MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSM

Total Repeats: 2316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_005229	CTG	2	6	77353	77358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505614
1502	NC_005229	ATT	2	6	77669	77674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505614
1503	NC_005229	CTT	2	6	77815	77820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505614
1504	NC_005229	GAC	2	6	77837	77842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505614
1505	NC_005229	GAC	2	6	77909	77914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505614
1506	NC_005229	T	6	6	77933	77938	0 %	100 %	0 %	0 %	38505614
1507	NC_005229	TG	3	6	77954	77959	0 %	50 %	50 %	0 %	38505614
1508	NC_005229	ATC	2	6	78006	78011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505614
1509	NC_005229	T	6	6	78034	78039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_005229	TCG	3	9	78208	78216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505615
1511	NC_005229	AAT	2	6	78222	78227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505615
1512	NC_005229	CTT	2	6	78246	78251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505615
1513	NC_005229	CAT	2	6	78318	78323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505615
1514	NC_005229	CCA	2	6	78333	78338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505615
1515	NC_005229	AGAA	2	8	78412	78419	75 %	0 %	25 %	0 %	38505615
1516	NC_005229	GCG	2	6	78442	78447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505615
1517	NC_005229	C	7	7	78477	78483	0 %	0 %	0 %	100 %	38505615
1518	NC_005229	GCG	2	6	78509	78514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505615
1519	NC_005229	GTC	2	6	78560	78565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505615
1520	NC_005229	CCA	2	6	78586	78591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505615
1521	NC_005229	ATC	2	6	78607	78612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505615
1522	NC_005229	ACG	2	6	78714	78719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505615
1523	NC_005229	A	6	6	78756	78761	100 %	0 %	0 %	0 %	38505615
1524	NC_005229	GTA	2	6	78840	78845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505615
1525	NC_005229	GAA	2	6	78912	78917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_005229	TA	3	6	78998	79003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_005229	TG	3	6	79132	79137	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_005229	T	6	6	79258	79263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_005229	CAT	2	6	79267	79272	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_005229	ACA	2	6	79305	79310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_005229	GGT	2	6	79323	79328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_005229	CCT	2	6	79391	79396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_005229	TCA	2	6	79464	79469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_005229	TGAT	2	8	79496	79503	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_005229	ATC	2	6	79521	79526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505616
1536	NC_005229	T	6	6	79548	79553	0 %	100 %	0 %	0 %	38505616
1537	NC_005229	CTTT	2	8	79560	79567	0 %	75 %	0 %	25 %	38505616
1538	NC_005229	ATC	3	9	79613	79621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505616
1539	NC_005229	GCC	2	6	79642	79647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505616
1540	NC_005229	GCT	2	6	79669	79674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505616
1541	NC_005229	CTT	2	6	79678	79683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505616
1542	NC_005229	TGA	2	6	79788	79793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505616
1543	NC_005229	TCA	2	6	79815	79820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505616
1544	NC_005229	ACA	2	6	79917	79922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505616
1545	NC_005229	TCC	2	6	80018	80023	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505616
1546	NC_005229	TCT	2	6	80028	80033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505616
1547	NC_005229	A	7	7	80068	80074	100 %	0 %	0 %	0 %	38505616
1548	NC_005229	ATT	2	6	80117	80122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505616
1549	NC_005229	TTCT	2	8	80169	80176	0 %	75 %	0 %	25 %	38505616
1550	NC_005229	T	6	6	80262	80267	0 %	100 %	0 %	0 %	38505616
1551	NC_005229	TCAT	2	8	80286	80293	25 %	50 %	0 %	25 %	38505616
1552	NC_005229	TTG	2	6	80360	80365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_005229	GT	3	6	80424	80429	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_005229	TTG	2	6	80511	80516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_005229	AGAAA	2	10	80565	80574	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_005229	A	7	7	80572	80578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_005229	TAG	2	6	80602	80607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_005229	ATCT	2	8	80641	80648	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_005229	CTGC	2	8	80660	80667	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1560	NC_005229	TTG	2	6	80707	80712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_005229	GCC	2	6	80834	80839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505617
1562	NC_005229	GAC	2	6	80850	80855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505617
1563	NC_005229	CCA	2	6	80979	80984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505617
1564	NC_005229	AGA	2	6	81036	81041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505617
1565	NC_005229	GTA	2	6	81072	81077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505617
