MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechococcus sp. WH 8102

Total Repeats: 54151

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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52002	NC_005070	GGCTGG	2	12	2338794	2338805	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	33866963
52003	NC_005070	GCT	3	9	2338849	2338857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866963
52004	NC_005070	GATC	2	8	2338927	2338934	25 %	25 %	25 %	25 %	33866963
52005	NC_005070	GCT	2	6	2338957	2338962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866963
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52117	NC_005070	GTTGCT	2	12	2343983	2343994	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	33866968
52118	NC_005070	GCA	2	6	2344037	2344042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866968
52119	NC_005070	TCC	2	6	2344129	2344134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33866968
52120	NC_005070	GCG	2	6	2344202	2344207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866968
52121	NC_005070	GTC	2	6	2344288	2344293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866968
52122	NC_005070	GGA	2	6	2344361	2344366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33866968
52123	NC_005070	GTA	2	6	2344380	2344385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33866968
52124	NC_005070	AGC	2	6	2344408	2344413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866968
52125	NC_005070	TCC	2	6	2344428	2344433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33866969
52126	NC_005070	GTG	2	6	2344437	2344442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866969
52127	NC_005070	CA	3	6	2344498	2344503	50 %	0 %	0 %	50 %	33866969
52128	NC_005070	ACG	2	6	2344544	2344549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866969
52129	NC_005070	TCG	2	6	2344635	2344640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866969
52130	NC_005070	CCA	2	6	2344663	2344668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866969
52131	NC_005070	ACCA	2	8	2344688	2344695	50 %	0 %	0 %	50 %	33866969
52132	NC_005070	CGC	2	6	2344742	2344747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866969
52133	NC_005070	TGA	2	6	2344788	2344793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33866969
52134	NC_005070	GCT	2	6	2344804	2344809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866969
52135	NC_005070	C	6	6	2344821	2344826	0 %	0 %	0 %	100 %	33866969
52136	NC_005070	GCT	2	6	2344843	2344848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866969
52137	NC_005070	AC	3	6	2344900	2344905	50 %	0 %	0 %	50 %	33866969
52138	NC_005070	CCA	2	6	2344963	2344968	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866969
52139	NC_005070	GGT	2	6	2345036	2345041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866969
52140	NC_005070	CCGC	2	8	2345068	2345075	0 %	0 %	25 %	75 %	33866969
52141	NC_005070	CAA	2	6	2345156	2345161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33866969
52142	NC_005070	CCT	3	9	2345181	2345189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33866970
52143	NC_005070	CGA	2	6	2345225	2345230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866970
52144	NC_005070	TCC	2	6	2345326	2345331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33866970
52145	NC_005070	AAC	2	6	2345339	2345344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33866970
52146	NC_005070	TCAC	2	8	2345363	2345370	25 %	25 %	0 %	50 %	33866970
52147	NC_005070	CAC	2	6	2345392	2345397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866970
52148	NC_005070	CCAA	2	8	2345414	2345421	50 %	0 %	0 %	50 %	33866970
52149	NC_005070	CCG	2	6	2345432	2345437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866970
52150	NC_005070	TCGA	2	8	2345459	2345466	25 %	25 %	25 %	25 %	33866970
52151	NC_005070	GCG	2	6	2345487	2345492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866970
52152	NC_005070	CCG	2	6	2345525	2345530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866970
52153	NC_005070	ACC	2	6	2345542	2345547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866970
52154	NC_005070	AAC	2	6	2345573	2345578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33866970
52155	NC_005070	AACCGC	2	12	2345597	2345608	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	33866970
52156	NC_005070	CAC	2	6	2345656	2345661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866970
52157	NC_005070	CCAGG	2	10	2345677	2345686	20 %	0 %	40 %	40 %	33866970
52158	NC_005070	CAC	3	9	2345689	2345697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866970
52159	NC_005070	CCG	2	6	2345730	2345735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866970
52160	NC_005070	CCA	2	6	2345739	2345744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866970
52161	NC_005070	CTG	2	6	2345803	2345808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866970
52162	NC_005070	GAA	2	6	2345815	2345820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33866970
52163	NC_005070	CAG	2	6	2345833	2345838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866970
