MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25001	NC_004631	GATA	2	8	1164679	1164686	50 %	25 %	25 %	0 %	29141556
25002	NC_004631	CAG	2	6	1164704	1164709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141556
25003	NC_004631	GC	3	6	1164815	1164820	0 %	0 %	50 %	50 %	29141556
25004	NC_004631	TCT	2	6	1164828	1164833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141556
25005	NC_004631	AGA	2	6	1164841	1164846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141556
25006	NC_004631	CGC	2	6	1164889	1164894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141556
25007	NC_004631	CAC	2	6	1164917	1164922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141556
25008	NC_004631	CAT	2	6	1164946	1164951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141556
25009	NC_004631	CG	3	6	1165013	1165018	0 %	0 %	50 %	50 %	29141556
25010	NC_004631	GCC	2	6	1165044	1165049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141556
25011	NC_004631	TCTG	2	8	1165134	1165141	0 %	50 %	25 %	25 %	29141556
25012	NC_004631	CG	3	6	1165242	1165247	0 %	0 %	50 %	50 %	29141556
25013	NC_004631	CG	3	6	1165317	1165322	0 %	0 %	50 %	50 %	29141556
25014	NC_004631	CGC	2	6	1165345	1165350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141556
25015	NC_004631	GAC	2	6	1165406	1165411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141556
25016	NC_004631	CGT	2	6	1165421	1165426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141556
25017	NC_004631	CAT	2	6	1165451	1165456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141556
25018	NC_004631	GAT	2	6	1165517	1165522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141556
25019	NC_004631	GCG	2	6	1165544	1165549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141556
25020	NC_004631	GCC	2	6	1165601	1165606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141556
25021	NC_004631	GCC	2	6	1165613	1165618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141556
25022	NC_004631	TGC	2	6	1165740	1165745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141556
25023	NC_004631	CAT	2	6	1165777	1165782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141556
25024	NC_004631	CGA	2	6	1165801	1165806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141556
25025	NC_004631	AGGT	2	8	1165890	1165897	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25026	NC_004631	TGC	2	6	1165912	1165917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25027	NC_004631	TAG	2	6	1165996	1166001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25028	NC_004631	T	7	7	1166031	1166037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25029	NC_004631	GGCA	2	8	1166062	1166069	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
25030	NC_004631	AT	3	6	1166128	1166133	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25031	NC_004631	AATT	2	8	1166146	1166153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25032	NC_004631	GGC	2	6	1166179	1166184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25033	NC_004631	GTC	2	6	1166251	1166256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25034	NC_004631	CGG	2	6	1166261	1166266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25035	NC_004631	TTG	2	6	1166344	1166349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25036	NC_004631	CACCAG	2	12	1166365	1166376	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25037	NC_004631	CAG	2	6	1166395	1166400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25038	NC_004631	TCGCTC	2	12	1166430	1166441	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
25039	NC_004631	TAA	2	6	1166444	1166449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141557
25040	NC_004631	GCG	2	6	1166464	1166469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141557
25041	NC_004631	CTGG	2	8	1166581	1166588	0 %	25 %	50 %	25 %	29141557
25042	NC_004631	GA	3	6	1166615	1166620	50 %	0 %	50 %	0 %	29141557
25043	NC_004631	CGG	2	6	1166664	1166669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141557
25044	NC_004631	AGGC	2	8	1166732	1166739	25 %	0 %	50 %	25 %	29141557
25045	NC_004631	GAT	2	6	1166779	1166784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141557
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25052	NC_004631	GCG	2	6	1167126	1167131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141557
25053	NC_004631	G	6	6	1167187	1167192	0 %	0 %	100 %	0 %	29141557
25054	NC_004631	GC	4	8	1167228	1167235	0 %	0 %	50 %	50 %	29141557
25055	NC_004631	GAAG	2	8	1167282	1167289	50 %	0 %	50 %	0 %	29141557
25056	NC_004631	CA	3	6	1167294	1167299	50 %	0 %	0 %	50 %	29141557
25057	NC_004631	ATC	2	6	1167308	1167313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141557
25058	NC_004631	CGG	2	6	1167336	1167341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141557
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25060	NC_004631	AAT	2	6	1167365	1167370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141557
25061	NC_004631	CCCG	2	8	1167373	1167380	0 %	0 %	25 %	75 %	29141557
25062	NC_004631	TTCC	2	8	1167402	1167409	0 %	50 %	0 %	50 %	29141557
25063	NC_004631	GC	3	6	1167457	1167462	0 %	0 %	50 %	50 %	29141557
25064	NC_004631	CAG	2	6	1167538	1167543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141557
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25069	NC_004631	AACC	2	8	1167811	1167818	50 %	0 %	0 %	50 %	409994497
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25085	NC_004631	TATT	2	8	1168765	1168772	25 %	75 %	0 %	0 %	409994497
25086	NC_004631	AAG	2	6	1168822	1168827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409994497
25087	NC_004631	GCG	2	6	1168850	1168855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409994497
25088	NC_004631	CAC	2	6	1169010	1169015	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409994497
25089	NC_004631	A	7	7	1169041	1169047	100 %	0 %	0 %	0 %	409994497
25090	NC_004631	AG	3	6	1169156	1169161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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25093	NC_004631	GCA	2	6	1169587	1169592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141558
25094	NC_004631	GTC	2	6	1169597	1169602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141558
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25096	NC_004631	GC	3	6	1169644	1169649	0 %	0 %	50 %	50 %	29141558
25097	NC_004631	CAG	2	6	1169672	1169677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141558
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25099	NC_004631	CTTCGC	2	12	1169776	1169787	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	29141558
25100	NC_004631	GA	3	6	1169808	1169813	50 %	0 %	50 %	0 %	29141558
25101	NC_004631	TCCCA	2	10	1169838	1169847	20 %	20 %	0 %	60 %	29141558
25102	NC_004631	CAA	2	6	1169900	1169905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141558
25103	NC_004631	CCG	2	6	1169914	1169919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141558
25104	NC_004631	GCC	2	6	1169943	1169948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141558
25105	NC_004631	TCA	2	6	1170009	1170014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141558
25106	NC_004631	CAG	2	6	1170032	1170037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141558
25107	NC_004631	A	6	6	1170041	1170046	100 %	0 %	0 %	0 %	29141558
25108	NC_004631	CTGCG	2	10	1170070	1170079	0 %	20 %	40 %	40 %	29141559
25109	NC_004631	GC	3	6	1170141	1170146	0 %	0 %	50 %	50 %	29141559
25110	NC_004631	GCCACC	2	12	1170236	1170247	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	29141559
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25114	NC_004631	CTT	2	6	1170459	1170464	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141559
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25119	NC_004631	CCG	2	6	1170651	1170656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141560
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25231	NC_004631	A	6	6	1176533	1176538	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25347	NC_004631	TTCA	2	8	1181927	1181934	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25348	NC_004631	AT	3	6	1181982	1181987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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25360	NC_004631	GT	3	6	1182764	1182769	0 %	50 %	50 %	0 %	29141569
25361	NC_004631	AT	3	6	1182835	1182840	50 %	50 %	0 %	0 %	29141569
25362	NC_004631	TCA	2	6	1182878	1182883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141569
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25365	NC_004631	GTC	2	6	1183046	1183051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141570
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25381	NC_004631	CT	4	8	1183738	1183745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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25473	NC_004631	ATTA	2	8	1188225	1188232	50 %	50 %	0 %	0 %	29141575
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