MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 8102

Total Repeats: 54151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_005070	GCGAC	2	10	533288	533297	20 %	0 %	40 %	40 %	33865076
12002	NC_005070	GTG	2	6	533319	533324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865076
12003	NC_005070	GGC	2	6	533377	533382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865076
12004	NC_005070	TGG	2	6	533397	533402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865076
12005	NC_005070	CTG	2	6	533438	533443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865076
12006	NC_005070	GTTG	2	8	533478	533485	0 %	50 %	50 %	0 %	33865076
12007	NC_005070	CGC	2	6	533591	533596	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33865077
12008	NC_005070	TTCA	2	8	533633	533640	25 %	50 %	0 %	25 %	33865077
12009	NC_005070	AGC	2	6	533658	533663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865077
12010	NC_005070	GGC	2	6	533671	533676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865077
12011	NC_005070	GCA	2	6	533689	533694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865077
12012	NC_005070	GCA	2	6	533701	533706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865077
12013	NC_005070	GCC	2	6	533711	533716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33865077
12014	NC_005070	GACG	2	8	533791	533798	25 %	0 %	50 %	25 %	33865077
12015	NC_005070	CAC	2	6	533922	533927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33865078
12016	NC_005070	TCA	2	6	533959	533964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33865078
12017	NC_005070	TGT	2	6	533969	533974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33865078
12018	NC_005070	GCT	2	6	534008	534013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865078
12019	NC_005070	GCT	2	6	534058	534063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12020	NC_005070	TG	3	6	534069	534074	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12021	NC_005070	ACA	2	6	534084	534089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12022	NC_005070	CA	3	6	534107	534112	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12023	NC_005070	TTGC	2	8	534124	534131	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12024	NC_005070	CGT	2	6	534194	534199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865079
12025	NC_005070	GGCG	2	8	534236	534243	0 %	0 %	75 %	25 %	33865079
12026	NC_005070	CTG	2	6	534315	534320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865079
12027	NC_005070	GTG	2	6	534349	534354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865079
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12030	NC_005070	CAG	2	6	534429	534434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865079
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12032	NC_005070	CCA	2	6	534590	534595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33865079
12033	NC_005070	CCT	2	6	534635	534640	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33865079
12034	NC_005070	GCTG	2	8	534644	534651	0 %	25 %	50 %	25 %	33865079
12035	NC_005070	C	6	6	534658	534663	0 %	0 %	0 %	100 %	33865079
12036	NC_005070	CGG	2	6	534713	534718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865079
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12040	NC_005070	ACC	2	6	534945	534950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33865080
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12042	NC_005070	TGC	2	6	534997	535002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865080
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12044	NC_005070	GCCTGG	2	12	535031	535042	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33865080
12045	NC_005070	GCCG	2	8	535057	535064	0 %	0 %	50 %	50 %	33865080
12046	NC_005070	CCT	2	6	535078	535083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33865080
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12049	NC_005070	G	7	7	535138	535144	0 %	0 %	100 %	0 %	33865080
12050	NC_005070	GGT	2	6	535146	535151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865080
12051	NC_005070	GGGCCT	2	12	535171	535182	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	33865080
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12053	NC_005070	GCG	2	6	535211	535216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865080
12054	NC_005070	CGG	2	6	535288	535293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865080
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12056	NC_005070	CGG	2	6	535373	535378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865080
12057	NC_005070	CGGGCG	2	12	535401	535412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865080
12058	NC_005070	CTC	2	6	535502	535507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33865080
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12061	NC_005070	GCT	2	6	535562	535567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865080
12062	NC_005070	TGC	2	6	535573	535578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865080
12063	NC_005070	C	6	6	535591	535596	0 %	0 %	0 %	100 %	33865080
12064	NC_005070	GCA	2	6	535624	535629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865080
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12068	NC_005070	CAC	2	6	535775	535780	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33865080
12069	NC_005070	G	6	6	535803	535808	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
