MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2004	NC_004631	ATG	2	6	92619	92624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140622
2005	NC_004631	GCC	2	6	92663	92668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140622
2006	NC_004631	CCG	2	6	92699	92704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140622
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2014	NC_004631	CGG	2	6	93029	93034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140622
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2062	NC_004631	AT	3	6	95630	95635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_004631	TAA	2	6	95718	95723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2132	NC_004631	TCTGT	2	10	98887	98896	0 %	60 %	20 %	20 %	29140631
2133	NC_004631	AATG	2	8	98980	98987	50 %	25 %	25 %	0 %	29140631
2134	NC_004631	TGG	2	6	99066	99071	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140631
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2137	NC_004631	GCC	2	6	99089	99094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140631
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2141	NC_004631	GCGCT	2	10	99197	99206	0 %	20 %	40 %	40 %	29140631
2142	NC_004631	CG	3	6	99211	99216	0 %	0 %	50 %	50 %	29140631
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2144	NC_004631	CTG	2	6	99332	99337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140631
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2167	NC_004631	TCTGT	2	10	100216	100225	0 %	60 %	20 %	20 %	29140631
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2241	NC_004631	CCCAA	2	10	104521	104530	40 %	0 %	0 %	60 %	29140637
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2251	NC_004631	CGT	2	6	104968	104973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140637
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2254	NC_004631	CGA	2	6	105108	105113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140637
2255	NC_004631	GTT	2	6	105119	105124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140637
2256	NC_004631	ATC	2	6	105141	105146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140637
2257	NC_004631	TTGTT	2	10	105228	105237	0 %	80 %	20 %	0 %	29140637
2258	NC_004631	TCT	2	6	105292	105297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140637
2259	NC_004631	TGG	2	6	105345	105350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140637
2260	NC_004631	CGT	2	6	105361	105366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140637
2261	NC_004631	GCT	2	6	105373	105378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140637
2262	NC_004631	CCTG	2	8	105381	105388	0 %	25 %	25 %	50 %	29140637
2263	NC_004631	ACG	2	6	105441	105446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140637
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2270	NC_004631	GTT	2	6	105726	105731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140638
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2378	NC_004631	CGG	2	6	111100	111105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140641
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2381	NC_004631	CCA	2	6	111242	111247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140641
2382	NC_004631	CG	3	6	111327	111332	0 %	0 %	50 %	50 %	29140641
2383	NC_004631	CGGCAG	2	12	111374	111385	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	29140641
2384	NC_004631	TCA	2	6	111492	111497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140641
2385	NC_004631	GGC	2	6	111500	111505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140641
2386	NC_004631	CGT	2	6	111511	111516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140641
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2391	NC_004631	CAG	3	9	111761	111769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140641
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2473	NC_004631	ATC	2	6	115557	115562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140643
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2483	NC_004631	TGA	2	6	116019	116024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140644
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2486	NC_004631	A	6	6	116344	116349	100 %	0 %	0 %	0 %	29140644
2487	NC_004631	GCC	2	6	116394	116399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140644
2488	NC_004631	TGGG	2	8	116434	116441	0 %	25 %	75 %	0 %	29140644
2489	NC_004631	TCAG	2	8	116493	116500	25 %	25 %	25 %	25 %	29140644
2490	NC_004631	GTTGAA	2	12	116531	116542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140644
2491	NC_004631	CA	3	6	116558	116563	50 %	0 %	0 %	50 %	29140644
2492	NC_004631	ACGGT	2	10	116619	116628	20 %	20 %	40 %	20 %	29140644
2493	NC_004631	ACCA	2	8	116631	116638	50 %	0 %	0 %	50 %	29140644
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2496	NC_004631	CAG	2	6	116880	116885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140644
2497	NC_004631	GCC	2	6	116961	116966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140644
2498	NC_004631	TGGCG	2	10	116987	116996	0 %	20 %	60 %	20 %	29140644
2499	NC_004631	GAAA	2	8	117061	117068	75 %	0 %	25 %	0 %	29140644
2500	NC_004631	TG	3	6	117091	117096	0 %	50 %	50 %	0 %	29140644

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