MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA

Total Repeats: 1955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005230	GC	3	6	2	7	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_005230	AAT	2	6	64	69	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005230	ATC	2	6	132	137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_005230	TCA	2	6	174	179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_005230	AGA	3	9	188	196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505669
6	NC_005230	TTA	2	6	243	248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505669
7	NC_005230	TTG	2	6	252	257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505669
8	NC_005230	GTT	2	6	359	364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505669
9	NC_005230	T	6	6	371	376	0 %	100 %	0 %	0 %	38505669
10	NC_005230	CTT	3	9	382	390	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505669
11	NC_005230	TGA	2	6	411	416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505669
12	NC_005230	TCA	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505669
13	NC_005230	CA	3	6	481	486	50 %	0 %	0 %	50 %	38505669
14	NC_005230	CCA	2	6	497	502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_005230	AT	3	6	599	604	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005230	CTT	2	6	613	618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_005230	TCC	2	6	666	671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_005230	T	7	7	672	678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005230	CTGTTT	2	12	679	690	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_005230	T	6	6	715	720	0 %	100 %	0 %	0 %	38505670
21	NC_005230	CCATC	2	10	761	770	20 %	20 %	0 %	60 %	38505670
22	NC_005230	CCT	2	6	784	789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505670
23	NC_005230	ACT	2	6	929	934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505670
24	NC_005230	TTTTA	2	10	937	946	20 %	80 %	0 %	0 %	38505670
25	NC_005230	TCT	2	6	956	961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505670
26	NC_005230	TAT	2	6	970	975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505670
27	NC_005230	TCTT	2	8	1024	1031	0 %	75 %	0 %	25 %	38505670
28	NC_005230	AT	3	6	1133	1138	50 %	50 %	0 %	0 %	38505670
29	NC_005230	TGT	2	6	1156	1161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505670
30	NC_005230	T	6	6	1168	1173	0 %	100 %	0 %	0 %	38505670
31	NC_005230	TAT	2	6	1192	1197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505670
32	NC_005230	TAT	2	6	1201	1206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505670
33	NC_005230	CTTC	2	8	1211	1218	0 %	50 %	0 %	50 %	38505670
34	NC_005230	ATA	2	6	1232	1237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505670
35	NC_005230	TCT	2	6	1243	1248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505670
36	NC_005230	T	6	6	1248	1253	0 %	100 %	0 %	0 %	38505670
37	NC_005230	AAC	2	6	1319	1324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_005230	ATT	2	6	1398	1403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505671
39	NC_005230	CAAA	2	8	1426	1433	75 %	0 %	0 %	25 %	38505671
40	NC_005230	GGC	2	6	1498	1503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505671
41	NC_005230	CTC	2	6	1624	1629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505671
42	NC_005230	TTG	2	6	1642	1647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505671
43	NC_005230	CGC	2	6	1682	1687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505671
44	NC_005230	A	6	6	1735	1740	100 %	0 %	0 %	0 %	38505671
45	NC_005230	TAA	2	6	1785	1790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505671
46	NC_005230	ATCA	2	8	1798	1805	50 %	25 %	0 %	25 %	38505671
47	NC_005230	CCCG	2	8	1968	1975	0 %	0 %	25 %	75 %	38505672
48	NC_005230	CCA	3	9	1987	1995	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505672
49	NC_005230	TCA	2	6	2001	2006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505672
50	NC_005230	AATTA	2	10	2018	2027	60 %	40 %	0 %	0 %	38505672
51	NC_005230	CTTGGT	2	12	2059	2070	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_005230	TGCC	2	8	2109	2116	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_005230	CAA	2	6	2138	2143	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_005230	AAAAT	2	10	2145	2154	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005230	CAT	2	6	2223	2228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_005230	TGG	2	6	2267	2272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005230	AAT	2	6	2298	2303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005230	AAT	2	6	2308	2313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005230	A	6	6	2337	2342	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005230	TGAA	2	8	2396	2403	50 %	25 %	25 %	0 %	38505673
61	NC_005230	GGCA	2	8	2418	2425	25 %	0 %	50 %	25 %	38505673
62	NC_005230	CCTGG	2	10	2545	2554	0 %	20 %	40 %	40 %	38505673
63	NC_005230	CAC	2	6	2563	2568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505673
64	NC_005230	A	6	6	2592	2597	100 %	0 %	0 %	0 %	38505673
65	NC_005230	TGA	2	6	2653	2658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505673
66	NC_005230	CAA	2	6	2672	2677	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505673
67	NC_005230	GCC	2	6	2765	2770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505673
68	NC_005230	G	6	6	2790	2795	0 %	0 %	100 %	0 %	38505673
69	NC_005230	CCG	2	6	2812	2817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505673
70	NC_005230	GAT	2	6	2830	2835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505673
71	NC_005230	CAA	2	6	2949	2954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505673
72	NC_005230	TAT	2	6	3000	3005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005230	T	6	6	3058	3063	0 %	100 %	0 %	0 %	38505674
74	NC_005230	CTA	2	6	3109	3114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505674
75	NC_005230	TTC	2	6	3122	3127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505674
76	NC_005230	TCT	2	6	3144	3149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505674
77	NC_005230	AAG	2	6	3173	3178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505674
78	NC_005230	TGT	2	6	3195	3200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505674
79	NC_005230	AT	3	6	3273	3278	50 %	50 %	0 %	0 %	38505674
80	NC_005230	TGA	2	6	3309	3314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505674