12070	NC_005070	GTC	2	6	535811	535816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12071	NC_005070	GCA	2	6	535870	535875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865081
12072	NC_005070	GATGTG	2	12	535881	535892	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	33865081
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12079	NC_005070	GGC	2	6	536087	536092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865081
12080	NC_005070	CAG	2	6	536102	536107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865081
12081	NC_005070	TGG	2	6	536174	536179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865081
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12083	NC_005070	TCG	2	6	536239	536244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865081
12084	NC_005070	GCT	2	6	536286	536291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865081
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12088	NC_005070	ACG	2	6	536479	536484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865081
12089	NC_005070	GAT	2	6	536505	536510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33865081
12090	NC_005070	TTC	2	6	536529	536534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33865081
12091	NC_005070	ACC	2	6	536535	536540	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33865081
12092	NC_005070	ACG	2	6	536669	536674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12096	NC_005070	CGC	2	6	536864	536869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33865082
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12099	NC_005070	TCT	2	6	537076	537081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33865083
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12103	NC_005070	TG	3	6	537291	537296	0 %	50 %	50 %	0 %	33865083
12104	NC_005070	CGA	2	6	537307	537312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865083
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12107	NC_005070	G	7	7	537345	537351	0 %	0 %	100 %	0 %	33865083
12108	NC_005070	CTT	2	6	537361	537366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33865083
12109	NC_005070	ACAA	2	8	537466	537473	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12110	NC_005070	ATC	2	6	537483	537488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12111	NC_005070	GTC	2	6	537498	537503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12112	NC_005070	TGC	2	6	537565	537570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865084
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12114	NC_005070	TGG	2	6	537586	537591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865084
12115	NC_005070	CAG	2	6	537600	537605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865084
12116	NC_005070	TCA	2	6	537650	537655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33865084
12117	NC_005070	AGC	2	6	537664	537669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865084
12118	NC_005070	CAG	2	6	537696	537701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865084
12119	NC_005070	GAG	2	6	537702	537707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33865084
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12121	NC_005070	AGC	3	9	537727	537735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865084
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12242	NC_005070	GCT	2	6	543152	543157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865088
12243	NC_005070	CGGC	2	8	543193	543200	0 %	0 %	50 %	50 %	33865088
12244	NC_005070	CGC	2	6	543216	543221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33865088
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12361	NC_005070	GCC	2	6	548264	548269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33865092
12362	NC_005070	G	6	6	548281	548286	0 %	0 %	100 %	0 %	33865092
12363	NC_005070	CGC	2	6	548334	548339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33865092
12364	NC_005070	CGA	2	6	548350	548355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865092
12365	NC_005070	GCT	2	6	548371	548376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865092
12366	NC_005070	CGC	2	6	548464	548469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33865092
12367	NC_005070	CGC	2	6	548499	548504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33865093
12368	NC_005070	TCC	2	6	548509	548514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33865093
12369	NC_005070	GTG	2	6	548515	548520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865093
12370	NC_005070	CTG	2	6	548545	548550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865093
12371	NC_005070	TGG	2	6	548573	548578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865093
12372	NC_005070	TTG	2	6	548696	548701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33865093
12373	NC_005070	G	6	6	548719	548724	0 %	0 %	100 %	0 %	33865093
12374	NC_005070	CCG	2	6	548796	548801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33865093
12375	NC_005070	TGG	2	6	548936	548941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865093
12376	NC_005070	TCGC	2	8	548967	548974	0 %	25 %	25 %	50 %	33865094
12377	NC_005070	GGT	2	6	548993	548998	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865094
12378	NC_005070	GCTG	2	8	549014	549021	0 %	25 %	50 %	25 %	33865094
12379	NC_005070	GTG	2	6	549027	549032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865094
