MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_004631	CG	3	6	997721	997726	0 %	0 %	50 %	50 %	29141386
21503	NC_004631	GCTG	2	8	997740	997747	0 %	25 %	50 %	25 %	29141386
21504	NC_004631	GCC	3	9	997810	997818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141386
21505	NC_004631	AAT	2	6	997830	997835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141386
21506	NC_004631	GCG	2	6	997865	997870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141386
21507	NC_004631	TCA	2	6	997913	997918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141386
21508	NC_004631	ACG	2	6	997931	997936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141387
21509	NC_004631	TAA	2	6	997954	997959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141387
21510	NC_004631	TACG	2	8	997969	997976	25 %	25 %	25 %	25 %	29141387
21511	NC_004631	ACG	2	6	997992	997997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141387
21512	NC_004631	CGCC	2	8	998050	998057	0 %	0 %	25 %	75 %	29141387
21513	NC_004631	CGA	2	6	998071	998076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141387
21514	NC_004631	GCA	2	6	998095	998100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141387
21515	NC_004631	CGC	3	9	998197	998205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141387
21516	NC_004631	CGG	2	6	998227	998232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141387
21517	NC_004631	TGG	2	6	998242	998247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141387
21518	NC_004631	T	6	6	998252	998257	0 %	100 %	0 %	0 %	29141387
21519	NC_004631	ATC	2	6	998282	998287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141387
21520	NC_004631	CGGA	2	8	998308	998315	25 %	0 %	50 %	25 %	29141387
21521	NC_004631	AAT	2	6	998455	998460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141388
21522	NC_004631	CCA	2	6	998547	998552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141388
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21524	NC_004631	CAG	2	6	998641	998646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141388
21525	NC_004631	CAGA	2	8	998677	998684	50 %	0 %	25 %	25 %	29141388
21526	NC_004631	GAC	2	6	998734	998739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141388
21527	NC_004631	GGT	2	6	998755	998760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141388
21528	NC_004631	TGA	2	6	998871	998876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141388
21529	NC_004631	CGC	2	6	998934	998939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141388
21530	NC_004631	TAA	2	6	998958	998963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141388
21531	NC_004631	ACC	2	6	998984	998989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141388
21532	NC_004631	TCAGGT	2	12	999021	999032	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	29141388
21533	NC_004631	GCG	2	6	999109	999114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141388
21534	NC_004631	CAG	2	6	999115	999120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141388
21535	NC_004631	AAT	2	6	999125	999130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141388
21536	NC_004631	TAA	2	6	999162	999167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141388
21537	NC_004631	CACG	2	8	999189	999196	25 %	0 %	25 %	50 %	29141388
21538	NC_004631	ATCGCT	2	12	999232	999243	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29141388
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21540	NC_004631	GCG	2	6	999403	999408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141389
21541	NC_004631	GGC	2	6	999428	999433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141389
21542	NC_004631	TTTG	2	8	999442	999449	0 %	75 %	25 %	0 %	29141389
21543	NC_004631	CGG	2	6	999469	999474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141389
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21545	NC_004631	GC	3	6	999540	999545	0 %	0 %	50 %	50 %	29141389
21546	NC_004631	ACA	2	6	999583	999588	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141389
21547	NC_004631	A	6	6	999632	999637	100 %	0 %	0 %	0 %	29141389
21548	NC_004631	GCGG	2	8	999645	999652	0 %	0 %	75 %	25 %	29141389
21549	NC_004631	TGC	3	9	999687	999695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141389
21550	NC_004631	GGC	2	6	999728	999733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141389
21551	NC_004631	AGTC	2	8	999796	999803	25 %	25 %	25 %	25 %	29141389
21552	NC_004631	CG	4	8	999939	999946	0 %	0 %	50 %	50 %	29141390
21553	NC_004631	ATC	2	6	999982	999987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141390
21554	NC_004631	TG	3	6	1000006	1000011	0 %	50 %	50 %	0 %	29141390
21555	NC_004631	TGT	2	6	1000028	1000033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141390
21556	NC_004631	CTG	3	9	1000045	1000053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141390
21557	NC_004631	TAC	2	6	1000077	1000082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141390
21558	NC_004631	GGC	2	6	1000135	1000140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141390
21559	NC_004631	GCGCG	2	10	1000146	1000155	0 %	0 %	60 %	40 %	29141390
21560	NC_004631	GCG	2	6	1000167	1000172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141390
21561	NC_004631	GC	3	6	1000257	1000262	0 %	0 %	50 %	50 %	29141390
21562	NC_004631	CTG	2	6	1000294	1000299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141390
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21564	NC_004631	GC	3	6	1000335	1000340	0 %	0 %	50 %	50 %	29141390
21565	NC_004631	GCGGTT	2	12	1000368	1000379	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	29141390
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21588	NC_004631	GCT	2	6	1001261	1001266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141391
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21591	NC_004631	TTC	2	6	1001469	1001474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141391
21592	NC_004631	CGC	2	6	1001514	1001519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141391
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21595	NC_004631	CCT	2	6	1001589	1001594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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21597	NC_004631	TCC	2	6	1001641	1001646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29141392
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21599	NC_004631	GGC	2	6	1001903	1001908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141392
21600	NC_004631	GACAA	2	10	1001911	1001920	60 %	0 %	20 %	20 %	29141392
21601	NC_004631	TTG	2	6	1001964	1001969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141392
21602	NC_004631	GTC	2	6	1001970	1001975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141392
21603	NC_004631	GCC	3	9	1002012	1002020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141392
21604	NC_004631	TGG	2	6	1002089	1002094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141392
21605	NC_004631	GGC	2	6	1002219	1002224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141392
21606	NC_004631	GCA	2	6	1002236	1002241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141392
21607	NC_004631	GCG	2	6	1002242	1002247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141392
21608	NC_004631	CCG	2	6	1002254	1002259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141392
21609	NC_004631	GCG	2	6	1002262	1002267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141392
21610	NC_004631	CAC	2	6	1002270	1002275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141392
21611	NC_004631	CG	4	8	1002280	1002287	0 %	0 %	50 %	50 %	29141392
21612	NC_004631	GT	3	6	1002374	1002379	0 %	50 %	50 %	0 %	29141392
21613	NC_004631	GC	3	6	1002381	1002386	0 %	0 %	50 %	50 %	29141392
21614	NC_004631	CAT	2	6	1002387	1002392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141392
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21617	NC_004631	GCAG	2	8	1002574	1002581	25 %	0 %	50 %	25 %	29141392
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21619	NC_004631	GGGCC	2	10	1002626	1002635	0 %	0 %	60 %	40 %	29141392
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21733	NC_004631	ACT	2	6	1007269	1007274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141397
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