MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 301 plasmid pCP301

Total Repeats: 4546

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004851	TCC	2	6	167916	167921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31983707
3502	NC_004851	T	6	6	167947	167952	0 %	100 %	0 %	0 %	31983707
3503	NC_004851	TGT	3	9	167990	167998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983707
3504	NC_004851	CGG	2	6	168289	168294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983707
3505	NC_004851	CTTC	2	8	168314	168321	0 %	50 %	0 %	50 %	31983707
3506	NC_004851	ATC	2	6	168477	168482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983707
3507	NC_004851	GAC	2	6	168500	168505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983707
3508	NC_004851	TA	3	6	168600	168605	50 %	50 %	0 %	0 %	31983707
3509	NC_004851	CG	3	6	168679	168684	0 %	0 %	50 %	50 %	31983707
3510	NC_004851	AT	3	6	168721	168726	50 %	50 %	0 %	0 %	31983707
3511	NC_004851	AGG	2	6	168786	168791	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	31983707
3512	NC_004851	GTG	2	6	168794	168799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	31983707
3513	NC_004851	TTTC	2	8	168908	168915	0 %	75 %	0 %	25 %	31983707
3514	NC_004851	CAG	2	6	168947	168952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983707
3515	NC_004851	TGAC	2	8	169079	169086	25 %	25 %	25 %	25 %	31983707
3516	NC_004851	AGA	2	6	169099	169104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	31983707
3517	NC_004851	AAC	2	6	169207	169212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983707
3518	NC_004851	ACG	2	6	169215	169220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983707
3519	NC_004851	AGC	2	6	169327	169332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983707
3520	NC_004851	ATC	2	6	169338	169343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983707
3521	NC_004851	TTCCC	2	10	169475	169484	0 %	40 %	0 %	60 %	31983698
3522	NC_004851	GAT	2	6	169670	169675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983698
3523	NC_004851	ATC	2	6	169704	169709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983698
3524	NC_004851	TCA	2	6	169841	169846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983699
3525	NC_004851	CTGGT	2	10	169875	169884	0 %	40 %	40 %	20 %	31983699
3526	NC_004851	TCAG	2	8	169898	169905	25 %	25 %	25 %	25 %	31983699
3527	NC_004851	GCAT	2	8	169920	169927	25 %	25 %	25 %	25 %	31983699
3528	NC_004851	TCA	2	6	169937	169942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983699
3529	NC_004851	CAG	2	6	169984	169989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983699
3530	NC_004851	TTA	2	6	169991	169996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	31983699
3531	NC_004851	CAA	2	6	170025	170030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983699
3532	NC_004851	CTT	2	6	170143	170148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983699
3533	NC_004851	GTAT	2	8	170243	170250	25 %	50 %	25 %	0 %	31983699
3534	NC_004851	TGT	2	6	170362	170367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983699
3535	NC_004851	TCGT	2	8	170379	170386	0 %	50 %	25 %	25 %	31983699
3536	NC_004851	TTG	2	6	170411	170416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983691
3537	NC_004851	CT	3	6	170475	170480	0 %	50 %	0 %	50 %	31983691
3538	NC_004851	CCG	2	6	170509	170514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983691
3539	NC_004851	TTC	2	6	170517	170522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983691
3540	NC_004851	CCACT	2	10	170594	170603	20 %	20 %	0 %	60 %	31983691
3541	NC_004851	GAC	2	6	170607	170612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983691
3542	NC_004851	GCG	2	6	170630	170635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	31983691
3543	NC_004851	GCC	2	6	170681	170686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983691
3544	NC_004851	CAGTG	2	10	170700	170709	20 %	20 %	40 %	20 %	31983691
3545	NC_004851	CAG	2	6	170721	170726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983691
3546	NC_004851	TC	4	8	170750	170757	0 %	50 %	0 %	50 %	31983691
3547	NC_004851	CAG	2	6	170766	170771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983691
3548	NC_004851	CTTT	2	8	170805	170812	0 %	75 %	0 %	25 %	31983691
3549	NC_004851	CAG	2	6	170854	170859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983691
3550	NC_004851	AGC	2	6	170955	170960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983691
3551	NC_004851	CGA	2	6	170970	170975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983691
3552	NC_004851	ATC	2	6	171032	171037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983691
3553	NC_004851	ACT	2	6	171044	171049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983691
3554	NC_004851	CCAT	2	8	171057	171064	25 %	25 %	0 %	50 %	31983691
3555	NC_004851	T	6	6	171178	171183	0 %	100 %	0 %	0 %	161485953
3556	NC_004851	CTT	2	6	171203	171208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161485953
3557	NC_004851	GAG	2	6	171210	171215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161485953
3558	NC_004851	GGC	2	6	171273	171278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161485953
3559	NC_004851	AAC	2	6	171297	171302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	161485953
3560	NC_004851	CGG	2	6	171311	171316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161485953
3561	NC_004851	CAG	2	6	171320	171325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161485953
3562	NC_004851	CTTC	2	8	171331	171338	0 %	50 %	0 %	50 %	161485953
3563	NC_004851	GCTG	3	12	171365	171376	0 %	25 %	50 %	25 %	161485953
3564	NC_004851	CTG	2	6	171429	171434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161485953
3565	NC_004851	TG	3	6	171454	171459	0 %	50 %	50 %	0 %	161485953
3566	NC_004851	ATCA	2	8	171492	171499	50 %	25 %	0 %	25 %	161485953