12380	NC_005070	GGT	2	6	549062	549067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865094
12381	NC_005070	ACTC	2	8	549116	549123	25 %	25 %	0 %	50 %	33865094
12382	NC_005070	ACA	2	6	549133	549138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33865094
12383	NC_005070	TGCC	2	8	549152	549159	0 %	25 %	25 %	50 %	33865094
12384	NC_005070	GGT	2	6	549206	549211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865094
12385	NC_005070	AG	3	6	549234	549239	50 %	0 %	50 %	0 %	33865094
12386	NC_005070	CGGCAA	2	12	549287	549298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865094
12387	NC_005070	CTG	2	6	549300	549305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865094
12388	NC_005070	ATC	2	6	549390	549395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33865094
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12390	NC_005070	CATC	2	8	549428	549435	25 %	25 %	0 %	50 %	33865094
12391	NC_005070	GGT	2	6	549450	549455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865094
12392	NC_005070	TGG	2	6	549463	549468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865094
12393	NC_005070	TGG	2	6	549511	549516	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865094
12394	NC_005070	AGC	2	6	549604	549609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865094
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12396	NC_005070	GCA	2	6	549696	549701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865094
12397	NC_005070	AGC	2	6	549768	549773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865094
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12399	NC_005070	GCT	2	6	549886	549891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865095
12400	NC_005070	G	7	7	549898	549904	0 %	0 %	100 %	0 %	33865095
12401	NC_005070	GCT	2	6	549931	549936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865095
12402	NC_005070	GCT	2	6	550027	550032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865095
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12405	NC_005070	GGC	2	6	550094	550099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865095
12406	NC_005070	CATC	2	8	550115	550122	25 %	25 %	0 %	50 %	33865095
12407	NC_005070	CTA	2	6	550135	550140	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33865095
12408	NC_005070	GCA	2	6	550179	550184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865095
12409	NC_005070	GCT	2	6	550192	550197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865095
12410	NC_005070	ACCG	2	8	550205	550212	25 %	0 %	25 %	50 %	33865095
12411	NC_005070	CGG	2	6	550230	550235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865095
12412	NC_005070	TGGG	2	8	550274	550281	0 %	25 %	75 %	0 %	33865095
12413	NC_005070	CAG	2	6	550334	550339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865095
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12415	NC_005070	AGC	2	6	550429	550434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865095
12416	NC_005070	TGC	2	6	550440	550445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865095
12417	NC_005070	CGG	4	12	550557	550568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865095
12418	NC_005070	GAA	2	6	550579	550584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33865095
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12420	NC_005070	GCG	2	6	550598	550603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865095
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12423	NC_005070	CTG	3	9	550754	550762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865095
12424	NC_005070	AGC	2	6	550764	550769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865095
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12426	NC_005070	TGG	2	6	550815	550820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865095
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12428	NC_005070	TGC	2	6	550967	550972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865096
12429	NC_005070	CGG	2	6	551030	551035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865096
12430	NC_005070	GGT	2	6	551044	551049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865096
12431	NC_005070	GGA	2	6	551076	551081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33865096
12432	NC_005070	CCA	2	6	551102	551107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33865096
12433	NC_005070	GCG	2	6	551117	551122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865096
12434	NC_005070	ACC	2	6	551164	551169	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33865096
12435	NC_005070	AGG	2	6	551177	551182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33865096
12436	NC_005070	TGG	2	6	551183	551188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865096
12437	NC_005070	CCGA	2	8	551203	551210	25 %	0 %	25 %	50 %	33865096
12438	NC_005070	TGC	2	6	551228	551233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865096
12439	NC_005070	GGC	2	6	551269	551274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865096
12440	NC_005070	CCGG	2	8	551301	551308	0 %	0 %	50 %	50 %	33865096
12441	NC_005070	TGAAGC	2	12	551340	551351	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33865096
12442	NC_005070	GGCG	2	8	551432	551439	0 %	0 %	75 %	25 %	33865096
12443	NC_005070	ACC	2	6	551447	551452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33865096
