MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_004631	CGT	2	6	860073	860078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141270
18502	NC_004631	CGG	2	6	860120	860125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141270
18503	NC_004631	TCG	2	6	860134	860139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141270
18504	NC_004631	TTGA	2	8	860184	860191	25 %	50 %	25 %	0 %	29141270
18505	NC_004631	TGGC	2	8	860249	860256	0 %	25 %	50 %	25 %	29141270
18506	NC_004631	TAA	2	6	860381	860386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141270
18507	NC_004631	GCG	2	6	860388	860393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141270
18508	NC_004631	A	6	6	860514	860519	100 %	0 %	0 %	0 %	29141271
18509	NC_004631	GCG	2	6	860526	860531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141271
18510	NC_004631	ATC	2	6	860603	860608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141271
18511	NC_004631	ACC	2	6	860613	860618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141271
18512	NC_004631	GGT	2	6	860779	860784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141271
18513	NC_004631	GCGAT	2	10	860796	860805	20 %	20 %	40 %	20 %	29141271
18514	NC_004631	GCA	2	6	860884	860889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141271
18515	NC_004631	CG	3	6	860894	860899	0 %	0 %	50 %	50 %	29141271
18516	NC_004631	GCT	2	6	861052	861057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141271
18517	NC_004631	CGG	2	6	861150	861155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141271
18518	NC_004631	TGT	2	6	861259	861264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141271
18519	NC_004631	GCC	2	6	861265	861270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141271
18520	NC_004631	CAT	2	6	861286	861291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141271
18521	NC_004631	GTG	2	6	861374	861379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141271
18522	NC_004631	GCT	2	6	861502	861507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141271
18523	NC_004631	GCT	2	6	861535	861540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141271
18524	NC_004631	GC	3	6	861551	861556	0 %	0 %	50 %	50 %	29141271
18525	NC_004631	GGC	2	6	861620	861625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141271
18526	NC_004631	TGG	2	6	861663	861668	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141271
18527	NC_004631	ATC	2	6	861674	861679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141271
18528	NC_004631	TGA	2	6	861702	861707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141271
18529	NC_004631	TC	3	6	861769	861774	0 %	50 %	0 %	50 %	29141271
18530	NC_004631	TTA	2	6	861786	861791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141271
18531	NC_004631	TTTTA	2	10	861877	861886	20 %	80 %	0 %	0 %	29141271
18532	NC_004631	ATT	2	6	861890	861895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141271
18533	NC_004631	T	6	6	861894	861899	0 %	100 %	0 %	0 %	29141271
18534	NC_004631	TTG	2	6	861936	861941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141271
18535	NC_004631	A	6	6	861948	861953	100 %	0 %	0 %	0 %	29141271
18536	NC_004631	TTA	2	6	861962	861967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141271
18537	NC_004631	ATT	2	6	862006	862011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18538	NC_004631	CA	3	6	862025	862030	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18539	NC_004631	GTG	2	6	862041	862046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18540	NC_004631	GATG	2	8	862105	862112	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18541	NC_004631	TGA	2	6	862113	862118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18542	NC_004631	TCC	2	6	862136	862141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18543	NC_004631	ATT	2	6	862160	862165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18544	NC_004631	CAG	2	6	862196	862201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18545	NC_004631	GCG	2	6	862202	862207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18546	NC_004631	CGT	2	6	862243	862248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18547	NC_004631	AGGA	2	8	862283	862290	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18548	NC_004631	TGG	2	6	862457	862462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18549	NC_004631	TGA	2	6	862567	862572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18550	NC_004631	CCG	2	6	862573	862578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18551	NC_004631	ACG	2	6	862642	862647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18552	NC_004631	GCA	2	6	862670	862675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18553	NC_004631	CTGG	2	8	862676	862683	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18554	NC_004631	CG	3	6	862691	862696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18555	NC_004631	CAC	2	6	862754	862759	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18556	NC_004631	CAG	2	6	862761	862766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18557	NC_004631	ATCG	2	8	862851	862858	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18558	NC_004631	ATTA	2	8	863052	863059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18559	NC_004631	CCG	2	6	863071	863076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18560	NC_004631	GCA	2	6	863084	863089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18561	NC_004631	GTG	2	6	863151	863156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18562	NC_004631	TCAA	2	8	863167	863174	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18563	NC_004631	GAG	2	6	863214	863219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18564	NC_004631	GAT	2	6	863237	863242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18572	NC_004631	CGG	2	6	863670	863675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141272
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18579	NC_004631	A	6	6	863975	863980	100 %	0 %	0 %	0 %	29141272
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18588	NC_004631	CAG	2	6	864449	864454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141272
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18590	NC_004631	GGT	2	6	864501	864506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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18594	NC_004631	CGG	2	6	864637	864642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141273
18595	NC_004631	GT	3	6	864711	864716	0 %	50 %	50 %	0 %	29141273
18596	NC_004631	GCG	2	6	864729	864734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141273
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18602	NC_004631	GC	3	6	865048	865053	0 %	0 %	50 %	50 %	29141273
18603	NC_004631	ATTG	2	8	865158	865165	25 %	50 %	25 %	0 %	29141273
18604	NC_004631	A	6	6	865250	865255	100 %	0 %	0 %	0 %	29141273
18605	NC_004631	TGG	2	6	865261	865266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141273
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18608	NC_004631	TTAAA	2	10	865516	865525	60 %	40 %	0 %	0 %	29141273
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18613	NC_004631	GTT	2	6	865945	865950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18614	NC_004631	CAT	2	6	865997	866002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18615	NC_004631	GCA	2	6	866011	866016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18616	NC_004631	GAA	2	6	866079	866084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18617	NC_004631	ATG	2	6	866088	866093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141274
18618	NC_004631	TGCC	2	8	866140	866147	0 %	25 %	25 %	50 %	29141274
18619	NC_004631	TCG	2	6	866179	866184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141274
18620	NC_004631	GAT	2	6	866192	866197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141274
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18622	NC_004631	AGC	2	6	866320	866325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141274
18623	NC_004631	ATCT	2	8	866357	866364	25 %	50 %	0 %	25 %	29141274
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18625	NC_004631	ATT	3	9	866484	866492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141274
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18998	NC_004631	GAT	2	6	883228	883233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141289
18999	NC_004631	ATT	2	6	883234	883239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141289
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