MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

< Previous12...3233343536373839404142...201202Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_004631	GCG	2	6	835828	835833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141251
18002	NC_004631	CCG	2	6	835860	835865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141251
18003	NC_004631	TCC	2	6	835929	835934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29141251
18004	NC_004631	AGC	2	6	835935	835940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141251
18005	NC_004631	TTA	2	6	835947	835952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141251
18006	NC_004631	TAA	2	6	835976	835981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141251
18007	NC_004631	GC	3	6	835984	835989	0 %	0 %	50 %	50 %	29141251
18008	NC_004631	GCC	2	6	836005	836010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141251
18009	NC_004631	TCT	2	6	836020	836025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141251
18010	NC_004631	AC	3	6	836069	836074	50 %	0 %	0 %	50 %	29141251
18011	NC_004631	AG	3	6	836227	836232	50 %	0 %	50 %	0 %	29141251
18012	NC_004631	CAG	2	6	836267	836272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141251
18013	NC_004631	GAC	2	6	836279	836284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141251
18014	NC_004631	GTA	2	6	836300	836305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141251
18015	NC_004631	CGC	2	6	836335	836340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141251
18016	NC_004631	TCA	2	6	836593	836598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141251
18017	NC_004631	GGCA	2	8	836603	836610	25 %	0 %	50 %	25 %	29141251
18018	NC_004631	A	6	6	836622	836627	100 %	0 %	0 %	0 %	29141251
18019	NC_004631	AGC	2	6	836673	836678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141251
18020	NC_004631	A	7	7	836724	836730	100 %	0 %	0 %	0 %	29141251
18021	NC_004631	GC	3	6	836941	836946	0 %	0 %	50 %	50 %	29141251
18022	NC_004631	ATA	2	6	836959	836964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141251
18023	NC_004631	GCC	2	6	837023	837028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141251
18024	NC_004631	GCG	2	6	837034	837039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141251
18025	NC_004631	GCC	2	6	837138	837143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141251
18026	NC_004631	ATA	2	6	837147	837152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141251
18027	NC_004631	GGC	2	6	837182	837187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141251
18028	NC_004631	TGC	2	6	837214	837219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141251
18029	NC_004631	CGAG	2	8	837220	837227	25 %	0 %	50 %	25 %	29141251
18030	NC_004631	CAT	2	6	837281	837286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141251
18031	NC_004631	GCG	2	6	837307	837312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141251
18032	NC_004631	ATA	2	6	837334	837339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141251
18033	NC_004631	CTGA	2	8	837539	837546	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18034	NC_004631	TCC	3	9	837572	837580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18035	NC_004631	GCC	2	6	837646	837651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18036	NC_004631	GCT	2	6	837690	837695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18037	NC_004631	C	6	6	837732	837737	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18038	NC_004631	TCA	2	6	837787	837792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141252
18039	NC_004631	TTA	2	6	837916	837921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141252
18040	NC_004631	GAA	2	6	837947	837952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141252
18041	NC_004631	ACTA	2	8	837962	837969	50 %	25 %	0 %	25 %	29141252
18042	NC_004631	GAA	2	6	838105	838110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141252
18043	NC_004631	ATT	2	6	838115	838120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141252
18044	NC_004631	CG	3	6	838147	838152	0 %	0 %	50 %	50 %	29141252
18045	NC_004631	CGC	2	6	838191	838196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141252
18046	NC_004631	CG	3	6	838347	838352	0 %	0 %	50 %	50 %	29141252
18047	NC_004631	CTGG	2	8	838534	838541	0 %	25 %	50 %	25 %	29141253
18048	NC_004631	CGG	2	6	838647	838652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141253
18049	NC_004631	GCG	2	6	838691	838696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141253
18050	NC_004631	TGA	2	6	838707	838712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141253
18051	NC_004631	GCTG	2	8	838818	838825	0 %	25 %	50 %	25 %	29141253
18052	NC_004631	GC	3	6	838971	838976	0 %	0 %	50 %	50 %	29141253
18053	NC_004631	CCGGC	2	10	838995	839004	0 %	0 %	40 %	60 %	29141253
18054	NC_004631	CCG	2	6	839020	839025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141253
18055	NC_004631	CAG	2	6	839048	839053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141253
18056	NC_004631	GAC	2	6	839139	839144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141254
18057	NC_004631	TGA	2	6	839147	839152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141254
18058	NC_004631	TGG	2	6	839168	839173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141254
18059	NC_004631	TTG	2	6	839194	839199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141254
18060	NC_004631	GCA	2	6	839232	839237	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141254
18061	NC_004631	CG	3	6	839244	839249	0 %	0 %	50 %	50 %	29141254
18062	NC_004631	CGCTG	2	10	839279	839288	0 %	20 %	40 %	40 %	29141254
18063	NC_004631	TCA	2	6	839412	839417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141254
18064	NC_004631	CGC	2	6	839465	839470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141254
18065	NC_004631	TGA	2	6	839490	839495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141254
18066	NC_004631	ATA	2	6	839516	839521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141254
18067	NC_004631	ATG	2	6	839612	839617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141254
18068	NC_004631	AGG	2	6	839867	839872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141254
18069	NC_004631	AGC	2	6	839957	839962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141254
