MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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16002	NC_004631	AATAA	2	10	746132	746141	80 %	20 %	0 %	0 %	29141170
16003	NC_004631	CG	3	6	746196	746201	0 %	0 %	50 %	50 %	29141170
16004	NC_004631	CGG	2	6	746215	746220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141170
16005	NC_004631	GGCT	2	8	746289	746296	0 %	25 %	50 %	25 %	29141170
16006	NC_004631	GCC	2	6	746471	746476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141170
16007	NC_004631	TGGC	2	8	746574	746581	0 %	25 %	50 %	25 %	29141170
16008	NC_004631	TG	3	6	746592	746597	0 %	50 %	50 %	0 %	29141170
16009	NC_004631	TCG	2	6	746643	746648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141170
16010	NC_004631	CTG	2	6	746704	746709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141170
16011	NC_004631	GC	3	6	746719	746724	0 %	0 %	50 %	50 %	29141170
16012	NC_004631	TGG	2	6	746731	746736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141170
16013	NC_004631	TCA	2	6	746745	746750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141170
16014	NC_004631	CAGTA	2	10	746772	746781	40 %	20 %	20 %	20 %	29141170
16015	NC_004631	CGG	2	6	746807	746812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141170
16016	NC_004631	GGC	2	6	746849	746854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141170
16017	NC_004631	ATG	2	6	746855	746860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141170
16018	NC_004631	GCT	2	6	746869	746874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141170
16019	NC_004631	GCC	2	6	746879	746884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141170
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16021	NC_004631	ATA	2	6	746962	746967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16022	NC_004631	ATT	2	6	746971	746976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16023	NC_004631	TCA	2	6	747023	747028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16024	NC_004631	CAA	2	6	747117	747122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16025	NC_004631	AAT	2	6	747165	747170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16026	NC_004631	AAG	2	6	747260	747265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141171
16027	NC_004631	CGC	2	6	747308	747313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141171
16028	NC_004631	CGC	2	6	747431	747436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141171
16029	NC_004631	AAAAT	2	10	747515	747524	80 %	20 %	0 %	0 %	29141171
16030	NC_004631	TTC	2	6	747673	747678	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141171
16031	NC_004631	CAA	2	6	747712	747717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141171
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16033	NC_004631	GC	3	6	747796	747801	0 %	0 %	50 %	50 %	29141171
16034	NC_004631	ACG	4	12	747826	747837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141171
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16036	NC_004631	CAT	2	6	747901	747906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141171
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16039	NC_004631	GTT	3	9	748124	748132	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141172
16040	NC_004631	TGC	2	6	748150	748155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141172
16041	NC_004631	CTG	2	6	748248	748253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141172
16042	NC_004631	ACGCG	2	10	748292	748301	20 %	0 %	40 %	40 %	29141172
16043	NC_004631	TAC	2	6	748360	748365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141172
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16047	NC_004631	TGGC	2	8	748529	748536	0 %	25 %	50 %	25 %	29141172
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16050	NC_004631	CTG	2	6	748632	748637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141172
16051	NC_004631	CCTG	2	8	748661	748668	0 %	25 %	25 %	50 %	29141172
16052	NC_004631	GGC	2	6	748684	748689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141172
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16054	NC_004631	CG	3	6	748732	748737	0 %	0 %	50 %	50 %	29141172
16055	NC_004631	GC	3	6	748744	748749	0 %	0 %	50 %	50 %	29141172
16056	NC_004631	ATT	2	6	748858	748863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141172
16057	NC_004631	TGC	2	6	748864	748869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141172
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16059	NC_004631	TTAT	2	8	748908	748915	25 %	75 %	0 %	0 %	29141172
16060	NC_004631	GC	3	6	749045	749050	0 %	0 %	50 %	50 %	29141172
16061	NC_004631	CATT	2	8	749082	749089	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16062	NC_004631	GCC	2	6	749163	749168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16063	NC_004631	GC	3	6	749240	749245	0 %	0 %	50 %	50 %	29141173
16064	NC_004631	CTG	2	6	749342	749347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141173
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16081	NC_004631	ATG	2	6	750309	750314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16082	NC_004631	AGTT	2	8	750348	750355	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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16087	NC_004631	TGG	2	6	750631	750636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16088	NC_004631	T	7	7	750699	750705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16089	NC_004631	ATA	2	6	750720	750725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16090	NC_004631	AAG	2	6	750746	750751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141174
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16097	NC_004631	TAT	2	6	751124	751129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141174
16098	NC_004631	GACT	2	8	751135	751142	25 %	25 %	25 %	25 %	29141174
16099	NC_004631	CTG	2	6	751241	751246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141174
16100	NC_004631	ACG	2	6	751283	751288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141174
16101	NC_004631	TG	3	6	751351	751356	0 %	50 %	50 %	0 %	29141174
16102	NC_004631	GATG	2	8	751381	751388	25 %	25 %	50 %	0 %	29141174
16103	NC_004631	GGT	2	6	751423	751428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141174
16104	NC_004631	CGATG	2	10	751441	751450	20 %	20 %	40 %	20 %	29141174
16105	NC_004631	ATA	2	6	751482	751487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141174
16106	NC_004631	TCG	2	6	751490	751495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141174
16107	NC_004631	CGGTA	2	10	751561	751570	20 %	20 %	40 %	20 %	29141174
16108	NC_004631	CAA	2	6	751582	751587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141174
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16110	NC_004631	GCA	2	6	751876	751881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16111	NC_004631	TC	3	6	751885	751890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16112	NC_004631	CGT	2	6	751891	751896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16113	NC_004631	TTG	2	6	751908	751913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16114	NC_004631	ATT	2	6	752033	752038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16115	NC_004631	GCA	2	6	752074	752079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16116	NC_004631	AAG	2	6	752095	752100	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16117	NC_004631	AAG	2	6	752119	752124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16118	NC_004631	CCA	2	6	752215	752220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16119	NC_004631	TGA	2	6	752273	752278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16120	NC_004631	CG	5	10	752299	752308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16121	NC_004631	GAT	2	6	752337	752342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16122	NC_004631	TTA	2	6	752381	752386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16124	NC_004631	ATT	2	6	752440	752445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16125	NC_004631	GAA	2	6	752497	752502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16126	NC_004631	TGGATA	2	12	752576	752587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16132	NC_004631	CGT	2	6	752908	752913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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