC_006086	TTGT	2	8	521842	521849	0 %	75 %	25 %	0 %	50913876
11076	NC_006086	CAG	2	6	521914	521919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913876
11077	NC_006086	CAG	2	6	521935	521940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913876
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11079	NC_006086	AGC	2	6	522053	522058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913876
11080	NC_006086	AAG	2	6	522070	522075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913876
11081	NC_006086	GGT	2	6	522102	522107	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913876
11082	NC_006086	GGT	2	6	522171	522176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913876
11083	NC_006086	TTGCT	2	10	522202	522211	0 %	60 %	20 %	20 %	50913876
11084	NC_006086	A	6	6	522235	522240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11085	NC_006086	CTTTT	2	10	522255	522264	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11086	NC_006086	T	6	6	522261	522266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11087	NC_006086	GA	3	6	522288	522293	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11088	NC_006086	T	6	6	522345	522350	0 %	100 %	0 %	0 %	50913877
11089	NC_006086	AATGA	2	10	522359	522368	60 %	20 %	20 %	0 %	50913877
11090	NC_006086	AGCAT	2	10	522525	522534	40 %	20 %	20 %	20 %	50913877
11091	NC_006086	TTA	2	6	522564	522569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913877
11092	NC_006086	T	7	7	522744	522750	0 %	100 %	0 %	0 %	50913877
11093	NC_006086	TTG	2	6	522786	522791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913877
11094	NC_006086	TAGTTG	2	12	522803	522814	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	50913877
11095	NC_006086	TTA	2	6	522828	522833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913877
11096	NC_006086	T	7	7	523025	523031	0 %	100 %	0 %	0 %	50913877
11097	NC_006086	T	6	6	523046	523051	0 %	100 %	0 %	0 %	50913877
11098	NC_006086	TAA	2	6	523180	523185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913877
11099	NC_006086	TTTG	2	8	523276	523283	0 %	75 %	25 %	0 %	50913877
11100	NC_006086	TTC	2	6	523319	523324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913877
11101	NC_006086	GAT	2	6	523327	523332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913877
11102	NC_006086	AGC	2	6	523397	523402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913877
11103	NC_006086	ATG	2	6	523499	523504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913877
11104	NC_006086	T	7	7	523578	523584	0 %	100 %	0 %	0 %	50913878
11105	NC_006086	TTC	2	6	523653	523658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913878
11106	NC_006086	TGG	2	6	523661	523666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913878
11107	NC_006086	CCA	2	6	523696	523701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50913878
11108	NC_006086	TTG	2	6	523704	523709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913878
11109	NC_006086	CCT	2	6	523720	523725	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50913878
11110	NC_006086	CTT	2	6	523757	523762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913878
11111	NC_006086	GGC	2	6	523869	523874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	50913878
11112	NC_006086	GCT	2	6	523904	523909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913878
11113	NC_006086	T	6	6	523949	523954	0 %	100 %	0 %	0 %	50913878
11114	NC_006086	T	8	8	524040	524047	0 %	100 %	0 %	0 %	50913878
11115	NC_006086	TAG	2	6	524116	524121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913878
11116	NC_006086	T	7	7	524159	524165	0 %	100 %	0 %	0 %	50913878
11117	NC_006086	GTC	2	6	524181	524186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913878
11118	NC_006086	CCA	2	6	524200	524205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50913878
11119	NC_006086	T	6	6	524256	524261	0 %	100 %	0 %	0 %	50913878
11120	NC_006086	GTCAAA	2	12	524271	524282	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50913878
11121	NC_006086	T	7	7	524367	524373	0 %	100 %	0 %	0 %	50913878
11122	NC_006086	AAT	2	6	524382	524387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913878
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11124	NC_006086	CAT	2	6	524399	524404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913878
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11126	NC_006086	GTTT	2	8	524431	524438	0 %	75 %	25 %	0 %	50913878
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11152	NC_006086	CCT	2	6	525628	525633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11155	NC_006086	TTTAG	2	10	525704	525713	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
11156	NC_006086	CT	3	6	525723	525728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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11163	NC_006086	CAT	2	6	526228	526233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913881
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11245	NC_006086	GAAG	2	8	530297	530304	50 %	0 %	50 %	0 %	50913883
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11493	NC_006086	TGC	2	6	542463	542468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11494	NC_006086	ACTT	2	8	542500	542507	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11495	NC_006086	AGCTG	2	10	542511	542520	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
11496	NC_006086	TTG	2	6	542609	542614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11497	NC_006086	AG	3	6	542632	542637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11498	NC_006086	AAAT	2	8	542645	542652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
11499	NC_006086	AAG	2	6	542654	542659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11500	NC_006086	CTT	2	6	542689	542694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913896

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