MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus epidermidis ATCC 12228 plasmid pSE-12228-06

Total Repeats: 149

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005003	CTTTA	2	10	17	26	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_005003	A	7	7	54	60	100 %	0 %	0 %	0 %	32470521
3	NC_005003	CTT	2	6	69	74	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470521
4	NC_005003	AAC	2	6	92	97	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470521
5	NC_005003	ATGA	2	8	129	136	50 %	25 %	25 %	0 %	32470521
6	NC_005003	A	6	6	171	176	100 %	0 %	0 %	0 %	32470521
7	NC_005003	AACA	2	8	192	199	75 %	0 %	0 %	25 %	32470521
8	NC_005003	T	8	8	286	293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005003	ATC	2	6	346	351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470522
10	NC_005003	TAA	2	6	376	381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470522
11	NC_005003	TGAAA	2	10	412	421	60 %	20 %	20 %	0 %	32470522
12	NC_005003	ATT	2	6	438	443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470522
13	NC_005003	AATT	2	8	459	466	50 %	50 %	0 %	0 %	32470522
14	NC_005003	ATA	2	6	522	527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470522
15	NC_005003	T	6	6	552	557	0 %	100 %	0 %	0 %	32470522
16	NC_005003	T	6	6	584	589	0 %	100 %	0 %	0 %	32470522
17	NC_005003	TAT	2	6	672	677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470522
18	NC_005003	CTA	2	6	765	770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470522
19	NC_005003	TA	4	8	769	776	50 %	50 %	0 %	0 %	32470522
20	NC_005003	ATT	2	6	784	789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470522
21	NC_005003	TGACAA	2	12	816	827	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	32470522
22	NC_005003	ATT	2	6	857	862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470522
23	NC_005003	AAT	2	6	898	903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470522
24	NC_005003	T	6	6	905	910	0 %	100 %	0 %	0 %	32470522
25	NC_005003	CTAT	2	8	972	979	25 %	50 %	0 %	25 %	32470522
26	NC_005003	AGC	2	6	1000	1005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470522
27	NC_005003	T	6	6	1025	1030	0 %	100 %	0 %	0 %	32470522
28	NC_005003	TA	3	6	1053	1058	50 %	50 %	0 %	0 %	32470522
29	NC_005003	T	6	6	1132	1137	0 %	100 %	0 %	0 %	32470522
30	NC_005003	ATT	2	6	1158	1163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005003	T	6	6	1184	1189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005003	ATTTT	2	10	1191	1200	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005003	TAA	2	6	1212	1217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005003	TGC	2	6	1240	1245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_005003	T	6	6	1289	1294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005003	A	6	6	1301	1306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005003	CAA	2	6	1333	1338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_005003	TGA	2	6	1401	1406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005003	GAA	2	6	1455	1460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005003	GTG	2	6	1464	1469	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005003	CGA	2	6	1506	1511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470523
42	NC_005003	ACA	2	6	1596	1601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470523
43	NC_005003	CGTT	2	8	1634	1641	0 %	50 %	25 %	25 %	32470523
44	NC_005003	CAAC	2	8	1761	1768	50 %	0 %	0 %	50 %	32470523
45	NC_005003	AAAAAT	2	12	1856	1867	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	32470523
46	NC_005003	TTTTA	2	10	1911	1920	20 %	80 %	0 %	0 %	32470524
47	NC_005003	TA	4	8	1990	1997	50 %	50 %	0 %	0 %	32470524
48	NC_005003	A	6	6	2010	2015	100 %	0 %	0 %	0 %	32470524
49	NC_005003	CAA	2	6	2033	2038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470524
50	NC_005003	ATC	2	6	2285	2290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470525
51	NC_005003	AAT	2	6	2383	2388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470525
52	NC_005003	ACG	2	6	2420	2425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470525
53	NC_005003	ACG	2	6	2518	2523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470525
54	NC_005003	GAA	2	6	2593	2598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470525
55	NC_005003	A	6	6	2683	2688	100 %	0 %	0 %	0 %	32470525
56	NC_005003	AGG	2	6	2724	2729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470525
57	NC_005003	ACG	2	6	2760	2765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470525
58	NC_005003	ACA	3	9	2766	2774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470525
59	NC_005003	TTG	2	6	2936	2941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470525
60	NC_005003	AG	3	6	2969	2974	50 %	0 %	50 %	0 %	32470525
61	NC_005003	GA	3	6	2978	2983	50 %	0 %	50 %	0 %	32470525
62	NC_005003	ATT	2	6	3001	3006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470525
63	NC_005003	ATCG	2	8	3010	3017	25 %	25 %	25 %	25 %	32470525
64	NC_005003	CA	3	6	3055	3060	50 %	0 %	0 %	50 %	32470526
65	NC_005003	TAA	2	6	3103	3108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470526
66	NC_005003	CA	3	6	3131	3136	50 %	0 %	0 %	50 %	32470526
67	NC_005003	AGA	2	6	3154	3159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470526
68	NC_005003	AC	3	6	3171	3176	50 %	0 %	0 %	50 %	32470526
69	NC_005003	AAC	2	6	3200	3205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470526
70	NC_005003	AAT	3	9	3227	3235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470526
71	NC_005003	A	7	7	3239	3245	100 %	0 %	0 %	0 %	32470526
72	NC_005003	TGAT	2	8	3246	3253	25 %	50 %	25 %	0 %	32470526
73	NC_005003	T	6	6	3335	3340	0 %	100 %	0 %	0 %	32470526
74	NC_005003	TATTT	2	10	3493	3502	20 %	80 %	0 %	0 %	32470526
75	NC_005003	TA	3	6	3511	3516	50 %	50 %	0 %	0 %	32470526
