MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16502	NC_004631	GAGG	2	8	769980	769987	25 %	0 %	75 %	0 %	29141191
16503	NC_004631	CGC	2	6	770023	770028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141191
16504	NC_004631	G	6	6	770069	770074	0 %	0 %	100 %	0 %	29141191
16505	NC_004631	CAT	2	6	770109	770114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141191
16506	NC_004631	ATGA	2	8	770157	770164	50 %	25 %	25 %	0 %	29141191
16507	NC_004631	AGCC	2	8	770240	770247	25 %	0 %	25 %	50 %	29141191
16508	NC_004631	TCG	2	6	770248	770253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141191
16509	NC_004631	ACC	2	6	770283	770288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141191
16510	NC_004631	CGG	2	6	770309	770314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141191
16511	NC_004631	GGC	2	6	770367	770372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16512	NC_004631	CCA	2	6	770432	770437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409994464
16513	NC_004631	CAC	2	6	770447	770452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409994464
16514	NC_004631	CGC	2	6	770530	770535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	409994464
16515	NC_004631	CAG	2	6	770558	770563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409994464
16516	NC_004631	GC	3	6	770575	770580	0 %	0 %	50 %	50 %	409994464
16517	NC_004631	GGC	2	6	770610	770615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409994464
16518	NC_004631	GGC	2	6	770617	770622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409994464
16519	NC_004631	CAG	2	6	770633	770638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409994464
16520	NC_004631	ACC	2	6	770646	770651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409994464
16521	NC_004631	CATA	2	8	770659	770666	50 %	25 %	0 %	25 %	409994464
16522	NC_004631	GC	3	6	770716	770721	0 %	0 %	50 %	50 %	409994464
16523	NC_004631	ACG	2	6	770750	770755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409994464
16524	NC_004631	CAT	2	6	770807	770812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409994464
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16526	NC_004631	C	6	6	770877	770882	0 %	0 %	0 %	100 %	409994464
16527	NC_004631	TAA	2	6	770947	770952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	409994464
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16529	NC_004631	GCA	2	6	771109	771114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16533	NC_004631	ACG	2	6	771268	771273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141193
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16541	NC_004631	CGCT	2	8	771632	771639	0 %	25 %	25 %	50 %	29141193
16542	NC_004631	TGC	2	6	771662	771667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141193
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16545	NC_004631	ATG	2	6	771796	771801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16547	NC_004631	CG	3	6	771850	771855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16548	NC_004631	TCA	2	6	771875	771880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16552	NC_004631	TGC	2	6	772229	772234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409994465
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16557	NC_004631	TTG	2	6	772361	772366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409994465
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16582	NC_004631	TTCA	2	8	773387	773394	25 %	50 %	0 %	25 %	29141194
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16587	NC_004631	GCATC	2	10	773566	773575	20 %	20 %	20 %	40 %	29141194
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16595	NC_004631	GCGG	2	8	773891	773898	0 %	0 %	75 %	25 %	29141194
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16605	NC_004631	GCCAG	2	10	774259	774268	20 %	0 %	40 %	40 %	29141194
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16610	NC_004631	GCGG	2	8	774515	774522	0 %	0 %	75 %	25 %	29141194
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16619	NC_004631	GA	3	6	774871	774876	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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16994	NC_004631	GTT	2	6	792864	792869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16995	NC_004631	TCC	2	6	792884	792889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16996	NC_004631	CGTG	2	8	792950	792957	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16997	NC_004631	CTGG	2	8	792980	792987	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16998	NC_004631	CCG	2	6	793045	793050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16999	NC_004631	TAA	2	6	793118	793123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17000	NC_004631	TAA	2	6	793292	793297	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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