MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_004631	GCG	2	6	117152	117157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140644
2502	NC_004631	GCC	2	6	117198	117203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140644
2503	NC_004631	GTC	2	6	117237	117242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_004631	GGA	2	6	117291	117296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_004631	TGT	3	9	117303	117311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_004631	CG	3	6	117343	117348	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2507	NC_004631	CGC	2	6	117422	117427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2508	NC_004631	GCC	2	6	117455	117460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2509	NC_004631	CG	3	6	117473	117478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2510	NC_004631	TGT	2	6	117486	117491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_004631	CG	3	6	117589	117594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2512	NC_004631	CTGA	2	8	117605	117612	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2513	NC_004631	ATAGCG	2	12	117621	117632	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2514	NC_004631	ATG	2	6	117663	117668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_004631	ATGA	2	8	117702	117709	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_004631	GTTC	2	8	117710	117717	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2517	NC_004631	ATG	2	6	117801	117806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_004631	TA	3	6	117811	117816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_004631	CAG	2	6	117817	117822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_004631	TTTA	2	8	117859	117866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_004631	A	6	6	117974	117979	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_004631	T	6	6	117986	117991	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_004631	GTTT	2	8	117992	117999	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_004631	TAAT	2	8	118000	118007	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_004631	ATA	2	6	118057	118062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_004631	TAAA	2	8	118083	118090	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_004631	TCG	2	6	118110	118115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_004631	CT	3	6	118120	118125	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2529	NC_004631	TAATT	2	10	118129	118138	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_004631	ATTTT	2	10	118155	118164	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_004631	CGGGTG	2	12	118171	118182	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
2532	NC_004631	T	6	6	118317	118322	0 %	100 %	0 %	0 %	29140645
2533	NC_004631	ACAGA	2	10	118338	118347	60 %	0 %	20 %	20 %	29140645
2534	NC_004631	ATT	2	6	118362	118367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140645
2535	NC_004631	T	7	7	118382	118388	0 %	100 %	0 %	0 %	29140645
2536	NC_004631	ATT	2	6	118431	118436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140645
2537	NC_004631	CAA	2	6	118468	118473	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140645
2538	NC_004631	TTC	2	6	118488	118493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140645
2539	NC_004631	GGAA	2	8	118502	118509	50 %	0 %	50 %	0 %	29140645
2540	NC_004631	ATA	2	6	118531	118536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140645
2541	NC_004631	AT	3	6	118589	118594	50 %	50 %	0 %	0 %	29140645
2542	NC_004631	TCA	2	6	118607	118612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140645
2543	NC_004631	C	6	6	118618	118623	0 %	0 %	0 %	100 %	29140645
2544	NC_004631	CAG	2	6	118697	118702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140646
2545	NC_004631	TGC	2	6	118707	118712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140646
2546	NC_004631	GCG	2	6	118726	118731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140646
2547	NC_004631	GGC	2	6	118738	118743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140646
2548	NC_004631	AGA	2	6	118744	118749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140646
2549	NC_004631	CTT	2	6	118765	118770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140646
2550	NC_004631	GCG	2	6	118860	118865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140646
2551	NC_004631	CAA	2	6	118891	118896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140646
2552	NC_004631	GTGG	2	8	118988	118995	0 %	25 %	75 %	0 %	29140646
2553	NC_004631	GT	3	6	119055	119060	0 %	50 %	50 %	0 %	29140646
2554	NC_004631	TGC	2	6	119065	119070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140646
2555	NC_004631	GAC	2	6	119118	119123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140646
2556	NC_004631	ACC	3	9	119166	119174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140646
2557	NC_004631	CGC	2	6	119230	119235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140646
2558	NC_004631	TCT	2	6	119331	119336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140646
2559	NC_004631	CAGCG	2	10	119513	119522	20 %	0 %	40 %	40 %	29140647
2560	NC_004631	ATCA	2	8	119554	119561	50 %	25 %	0 %	25 %	29140647
2561	NC_004631	GC	3	6	119640	119645	0 %	0 %	50 %	50 %	29140647
2562	NC_004631	GCCA	2	8	119647	119654	25 %	0 %	25 %	50 %	29140647
2563	NC_004631	GCG	2	6	119736	119741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140647
2564	NC_004631	CAG	2	6	119767	119772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140647
2565	NC_004631	CGA	2	6	119805	119810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140647
2566	NC_004631	GCCGG	2	10	119813	119822	0 %	0 %	60 %	40 %	29140647
2567	NC_004631	GCC	2	6	119860	119865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140647
2568	NC_004631	AC	3	6	119920	119925	50 %	0 %	0 %	50 %	29140647
2569	NC_004631	CGAGC	2	10	119938	119947	20 %	0 %	40 %	40 %	29140647
2570	NC_004631	TCC	2	6	119984	119989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29140647
2571	NC_004631	GCC	2	6	120001	120006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140647
2572	NC_004631	GCG	2	6	120047	120052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140647
