MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 8102

Total Repeats: 54151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_005070	TCGGAC	2	12	1938462	1938473	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33866574
43003	NC_005070	CTGT	2	8	1938554	1938561	0 %	50 %	25 %	25 %	33866574
43004	NC_005070	ACA	2	6	1938605	1938610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33866575
43005	NC_005070	TGG	2	6	1938688	1938693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866575
43006	NC_005070	AGG	2	6	1938713	1938718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33866575
43007	NC_005070	GCT	2	6	1938720	1938725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866575
43008	NC_005070	AGG	2	6	1938740	1938745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33866575
43009	NC_005070	CTGG	2	8	1938750	1938757	0 %	25 %	50 %	25 %	33866575
43010	NC_005070	GTCC	2	8	1938845	1938852	0 %	25 %	25 %	50 %	33866575
43011	NC_005070	GCG	2	6	1938872	1938877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866575
43012	NC_005070	CCG	2	6	1938903	1938908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866575
43013	NC_005070	CTG	2	6	1938943	1938948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866575
43014	NC_005070	TCA	2	6	1938953	1938958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33866575
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43019	NC_005070	TGC	2	6	1939340	1939345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866575
43020	NC_005070	GAC	2	6	1939351	1939356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866575
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43025	NC_005070	GCCG	2	8	1939692	1939699	0 %	0 %	50 %	50 %	33866575
43026	NC_005070	TCAG	2	8	1939826	1939833	25 %	25 %	25 %	25 %	33866575
43027	NC_005070	CGG	2	6	1939863	1939868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866575
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43031	NC_005070	GCCA	2	8	1939977	1939984	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43032	NC_005070	GCA	2	6	1940090	1940095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866576
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43038	NC_005070	CAT	2	6	1940217	1940222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33866576
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43043	NC_005070	TGC	2	6	1940513	1940518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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43102	NC_005070	CTG	2	6	1943298	1943303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866579
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43234	NC_005070	GGC	2	6	1948804	1948809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866583
43235	NC_005070	G	6	6	1948833	1948838	0 %	0 %	100 %	0 %	33866583
43236	NC_005070	GCC	2	6	1948859	1948864	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866583
43237	NC_005070	GGT	2	6	1948878	1948883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866583
43238	NC_005070	ATC	2	6	1948891	1948896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33866583
43239	NC_005070	CCA	3	9	1948911	1948919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866583
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43241	NC_005070	CGG	3	9	1948929	1948937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866583
43242	NC_005070	GGT	2	6	1948953	1948958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866583
43243	NC_005070	TGC	2	6	1949001	1949006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866583
43244	NC_005070	CTGCGC	2	12	1949065	1949076	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	33866583
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43249	NC_005070	GCCA	2	8	1949225	1949232	25 %	0 %	25 %	50 %	33866583
43250	NC_005070	CTG	2	6	1949242	1949247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866583
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43253	NC_005070	CGG	3	9	1949374	1949382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866584
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43258	NC_005070	TGC	3	9	1949515	1949523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866584
43259	NC_005070	ACG	2	6	1949551	1949556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866584
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43261	NC_005070	GCA	2	6	1949579	1949584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866584
43262	NC_005070	ACC	2	6	1949605	1949610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866584
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43264	NC_005070	GGA	2	6	1949666	1949671	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33866584
43265	NC_005070	GC	3	6	1949713	1949718	0 %	0 %	50 %	50 %	33866584
43266	NC_005070	GGT	3	9	1949726	1949734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866584
43267	NC_005070	TGAAC	2	10	1949741	1949750	40 %	20 %	20 %	20 %	33866584
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43270	NC_005070	ATC	2	6	1949826	1949831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33866584
43271	NC_005070	CG	3	6	1949841	1949846	0 %	0 %	50 %	50 %	33866584
43272	NC_005070	CGG	2	6	1949901	1949906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866584
43273	NC_005070	GGA	3	9	1949915	1949923	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33866584
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43280	NC_005070	CTCCG	2	10	1950153	1950162	0 %	20 %	20 %	60 %	33866584
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43283	NC_005070	CG	3	6	1950240	1950245	0 %	0 %	50 %	50 %	33866584
43284	NC_005070	GCT	2	6	1950311	1950316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866584
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43294	NC_005070	CAG	2	6	1950771	1950776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866585
43295	NC_005070	ATC	2	6	1950783	1950788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33866585
43296	NC_005070	CAG	2	6	1950801	1950806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866585
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43299	NC_005070	TCAA	2	8	1950874	1950881	50 %	25 %	0 %	25 %	33866585
