MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

< Previous12...3031323334353637383940...201202Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_004631	TCA	2	6	793347	793352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17002	NC_004631	AAT	2	6	793389	793394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17003	NC_004631	TCG	2	6	793406	793411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17004	NC_004631	ATG	2	6	793420	793425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17005	NC_004631	ATT	2	6	793441	793446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17006	NC_004631	ATTA	2	8	793611	793618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17007	NC_004631	ACG	2	6	793642	793647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17008	NC_004631	G	6	6	793702	793707	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17009	NC_004631	TAC	2	6	793715	793720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17010	NC_004631	CGA	2	6	793750	793755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17011	NC_004631	TGA	3	9	793760	793768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17012	NC_004631	GGCA	2	8	793805	793812	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17013	NC_004631	TCA	2	6	793847	793852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17014	NC_004631	GTC	2	6	793934	793939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17015	NC_004631	CGG	2	6	793955	793960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
17016	NC_004631	ACC	2	6	794088	794093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17017	NC_004631	A	6	6	794097	794102	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17018	NC_004631	GGT	2	6	794108	794113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17019	NC_004631	GCC	2	6	794208	794213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17020	NC_004631	CGT	2	6	794228	794233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17021	NC_004631	TTA	2	6	794272	794277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17022	NC_004631	ATG	2	6	794317	794322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17023	NC_004631	TAG	2	6	794323	794328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17024	NC_004631	ATC	2	6	794329	794334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17025	NC_004631	TTG	2	6	794353	794358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17026	NC_004631	TATT	2	8	794374	794381	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17027	NC_004631	CGAA	2	8	794382	794389	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17028	NC_004631	TGA	2	6	794468	794473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17029	NC_004631	GTG	2	6	794498	794503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17030	NC_004631	GGT	2	6	794505	794510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17031	NC_004631	CTTT	2	8	794522	794529	0 %	75 %	0 %	25 %	29141212
17032	NC_004631	TAATT	2	10	794597	794606	40 %	60 %	0 %	0 %	29141212
17033	NC_004631	ATC	2	6	794718	794723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141212
17034	NC_004631	ATA	3	9	794776	794784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141212
17035	NC_004631	GGT	2	6	794894	794899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141212
17036	NC_004631	CTT	2	6	794914	794919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141212
17037	NC_004631	TA	3	6	795127	795132	50 %	50 %	0 %	0 %	29141212
17038	NC_004631	CAA	2	6	795149	795154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141212
17039	NC_004631	ATA	2	6	795166	795171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141212
17040	NC_004631	AAAC	2	8	795207	795214	75 %	0 %	0 %	25 %	29141212
17041	NC_004631	TC	3	6	795236	795241	0 %	50 %	0 %	50 %	29141212
17042	NC_004631	CAG	2	6	795242	795247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141212
17043	NC_004631	GTG	2	6	795280	795285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141212
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17046	NC_004631	CGC	2	6	795400	795405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141212
17047	NC_004631	TGATA	2	10	795413	795422	40 %	40 %	20 %	0 %	29141212
17048	NC_004631	TAT	2	6	795431	795436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141212
17049	NC_004631	TTA	2	6	795443	795448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141212
17050	NC_004631	AT	4	8	795521	795528	50 %	50 %	0 %	0 %	29141212
17051	NC_004631	AT	3	6	795543	795548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17052	NC_004631	TGAA	2	8	795560	795567	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17053	NC_004631	AAT	2	6	795583	795588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17054	NC_004631	CAA	2	6	795688	795693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17055	NC_004631	AGG	2	6	795696	795701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17056	NC_004631	TAA	2	6	795729	795734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17057	NC_004631	A	6	6	795733	795738	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17058	NC_004631	T	7	7	795778	795784	0 %	100 %	0 %	0 %	29141213
17059	NC_004631	GAT	2	6	795788	795793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141213
17060	NC_004631	A	6	6	795794	795799	100 %	0 %	0 %	0 %	29141213
17061	NC_004631	CAT	2	6	795806	795811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141213
17062	NC_004631	TGA	2	6	795818	795823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141213
17063	NC_004631	CGC	2	6	795857	795862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141213
17064	NC_004631	GGC	2	6	796038	796043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141213
17065	NC_004631	GCAA	2	8	796060	796067	50 %	0 %	25 %	25 %	29141213
17066	NC_004631	GC	3	6	796070	796075	0 %	0 %	50 %	50 %	29141213
17067	NC_004631	GCA	2	6	796079	796084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141213
17068	NC_004631	ACTT	2	8	796085	796092	25 %	50 %	0 %	25 %	29141213
17069	NC_004631	GT	3	6	796134	796139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17070	NC_004631	CTG	2	6	796147	796152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17072	NC_004631	GCA	2	6	796225	796230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17073	NC_004631	CCG	2	6	796302	796307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17074	NC_004631	GAC	2	6	796382	796387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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17076	NC_004631	ACC	2	6	796427	796432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17077	NC_004631	CTT	2	6	796480	796485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17078	NC_004631	GCG	2	6	796537	796542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141214
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17080	NC_004631	CGT	2	6	796599	796604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141214
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17086	NC_004631	TCG	2	6	796830	796835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141214
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17093	NC_004631	CGG	2	6	797117	797122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141214
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17096	NC_004631	CTGG	2	8	797194	797201	0 %	25 %	50 %	25 %	29141214
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17112	NC_004631	CGG	2	6	798012	798017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141215
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17250	NC_004631	CTG	2	6	804462	804467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141221
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