52164	NC_005070	GGC	2	6	2345839	2345844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866970
52165	NC_005070	CCAG	2	8	2345928	2345935	25 %	0 %	25 %	50 %	33866970
52166	NC_005070	CCA	2	6	2345940	2345945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866970
52167	NC_005070	GCG	2	6	2345955	2345960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866970
52168	NC_005070	A	6	6	2346010	2346015	100 %	0 %	0 %	0 %	33866970
52169	NC_005070	CGC	2	6	2346067	2346072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866970
52170	NC_005070	ACC	2	6	2346079	2346084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866970
52171	NC_005070	A	6	6	2346091	2346096	100 %	0 %	0 %	0 %	33866970
52172	NC_005070	CAGAT	2	10	2346134	2346143	40 %	20 %	20 %	20 %	33866970
52173	NC_005070	CAA	2	6	2346156	2346161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33866970
52174	NC_005070	CAA	2	6	2346184	2346189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33866970
52175	NC_005070	CAG	2	6	2346213	2346218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866970
52176	NC_005070	GCA	2	6	2346221	2346226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866970
52177	NC_005070	CCA	2	6	2346309	2346314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866971
52178	NC_005070	GTG	2	6	2346401	2346406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866971
52179	NC_005070	CAG	2	6	2346420	2346425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866971
52180	NC_005070	GAC	2	6	2346465	2346470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866971
52181	NC_005070	AGG	2	6	2346507	2346512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33866971
52182	NC_005070	CAC	3	9	2346550	2346558	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866971
52183	NC_005070	CGA	2	6	2346570	2346575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866971
52184	NC_005070	GCC	2	6	2346583	2346588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866971
52185	NC_005070	TTG	2	6	2346758	2346763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33866971
52186	NC_005070	ACC	2	6	2346782	2346787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866971
52187	NC_005070	GAT	2	6	2346805	2346810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33866971
52188	NC_005070	TCCA	2	8	2346839	2346846	25 %	25 %	0 %	50 %	33866971
52189	NC_005070	CGGTG	2	10	2346871	2346880	0 %	20 %	60 %	20 %	33866971
52190	NC_005070	AGGCC	2	10	2346927	2346936	20 %	0 %	40 %	40 %	33866971
52191	NC_005070	CCAG	2	8	2346938	2346945	25 %	0 %	25 %	50 %	33866971
52192	NC_005070	AC	3	6	2346948	2346953	50 %	0 %	0 %	50 %	33866971
52193	NC_005070	GC	3	6	2346994	2346999	0 %	0 %	50 %	50 %	33866971
52194	NC_005070	CGG	2	6	2347074	2347079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866971
52195	NC_005070	CTG	2	6	2347108	2347113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866971
52196	NC_005070	GCA	2	6	2347269	2347274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866971
52197	NC_005070	CAC	2	6	2347297	2347302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866971
52198	NC_005070	GGT	2	6	2347306	2347311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866971
52199	NC_005070	AGG	2	6	2347492	2347497	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52200	NC_005070	CTC	2	6	2347512	2347517	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52201	NC_005070	GGC	2	6	2347573	2347578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866972
52202	NC_005070	GAG	2	6	2347635	2347640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	33866972
52203	NC_005070	GGT	3	9	2347719	2347727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866972
52204	NC_005070	GTC	3	9	2347795	2347803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866972
52205	NC_005070	CTT	2	6	2347828	2347833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33866972
52206	NC_005070	TGT	2	6	2347848	2347853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33866972
52207	NC_005070	GCG	2	6	2347913	2347918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866972
52208	NC_005070	TCGA	2	8	2347940	2347947	25 %	25 %	25 %	25 %	33866972
52209	NC_005070	CAT	2	6	2347948	2347953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33866972
52210	NC_005070	TCA	2	6	2348031	2348036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33866972
52211	NC_005070	GTA	2	6	2348038	2348043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33866972
52212	NC_005070	GAA	2	6	2348083	2348088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33866972
52213	NC_005070	TGA	2	6	2348118	2348123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33866972
52214	NC_005070	CCG	2	6	2348129	2348134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866972
52215	NC_005070	CAGG	2	8	2348136	2348143	25 %	0 %	50 %	25 %	33866972
52216	NC_005070	CTT	2	6	2348146	2348151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33866972
52217	NC_005070	GAT	2	6	2348161	2348166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33866972
52218	NC_005070	AG	3	6	2348225	2348230	50 %	0 %	50 %	0 %	33866972
