MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 plasmid pSYSM

Total Repeats: 2316

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005229	T	6	6	55	60	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005229	TTA	2	6	148	153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005229	ATT	2	6	201	206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505536
4	NC_005229	A	6	6	229	234	100 %	0 %	0 %	0 %	38505536
5	NC_005229	CGG	2	6	356	361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505536
6	NC_005229	ATC	2	6	461	466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_005229	AGA	2	6	475	480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005229	T	7	7	489	495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005229	TAT	2	6	552	557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005229	A	6	6	586	591	100 %	0 %	0 %	0 %	38505537
11	NC_005229	TAG	2	6	652	657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505537
12	NC_005229	TTG	2	6	698	703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505537
13	NC_005229	AAC	2	6	721	726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505537
14	NC_005229	CAT	2	6	766	771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505537
15	NC_005229	CCGA	2	8	865	872	25 %	0 %	25 %	50 %	38505537
16	NC_005229	AG	3	6	952	957	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005229	TTG	2	6	1089	1094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005229	TCT	2	6	1221	1226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505538
19	NC_005229	CGC	2	6	1238	1243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505538
20	NC_005229	ATA	2	6	1299	1304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505538
21	NC_005229	ACA	2	6	1362	1367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505538
22	NC_005229	TTAA	2	8	1416	1423	50 %	50 %	0 %	0 %	38505538
23	NC_005229	TCA	2	6	1500	1505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505538
24	NC_005229	CTA	2	6	1637	1642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505539
25	NC_005229	ATG	2	6	1643	1648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505539
26	NC_005229	CGC	2	6	1691	1696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505539
27	NC_005229	ATA	2	6	1699	1704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505539
28	NC_005229	CAG	2	6	1843	1848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_005229	TTAC	2	8	1913	1920	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_005229	AG	3	6	1948	1953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005229	ATT	2	6	1956	1961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005229	TC	3	6	2017	2022	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_005229	AAT	2	6	2030	2035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005229	AAG	2	6	2052	2057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005229	TAA	2	6	2106	2111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005229	TAT	2	6	2112	2117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005229	A	6	6	2132	2137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005229	AAT	2	6	2149	2154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005229	ACAAA	2	10	2177	2186	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_005229	AATCA	2	10	2222	2231	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_005229	CT	3	6	2233	2238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_005229	TCG	2	6	2253	2258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_005229	CTG	2	6	2278	2283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_005229	TAT	2	6	2290	2295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005229	TC	3	6	2323	2328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_005229	CTC	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_005229	ATT	2	6	2419	2424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005229	T	6	6	2471	2476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005229	TCTA	2	8	2489	2496	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_005229	CCT	2	6	2544	2549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38505540
51	NC_005229	GCC	2	6	2552	2557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505540
52	NC_005229	TGT	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505540
53	NC_005229	CAGT	2	8	2664	2671	25 %	25 %	25 %	25 %	38505540
54	NC_005229	GGC	2	6	2681	2686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505540
55	NC_005229	CGC	2	6	2788	2793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505540
56	NC_005229	AAC	2	6	2981	2986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505540
57	NC_005229	GGA	2	6	3001	3006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505540
58	NC_005229	TAC	2	6	3041	3046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505540
59	NC_005229	TAGAGC	2	12	3060	3071	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	38505540
60	NC_005229	CAC	2	6	3124	3129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505540
61	NC_005229	GAT	2	6	3140	3145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
62	NC_005229	CCTC	2	8	3230	3237	0 %	25 %	0 %	75 %	38505540
63	NC_005229	TTG	2	6	3281	3286	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505540
64	NC_005229	CTT	2	6	3291	3296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505540
65	NC_005229	T	6	6	3316	3321	0 %	100 %	0 %	0 %	38505540
66	NC_005229	TGCC	2	8	3360	3367	0 %	25 %	25 %	50 %	38505540
67	NC_005229	TAC	2	6	3418	3423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505540
68	NC_005229	ACA	2	6	3431	3436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505540
69	NC_005229	AGA	2	6	3454	3459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505540
70	NC_005229	GTTT	2	8	3477	3484	0 %	75 %	25 %	0 %	38505540
71	NC_005229	GAT	2	6	3653	3658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
