MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_004631	CCG	2	6	1065754	1065759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141457
23003	NC_004631	TCG	2	6	1065763	1065768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141457
23004	NC_004631	GC	3	6	1065790	1065795	0 %	0 %	50 %	50 %	29141457
23005	NC_004631	TCT	2	6	1065811	1065816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141457
23006	NC_004631	A	6	6	1065831	1065836	100 %	0 %	0 %	0 %	29141457
23007	NC_004631	GC	3	6	1065856	1065861	0 %	0 %	50 %	50 %	29141457
23008	NC_004631	CGA	2	6	1065896	1065901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141457
23009	NC_004631	GAC	2	6	1065948	1065953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141457
23010	NC_004631	CTGAA	2	10	1066015	1066024	40 %	20 %	20 %	20 %	29141457
23011	NC_004631	GAA	2	6	1066035	1066040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141457
23012	NC_004631	GTGG	2	8	1066083	1066090	0 %	25 %	75 %	0 %	29141457
23013	NC_004631	GCA	2	6	1066121	1066126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141457
23014	NC_004631	GAGCAG	2	12	1066155	1066166	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	29141457
23015	NC_004631	CGC	3	9	1066210	1066218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141457
23016	NC_004631	CCG	3	9	1066309	1066317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141457
23017	NC_004631	TGA	2	6	1066324	1066329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141457
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23020	NC_004631	CGG	2	6	1066447	1066452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23021	NC_004631	TCA	2	6	1066469	1066474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23022	NC_004631	GCG	2	6	1066479	1066484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23023	NC_004631	CAA	2	6	1066497	1066502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23024	NC_004631	TGG	2	6	1066549	1066554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141458
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23026	NC_004631	CAGT	2	8	1066620	1066627	25 %	25 %	25 %	25 %	29141458
23027	NC_004631	GCA	2	6	1066633	1066638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141458
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23033	NC_004631	GC	3	6	1066969	1066974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23034	NC_004631	T	7	7	1066975	1066981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23035	NC_004631	ATT	2	6	1067075	1067080	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141459
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23039	NC_004631	TCGC	2	8	1067202	1067209	0 %	25 %	25 %	50 %	29141459
23040	NC_004631	GTGG	2	8	1067213	1067220	0 %	25 %	75 %	0 %	29141459
23041	NC_004631	TGA	2	6	1067221	1067226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141459
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23053	NC_004631	CGG	2	6	1067751	1067756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23054	NC_004631	ATT	2	6	1067777	1067782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141460
23055	NC_004631	GAT	2	6	1067885	1067890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141460
23056	NC_004631	ATC	2	6	1067933	1067938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141460
23057	NC_004631	GAA	2	6	1067986	1067991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141460
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23069	NC_004631	ATG	2	6	1068613	1068618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141461
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23103	NC_004631	TGT	2	6	1069762	1069767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141462
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23106	NC_004631	TTA	2	6	1069817	1069822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23110	NC_004631	CGT	2	6	1070028	1070033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23111	NC_004631	T	7	7	1070104	1070110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23112	NC_004631	ATT	2	6	1070176	1070181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141463
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23120	NC_004631	AAG	2	6	1070636	1070641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141463
23121	NC_004631	TGC	2	6	1070646	1070651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141463
23122	NC_004631	TGG	2	6	1070654	1070659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141463
23123	NC_004631	AAG	2	6	1070678	1070683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141463
23124	NC_004631	GTAA	2	8	1070695	1070702	50 %	25 %	25 %	0 %	29141463
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23127	NC_004631	CAG	2	6	1070800	1070805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141464
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23131	NC_004631	ATG	2	6	1071094	1071099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141464
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23140	NC_004631	GC	3	6	1071397	1071402	0 %	0 %	50 %	50 %	29141464
23141	NC_004631	GC	3	6	1071420	1071425	0 %	0 %	50 %	50 %	29141464
23142	NC_004631	CGC	2	6	1071430	1071435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141464
23143	NC_004631	CTG	2	6	1071579	1071584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141464
23144	NC_004631	TTC	2	6	1071600	1071605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141464
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23147	NC_004631	GC	3	6	1071740	1071745	0 %	0 %	50 %	50 %	29141464
23148	NC_004631	CGC	2	6	1071766	1071771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141464
23149	NC_004631	TCA	2	6	1071804	1071809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23150	NC_004631	AGCGC	2	10	1071837	1071846	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23151	NC_004631	AC	3	6	1071856	1071861	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23152	NC_004631	TCA	2	6	1071881	1071886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141465
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23154	NC_004631	CA	3	6	1071911	1071916	50 %	0 %	0 %	50 %	29141465
23155	NC_004631	CGCC	2	8	1072004	1072011	0 %	0 %	25 %	75 %	29141465