76	NC_005003	AAAT	2	8	3552	3559	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005003	GAA	2	6	3582	3587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005003	T	7	7	3662	3668	0 %	100 %	0 %	0 %	32470527
79	NC_005003	T	6	6	3708	3713	0 %	100 %	0 %	0 %	32470527
80	NC_005003	ATTT	2	8	3749	3756	25 %	75 %	0 %	0 %	32470527
81	NC_005003	GAA	2	6	3807	3812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470527
82	NC_005003	GAA	2	6	3854	3859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005003	TTAA	2	8	3863	3870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005003	CGA	2	6	3878	3883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_005003	CGA	2	6	3911	3916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_005003	TTA	2	6	3934	3939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005003	AAT	2	6	3975	3980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005003	TTA	2	6	3999	4004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005003	T	6	6	4006	4011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005003	ATA	2	6	4014	4019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005003	CAC	2	6	4026	4031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_005003	TGG	2	6	4037	4042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005003	T	7	7	4268	4274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005003	TTA	2	6	4293	4298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005003	TA	3	6	4358	4363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005003	TGGAG	2	10	4378	4387	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005003	AGT	2	6	4406	4411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005003	TAA	2	6	4451	4456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470528
99	NC_005003	T	6	6	4473	4478	0 %	100 %	0 %	0 %	32470528
100	NC_005003	TAA	2	6	4487	4492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470528
101	NC_005003	GAA	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470528
102	NC_005003	AGA	2	6	4634	4639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470528
103	NC_005003	TTA	2	6	4651	4656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470528
104	NC_005003	TAAAGA	2	12	4691	4702	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	32470528
105	NC_005003	ATT	2	6	4740	4745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470528
106	NC_005003	AC	3	6	4791	4796	50 %	0 %	0 %	50 %	32470528
107	NC_005003	TGA	2	6	4874	4879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470528
108	NC_005003	TAA	2	6	4976	4981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	32470528
109	NC_005003	AATAA	2	10	4992	5001	80 %	20 %	0 %	0 %	32470528
110	NC_005003	A	7	7	5006	5012	100 %	0 %	0 %	0 %	32470528
111	NC_005003	AT	3	6	5111	5116	50 %	50 %	0 %	0 %	32470528
112	NC_005003	A	6	6	5125	5130	100 %	0 %	0 %	0 %	32470528
113	NC_005003	AGA	2	6	5144	5149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470528
114	NC_005003	A	6	6	5171	5176	100 %	0 %	0 %	0 %	32470528
115	NC_005003	AAC	2	6	5221	5226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470528
116	NC_005003	TTTTG	2	10	5283	5292	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005003	TATTT	2	10	5293	5302	20 %	80 %	0 %	0 %	32470529
118	NC_005003	CCA	2	6	5357	5362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470529
119	NC_005003	T	6	6	5388	5393	0 %	100 %	0 %	0 %	32470529
120	NC_005003	T	6	6	5403	5408	0 %	100 %	0 %	0 %	32470529
121	NC_005003	CTATTT	2	12	5409	5420	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	32470529
122	NC_005003	T	6	6	5444	5449	0 %	100 %	0 %	0 %	32470529
123	NC_005003	T	7	7	5456	5462	0 %	100 %	0 %	0 %	32470529
124	NC_005003	A	6	6	5478	5483	100 %	0 %	0 %	0 %	32470529
125	NC_005003	ATT	2	6	5490	5495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470529
126	NC_005003	ATG	2	6	5526	5531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470529
127	NC_005003	TTA	2	6	5614	5619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470529
128	NC_005003	TGT	2	6	5664	5669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470529
129	NC_005003	ATT	2	6	5685	5690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	32470529
130	NC_005003	TCC	3	9	5691	5699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470529
131	NC_005003	AGA	2	6	5705	5710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470529
132	NC_005003	ACT	2	6	5777	5782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470529
133	NC_005003	CTT	2	6	5785	5790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470529
134	NC_005003	ACT	2	6	5911	5916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_005003	A	7	7	5925	5931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005003	TA	3	6	6007	6012	50 %	50 %	0 %	0 %	32470530
137	NC_005003	AT	3	6	6066	6071	50 %	50 %	0 %	0 %	32470530
138	NC_005003	TTG	2	6	6128	6133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470530
139	NC_005003	CAA	2	6	6154	6159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470530
140	NC_005003	CCT	2	6	6217	6222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_005003	A	6	6	6253	6258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005003	GT	3	6	6274	6279	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005003	AAC	2	6	6346	6351	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_005003	TAGT	2	8	6457	6464	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005003	GAATA	2	10	6495	6504	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005003	A	6	6	6507	6512	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005003	AT	3	6	6535	6540	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005003	TAA	2	6	6553	6558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_005003	T	7	7	6566	6572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.