MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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27002	NC_004631	GGC	2	6	1261636	1261641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141658
27003	NC_004631	GAT	2	6	1261648	1261653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141658
27004	NC_004631	AGTC	2	8	1261738	1261745	25 %	25 %	25 %	25 %	29141658
27005	NC_004631	TTGA	2	8	1261811	1261818	25 %	50 %	25 %	0 %	29141658
27006	NC_004631	GAT	2	6	1261850	1261855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141659
27007	NC_004631	AGC	3	9	1261897	1261905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141659
27008	NC_004631	TAT	2	6	1261980	1261985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141659
27009	NC_004631	TTA	2	6	1262012	1262017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141659
27010	NC_004631	TGC	2	6	1262041	1262046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141659
27011	NC_004631	T	7	7	1262147	1262153	0 %	100 %	0 %	0 %	29141659
27012	NC_004631	GTTTT	2	10	1262180	1262189	0 %	80 %	20 %	0 %	29141659
27013	NC_004631	CCTT	2	8	1262221	1262228	0 %	50 %	0 %	50 %	29141659
27014	NC_004631	CGT	2	6	1262251	1262256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141659
27015	NC_004631	CGA	2	6	1262279	1262284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141659
27016	NC_004631	GTG	2	6	1262295	1262300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141659
27017	NC_004631	TAT	2	6	1262309	1262314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141659
27018	NC_004631	ATG	2	6	1262350	1262355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141659
27019	NC_004631	CG	3	6	1262470	1262475	0 %	0 %	50 %	50 %	29141659
27020	NC_004631	TTA	2	6	1262486	1262491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141659
27021	NC_004631	AGT	2	6	1262601	1262606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141659
27022	NC_004631	TTA	2	6	1262617	1262622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141659
27023	NC_004631	AAG	2	6	1262631	1262636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141659
27024	NC_004631	TAT	2	6	1262814	1262819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27025	NC_004631	GTC	2	6	1262836	1262841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141660
27026	NC_004631	TGG	2	6	1262847	1262852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141660
27027	NC_004631	AGC	2	6	1262857	1262862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141660
27028	NC_004631	TTA	2	6	1262888	1262893	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141660
27029	NC_004631	AAG	2	6	1262953	1262958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141660
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27031	NC_004631	TGAT	2	8	1262990	1262997	25 %	50 %	25 %	0 %	29141660
27032	NC_004631	TTTA	2	8	1263171	1263178	25 %	75 %	0 %	0 %	29141660
27033	NC_004631	CAT	2	6	1263210	1263215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141660
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27035	NC_004631	CGG	2	6	1263269	1263274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141660
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27037	NC_004631	GAATGA	2	12	1263381	1263392	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	29141660
27038	NC_004631	TTA	2	6	1263434	1263439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141660
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27040	NC_004631	A	6	6	1263522	1263527	100 %	0 %	0 %	0 %	29141660
27041	NC_004631	GATT	2	8	1263554	1263561	25 %	50 %	25 %	0 %	29141660
27042	NC_004631	CGCT	2	8	1263562	1263569	0 %	25 %	25 %	50 %	29141660
27043	NC_004631	TGC	2	6	1263575	1263580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141660
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27046	NC_004631	GC	5	10	1263656	1263665	0 %	0 %	50 %	50 %	29141660
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27051	NC_004631	CGG	2	6	1263866	1263871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141660
27052	NC_004631	CGC	2	6	1263917	1263922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141660
27053	NC_004631	GCG	2	6	1264003	1264008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141660
27054	NC_004631	ATG	2	6	1264025	1264030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141660
27055	NC_004631	TGC	2	6	1264031	1264036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141660
27056	NC_004631	CCGA	2	8	1264067	1264074	25 %	0 %	25 %	50 %	29141660
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27062	NC_004631	CTGC	2	8	1264342	1264349	0 %	25 %	25 %	50 %	29141661
27063	NC_004631	TTTTG	2	10	1264368	1264377	0 %	80 %	20 %	0 %	29141661
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27071	NC_004631	GAG	2	6	1264772	1264777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141661
27072	NC_004631	CT	3	6	1264782	1264787	0 %	50 %	0 %	50 %	29141661
27073	NC_004631	ACA	2	6	1264817	1264822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141661
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27084	NC_004631	GT	3	6	1265343	1265348	0 %	50 %	50 %	0 %	29141662
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27087	NC_004631	AG	3	6	1265638	1265643	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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27089	NC_004631	TATT	2	8	1265686	1265693	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27090	NC_004631	GCC	2	6	1265750	1265755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141663
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27094	NC_004631	CTT	2	6	1265814	1265819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141663
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27098	NC_004631	TCA	2	6	1266032	1266037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141663
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27100	NC_004631	CAG	2	6	1266142	1266147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141663
27101	NC_004631	T	6	6	1266211	1266216	0 %	100 %	0 %	0 %	29141663
27102	NC_004631	AGG	2	6	1266232	1266237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141663
27103	NC_004631	ACC	2	6	1266332	1266337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141663
27104	NC_004631	CG	3	6	1266352	1266357	0 %	0 %	50 %	50 %	29141663
27105	NC_004631	AAT	2	6	1266391	1266396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141663
27106	NC_004631	TGC	2	6	1266398	1266403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141663
27107	NC_004631	CTGA	2	8	1266418	1266425	25 %	25 %	25 %	25 %	29141663
27108	NC_004631	GCC	2	6	1266520	1266525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141663
27109	NC_004631	GGC	2	6	1266539	1266544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141663
27110	NC_004631	ATCC	2	8	1266607	1266614	25 %	25 %	0 %	50 %	29141663
27111	NC_004631	GCCC	2	8	1266687	1266694	0 %	0 %	25 %	75 %	29141663
27112	NC_004631	GAC	2	6	1266696	1266701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141663
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27114	NC_004631	CGG	2	6	1267004	1267009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141663
27115	NC_004631	GC	3	6	1267257	1267262	0 %	0 %	50 %	50 %	29141663
27116	NC_004631	A	6	6	1267342	1267347	100 %	0 %	0 %	0 %	29141663
27117	NC_004631	TTA	2	6	1267358	1267363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141663
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27119	NC_004631	CAG	2	6	1267434	1267439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141663
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