MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-01

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005008	GTTTA	2	10	38	47	20 %	60 %	20 %	0 %	32470589
2	NC_005008	TA	3	6	46	51	50 %	50 %	0 %	0 %	32470589
3	NC_005008	A	6	6	51	56	100 %	0 %	0 %	0 %	32470589
4	NC_005008	GTTT	2	8	64	71	0 %	75 %	25 %	0 %	32470589
5	NC_005008	T	6	6	105	110	0 %	100 %	0 %	0 %	32470589
6	NC_005008	AAATG	2	10	119	128	60 %	20 %	20 %	0 %	32470589
7	NC_005008	TAC	2	6	170	175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470589
8	NC_005008	AT	3	6	206	211	50 %	50 %	0 %	0 %	32470589
9	NC_005008	CAG	2	6	232	237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470589
10	NC_005008	TA	3	6	258	263	50 %	50 %	0 %	0 %	32470589
11	NC_005008	A	7	7	269	275	100 %	0 %	0 %	0 %	32470589
12	NC_005008	ATT	2	6	282	287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470589
13	NC_005008	ATTG	2	8	314	321	25 %	50 %	25 %	0 %	32470589
14	NC_005008	T	6	6	342	347	0 %	100 %	0 %	0 %	32470589
15	NC_005008	CTG	2	6	385	390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470589
16	NC_005008	TGG	2	6	409	414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470589
17	NC_005008	A	7	7	437	443	100 %	0 %	0 %	0 %	32470589
18	NC_005008	AAT	2	6	515	520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470589
19	NC_005008	TTA	2	6	589	594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470589
20	NC_005008	CAA	2	6	616	621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470589
21	NC_005008	A	6	6	620	625	100 %	0 %	0 %	0 %	32470589
22	NC_005008	TAT	2	6	665	670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470589
23	NC_005008	T	6	6	707	712	0 %	100 %	0 %	0 %	32470589
24	NC_005008	T	6	6	729	734	0 %	100 %	0 %	0 %	32470589
25	NC_005008	TTA	2	6	742	747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470589
26	NC_005008	TTA	2	6	775	780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470589
27	NC_005008	GTTT	2	8	817	824	0 %	75 %	25 %	0 %	32470589
28	NC_005008	TGG	2	6	827	832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470589
29	NC_005008	TAG	2	6	847	852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470589
30	NC_005008	ATG	2	6	879	884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470589
31	NC_005008	TGG	2	6	971	976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470589
32	NC_005008	T	6	6	977	982	0 %	100 %	0 %	0 %	32470589
33	NC_005008	ATT	2	6	1001	1006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470589
34	NC_005008	TTTTA	2	10	1010	1019	20 %	80 %	0 %	0 %	32470589
35	NC_005008	T	6	6	1043	1048	0 %	100 %	0 %	0 %	32470589
36	NC_005008	T	6	6	1059	1064	0 %	100 %	0 %	0 %	32470589
37	NC_005008	ACT	2	6	1086	1091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470589
38	NC_005008	AGT	2	6	1158	1163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470589
39	NC_005008	GAA	3	9	1170	1178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470589
40	NC_005008	T	6	6	1214	1219	0 %	100 %	0 %	0 %	32470589
41	NC_005008	AGG	2	6	1247	1252	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470589
42	NC_005008	ATT	2	6	1303	1308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470589
43	NC_005008	TTA	2	6	1351	1356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470589
44	NC_005008	TGT	2	6	1362	1367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470589
45	NC_005008	ATT	2	6	1377	1382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470589
46	NC_005008	TTATA	2	10	1416	1425	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005008	T	6	6	1467	1472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005008	TTA	2	6	1522	1527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005008	GT	3	6	1540	1545	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005008	ATA	2	6	1683	1688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470590
51	NC_005008	ACTT	2	8	1721	1728	25 %	50 %	0 %	25 %	32470590
52	NC_005008	TAA	2	6	1750	1755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470590
53	NC_005008	TAA	2	6	1765	1770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470590
54	NC_005008	TTGA	2	8	1772	1779	25 %	50 %	25 %	0 %	32470590
55	NC_005008	A	6	6	1782	1787	100 %	0 %	0 %	0 %	32470590
56	NC_005008	AGA	2	6	1891	1896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470590
57	NC_005008	T	6	6	1907	1912	0 %	100 %	0 %	0 %	32470590
58	NC_005008	TAT	2	6	1959	1964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470590
59	NC_005008	A	6	6	1986	1991	100 %	0 %	0 %	0 %	32470590
60	NC_005008	CAC	2	6	1992	1997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470590
61	NC_005008	GTT	2	6	2012	2017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470590
