MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 93684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004741	TGA	2	6	23657	23662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061594
502	NC_004741	GTGG	2	8	23838	23845	0 %	25 %	75 %	0 %	30061594
503	NC_004741	GGC	2	6	23888	23893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061594
504	NC_004741	ACG	2	6	23965	23970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061594
505	NC_004741	CTG	2	6	23974	23979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061594
506	NC_004741	CAG	2	6	23985	23990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061594
507	NC_004741	GCT	2	6	24052	24057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061594
508	NC_004741	CGGTGA	2	12	24131	24142	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	30061594
509	NC_004741	TGA	2	6	24159	24164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061594
510	NC_004741	GCTG	2	8	24192	24199	0 %	25 %	50 %	25 %	30061595
511	NC_004741	TGG	2	6	24204	24209	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061595
512	NC_004741	GCA	2	6	24234	24239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061595
513	NC_004741	TCC	2	6	24249	24254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30061595
514	NC_004741	GCG	2	6	24326	24331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061595
515	NC_004741	GCG	2	6	24351	24356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061595
516	NC_004741	TGA	2	6	24414	24419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061595
517	NC_004741	ATT	2	6	24470	24475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30061595
518	NC_004741	GGC	2	6	24476	24481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061595
519	NC_004741	GC	3	6	24480	24485	0 %	0 %	50 %	50 %	30061595
520	NC_004741	A	6	6	24644	24649	100 %	0 %	0 %	0 %	30061595
521	NC_004741	AAT	2	6	24651	24656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30061595
522	NC_004741	CGA	2	6	24798	24803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061596
523	NC_004741	CAC	2	6	24807	24812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061596
524	NC_004741	CAA	2	6	24828	24833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30061596
525	NC_004741	CTG	2	6	24895	24900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061596
526	NC_004741	ACC	2	6	24922	24927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061596
527	NC_004741	GCG	2	6	24946	24951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061596
528	NC_004741	CCG	2	6	24990	24995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061596
529	NC_004741	ATGG	2	8	25051	25058	25 %	25 %	50 %	0 %	30061596
530	NC_004741	TTG	2	6	25254	25259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061597
531	NC_004741	AT	3	6	25289	25294	50 %	50 %	0 %	0 %	30061597
532	NC_004741	GTG	2	6	25307	25312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061597
533	NC_004741	GAA	2	6	25532	25537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061597
534	NC_004741	TG	3	6	25639	25644	0 %	50 %	50 %	0 %	30061597
535	NC_004741	TGG	2	6	25845	25850	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061597
536	NC_004741	CTC	2	6	25864	25869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30061597
537	NC_004741	TTGA	2	8	25922	25929	25 %	50 %	25 %	0 %	30061597
538	NC_004741	TGG	2	6	26025	26030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061597
539	NC_004741	GCA	2	6	26038	26043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061597
540	NC_004741	GTG	3	9	26049	26057	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061597
541	NC_004741	GAA	2	6	26081	26086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061597
542	NC_004741	AGC	2	6	26150	26155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_004741	T	6	6	26192	26197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_004741	GAA	2	6	26200	26205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_004741	GCC	2	6	26266	26271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30061598
546	NC_004741	TGA	2	6	26303	26308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061598
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548	NC_004741	GCA	2	6	26437	26442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061598
549	NC_004741	TGGC	2	8	26465	26472	0 %	25 %	50 %	25 %	30061598
550	NC_004741	TTG	2	6	26480	26485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061598
551	NC_004741	TGG	2	6	26567	26572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061598
552	NC_004741	TCG	2	6	26637	26642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061598
553	NC_004741	CTG	2	6	26663	26668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061598
554	NC_004741	CTGG	2	8	26925	26932	0 %	25 %	50 %	25 %	30061598
555	NC_004741	ACG	2	6	27004	27009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30061598
556	NC_004741	GTGG	2	8	27090	27097	0 %	25 %	75 %	0 %	30061598
557	NC_004741	TCAT	2	8	27149	27156	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
558	NC_004741	TCCC	2	8	27179	27186	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
559	NC_004741	TGGC	2	8	27220	27227	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
560	NC_004741	ATG	2	6	27294	27299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30061599
561	NC_004741	G	6	6	27329	27334	0 %	0 %	100 %	0 %	30061599
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565	NC_004741	TCT	2	6	27413	27418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30061599
566	NC_004741	GCTG	2	8	27442	27449	0 %	25 %	50 %	25 %	30061599
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574	NC_004741	CAT	2	6	27764	27769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061599
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577	NC_004741	TAT	2	6	28124	28129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_004741	ATTTA	2	10	28146	28155	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_004741	TCT	2	6	28245	28250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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581	NC_004741	TCT	2	6	28321	28326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_004741	TGC	2	6	28327	28332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_004741	GAT	2	6	28357	28362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
584	NC_004741	CATG	2	8	28389	28396	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
585	NC_004741	ATA	2	6	28406	28411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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587	NC_004741	GCC	2	6	28461	28466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_004741	TCG	2	6	28480	28485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_004741	TCA	2	6	28511	28516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_004741	AGTG	2	8	28539	28546	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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593	NC_004741	CTTA	2	8	28729	28736	25 %	50 %	0 %	25 %	30061600
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596	NC_004741	CT	3	6	28858	28863	0 %	50 %	0 %	50 %	30061600
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598	NC_004741	CG	3	6	29008	29013	0 %	0 %	50 %	50 %	30061600
599	NC_004741	ACC	2	6	29053	29058	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30061600
600	NC_004741	CGG	2	6	29100	29105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061600
601	NC_004741	A	6	6	29119	29124	100 %	0 %	0 %	0 %	30061600
602	NC_004741	CGT	2	6	29145	29150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30061600
603	NC_004741	TGG	2	6	29192	29197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061600
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609	NC_004741	CATCG	2	10	29587	29596	20 %	20 %	20 %	40 %	30061600
610	NC_004741	AGCC	2	8	29631	29638	25 %	0 %	25 %	50 %	30061600
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612	NC_004741	GTT	2	6	29661	29666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30061600
613	NC_004741	ACT	2	6	29812	29817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061601
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629	NC_004741	GAA	2	6	30297	30302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30061601
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631	NC_004741	TGAT	2	8	30346	30353	25 %	50 %	25 %	0 %	30061601
632	NC_004741	GTG	2	6	30390	30395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30061601
633	NC_004741	CAT	2	6	30416	30421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30061601
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641	NC_004741	CG	3	6	31062	31067	0 %	0 %	50 %	50 %	30061601
642	NC_004741	CTGT	2	8	31071	31078	0 %	50 %	25 %	25 %	30061601
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645	NC_004741	GGCG	2	8	31247	31254	0 %	0 %	75 %	25 %	30061601
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653	NC_004741	CTGAAA	2	12	31785	31796	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	30061601
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655	NC_004741	CGTC	2	8	31875	31882	0 %	25 %	25 %	50 %	30061601
656	NC_004741	CGG	2	6	31892	31897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061601
657	NC_004741	CGG	2	6	31951	31956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30061601
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688	NC_004741	TGA	2	6	33073	33078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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694	NC_004741	GAT	2	6	33395	33400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161486554
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862	NC_004741	A	7	7	41079	41085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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894	NC_004741	CAG	2	6	42428	42433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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