18070	NC_004631	CAT	2	6	840019	840024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141254
18071	NC_004631	GGC	2	6	840043	840048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141254
18072	NC_004631	TCGCG	2	10	840095	840104	0 %	20 %	40 %	40 %	29141254
18073	NC_004631	GCC	2	6	840114	840119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141254
18074	NC_004631	CGG	2	6	840143	840148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141254
18075	NC_004631	CGA	2	6	840206	840211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141254
18076	NC_004631	GA	3	6	840272	840277	50 %	0 %	50 %	0 %	29141254
18077	NC_004631	GGAAA	2	10	840467	840476	60 %	0 %	40 %	0 %	29141254
18078	NC_004631	GAAT	2	8	840512	840519	50 %	25 %	25 %	0 %	29141254
18079	NC_004631	GCA	2	6	840534	840539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141254
18080	NC_004631	GCG	3	9	840554	840562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141254
18081	NC_004631	GCA	2	6	840567	840572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141254
18082	NC_004631	CGA	2	6	840654	840659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141254
18083	NC_004631	TCT	2	6	840673	840678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141254
18084	NC_004631	GGC	2	6	840757	840762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141254
18085	NC_004631	GAA	2	6	840957	840962	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141254
18086	NC_004631	GCT	2	6	840963	840968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141254
18087	NC_004631	GCCT	2	8	841029	841036	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18088	NC_004631	AAT	2	6	841156	841161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141255
18089	NC_004631	AAT	2	6	841215	841220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141255
18090	NC_004631	TCC	2	6	841281	841286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29141255
18091	NC_004631	TTC	2	6	841326	841331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141255
18092	NC_004631	GGCG	2	8	841342	841349	0 %	0 %	75 %	25 %	29141255
18093	NC_004631	GCAG	2	8	841488	841495	25 %	0 %	50 %	25 %	29141255
18094	NC_004631	CGC	2	6	841558	841563	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141255
18095	NC_004631	TTG	2	6	841571	841576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141255
18096	NC_004631	GAC	2	6	841595	841600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141255
18097	NC_004631	CAG	2	6	841664	841669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141255
18098	NC_004631	ATG	2	6	841731	841736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141255
18099	NC_004631	ATC	2	6	841776	841781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141255
18100	NC_004631	GTC	2	6	841811	841816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141255
18101	NC_004631	CGG	2	6	841834	841839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141255
18102	NC_004631	T	6	6	841865	841870	0 %	100 %	0 %	0 %	29141255
18103	NC_004631	GAAA	2	8	841929	841936	75 %	0 %	25 %	0 %	29141255
18104	NC_004631	CGG	3	9	841938	841946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141255
18105	NC_004631	GTTG	2	8	841960	841967	0 %	50 %	50 %	0 %	29141255
18106	NC_004631	ATC	2	6	841977	841982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141255
18107	NC_004631	AAACC	2	10	842028	842037	60 %	0 %	0 %	40 %	29141255
18108	NC_004631	CCA	2	6	842044	842049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141255
18109	NC_004631	TGG	2	6	842095	842100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141255
18110	NC_004631	GTT	2	6	842105	842110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141255
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18114	NC_004631	GA	3	6	842225	842230	50 %	0 %	50 %	0 %	29141255
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18116	NC_004631	ACC	2	6	842262	842267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141255
18117	NC_004631	CGTT	2	8	842325	842332	0 %	50 %	25 %	25 %	29141255
18118	NC_004631	TGG	2	6	842341	842346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141255
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18122	NC_004631	ATC	2	6	842481	842486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141255
18123	NC_004631	GC	4	8	842507	842514	0 %	0 %	50 %	50 %	29141255
18124	NC_004631	CGG	2	6	842528	842533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141255
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18127	NC_004631	CGG	2	6	842705	842710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18128	NC_004631	AATGC	2	10	842714	842723	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18129	NC_004631	AAT	2	6	842798	842803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18130	NC_004631	AT	3	6	842811	842816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18131	NC_004631	GTGGA	2	10	842833	842842	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18132	NC_004631	TAAA	2	8	842844	842851	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18133	NC_004631	ATC	2	6	842879	842884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18136	NC_004631	GC	3	6	842985	842990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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18140	NC_004631	T	7	7	843201	843207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18143	NC_004631	ATG	2	6	843321	843326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141256
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18165	NC_004631	CGC	2	6	844726	844731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141257
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18240	NC_004631	CGCGG	2	10	848303	848312	0 %	0 %	60 %	40 %	29141260
18241	NC_004631	TCACG	2	10	848395	848404	20 %	20 %	20 %	40 %	29141260
18242	NC_004631	GTG	2	6	848420	848425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141260
18243	NC_004631	TGG	3	9	848451	848459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141260
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18439	NC_004631	AATAAC	2	12	857516	857527	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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18492	NC_004631	GGA	2	6	859754	859759	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141270
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