23156	NC_004631	CG	3	6	1072039	1072044	0 %	0 %	50 %	50 %	29141465
23157	NC_004631	GCG	2	6	1072048	1072053	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141465
23158	NC_004631	CAG	2	6	1072062	1072067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141465
23159	NC_004631	AGC	2	6	1072138	1072143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141465
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23171	NC_004631	ATG	2	6	1072811	1072816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141466
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23177	NC_004631	ACGTAA	2	12	1073123	1073134	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	29141466
23178	NC_004631	TCA	2	6	1073229	1073234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141466
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23180	NC_004631	AAACT	2	10	1073386	1073395	60 %	20 %	0 %	20 %	29141466
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23182	NC_004631	CTT	2	6	1073498	1073503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161486810
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23190	NC_004631	GAT	3	9	1073834	1073842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161486810
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23215	NC_004631	TG	3	6	1075788	1075793	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23216	NC_004631	TGTTT	2	10	1075799	1075808	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23217	NC_004631	TG	3	6	1075809	1075814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23218	NC_004631	CAG	2	6	1075857	1075862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23219	NC_004631	A	8	8	1075885	1075892	100 %	0 %	0 %	0 %	29141469
23220	NC_004631	CAT	2	6	1075997	1076002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141469
23221	NC_004631	TCG	2	6	1076061	1076066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141469
23222	NC_004631	TAAT	2	8	1076075	1076082	50 %	50 %	0 %	0 %	29141469
23223	NC_004631	CGC	2	6	1076153	1076158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141469
23224	NC_004631	GAT	2	6	1076169	1076174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141469
23225	NC_004631	A	7	7	1076200	1076206	100 %	0 %	0 %	0 %	29141469
23226	NC_004631	GAG	2	6	1076245	1076250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141469
23227	NC_004631	CGT	2	6	1076254	1076259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141469
23228	NC_004631	ACG	2	6	1076261	1076266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141469
23229	NC_004631	A	6	6	1076339	1076344	100 %	0 %	0 %	0 %	29141469
23230	NC_004631	GGC	2	6	1076346	1076351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141469
23231	NC_004631	GC	3	6	1076431	1076436	0 %	0 %	50 %	50 %	29141469
23232	NC_004631	TAC	2	6	1076488	1076493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141469
23233	NC_004631	CTGC	2	8	1076563	1076570	0 %	25 %	25 %	50 %	29141469
23234	NC_004631	TGA	2	6	1076582	1076587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141469
23235	NC_004631	GAC	2	6	1076692	1076697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141469
23236	NC_004631	AAAT	2	8	1076842	1076849	75 %	25 %	0 %	0 %	29141469
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23238	NC_004631	TGA	2	6	1076897	1076902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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23358	NC_004631	CGG	2	6	1082657	1082662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141473
23359	NC_004631	GC	3	6	1082690	1082695	0 %	0 %	50 %	50 %	29141473
23360	NC_004631	ATG	2	6	1082770	1082775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141473
23361	NC_004631	TGC	2	6	1082776	1082781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141473
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23377	NC_004631	AC	3	6	1083223	1083228	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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23466	NC_004631	CGT	2	6	1087431	1087436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141479
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23475	NC_004631	GTACC	2	10	1087868	1087877	20 %	20 %	20 %	40 %	29141479
23476	NC_004631	CG	3	6	1087918	1087923	0 %	0 %	50 %	50 %	29141479
23477	NC_004631	ACGTG	2	10	1088062	1088071	20 %	20 %	40 %	20 %	29141479
23478	NC_004631	TTC	2	6	1088120	1088125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141479
23479	NC_004631	GAC	2	6	1088129	1088134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141479
23480	NC_004631	TGGATA	2	12	1088155	1088166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141479
23481	NC_004631	ACG	2	6	1088174	1088179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141479
23482	NC_004631	ATC	2	6	1088287	1088292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141479
23483	NC_004631	TTACGG	2	12	1088330	1088341	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	29141479
23484	NC_004631	CAG	3	9	1088372	1088380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141479
23485	NC_004631	CGG	3	9	1088432	1088440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141479
23486	NC_004631	GCA	2	6	1088450	1088455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141479
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23489	NC_004631	GCGG	2	8	1088580	1088587	0 %	0 %	75 %	25 %	29141479
23490	NC_004631	AACG	2	8	1088610	1088617	50 %	0 %	25 %	25 %	29141479
23491	NC_004631	TTG	2	6	1088656	1088661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141479
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23493	NC_004631	CTG	2	6	1088808	1088813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141479
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23495	NC_004631	GTGG	2	8	1088864	1088871	0 %	25 %	75 %	0 %	29141479
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23497	NC_004631	GGT	2	6	1088940	1088945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141479
23498	NC_004631	CG	4	8	1089037	1089044	0 %	0 %	50 %	50 %	29141479
23499	NC_004631	TGC	2	6	1089089	1089094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141480
23500	NC_004631	TTA	2	6	1089169	1089174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141480

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