12444	NC_005070	TAA	2	6	551596	551601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	33865096
12445	NC_005070	AAT	2	6	551605	551610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12446	NC_005070	ACAG	2	8	551668	551675	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12447	NC_005070	ACC	2	6	551690	551695	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12448	NC_005070	ATGT	2	8	551736	551743	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12449	NC_005070	ATCC	2	8	551792	551799	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12450	NC_005070	GAT	2	6	551815	551820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12451	NC_005070	GAGC	2	8	551848	551855	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12452	NC_005070	GCC	2	6	552052	552057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33865097
12453	NC_005070	ACC	2	6	552068	552073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33865097
12454	NC_005070	CGG	2	6	552074	552079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865097
12455	NC_005070	GCA	3	9	552114	552122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865097
12456	NC_005070	CCCT	2	8	552127	552134	0 %	25 %	0 %	75 %	33865097
12457	NC_005070	CGG	2	6	552227	552232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865098
12458	NC_005070	CGATGT	2	12	552272	552283	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	33865098
12459	NC_005070	TGC	2	6	552327	552332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865098
12460	NC_005070	CCT	2	6	552395	552400	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33865098
12461	NC_005070	AGG	2	6	552404	552409	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33865098
12462	NC_005070	CAC	2	6	552437	552442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33865098
12463	NC_005070	CCG	2	6	552449	552454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33865098
12464	NC_005070	CTG	2	6	552456	552461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865098
12465	NC_005070	GGCCA	2	10	552471	552480	20 %	0 %	40 %	40 %	33865098
12466	NC_005070	GTT	2	6	552483	552488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33865098
12467	NC_005070	ACG	2	6	552556	552561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865098
12468	NC_005070	GTT	2	6	552630	552635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33865098
12469	NC_005070	GTG	2	6	552646	552651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865098
12470	NC_005070	CGG	3	9	552656	552664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865098
12471	NC_005070	CGG	2	6	552686	552691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865098
12472	NC_005070	AGG	2	6	552713	552718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33865098
12473	NC_005070	CGCTG	2	10	552786	552795	0 %	20 %	40 %	40 %	33865098
12474	NC_005070	TCA	2	6	552812	552817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33865098
12475	NC_005070	GGC	2	6	552828	552833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865098
12476	NC_005070	CCG	2	6	552853	552858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33865098
12477	NC_005070	CCA	2	6	552881	552886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33865098
12478	NC_005070	TCACC	2	10	552902	552911	20 %	20 %	0 %	60 %	33865098
12479	NC_005070	CGG	3	9	553052	553060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865098
12480	NC_005070	CAC	2	6	553083	553088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33865098
12481	NC_005070	GGA	2	6	553093	553098	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33865098
12482	NC_005070	CCA	2	6	553103	553108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33865098
12483	NC_005070	GC	3	6	553260	553265	0 %	0 %	50 %	50 %	33865098
12484	NC_005070	GCC	2	6	553273	553278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33865098
12485	NC_005070	GCT	3	9	553285	553293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865098
12486	NC_005070	AGCTG	2	10	553313	553322	20 %	20 %	40 %	20 %	33865098
12487	NC_005070	GCTG	2	8	553347	553354	0 %	25 %	50 %	25 %	33865098
12488	NC_005070	GGC	2	6	553359	553364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865098
12489	NC_005070	GGC	3	9	553368	553376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865098
12490	NC_005070	GCCCCA	2	12	553412	553423	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	33865098
12491	NC_005070	ACC	2	6	553426	553431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33865098
12492	NC_005070	GTT	2	6	553446	553451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33865098
12493	NC_005070	CAG	2	6	553467	553472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865098
12494	NC_005070	TGC	3	9	553498	553506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33865098
12495	NC_005070	GGC	2	6	553512	553517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33865098
12496	NC_005070	GC	3	6	553533	553538	0 %	0 %	50 %	50 %	33865098
12497	NC_005070	GCA	2	6	553565	553570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33865098
12498	NC_005070	CAC	2	6	553575	553580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33865098
12499	NC_005070	GGT	2	6	553611	553616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33865098
12500	NC_005070	GA	5	10	553618	553627	50 %	0 %	50 %	0 %	33865098

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