MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSM

Total Repeats: 2316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005229	CAT	2	6	25452	25457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505557
502	NC_005229	ACA	3	9	25487	25495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505557
503	NC_005229	TTG	2	6	25531	25536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505557
504	NC_005229	ATGA	2	8	25572	25579	50 %	25 %	25 %	0 %	38505557
505	NC_005229	CAAT	2	8	25661	25668	50 %	25 %	0 %	25 %	38505557
506	NC_005229	CGT	2	6	25671	25676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505557
507	NC_005229	CCCAT	2	10	25793	25802	20 %	20 %	0 %	60 %	38505557
508	NC_005229	TAC	2	6	25871	25876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505557
509	NC_005229	ATC	2	6	25946	25951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505557
510	NC_005229	TAA	2	6	25958	25963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_005229	TAAAAA	2	12	26010	26021	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	38505558
512	NC_005229	ATT	2	6	26075	26080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505558
513	NC_005229	ATT	2	6	26288	26293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505558
514	NC_005229	AGG	2	6	26298	26303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505558
515	NC_005229	GTG	2	6	26346	26351	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505558
516	NC_005229	T	6	6	26371	26376	0 %	100 %	0 %	0 %	38505558
517	NC_005229	GAA	2	6	26414	26419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505558
518	NC_005229	GAA	2	6	26435	26440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505558
519	NC_005229	GAA	2	6	26450	26455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505558
520	NC_005229	AT	3	6	26475	26480	50 %	50 %	0 %	0 %	38505558
521	NC_005229	ATA	2	6	26634	26639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505558
522	NC_005229	TTG	2	6	26646	26651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505558
523	NC_005229	AT	3	6	26656	26661	50 %	50 %	0 %	0 %	38505558
524	NC_005229	AAC	2	6	26709	26714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505558
525	NC_005229	GGT	2	6	26756	26761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505558
526	NC_005229	TTG	2	6	26805	26810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505558
527	NC_005229	TG	3	6	26889	26894	0 %	50 %	50 %	0 %	38505558
528	NC_005229	GAA	2	6	26897	26902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505558
529	NC_005229	GAA	2	6	26945	26950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505558
530	NC_005229	TAA	2	6	27045	27050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505558
531	NC_005229	TCT	2	6	27195	27200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505559
532	NC_005229	GAA	2	6	27202	27207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505559
533	NC_005229	A	6	6	27216	27221	100 %	0 %	0 %	0 %	38505559
534	NC_005229	ATT	2	6	27247	27252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505559
535	NC_005229	AATT	2	8	27272	27279	50 %	50 %	0 %	0 %	38505559
536	NC_005229	ACC	2	6	27349	27354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505559
537	NC_005229	TAT	2	6	27360	27365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505559
538	NC_005229	AT	3	6	27446	27451	50 %	50 %	0 %	0 %	38505559
539	NC_005229	TGC	2	6	27501	27506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505559
540	NC_005229	AAAC	2	8	27550	27557	75 %	0 %	0 %	25 %	38505559
541	NC_005229	TAA	2	6	27588	27593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505559
542	NC_005229	CTC	2	6	27659	27664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505559
543	NC_005229	CAT	2	6	27753	27758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_005229	T	6	6	27763	27768	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_005229	AAG	2	6	27782	27787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
546	NC_005229	T	6	6	27796	27801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_005229	ATT	2	6	27809	27814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_005229	AGA	2	6	27823	27828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_005229	TAGT	2	8	27836	27843	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
550	NC_005229	TTG	2	6	27880	27885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505560
551	NC_005229	TCT	2	6	27890	27895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505560
552	NC_005229	ATC	2	6	27913	27918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505560
553	NC_005229	ATT	2	6	28052	28057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505560
554	NC_005229	CGTTGC	2	12	28112	28123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505561
555	NC_005229	AAT	2	6	28271	28276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505561
556	NC_005229	TCC	3	9	28283	28291	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505561
557	NC_005229	T	6	6	28312	28317	0 %	100 %	0 %	0 %	38505561
558	NC_005229	TCA	2	6	28335	28340	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505561
559	NC_005229	CAT	2	6	28426	28431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505561
560	NC_005229	A	6	6	28473	28478	100 %	0 %	0 %	0 %	38505561
561	NC_005229	AAC	2	6	28574	28579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505561
562	NC_005229	CTTT	2	8	28620	28627	0 %	75 %	0 %	25 %	38505561
563	NC_005229	TTG	2	6	28648	28653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505561
564	NC_005229	CTT	2	6	28719	28724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505561
565	NC_005229	ACA	2	6	28737	28742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505561