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43328	NC_005070	CCA	3	9	1952208	1952216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866587
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43331	NC_005070	CTG	2	6	1952390	1952395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866587
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43342	NC_005070	GCC	2	6	1952817	1952822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866588
43343	NC_005070	AG	4	8	1952917	1952924	50 %	0 %	50 %	0 %	33866588
43344	NC_005070	GGCCAA	2	12	1952931	1952942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866588
43345	NC_005070	CACCC	2	10	1952975	1952984	20 %	0 %	0 %	80 %	33866588
43346	NC_005070	C	6	6	1952995	1953000	0 %	0 %	0 %	100 %	33866588
43347	NC_005070	GCA	2	6	1953077	1953082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866588
43348	NC_005070	CCAG	2	8	1953128	1953135	25 %	0 %	25 %	50 %	33866588
43349	NC_005070	GCA	4	12	1953137	1953148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866588
43350	NC_005070	CCGCT	2	10	1953149	1953158	0 %	20 %	20 %	60 %	33866588
43351	NC_005070	CAC	2	6	1953189	1953194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866588
43352	NC_005070	GGCATG	2	12	1953210	1953221	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	33866588
43353	NC_005070	C	6	6	1953343	1953348	0 %	0 %	0 %	100 %	33866588
43354	NC_005070	CGCA	2	8	1953351	1953358	25 %	0 %	25 %	50 %	33866588
43355	NC_005070	CCA	2	6	1953362	1953367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866588
43356	NC_005070	GGC	2	6	1953371	1953376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866588
43357	NC_005070	CCA	2	6	1953398	1953403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866588
43358	NC_005070	CTG	2	6	1953408	1953413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866588
43359	NC_005070	GTGATC	2	12	1953494	1953505	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	33866589
43360	NC_005070	GGC	2	6	1953509	1953514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866589
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43362	NC_005070	GCT	2	6	1953538	1953543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866589
43363	NC_005070	GCT	2	6	1953568	1953573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866589
43364	NC_005070	G	6	6	1953592	1953597	0 %	0 %	100 %	0 %	33866589
43365	NC_005070	CCG	2	6	1953613	1953618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866589
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43367	NC_005070	CTG	3	9	1953689	1953697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866589
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43371	NC_005070	GGT	2	6	1953904	1953909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866589
43372	NC_005070	CTG	2	6	1953980	1953985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866589
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43374	NC_005070	CGGAC	2	10	1954092	1954101	20 %	0 %	40 %	40 %	33866589
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43378	NC_005070	GCC	2	6	1954325	1954330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866589
43379	NC_005070	GCC	2	6	1954348	1954353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866589
43380	NC_005070	GTG	2	6	1954457	1954462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866589
43381	NC_005070	CGG	2	6	1954463	1954468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866589
43382	NC_005070	CGA	2	6	1954513	1954518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866589
43383	NC_005070	GACG	2	8	1954556	1954563	25 %	0 %	50 %	25 %	33866589
43384	NC_005070	CGG	2	6	1954569	1954574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866589
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43387	NC_005070	TGG	2	6	1954785	1954790	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866589
43388	NC_005070	G	6	6	1954789	1954794	0 %	0 %	100 %	0 %	33866589
43389	NC_005070	GCTCTG	2	12	1954858	1954869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866589
43390	NC_005070	CGGC	2	8	1954899	1954906	0 %	0 %	50 %	50 %	33866589
43391	NC_005070	TGCC	2	8	1954927	1954934	0 %	25 %	25 %	50 %	33866589
43392	NC_005070	TGG	2	6	1954941	1954946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866589
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43394	NC_005070	GGC	2	6	1954955	1954960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866589
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43400	NC_005070	TGGCCA	2	12	1955141	1955152	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33866590
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43408	NC_005070	TGGC	2	8	1955497	1955504	0 %	25 %	50 %	25 %	33866590
43409	NC_005070	GCA	2	6	1955537	1955542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866590
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43411	NC_005070	ACCGA	2	10	1955554	1955563	40 %	0 %	20 %	40 %	33866590
43412	NC_005070	AGC	2	6	1955620	1955625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866590
43413	NC_005070	GCA	2	6	1955658	1955663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866590
43414	NC_005070	CAGG	2	8	1955667	1955674	25 %	0 %	50 %	25 %	33866590
43415	NC_005070	CTG	2	6	1955723	1955728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866590
43416	NC_005070	GAA	2	6	1955731	1955736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33866590
43417	NC_005070	GC	3	6	1955770	1955775	0 %	0 %	50 %	50 %	33866590
43418	NC_005070	CGAT	2	8	1955786	1955793	25 %	25 %	25 %	25 %	33866590
43419	NC_005070	CGA	2	6	1955813	1955818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866590
43420	NC_005070	TCGA	2	8	1955876	1955883	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43421	NC_005070	CTG	2	6	1955965	1955970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43422	NC_005070	TGG	2	6	1956017	1956022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866591
43423	NC_005070	CTG	2	6	1956052	1956057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43424	NC_005070	TGG	2	6	1956085	1956090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866591
