MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-03

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005006	TGAA	2	8	23	30	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005006	AGT	2	6	37	42	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005006	AGA	2	6	45	50	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005006	GAA	2	6	81	86	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005006	GTTT	2	8	89	96	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005006	AAAT	2	8	114	121	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005006	TAA	2	6	154	159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005006	CAA	2	6	180	185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_005006	A	7	7	194	200	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005006	TAAT	2	8	205	212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005006	TTTA	2	8	233	240	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005006	TAA	2	6	287	292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005006	A	6	6	298	303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005006	TTG	2	6	309	314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005006	GT	3	6	347	352	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005006	TTTA	2	8	354	361	25 %	75 %	0 %	0 %	32470573
17	NC_005006	TAA	2	6	378	383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470573
18	NC_005006	A	6	6	498	503	100 %	0 %	0 %	0 %	32470573
19	NC_005006	TCA	2	6	521	526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470573
20	NC_005006	G	6	6	529	534	0 %	0 %	100 %	0 %	32470573
21	NC_005006	C	7	7	568	574	0 %	0 %	0 %	100 %	32470573
22	NC_005006	T	6	6	591	596	0 %	100 %	0 %	0 %	32470573
23	NC_005006	T	6	6	610	615	0 %	100 %	0 %	0 %	32470573
24	NC_005006	ATATT	2	10	636	645	40 %	60 %	0 %	0 %	32470573
25	NC_005006	ATAAC	2	10	650	659	60 %	20 %	0 %	20 %	32470573
26	NC_005006	ACC	2	6	660	665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470573
27	NC_005006	TGA	2	6	675	680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470573
28	NC_005006	A	7	7	695	701	100 %	0 %	0 %	0 %	32470573
29	NC_005006	TTTG	2	8	720	727	0 %	75 %	25 %	0 %	32470573
30	NC_005006	TTA	2	6	753	758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470573
31	NC_005006	TGATGT	2	12	780	791	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	32470573
32	NC_005006	CAA	2	6	816	821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470573
33	NC_005006	TGA	2	6	861	866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470573
34	NC_005006	TGT	2	6	974	979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470573
35	NC_005006	ACT	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470573
36	NC_005006	TGT	2	6	1017	1022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470573
37	NC_005006	CAT	2	6	1042	1047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470573
38	NC_005006	GGT	2	6	1096	1101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470573
39	NC_005006	GTT	2	6	1134	1139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470573
40	NC_005006	CTC	2	6	1430	1435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470573
41	NC_005006	ATA	2	6	1511	1516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470573
42	NC_005006	ATC	2	6	1562	1567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470573
43	NC_005006	ATC	2	6	1639	1644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470573
44	NC_005006	TAT	2	6	1717	1722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470573
45	NC_005006	ACA	2	6	1787	1792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470573
46	NC_005006	AT	3	6	1839	1844	50 %	50 %	0 %	0 %	32470573
47	NC_005006	GGT	2	6	1846	1851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470573
48	NC_005006	TGAT	2	8	1946	1953	25 %	50 %	25 %	0 %	32470573
49	NC_005006	CAA	2	6	1977	1982	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470573
50	NC_005006	CTA	2	6	2075	2080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470573
51	NC_005006	GCA	2	6	2170	2175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470573
52	NC_005006	TGA	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470573
53	NC_005006	TCA	2	6	2291	2296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470573
54	NC_005006	AAG	2	6	2365	2370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470573
55	NC_005006	CAA	3	9	2519	2527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470573
56	NC_005006	GT	3	6	2543	2548	0 %	50 %	50 %	0 %	32470573
57	NC_005006	TGA	2	6	2652	2657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470573
58	NC_005006	TTA	2	6	2693	2698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470573
59	NC_005006	TTC	2	6	2779	2784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470573
60	NC_005006	ATG	2	6	2864	2869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470573
61	NC_005006	TGT	2	6	2999	3004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470573
62	NC_005006	AG	3	6	3010	3015	50 %	0 %	50 %	0 %	32470573
63	NC_005006	AGA	2	6	3063	3068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470573
64	NC_005006	TGT	2	6	3110	3115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470573
65	NC_005006	TGGT	2	8	3165	3172	0 %	50 %	50 %	0 %	32470573
66	NC_005006	GAA	2	6	3199	3204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470573
67	NC_005006	GAT	2	6	3262	3267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470573
68	NC_005006	AAC	2	6	3298	3303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470573
69	NC_005006	TGA	2	6	3348	3353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470573
70	NC_005006	TTG	2	6	3356	3361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470573
71	NC_005006	CAA	2	6	3367	3372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470573
72	NC_005006	GAT	2	6	3442	3447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470573
73	NC_005006	T	6	6	3447	3452	0 %	100 %	0 %	0 %	32470573
74	NC_005006	AC	3	6	3558	3563	50 %	0 %	0 %	50 %	32470573
75	NC_005006	TTA	2	6	3571	3576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470573
76	NC_005006	TAT	2	6	3628	3633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470573
77	NC_005006	GAA	2	6	3643	3648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470573
78	NC_005006	TTA	2	6	3651	3656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470573
79	NC_005006	TAA	2	6	3660	3665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005006	A	6	6	3664	3669	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005006	AGG	2	6	3671	3676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005006	A	6	6	3733	3738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005006	TGA	2	6	3745	3750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005006	TGATG	2	10	3760	3769	20 %	40 %	40 %	0 %	32470574
85	NC_005006	TGT	2	6	3787	3792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470574
86	NC_005006	ATT	2	6	3808	3813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470574
87	NC_005006	ATG	3	9	3819	3827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470574
88	NC_005006	AAT	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470574