566	NC_005229	TAAA	2	8	28813	28820	75 %	25 %	0 %	0 %	38505561
567	NC_005229	GTT	2	6	28839	28844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505561
568	NC_005229	T	7	7	28851	28857	0 %	100 %	0 %	0 %	38505561
569	NC_005229	TCT	2	6	28862	28867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505561
570	NC_005229	TCG	2	6	28872	28877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505561
571	NC_005229	AAG	2	6	28982	28987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505561
572	NC_005229	TCA	2	6	28989	28994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505561
573	NC_005229	TTC	2	6	29185	29190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505561
574	NC_005229	ATA	2	6	29197	29202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505561
575	NC_005229	T	6	6	29301	29306	0 %	100 %	0 %	0 %	38505561
576	NC_005229	CTG	2	6	29346	29351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505561
577	NC_005229	CAA	2	6	29463	29468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505561
578	NC_005229	TCC	2	6	29477	29482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505561
579	NC_005229	A	6	6	29503	29508	100 %	0 %	0 %	0 %	38505561
580	NC_005229	AGG	2	6	29540	29545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505561
581	NC_005229	GCC	2	6	29568	29573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505561
582	NC_005229	AAT	2	6	29575	29580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505561
583	NC_005229	GCT	2	6	29582	29587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505561
584	NC_005229	TGA	2	6	29612	29617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505561
585	NC_005229	TCAA	2	8	29633	29640	50 %	25 %	0 %	25 %	38505561
586	NC_005229	CTG	2	6	29689	29694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38505561
587	NC_005229	AGG	2	6	29818	29823	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505561
588	NC_005229	TG	3	6	29873	29878	0 %	50 %	50 %	0 %	38505561
589	NC_005229	TTTAG	2	10	29987	29996	20 %	60 %	20 %	0 %	38505561
590	NC_005229	TCA	2	6	30008	30013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505561
591	NC_005229	AAT	2	6	30067	30072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505561
592	NC_005229	ATTT	2	8	30167	30174	25 %	75 %	0 %	0 %	38505561
593	NC_005229	T	6	6	30172	30177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_005229	T	6	6	30196	30201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_005229	AAAGAT	2	12	30238	30249	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_005229	CTGC	2	8	30326	30333	0 %	25 %	25 %	50 %	38505562
597	NC_005229	GGT	2	6	30334	30339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505562
598	NC_005229	TTA	2	6	30387	30392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505562
599	NC_005229	ATG	2	6	30410	30415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505562
600	NC_005229	TCCCC	2	10	30460	30469	0 %	20 %	0 %	80 %	38505562
601	NC_005229	ATT	2	6	30563	30568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505562
602	NC_005229	CCCGC	2	10	30736	30745	0 %	0 %	20 %	80 %	38505563
603	NC_005229	TAAA	2	8	30760	30767	75 %	25 %	0 %	0 %	38505563
604	NC_005229	A	6	6	30765	30770	100 %	0 %	0 %	0 %	38505563
605	NC_005229	GTG	2	6	30828	30833	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505563
606	NC_005229	AACC	2	8	30840	30847	50 %	0 %	0 %	50 %	38505563
607	NC_005229	TCC	2	6	30861	30866	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505563
608	NC_005229	CCA	2	6	30922	30927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505563
609	NC_005229	CAACGG	2	12	30958	30969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505563
610	NC_005229	G	7	7	31004	31010	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
611	NC_005229	TCA	2	6	31077	31082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_005229	CAAA	2	8	31084	31091	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
613	NC_005229	CAA	2	6	31178	31183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_005229	TTC	2	6	31206	31211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_005229	CTA	2	6	31226	31231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_005229	ACT	2	6	31242	31247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_005229	TGA	2	6	31285	31290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
618	NC_005229	AGA	2	6	31316	31321	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
619	NC_005229	GGAG	2	8	31388	31395	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
620	NC_005229	AG	3	6	31409	31414	50 %	0 %	50 %	0 %	38505564
621	NC_005229	A	6	6	31417	31422	100 %	0 %	0 %	0 %	38505564
622	NC_005229	ACAGT	2	10	31424	31433	40 %	20 %	20 %	20 %	38505564
623	NC_005229	GT	3	6	31432	31437	0 %	50 %	50 %	0 %	38505564
624	NC_005229	AT	3	6	31464	31469	50 %	50 %	0 %	0 %	38505564
625	NC_005229	AT	3	6	31501	31506	50 %	50 %	0 %	0 %	38505564
626	NC_005229	AAAG	2	8	31533	31540	75 %	0 %	25 %	0 %	38505564
627	NC_005229	CAT	2	6	31557	31562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505564
628	NC_005229	ACT	2	6	31588	31593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505564
629	NC_005229	A	8	8	31633	31640	100 %	0 %	0 %	0 %	38505564
630	NC_005229	GAAG	2	8	31670	31677	50 %	0 %	50 %	0 %	38505564
631	NC_005229	ATA	2	6	31682	31687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505564
632	NC_005229	TAA	2	6	31689	31694	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505564
633	NC_005229	A	6	6	31715	31720	100 %	0 %	0 %	0 %	38505564
634	NC_005229	ACA	2	6	31727	31732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505564
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