MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_004631	GCT	2	6	1140640	1140645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141531
24502	NC_004631	CCA	2	6	1140651	1140656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141531
24503	NC_004631	GCG	2	6	1140684	1140689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141531
24504	NC_004631	GAC	2	6	1140737	1140742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141531
24505	NC_004631	TGA	2	6	1140796	1140801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141531
24506	NC_004631	GGC	2	6	1140846	1140851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141531
24507	NC_004631	GCCT	2	8	1140939	1140946	0 %	25 %	25 %	50 %	29141531
24508	NC_004631	CCG	2	6	1141002	1141007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141531
24509	NC_004631	GC	3	6	1141036	1141041	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24510	NC_004631	AAC	2	6	1141124	1141129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141532
24511	NC_004631	AC	3	6	1141168	1141173	50 %	0 %	0 %	50 %	29141532
24512	NC_004631	GCC	2	6	1141208	1141213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141532
24513	NC_004631	GCG	2	6	1141215	1141220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141532
24514	NC_004631	GCGT	2	8	1141278	1141285	0 %	25 %	50 %	25 %	29141532
24515	NC_004631	GAT	2	6	1141333	1141338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141532
24516	NC_004631	CGC	2	6	1141405	1141410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141532
24517	NC_004631	CG	3	6	1141417	1141422	0 %	0 %	50 %	50 %	29141532
24518	NC_004631	ATG	2	6	1141614	1141619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141532
24519	NC_004631	GGC	2	6	1141675	1141680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141532
24520	NC_004631	GA	3	6	1141683	1141688	50 %	0 %	50 %	0 %	29141532
24521	NC_004631	GAA	2	6	1141741	1141746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141532
24522	NC_004631	ACT	2	6	1141771	1141776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24523	NC_004631	CAT	2	6	1141832	1141837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24524	NC_004631	TAA	2	6	1141855	1141860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141533
24525	NC_004631	CGC	2	6	1141942	1141947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141533
24526	NC_004631	TGA	2	6	1141966	1141971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141533
24527	NC_004631	GGC	2	6	1142010	1142015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141533
24528	NC_004631	CAG	2	6	1142037	1142042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141533
24529	NC_004631	GCG	2	6	1142083	1142088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141533
24530	NC_004631	CG	3	6	1142087	1142092	0 %	0 %	50 %	50 %	29141533
24531	NC_004631	CG	3	6	1142113	1142118	0 %	0 %	50 %	50 %	29141533
24532	NC_004631	AGTT	2	8	1142173	1142180	25 %	50 %	25 %	0 %	29141533
24533	NC_004631	CAG	2	6	1142286	1142291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141533
24534	NC_004631	GTC	2	6	1142292	1142297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141533
24535	NC_004631	CGAT	2	8	1142311	1142318	25 %	25 %	25 %	25 %	29141533
24536	NC_004631	CGG	2	6	1142330	1142335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141533
24537	NC_004631	ATA	2	6	1142479	1142484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24538	NC_004631	AAAT	2	8	1142486	1142493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24539	NC_004631	TAAT	2	8	1142524	1142531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24540	NC_004631	TGA	2	6	1142587	1142592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24541	NC_004631	CGA	2	6	1142593	1142598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24542	NC_004631	GAA	2	6	1142624	1142629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141534
24543	NC_004631	CTG	2	6	1142650	1142655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141534
24544	NC_004631	CGG	2	6	1142662	1142667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141534
24545	NC_004631	GCG	2	6	1142715	1142720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141534
24546	NC_004631	AGA	2	6	1142783	1142788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141534
24547	NC_004631	ACA	2	6	1142816	1142821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141534
24548	NC_004631	A	6	6	1142835	1142840	100 %	0 %	0 %	0 %	29141534
24549	NC_004631	TGA	2	6	1142857	1142862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141534
24550	NC_004631	CGC	2	6	1142947	1142952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141534
24551	NC_004631	GCG	2	6	1142980	1142985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141534
24552	NC_004631	CGG	2	6	1142986	1142991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141534
24553	NC_004631	ATT	2	6	1142997	1143002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141534
24554	NC_004631	GTT	2	6	1143108	1143113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141534
24555	NC_004631	GC	3	6	1143184	1143189	0 %	0 %	50 %	50 %	29141534
24556	NC_004631	ACG	2	6	1143270	1143275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141534
24557	NC_004631	GCT	2	6	1143353	1143358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141534
24558	NC_004631	TGGG	2	8	1143445	1143452	0 %	25 %	75 %	0 %	29141534
24559	NC_004631	CTG	2	6	1143459	1143464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141534
24560	NC_004631	AAT	2	6	1143564	1143569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141534
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24562	NC_004631	CGG	3	9	1143614	1143622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141534