62	NC_005008	TGA	2	6	2026	2031	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470590
63	NC_005008	AAG	2	6	2049	2054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470590
64	NC_005008	TAA	2	6	2062	2067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470590
65	NC_005008	A	6	6	2066	2071	100 %	0 %	0 %	0 %	32470590
66	NC_005008	AGAT	2	8	2089	2096	50 %	25 %	25 %	0 %	32470590
67	NC_005008	AAC	2	6	2112	2117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470590
68	NC_005008	A	6	6	2193	2198	100 %	0 %	0 %	0 %	32470590
69	NC_005008	A	6	6	2235	2240	100 %	0 %	0 %	0 %	32470590
70	NC_005008	GGT	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470590
71	NC_005008	TGT	2	6	2389	2394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470590
72	NC_005008	GCT	2	6	2438	2443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470590
73	NC_005008	TA	3	6	2468	2473	50 %	50 %	0 %	0 %	32470590
74	NC_005008	GAT	2	6	2492	2497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470590
75	NC_005008	GA	3	6	2514	2519	50 %	0 %	50 %	0 %	32470590
76	NC_005008	GAT	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470590
77	NC_005008	TTA	2	6	2528	2533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470590
78	NC_005008	GAA	2	6	2673	2678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470590
79	NC_005008	TAA	2	6	2698	2703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470590
80	NC_005008	AGA	2	6	2710	2715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470590
81	NC_005008	A	7	7	2753	2759	100 %	0 %	0 %	0 %	32470590
82	NC_005008	GAACAG	2	12	2780	2791	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	32470590
83	NC_005008	CAA	2	6	2792	2797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470590
84	NC_005008	AAC	2	6	2799	2804	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470590
85	NC_005008	TTGG	2	8	2870	2877	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005008	GTTG	2	8	2910	2917	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005008	CAA	2	6	2955	2960	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_005008	GAA	2	6	3022	3027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005008	AAGT	2	8	3063	3070	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005008	TAG	2	6	3086	3091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005008	ATA	2	6	3109	3114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005008	TAAA	2	8	3123	3130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005008	A	7	7	3128	3134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005008	TAA	2	6	3176	3181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005008	CAT	2	6	3229	3234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_005008	A	7	7	3241	3247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005008	GTT	2	6	3254	3259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005008	AT	4	8	3311	3318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005008	T	6	6	3363	3368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005008	TG	3	6	3473	3478	0 %	50 %	50 %	0 %	32470591
101	NC_005008	TTC	2	6	3598	3603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470591
102	NC_005008	TAAAGC	2	12	3614	3625	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	32470591
103	NC_005008	CAAA	2	8	3709	3716	75 %	0 %	0 %	25 %	32470591
104	NC_005008	ATA	2	6	3753	3758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470591
105	NC_005008	AGATT	2	10	3786	3795	40 %	40 %	20 %	0 %	32470591
106	NC_005008	GAT	2	6	3813	3818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470591
107	NC_005008	ACT	2	6	3826	3831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470591
108	NC_005008	T	6	6	3865	3870	0 %	100 %	0 %	0 %	32470591
109	NC_005008	GA	3	6	3911	3916	50 %	0 %	50 %	0 %	32470591
110	NC_005008	TTA	2	6	3928	3933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470591
111	NC_005008	TAA	2	6	3941	3946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470591
112	NC_005008	TGG	2	6	4030	4035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470591
113	NC_005008	TGA	2	6	4136	4141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470591
114	NC_005008	AGA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470591
115	NC_005008	CGAA	2	8	4249	4256	50 %	0 %	25 %	25 %	32470591
116	NC_005008	ATATTA	2	12	4319	4330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005008	AT	3	6	4344	4349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005008	AGG	2	6	4367	4372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005008	T	7	7	4374	4380	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005008	AAT	2	6	4427	4432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.