1566	NC_005229	GCA	2	6	81299	81304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505617
1567	NC_005229	CTG	2	6	81381	81386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505617
1568	NC_005229	GGAA	2	8	81442	81449	50 %	0 %	50 %	0 %	38505617
1569	NC_005229	GAA	2	6	81520	81525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505617
1570	NC_005229	TGACT	2	10	81641	81650	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1571	NC_005229	TTG	2	6	81712	81717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_005229	GGT	2	6	81743	81748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_005229	C	6	6	81811	81816	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1574	NC_005229	GGC	2	6	81867	81872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1575	NC_005229	GCAA	2	8	81903	81910	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1576	NC_005229	GTT	2	6	81919	81924	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_005229	T	6	6	81945	81950	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_005229	CGC	2	6	81953	81958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_005229	CTA	2	6	82012	82017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1580	NC_005229	ATGT	2	8	82079	82086	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_005229	T	6	6	82108	82113	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_005229	T	6	6	82140	82145	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_005229	ATTTTA	2	12	82311	82322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505618
1584	NC_005229	TTTA	2	8	82327	82334	25 %	75 %	0 %	0 %	38505618
1585	NC_005229	CTTT	2	8	82356	82363	0 %	75 %	0 %	25 %	38505618
1586	NC_005229	AAAC	2	8	82456	82463	75 %	0 %	0 %	25 %	38505618
1587	NC_005229	AAAT	2	8	82477	82484	75 %	25 %	0 %	0 %	38505618
1588	NC_005229	TTTC	2	8	82518	82525	0 %	75 %	0 %	25 %	38505618
1589	NC_005229	GCAA	2	8	82556	82563	50 %	0 %	25 %	25 %	38505618
1590	NC_005229	TGCTTC	2	12	82576	82587	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	38505618
1591	NC_005229	ATA	2	6	82741	82746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505618
1592	NC_005229	CTTT	2	8	82761	82768	0 %	75 %	0 %	25 %	38505618
1593	NC_005229	TAA	2	6	82792	82797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505618
1594	NC_005229	TAA	2	6	82801	82806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505618
1595	NC_005229	TCA	2	6	82871	82876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505618
1596	NC_005229	CAA	2	6	82889	82894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505618
1597	NC_005229	CTT	2	6	82901	82906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505618
1598	NC_005229	AAT	2	6	82950	82955	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505618
1599	NC_005229	GCATCT	2	12	83132	83143	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	38505618
1600	NC_005229	AGT	2	6	83147	83152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505618
1601	NC_005229	AAT	2	6	83177	83182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505618
1602	NC_005229	TAC	2	6	83188	83193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505618
1603	NC_005229	TCA	2	6	83288	83293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505618
1604	NC_005229	AGA	2	6	83309	83314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505618
1605	NC_005229	A	6	6	83325	83330	100 %	0 %	0 %	0 %	38505618
1606	NC_005229	CTT	2	6	83421	83426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505618
1607	NC_005229	A	6	6	83442	83447	100 %	0 %	0 %	0 %	38505618
1608	NC_005229	TTG	2	6	83451	83456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505618
1609	NC_005229	GTT	2	6	83460	83465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505618
1610	NC_005229	T	6	6	83518	83523	0 %	100 %	0 %	0 %	38505618
1611	NC_005229	ATT	2	6	83533	83538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505618
1612	NC_005229	TAG	2	6	83617	83622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505618
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1614	NC_005229	GCT	2	6	83648	83653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505618
1615	NC_005229	AGA	2	6	83672	83677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505618
1616	NC_005229	AGA	2	6	83695	83700	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505618
1617	NC_005229	TCTT	2	8	83800	83807	0 %	75 %	0 %	25 %	38505618
1618	NC_005229	TCT	2	6	83878	83883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505618
1619	NC_005229	GAT	2	6	83891	83896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505618
1620	NC_005229	CAT	2	6	83946	83951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505618
1621	NC_005229	CAG	2	6	83988	83993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505618
1622	NC_005229	AT	3	6	83996	84001	50 %	50 %	0 %	0 %	38505618
1623	NC_005229	T	8	8	84006	84013	0 %	100 %	0 %	0 %	38505618
1624	NC_005229	TAG	2	6	84052	84057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505618
1625	NC_005229	TTTATA	2	12	84158	84169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505618
1626	NC_005229	T	6	6	84190	84195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_005229	TA	4	8	84214	84221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_005229	T	8	8	84256	84263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_005229	ACA	2	6	84325	84330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_005229	CCAA	2	8	84428	84435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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1632	NC_005229	CCT	2	6	84516	84521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505619
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