3567	NC_004851	GCA	2	6	171667	171672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_004851	CAG	2	6	171674	171679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_004851	CTTC	2	8	171685	171692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_004851	ATT	2	6	171698	171703	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_004851	T	6	6	171702	171707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_004851	GGCTG	2	10	171722	171731	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3573	NC_004851	CTG	2	6	171783	171788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_004851	AAT	2	6	171789	171794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_004851	T	6	6	171800	171805	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3576	NC_004851	GAG	2	6	171809	171814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3577	NC_004851	TTTACG	2	12	171816	171827	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3578	NC_004851	AT	3	6	171883	171888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3579	NC_004851	TCAGCA	2	12	171966	171977	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	31983665
3580	NC_004851	ACT	3	9	171996	172004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983665
3581	NC_004851	T	6	6	172145	172150	0 %	100 %	0 %	0 %	31983665
3582	NC_004851	TAC	2	6	172203	172208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983665
3583	NC_004851	A	6	6	172326	172331	100 %	0 %	0 %	0 %	31983665
3584	NC_004851	CT	3	6	172371	172376	0 %	50 %	0 %	50 %	31983665
3585	NC_004851	CCA	2	6	172438	172443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	31983665
3586	NC_004851	T	6	6	172533	172538	0 %	100 %	0 %	0 %	31983665
3587	NC_004851	ACATTT	2	12	172540	172551	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	31983665
3588	NC_004851	CTC	2	6	172554	172559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	31983665
3589	NC_004851	CAG	2	6	172577	172582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	31983665
3590	NC_004851	TA	4	8	172626	172633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3591	NC_004851	TTC	2	6	172645	172650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_004851	ACA	2	6	172674	172679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_004851	A	6	6	172679	172684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_004851	ACC	2	6	172745	172750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3595	NC_004851	AT	3	6	172760	172765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3596	NC_004851	TCA	2	6	172806	172811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_004851	AC	3	6	172837	172842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_004851	GTT	2	6	172879	172884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3599	NC_004851	TGC	2	6	172892	172897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_004851	TCA	2	6	172915	172920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_004851	CCG	2	6	172971	172976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	31983617
3602	NC_004851	AAC	2	6	173170	173175	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983617
3603	NC_004851	ATTC	2	8	173307	173314	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3604	NC_004851	CAA	2	6	173401	173406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_004851	ACGA	2	8	173431	173438	50 %	0 %	25 %	25 %	31983700
3606	NC_004851	ACA	2	6	173450	173455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31983700
3607	NC_004851	ATAC	2	8	173567	173574	50 %	25 %	0 %	25 %	31983700
3608	NC_004851	AGAA	2	8	173666	173673	75 %	0 %	25 %	0 %	31983700
3609	NC_004851	TGT	2	6	173785	173790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983700
3610	NC_004851	CTG	2	6	173828	173833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983700
3611	NC_004851	GAT	2	6	173873	173878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983700
3612	NC_004851	ATGC	2	8	173890	173897	25 %	25 %	25 %	25 %	31983700
3613	NC_004851	ACTG	2	8	173911	173918	25 %	25 %	25 %	25 %	31983700
3614	NC_004851	GACCA	2	10	173932	173941	40 %	0 %	20 %	40 %	31983700
3615	NC_004851	ATG	2	6	173970	173975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983700
3616	NC_004851	GAT	2	6	174108	174113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983700
3617	NC_004851	ATC	2	6	174142	174147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31983701
3618	NC_004851	GGGAA	2	10	174353	174362	40 %	0 %	60 %	0 %	31983701
3619	NC_004851	GAT	2	6	174494	174499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31983708
3620	NC_004851	GCT	2	6	174505	174510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983708
3621	NC_004851	CGT	2	6	174617	174622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	31983708
3622	NC_004851	TGT	2	6	174624	174629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	31983708
3623	NC_004851	TCT	2	6	174733	174738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31983708
3624	NC_004851	GTCA	2	8	174751	174758	25 %	25 %	25 %	25 %	31983708
3625	NC_004851	CTGC	2	8	174881	174888	0 %	25 %	25 %	50 %	31983708
3626	NC_004851	GAAA	2	8	174922	174929	75 %	0 %	25 %	0 %	31983708
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3753	NC_004851	CCT	2	6	181803	181808	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56404031
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3773	NC_004851	CTC	2	6	183184	183189	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3777	NC_004851	TA	3	6	183275	183280	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3785	NC_004851	GGCAG	2	10	183696	183705	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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3879	NC_004851	T	6	6	188567	188572	0 %	100 %	0 %	0 %	31983664
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