81	NC_005230	TTG	2	6	3320	3325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505674
82	NC_005230	ATT	3	9	3370	3378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505675
83	NC_005230	CGC	2	6	3472	3477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505675
84	NC_005230	ATC	2	6	3508	3513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505675
85	NC_005230	GCC	2	6	3534	3539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505675
86	NC_005230	TTG	2	6	3552	3557	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505675
87	NC_005230	TAG	2	6	3574	3579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505675
88	NC_005230	AAT	2	6	3706	3711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005230	CCT	2	6	3725	3730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_005230	CCA	2	6	3800	3805	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_005230	TTC	2	6	3858	3863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_005230	CAG	2	6	3883	3888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_005230	TC	3	6	3890	3895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_005230	AAC	2	6	3920	3925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_005230	ATC	2	6	4020	4025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_005230	TGA	2	6	4067	4072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005230	AAT	2	6	4130	4135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005230	A	7	7	4183	4189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005230	AAT	2	6	4228	4233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005230	GAT	2	6	4240	4245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505676
101	NC_005230	TATC	2	8	4274	4281	25 %	50 %	0 %	25 %	38505676
102	NC_005230	GAG	2	6	4375	4380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505676
103	NC_005230	GAG	2	6	4404	4409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505676
104	NC_005230	AT	3	6	4419	4424	50 %	50 %	0 %	0 %	38505676
105	NC_005230	GCAA	2	8	4439	4446	50 %	0 %	25 %	25 %	38505676
106	NC_005230	A	7	7	4445	4451	100 %	0 %	0 %	0 %	38505676
107	NC_005230	ATA	2	6	4475	4480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505676
108	NC_005230	A	6	6	4489	4494	100 %	0 %	0 %	0 %	38505676
109	NC_005230	AGGA	2	8	4508	4515	50 %	0 %	50 %	0 %	38505676
110	NC_005230	TCA	2	6	4600	4605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505676
111	NC_005230	G	6	6	4648	4653	0 %	0 %	100 %	0 %	38505676
112	NC_005230	ATA	2	6	4683	4688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505676
113	NC_005230	AGA	2	6	4708	4713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505676
114	NC_005230	AAT	2	6	4820	4825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505676
115	NC_005230	AG	3	6	4885	4890	50 %	0 %	50 %	0 %	38505676
116	NC_005230	TGA	2	6	4978	4983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505676
117	NC_005230	A	6	6	4983	4988	100 %	0 %	0 %	0 %	38505676
118	NC_005230	A	7	7	5003	5009	100 %	0 %	0 %	0 %	38505676
119	NC_005230	AAG	2	6	5154	5159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505676
120	NC_005230	ACA	2	6	5165	5170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505676
121	NC_005230	TG	3	6	5205	5210	0 %	50 %	50 %	0 %	38505676
122	NC_005230	A	6	6	5211	5216	100 %	0 %	0 %	0 %	38505676
123	NC_005230	TGA	2	6	5255	5260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505676
124	NC_005230	TTTGC	2	10	5262	5271	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
125	NC_005230	ATT	2	6	5278	5283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005230	ATT	2	6	5339	5344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505677
127	NC_005230	CTC	2	6	5370	5375	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505677
128	NC_005230	GAG	2	6	5399	5404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505677
129	NC_005230	TTTCAA	2	12	5474	5485	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	38505677
130	NC_005230	ATTA	2	8	5508	5515	50 %	50 %	0 %	0 %	38505677
131	NC_005230	TGA	2	6	5852	5857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505677
132	NC_005230	G	6	6	5890	5895	0 %	0 %	100 %	0 %	38505677
133	NC_005230	TTG	2	6	5967	5972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505677
134	NC_005230	TAAA	2	8	6006	6013	75 %	25 %	0 %	0 %	38505677
135	NC_005230	GA	3	6	6034	6039	50 %	0 %	50 %	0 %	38505677
136	NC_005230	CTT	2	6	6057	6062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505677
137	NC_005230	CAT	2	6	6149	6154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505677
138	NC_005230	CAAA	2	8	6294	6301	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_005230	TAT	2	6	6302	6307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005230	CT	3	6	6392	6397	0 %	50 %	0 %	50 %	38505678
141	NC_005230	ACC	2	6	6515	6520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505678
142	NC_005230	CTGC	2	8	6613	6620	0 %	25 %	25 %	50 %	38505678
143	NC_005230	TAG	2	6	6680	6685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505678
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274	NC_005230	A	6	6	14068	14073	100 %	0 %	0 %	0 %	38505682
275	NC_005230	GGGT	2	8	14092	14099	0 %	25 %	75 %	0 %	38505682
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277	NC_005230	T	7	7	14160	14166	0 %	100 %	0 %	0 %	38505682
278	NC_005230	GAT	2	6	14225	14230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505682
279	NC_005230	CTTA	2	8	14244	14251	25 %	50 %	0 %	25 %	38505683
280	NC_005230	CGT	2	6	14273	14278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505683
281	NC_005230	GGAAAT	2	12	14302	14313	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	38505683
282	NC_005230	ATC	2	6	14337	14342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505683
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292	NC_005230	CTA	2	6	14599	14604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505683
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410	NC_005230	CTT	2	6	19506	19511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
411	NC_005230	CTA	2	6	19517	19522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
412	NC_005230	CTA	2	6	19591	19596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505689
413	NC_005230	CTA	2	6	19665	19670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505689
414	NC_005230	CTA	2	6	19736	19741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505689
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