89	NC_005006	A	6	6	3926	3931	100 %	0 %	0 %	0 %	32470574
90	NC_005006	CA	3	6	3946	3951	50 %	0 %	0 %	50 %	32470574
91	NC_005006	TAA	2	6	3977	3982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470574
92	NC_005006	T	6	6	4021	4026	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005006	ATTT	2	8	4089	4096	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005006	GTA	2	6	4126	4131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005006	AAT	2	6	4146	4151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005006	TGT	3	9	4155	4163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005006	CAA	2	6	4243	4248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470575
98	NC_005006	TTG	2	6	4315	4320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470575
99	NC_005006	AAC	2	6	4351	4356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470575
100	NC_005006	AAC	2	6	4369	4374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470575
101	NC_005006	GAT	2	6	4443	4448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470575
102	NC_005006	TAA	2	6	4561	4566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470575
103	NC_005006	TTA	2	6	4569	4574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470575
104	NC_005006	AAG	2	6	4671	4676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470575
105	NC_005006	TTG	2	6	4726	4731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470575
106	NC_005006	AGTAC	2	10	4791	4800	40 %	20 %	20 %	20 %	32470575
107	NC_005006	GAG	2	6	4821	4826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470575
108	NC_005006	ATA	2	6	4828	4833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470575
109	NC_005006	A	6	6	4851	4856	100 %	0 %	0 %	0 %	32470575
110	NC_005006	AGA	2	6	4860	4865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470576
111	NC_005006	ACA	2	6	4906	4911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470576
112	NC_005006	AAAGA	2	10	4927	4936	80 %	0 %	20 %	0 %	32470576
113	NC_005006	GTT	2	6	5007	5012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470576
114	NC_005006	ATTT	2	8	5069	5076	25 %	75 %	0 %	0 %	32470576
115	NC_005006	GAT	2	6	5077	5082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470576
116	NC_005006	TCA	2	6	5119	5124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470576
117	NC_005006	CAT	2	6	5153	5158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470576
118	NC_005006	ATCAC	2	10	5217	5226	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_005006	GT	3	6	5259	5264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005006	AG	3	6	5272	5277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005006	AG	4	8	5281	5288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005006	TC	3	6	5296	5301	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_005006	T	9	9	5419	5427	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005006	TAT	2	6	5465	5470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005006	AATC	2	8	5485	5492	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_005006	CAT	2	6	5515	5520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470577
127	NC_005006	AT	3	6	5812	5817	50 %	50 %	0 %	0 %	32470577
128	NC_005006	AC	3	6	5829	5834	50 %	0 %	0 %	50 %	32470577
129	NC_005006	GAT	2	6	5861	5866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470577
130	NC_005006	A	6	6	5869	5874	100 %	0 %	0 %	0 %	32470577
131	NC_005006	A	6	6	5911	5916	100 %	0 %	0 %	0 %	32470577
132	NC_005006	CAA	2	6	5954	5959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470577
133	NC_005006	AAGT	2	8	5963	5970	50 %	25 %	25 %	0 %	32470577
134	NC_005006	CGT	2	6	6049	6054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_005006	ATA	2	6	6143	6148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470578
136	NC_005006	AAG	2	6	6152	6157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470578
137	NC_005006	ATT	2	6	6178	6183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470578
138	NC_005006	CAA	2	6	6227	6232	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470578
139	NC_005006	TGAT	2	8	6437	6444	25 %	50 %	25 %	0 %	32470578
140	NC_005006	AC	3	6	6452	6457	50 %	0 %	0 %	50 %	32470578
141	NC_005006	TAAA	2	8	6482	6489	75 %	25 %	0 %	0 %	32470578
142	NC_005006	GAT	2	6	6610	6615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470578
143	NC_005006	GAA	2	6	6658	6663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470578
144	NC_005006	CAA	2	6	6732	6737	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470578
145	NC_005006	AGA	2	6	6786	6791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470578
146	NC_005006	ACA	2	6	6876	6881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470578
147	NC_005006	CAA	3	9	6883	6891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470578
148	NC_005006	GAT	2	6	6919	6924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470578
149	NC_005006	TGA	3	9	6948	6956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470578
150	NC_005006	GAG	2	6	6985	6990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470578
151	NC_005006	ACA	2	6	7056	7061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470578
152	NC_005006	AAC	2	6	7087	7092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470578
153	NC_005006	ACA	2	6	7102	7107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470578
154	NC_005006	AAAGAC	2	12	7135	7146	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	32470578
155	NC_005006	AC	3	6	7172	7177	50 %	0 %	0 %	50 %	32470579
156	NC_005006	A	6	6	7309	7314	100 %	0 %	0 %	0 %	32470579
157	NC_005006	AGG	2	6	7377	7382	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470579
158	NC_005006	CAA	2	6	7383	7388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470579
159	NC_005006	AAG	2	6	7439	7444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470579
160	NC_005006	TGG	2	6	7461	7466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470579
161	NC_005006	TTG	2	6	7470	7475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470579
162	NC_005006	TGT	2	6	7483	7488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470579
163	NC_005006	GTT	2	6	7489	7494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470579
164	NC_005006	CAA	2	6	7551	7556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470579
165	NC_005006	GGT	2	6	7687	7692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_005006	AAC	2	6	7820	7825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470580
167	NC_005006	GTG	2	6	7865	7870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470580
168	NC_005006	AAAC	2	8	7883	7890	75 %	0 %	0 %	25 %	32470580
169	NC_005006	ACA	2	6	7905	7910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470580
170	NC_005006	GTT	2	6	7911	7916	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470580
171	NC_005006	GAA	2	6	7948	7953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470580
172	NC_005006	TTA	2	6	7984	7989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470580
173	NC_005006	CAA	3	9	7993	8001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470580

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.