52219	NC_005070	GCT	2	6	2348235	2348240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866972
52220	NC_005070	AACC	2	8	2348283	2348290	50 %	0 %	0 %	50 %	33866972
52221	NC_005070	GAA	2	6	2348293	2348298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33866972
52222	NC_005070	TGG	2	6	2348337	2348342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866972
52223	NC_005070	CTG	2	6	2348353	2348358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866972
52224	NC_005070	AGA	2	6	2348379	2348384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	33866972
52225	NC_005070	TGT	2	6	2348385	2348390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33866972
52226	NC_005070	GTA	2	6	2348422	2348427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33866972
52227	NC_005070	TTC	2	6	2348438	2348443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33866972
52228	NC_005070	GCA	2	6	2348457	2348462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866972
52229	NC_005070	GAC	2	6	2348497	2348502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866972
52230	NC_005070	CCTGGT	2	12	2348508	2348519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	33866972
52231	NC_005070	CTT	2	6	2348527	2348532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33866972
52232	NC_005070	CGA	2	6	2348574	2348579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866972
52233	NC_005070	ACC	2	6	2348617	2348622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866972
52234	NC_005070	GCG	2	6	2348624	2348629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866972
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52352	NC_005070	TCGA	2	8	2353645	2353652	25 %	25 %	25 %	25 %	33866979
52353	NC_005070	CTT	2	6	2353692	2353697	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	33866979
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52468	NC_005070	CCG	2	6	2358751	2358756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866984
52469	NC_005070	GAC	2	6	2358801	2358806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866984
52470	NC_005070	CAG	2	6	2358824	2358829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866984
52471	NC_005070	GCTT	2	8	2358861	2358868	0 %	50 %	25 %	25 %	33866984
52472	NC_005070	TCC	2	6	2358874	2358879	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33866984
52473	NC_005070	CAAA	2	8	2358893	2358900	75 %	0 %	0 %	25 %	33866984
52474	NC_005070	CAC	3	9	2358933	2358941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866984
52475	NC_005070	CTC	2	6	2358942	2358947	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	33866984
52476	NC_005070	GCA	2	6	2358977	2358982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	33866984
52477	NC_005070	GATCC	2	10	2359032	2359041	20 %	20 %	20 %	40 %	33866984
52478	NC_005070	TCA	2	6	2359123	2359128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	33866984
52479	NC_005070	TGA	2	6	2359145	2359150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	33866984
52480	NC_005070	CAC	2	6	2359209	2359214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866984
52481	NC_005070	GTT	2	6	2359227	2359232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33866984
52482	NC_005070	GGT	2	6	2359278	2359283	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	33866984
52483	NC_005070	CCG	2	6	2359312	2359317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866984
52484	NC_005070	GCG	2	6	2359400	2359405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	33866984
52485	NC_005070	TGT	2	6	2359406	2359411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	33866984
52486	NC_005070	CGC	2	6	2359446	2359451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	33866984
52487	NC_005070	AAC	2	6	2359459	2359464	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	33866984
52488	NC_005070	CCA	2	6	2359523	2359528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	33866984
52489	NC_005070	AGCGG	2	10	2359610	2359619	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
52490	NC_005070	CCT	2	6	2359628	2359633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52491	NC_005070	TG	3	6	2359644	2359649	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52492	NC_005070	CAT	2	6	2359715	2359720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52493	NC_005070	AAC	2	6	2359729	2359734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52494	NC_005070	AAG	2	6	2359760	2359765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52495	NC_005070	GAAT	2	8	2359796	2359803	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52496	NC_005070	CCG	2	6	2359811	2359816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52497	NC_005070	ACC	2	6	2359867	2359872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52498	NC_005070	CCA	2	6	2359921	2359926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52499	NC_005070	CCA	2	6	2359951	2359956	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52500	NC_005070	AGC	2	6	2359965	2359970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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