24563	NC_004631	CGT	2	6	1143638	1143643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141534
24564	NC_004631	CTG	2	6	1143678	1143683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141534
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24567	NC_004631	AAGA	2	8	1143981	1143988	75 %	0 %	25 %	0 %	29141534
24568	NC_004631	GCA	2	6	1144046	1144051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141534
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24571	NC_004631	GCG	2	6	1144099	1144104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141534
24572	NC_004631	AAGA	2	8	1144128	1144135	75 %	0 %	25 %	0 %	29141534
24573	NC_004631	TGAC	2	8	1144144	1144151	25 %	25 %	25 %	25 %	29141534
24574	NC_004631	ACG	2	6	1144256	1144261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141534
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24576	NC_004631	T	8	8	1144348	1144355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24577	NC_004631	TG	3	6	1144423	1144428	0 %	50 %	50 %	0 %	29141535
24578	NC_004631	GATC	2	8	1144541	1144548	25 %	25 %	25 %	25 %	29141535
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24585	NC_004631	TGA	2	6	1144919	1144924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141535
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24592	NC_004631	CG	3	6	1145120	1145125	0 %	0 %	50 %	50 %	29141535
24593	NC_004631	TGG	2	6	1145212	1145217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141535
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24596	NC_004631	ACG	2	6	1145507	1145512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141535
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24598	NC_004631	AAT	2	6	1145558	1145563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24599	NC_004631	A	7	7	1145566	1145572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24600	NC_004631	A	6	6	1145574	1145579	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24601	NC_004631	TTC	2	6	1145586	1145591	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24602	NC_004631	T	6	6	1145596	1145601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24603	NC_004631	CGTTA	2	10	1145656	1145665	20 %	40 %	20 %	20 %	29141536
24604	NC_004631	AAT	2	6	1145781	1145786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141536
24605	NC_004631	GA	3	6	1145870	1145875	50 %	0 %	50 %	0 %	29141536
24606	NC_004631	A	7	7	1145875	1145881	100 %	0 %	0 %	0 %	29141536
24607	NC_004631	TCC	2	6	1145902	1145907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29141537
24608	NC_004631	TCT	2	6	1145931	1145936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141537
24609	NC_004631	CTT	2	6	1145937	1145942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141537
24610	NC_004631	TTC	2	6	1145962	1145967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141537
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24652	NC_004631	GGT	2	6	1147964	1147969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141540
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24714	NC_004631	CCTG	2	8	1151178	1151185	0 %	25 %	25 %	50 %	29141546
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24728	NC_004631	TCG	2	6	1151847	1151852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141546
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24731	NC_004631	GCCA	2	8	1152001	1152008	25 %	0 %	25 %	50 %	29141546
24732	NC_004631	GAT	2	6	1152020	1152025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141546
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24734	NC_004631	TGCA	2	8	1152083	1152090	25 %	25 %	25 %	25 %	29141546
24735	NC_004631	TCA	2	6	1152091	1152096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141546
24736	NC_004631	GTC	2	6	1152158	1152163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141546
24737	NC_004631	CGC	2	6	1152181	1152186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141546
24738	NC_004631	CAC	2	6	1152239	1152244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141546
24739	NC_004631	ACG	2	6	1152249	1152254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141546
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24976	NC_004631	CGCC	2	8	1163368	1163375	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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24980	NC_004631	ATCC	2	8	1163480	1163487	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24981	NC_004631	GGC	2	6	1163513	1163518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24982	NC_004631	GGC	2	6	1163554	1163559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24983	NC_004631	GGGCG	2	10	1163604	1163613	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
24984	NC_004631	TCC	2	6	1163652	1163657	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24985	NC_004631	GAC	2	6	1163663	1163668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24986	NC_004631	TTG	2	6	1163678	1163683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24987	NC_004631	TCCA	2	8	1163709	1163716	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24988	NC_004631	AAAG	2	8	1163804	1163811	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24989	NC_004631	GTA	2	6	1163831	1163836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24990	NC_004631	AGT	2	6	1163962	1163967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24991	NC_004631	CAA	2	6	1164154	1164159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24992	NC_004631	CAT	2	6	1164286	1164291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24999	NC_004631	GC	4	8	1164594	1164601	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25000	NC_004631	A	6	6	1164624	1164629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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