MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSA

Total Repeats: 1955

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_005230	CTG	2	6	80350	80355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505753
1502	NC_005230	TCTT	2	8	80444	80451	0 %	75 %	0 %	25 %	38505753
1503	NC_005230	ATC	2	6	80467	80472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505753
1504	NC_005230	TGA	2	6	80477	80482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505753
1505	NC_005230	AAC	2	6	80542	80547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505753
1506	NC_005230	ATT	2	6	80605	80610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505753
1507	NC_005230	CTT	2	6	80612	80617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505753
1508	NC_005230	TGT	2	6	80632	80637	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505753
1509	NC_005230	AATT	2	8	80659	80666	50 %	50 %	0 %	0 %	38505753
1510	NC_005230	TCA	2	6	80699	80704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505753
1511	NC_005230	TAC	2	6	80718	80723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505753
1512	NC_005230	AAAG	2	8	80746	80753	75 %	0 %	25 %	0 %	38505753
1513	NC_005230	TAA	2	6	80786	80791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505753
1514	NC_005230	TCC	2	6	80818	80823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505753
1515	NC_005230	TAAA	2	8	80824	80831	75 %	25 %	0 %	0 %	38505753
1516	NC_005230	A	6	6	80902	80907	100 %	0 %	0 %	0 %	38505753
1517	NC_005230	AGG	2	6	81037	81042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505753
1518	NC_005230	CATT	2	8	81137	81144	25 %	50 %	0 %	25 %	38505753
1519	NC_005230	TTA	2	6	81149	81154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505753
1520	NC_005230	TAG	2	6	81238	81243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505753
1521	NC_005230	T	7	7	81244	81250	0 %	100 %	0 %	0 %	38505753
1522	NC_005230	CAA	2	6	81259	81264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505753
1523	NC_005230	TATT	2	8	81279	81286	25 %	75 %	0 %	0 %	38505753
1524	NC_005230	T	6	6	81325	81330	0 %	100 %	0 %	0 %	38505753
1525	NC_005230	AAT	2	6	81432	81437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505753
1526	NC_005230	GAT	2	6	81441	81446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505753
1527	NC_005230	TTCC	2	8	81447	81454	0 %	50 %	0 %	50 %	38505753
1528	NC_005230	C	6	6	81743	81748	0 %	0 %	0 %	100 %	38505753
1529	NC_005230	CAT	2	6	81831	81836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505753
1530	NC_005230	CAG	2	6	81903	81908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505753
1531	NC_005230	AGG	2	6	81936	81941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_005230	ACC	3	9	82009	82017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_005230	T	6	6	82021	82026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_005230	CAC	2	6	82032	82037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_005230	CTTT	2	8	82056	82063	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1536	NC_005230	TCC	2	6	82084	82089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1537	NC_005230	GGC	2	6	82106	82111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1538	NC_005230	ATG	2	6	82151	82156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_005230	GAA	2	6	82176	82181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_005230	ATTA	2	8	82191	82198	50 %	50 %	0 %	0 %	38505754
1541	NC_005230	ATT	2	6	82340	82345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505754
1542	NC_005230	A	6	6	82373	82378	100 %	0 %	0 %	0 %	38505754
1543	NC_005230	T	6	6	82394	82399	0 %	100 %	0 %	0 %	38505754
1544	NC_005230	CTT	2	6	82420	82425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505754
1545	NC_005230	TGA	2	6	82524	82529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505754
1546	NC_005230	GA	3	6	82541	82546	50 %	0 %	50 %	0 %	38505754
1547	NC_005230	TTA	2	6	82560	82565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505754
1548	NC_005230	TAA	2	6	82602	82607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_005230	CAA	2	6	82641	82646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505755
1550	NC_005230	TAA	2	6	82699	82704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505755
1551	NC_005230	CGCC	2	8	82719	82726	0 %	0 %	25 %	75 %	38505755
1552	NC_005230	CTT	2	6	82794	82799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505755
1553	NC_005230	CCA	2	6	82811	82816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505755
1554	NC_005230	GATT	2	8	82931	82938	25 %	50 %	25 %	0 %	38505755
1555	NC_005230	GAAT	2	8	82941	82948	50 %	25 %	25 %	0 %	38505755
1556	NC_005230	T	7	7	82948	82954	0 %	100 %	0 %	0 %	38505755
1557	NC_005230	TAAA	2	8	83008	83015	75 %	25 %	0 %	0 %	38505755
1558	NC_005230	AGC	2	6	83068	83073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505755
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1560	NC_005230	GTG	2	6	83357	83362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505755
1561	NC_005230	CCG	2	6	83363	83368	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505755
1562	NC_005230	GA	3	6	83379	83384	50 %	0 %	50 %	0 %	38505755
1563	NC_005230	ATA	2	6	83418	83423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505755
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1565	NC_005230	TTG	2	6	83643	83648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505756
1566	NC_005230	AAG	2	6	83655	83660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505756
1567	NC_005230	ATT	3	9	83807	83815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505756
1568	NC_005230	GA	3	6	83822	83827	50 %	0 %	50 %	0 %	38505756
1569	NC_005230	TAA	2	6	83888	83893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1590	NC_005230	TTA	2	6	85174	85179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1598	NC_005230	GCG	2	6	85443	85448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505758
1599	NC_005230	TGG	2	6	85522	85527	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505758
1600	NC_005230	T	6	6	85583	85588	0 %	100 %	0 %	0 %	38505758
1601	NC_005230	TCT	2	6	85590	85595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505758
1602	NC_005230	GTG	2	6	85673	85678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505758
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1604	NC_005230	AAT	2	6	85771	85776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505758
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1607	NC_005230	TTGG	2	8	85946	85953	0 %	50 %	50 %	0 %	38505758
1608	NC_005230	CAG	2	6	85961	85966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505758
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1931	NC_005230	GAG	2	6	102064	102069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1932	NC_005230	GCC	2	6	102236	102241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1933	NC_005230	GTA	2	6	102308	102313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1948	NC_005230	GGA	2	6	102927	102932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1950	NC_005230	ATC	2	6	102980	102985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1952	NC_005230	CCAAA	2	10	103059	103068	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1954	NC_005230	CAC	2	6	103270	103275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1955	NC_005230	CGT	2	6	103276	103281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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