43425	NC_005070	GCT	2	6	1956096	1956101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43426	NC_005070	CAG	2	6	1956123	1956128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43427	NC_005070	CGTGCT	2	12	1956132	1956143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43428	NC_005070	CTG	2	6	1956166	1956171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43429	NC_005070	CTG	2	6	1956216	1956221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43430	NC_005070	CGC	3	9	1956236	1956244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866591
43431	NC_005070	GCT	2	6	1956258	1956263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43432	NC_005070	CTG	2	6	1956301	1956306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43433	NC_005070	TCAGC	2	10	1956339	1956348	20 %	20 %	20 %	40 %	33866591
43434	NC_005070	GCG	2	6	1956357	1956362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866591
43435	NC_005070	CAG	2	6	1956459	1956464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43436	NC_005070	ACA	2	6	1956512	1956517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33866591
43437	NC_005070	CTG	2	6	1956541	1956546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43438	NC_005070	TGC	2	6	1956638	1956643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43439	NC_005070	GCA	2	6	1956678	1956683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43440	NC_005070	GCT	2	6	1956693	1956698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43441	NC_005070	AGG	2	6	1956764	1956769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33866591
43442	NC_005070	TGC	2	6	1956797	1956802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43443	NC_005070	GGA	2	6	1956816	1956821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33866591
43444	NC_005070	GTT	2	6	1956831	1956836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33866591
43445	NC_005070	CTG	2	6	1956886	1956891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43446	NC_005070	TGC	3	9	1956935	1956943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43447	NC_005070	CGA	2	6	1956945	1956950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866591
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43449	NC_005070	GCACC	2	10	1957019	1957028	20 %	0 %	20 %	60 %	33866591
43450	NC_005070	AGCTGG	2	12	1957054	1957065	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	33866591
43451	NC_005070	GCA	2	6	1957071	1957076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43452	NC_005070	GCCGGA	2	12	1957089	1957100	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	33866591
43453	NC_005070	ATC	3	9	1957105	1957113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33866591
43454	NC_005070	CTG	2	6	1957117	1957122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43455	NC_005070	GCC	2	6	1957153	1957158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866591
43456	NC_005070	CTG	2	6	1957204	1957209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43457	NC_005070	C	6	6	1957247	1957252	0 %	0 %	0 %	100 %	33866591
43458	NC_005070	AGGC	2	8	1957266	1957273	25 %	0 %	50 %	25 %	33866591
43459	NC_005070	GCC	2	6	1957289	1957294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866591
43460	NC_005070	TGC	2	6	1957322	1957327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866591
43461	NC_005070	TCT	2	6	1957359	1957364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33866591
43462	NC_005070	GACT	2	8	1957369	1957376	25 %	25 %	25 %	25 %	33866591
43463	NC_005070	GAC	2	6	1957407	1957412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43464	NC_005070	CCA	2	6	1957460	1957465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866592
43465	NC_005070	AAG	2	6	1957475	1957480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33866592
43466	NC_005070	CAG	2	6	1957547	1957552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866592
43467	NC_005070	CAC	2	6	1957564	1957569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866592
43468	NC_005070	ATCGGC	2	12	1957583	1957594	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	33866592
43469	NC_005070	TGG	2	6	1957646	1957651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866592
43470	NC_005070	AC	3	6	1957691	1957696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43471	NC_005070	GAA	2	6	1957704	1957709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43472	NC_005070	TGA	2	6	1957793	1957798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33866593
43473	NC_005070	CGT	2	6	1957886	1957891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866593
43474	NC_005070	GTG	2	6	1957918	1957923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866593
43475	NC_005070	TGC	2	6	1958036	1958041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866593
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43478	NC_005070	GCC	3	9	1958142	1958150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866594
43479	NC_005070	GCT	3	9	1958157	1958165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866594
43480	NC_005070	CTTCA	2	10	1958189	1958198	20 %	40 %	0 %	40 %	33866594
43481	NC_005070	GCT	2	6	1958227	1958232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866594
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43488	NC_005070	CGG	2	6	1958429	1958434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866594
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43490	NC_005070	TCC	2	6	1958481	1958486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33866594
43491	NC_005070	TTC	2	6	1958493	1958498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33866594
43492	NC_005070	ACC	2	6	1958555	1958560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866594
43493	NC_005070	TGG	2	6	1958563	1958568	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866594
43494	NC_005070	TCA	2	6	1958677	1958682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33866594
43495	NC_005070	GGC	2	6	1958747	1958752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866594
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43497	NC_005070	GAGG	2	8	1958870	1958877	25 %	0 %	75 %	0 %	33866594
43498	NC_005070	CGA	2	6	1958911	1958916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866594
43499	NC_005070	GGC	2	6	1958918	1958923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866594
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