2573	NC_004631	CTG	2	6	120088	120093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140647
2574	NC_004631	GTT	2	6	120123	120128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140647
2575	NC_004631	AGT	3	9	120151	120159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140647
2576	NC_004631	GCC	2	6	120172	120177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140647
2577	NC_004631	GC	3	6	120211	120216	0 %	0 %	50 %	50 %	29140647
2578	NC_004631	GGCG	2	8	120259	120266	0 %	0 %	75 %	25 %	29140647
2579	NC_004631	GCT	2	6	120277	120282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140647
2580	NC_004631	TCGCCG	2	12	120311	120322	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	29140647
2581	NC_004631	CAC	2	6	120331	120336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140647
2582	NC_004631	ATTTG	2	10	120381	120390	20 %	60 %	20 %	0 %	29140647
2583	NC_004631	GTCA	2	8	120409	120416	25 %	25 %	25 %	25 %	29140647
2584	NC_004631	GAC	2	6	120544	120549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140647
2585	NC_004631	TGC	2	6	120554	120559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140647
2586	NC_004631	CG	3	6	120569	120574	0 %	0 %	50 %	50 %	29140647
2587	NC_004631	GCC	2	6	120595	120600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140647
2588	NC_004631	GGTTCA	2	12	120612	120623	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	29140647
2589	NC_004631	GCG	2	6	120656	120661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140647
2590	NC_004631	AGT	2	6	120683	120688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140647
2591	NC_004631	ACC	2	6	120752	120757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140647
2592	NC_004631	GCTG	2	8	120936	120943	0 %	25 %	50 %	25 %	29140647
2593	NC_004631	TGT	2	6	121059	121064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140648
2594	NC_004631	CTG	2	6	121082	121087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140648
2595	NC_004631	GCG	2	6	121091	121096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140648
2596	NC_004631	GGC	2	6	121175	121180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140648
2597	NC_004631	CGG	2	6	121210	121215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140648
2598	NC_004631	GCG	2	6	121224	121229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140648
2599	NC_004631	CGA	2	6	121255	121260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140648
2600	NC_004631	GCA	2	6	121286	121291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140648
2601	NC_004631	GCC	2	6	121325	121330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140648
2602	NC_004631	GC	5	10	121386	121395	0 %	0 %	50 %	50 %	29140648
2603	NC_004631	CAC	2	6	121523	121528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140648
2604	NC_004631	GCT	2	6	121585	121590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140648
2605	NC_004631	CTGG	2	8	121592	121599	0 %	25 %	50 %	25 %	29140648
2606	NC_004631	TGC	2	6	121626	121631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140648
2607	NC_004631	GTT	2	6	121639	121644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140648
2608	NC_004631	CAC	2	6	121730	121735	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140648
2609	NC_004631	CGC	2	6	121891	121896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140648
2610	NC_004631	CAC	2	6	121904	121909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140648
2611	NC_004631	CGG	2	6	121969	121974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140648
2612	NC_004631	TCA	2	6	122031	122036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140648
2613	NC_004631	AAG	2	6	122037	122042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140648
2614	NC_004631	GGC	2	6	122049	122054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140648
2615	NC_004631	CGG	2	6	122109	122114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140648
2616	NC_004631	GTG	2	6	122130	122135	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140648
2617	NC_004631	AGC	2	6	122142	122147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140648
2618	NC_004631	CA	3	6	122161	122166	50 %	0 %	0 %	50 %	29140648
2619	NC_004631	CGG	2	6	122182	122187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140648
2620	NC_004631	GCC	2	6	122258	122263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140648
2621	NC_004631	AGT	2	6	122275	122280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140648
2622	NC_004631	TCG	2	6	122316	122321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140648
2623	NC_004631	CTT	2	6	122323	122328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140648
2624	NC_004631	CGG	2	6	122332	122337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140648
2625	NC_004631	GCG	2	6	122481	122486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140648
2626	NC_004631	CG	3	6	122539	122544	0 %	0 %	50 %	50 %	29140648
2627	NC_004631	GAT	2	6	122545	122550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140648
2628	NC_004631	GTT	2	6	122561	122566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140648
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2631	NC_004631	TCG	2	6	122628	122633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140648
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2635	NC_004631	AG	3	6	122745	122750	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_004631	CAGG	2	8	122767	122774	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2637	NC_004631	AATGCT	2	12	122797	122808	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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2641	NC_004631	G	6	6	123029	123034	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2642	NC_004631	T	7	7	123143	123149	0 %	100 %	0 %	0 %	29140649
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2751	NC_004631	GCTT	2	8	127676	127683	0 %	50 %	25 %	25 %	29140653
2752	NC_004631	GCC	2	6	127743	127748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140653
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2803	NC_004631	AAT	2	6	129966	129971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2998	NC_004631	AAAGC	2	10	139811	139820	60 %	0 %	20 %	20 %	29140663
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