72	NC_005229	CGG	2	6	3667	3672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505540
73	NC_005229	GGAG	2	8	3877	3884	25 %	0 %	75 %	0 %	38505540
74	NC_005229	ATG	2	6	4011	4016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
75	NC_005229	TGG	2	6	4030	4035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505540
76	NC_005229	AGG	2	6	4036	4041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505540
77	NC_005229	ACA	2	6	4080	4085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505540
78	NC_005229	GCC	2	6	4163	4168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505540
79	NC_005229	TGA	2	6	4216	4221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
80	NC_005229	AG	3	6	4236	4241	50 %	0 %	50 %	0 %	38505540
81	NC_005229	TTA	2	6	4244	4249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505540
82	NC_005229	TGG	2	6	4267	4272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505540
83	NC_005229	GCC	2	6	4406	4411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505540
84	NC_005229	ACG	2	6	4454	4459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38505540
85	NC_005229	AAT	2	6	4673	4678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38505540
86	NC_005229	CTT	2	6	4744	4749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38505540
87	NC_005229	GTT	2	6	4751	4756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505540
88	NC_005229	CAA	2	6	4808	4813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505540
89	NC_005229	TGG	2	6	4818	4823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505540
90	NC_005229	AAC	2	6	4850	4855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505540
91	NC_005229	TCAG	2	8	4872	4879	25 %	25 %	25 %	25 %	38505540
92	NC_005229	GGA	2	6	4883	4888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38505540
93	NC_005229	TTAAT	2	10	4914	4923	40 %	60 %	0 %	0 %	38505540
94	NC_005229	CTAA	2	8	4943	4950	50 %	25 %	0 %	25 %	38505540
95	NC_005229	T	6	6	4982	4987	0 %	100 %	0 %	0 %	38505540
96	NC_005229	CAAT	2	8	5071	5078	50 %	25 %	0 %	25 %	38505540
97	NC_005229	ACC	2	6	5081	5086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505540
98	NC_005229	CTGG	2	8	5105	5112	0 %	25 %	50 %	25 %	38505540
99	NC_005229	TTA	2	6	5190	5195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38505540
100	NC_005229	TTG	2	6	5216	5221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505540
101	NC_005229	GAT	2	6	5270	5275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
102	NC_005229	CTA	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505540
103	NC_005229	TCCG	2	8	5321	5328	0 %	25 %	25 %	50 %	38505540
104	NC_005229	ATG	2	6	5412	5417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
105	NC_005229	GGC	2	6	5465	5470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505540
106	NC_005229	GAA	2	6	5507	5512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505540
107	NC_005229	ATC	2	6	5698	5703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505540
108	NC_005229	AGGA	2	8	5796	5803	50 %	0 %	50 %	0 %	38505540
109	NC_005229	CGG	2	6	5826	5831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38505540
110	NC_005229	CAA	2	6	5892	5897	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505540
111	NC_005229	CCG	3	9	5934	5942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505540
112	NC_005229	AT	3	6	6099	6104	50 %	50 %	0 %	0 %	38505540
113	NC_005229	TAAC	2	8	6123	6130	50 %	25 %	0 %	25 %	38505540
114	NC_005229	GAT	2	6	6200	6205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
115	NC_005229	T	6	6	6205	6210	0 %	100 %	0 %	0 %	38505540
116	NC_005229	TGA	2	6	6232	6237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
117	NC_005229	CAT	2	6	6244	6249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505540
118	NC_005229	TGT	2	6	6268	6273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505540
119	NC_005229	CCG	2	6	6298	6303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38505540
120	NC_005229	AGA	2	6	6331	6336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505540
121	NC_005229	A	6	6	6360	6365	100 %	0 %	0 %	0 %	38505540
122	NC_005229	ACA	2	6	6435	6440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505540
123	NC_005229	C	6	6	6461	6466	0 %	0 %	0 %	100 %	38505540
124	NC_005229	TC	3	6	6474	6479	0 %	50 %	0 %	50 %	38505540
125	NC_005229	AACTTT	2	12	6494	6505	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	38505540
126	NC_005229	AGA	2	6	6649	6654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505540
127	NC_005229	TGT	2	6	6751	6756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505540
128	NC_005229	CAC	2	6	6772	6777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38505540
129	NC_005229	AAG	2	6	6807	6812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505540
130	NC_005229	TGG	2	6	6861	6866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505540
131	NC_005229	TGT	2	6	6967	6972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38505540
132	NC_005229	GA	3	6	7024	7029	50 %	0 %	50 %	0 %	38505540
133	NC_005229	GAA	2	6	7049	7054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505540
134	NC_005229	TAC	2	6	7061	7066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38505540
135	NC_005229	CCCAA	2	10	7129	7138	40 %	0 %	0 %	60 %	38505540
136	NC_005229	AAC	2	6	7316	7321	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38505540
137	NC_005229	AAG	2	6	7425	7430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38505540
138	NC_005229	TGA	2	6	7447	7452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38505540
139	NC_005229	TCAG	2	8	7462	7469	25 %	25 %	25 %	25 %	38505540
140	NC_005229	TGG	2	6	7504	7509	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38505540
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273	NC_005229	GAGC	2	8	13617	13624	25 %	0 %	50 %	25 %	38505540
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