MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_004631	CTT	2	6	721216	721221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141149
15502	NC_004631	ATG	2	6	721224	721229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141149
15503	NC_004631	CGT	2	6	721279	721284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141149
15504	NC_004631	TCA	2	6	721338	721343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141149
15505	NC_004631	GTA	2	6	721346	721351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141149
15506	NC_004631	GCC	2	6	721404	721409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141149
15507	NC_004631	AGT	2	6	721411	721416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141149
15508	NC_004631	GCG	2	6	721489	721494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141149
15509	NC_004631	TCT	2	6	721572	721577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141149
15510	NC_004631	GTA	2	6	721632	721637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141149
15511	NC_004631	CGG	2	6	721777	721782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141149
15512	NC_004631	TCA	2	6	721827	721832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141149
15513	NC_004631	GGT	2	6	721838	721843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141149
15514	NC_004631	GTAC	2	8	721869	721876	25 %	25 %	25 %	25 %	29141149
15515	NC_004631	GCA	2	6	721959	721964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141149
15516	NC_004631	CTTT	2	8	722034	722041	0 %	75 %	0 %	25 %	29141149
15517	NC_004631	CCTGGG	2	12	722047	722058	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	29141149
15518	NC_004631	CG	3	6	722095	722100	0 %	0 %	50 %	50 %	29141149
15519	NC_004631	ATC	2	6	722103	722108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141149
15520	NC_004631	AAT	2	6	722163	722168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_004631	ATC	2	6	722520	722525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141150
15522	NC_004631	CGG	2	6	722543	722548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141150
15523	NC_004631	CTG	2	6	722583	722588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141150
15524	NC_004631	TGC	2	6	722782	722787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141150
15525	NC_004631	TGC	2	6	722806	722811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141150
15526	NC_004631	CGG	2	6	722838	722843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141150
15527	NC_004631	CGA	2	6	722915	722920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141150
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15531	NC_004631	CGC	2	6	723290	723295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141150
15532	NC_004631	TAA	2	6	723303	723308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141150
15533	NC_004631	CAT	2	6	723348	723353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141150
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15536	NC_004631	CTG	2	6	723537	723542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141150
15537	NC_004631	GAA	2	6	723566	723571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141150
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15540	NC_004631	GTATT	2	10	723637	723646	20 %	60 %	20 %	0 %	29141150
15541	NC_004631	TGC	2	6	723699	723704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141150
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15543	NC_004631	GT	3	6	723953	723958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15544	NC_004631	ATA	2	6	724014	724019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15545	NC_004631	CTG	2	6	724030	724035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15546	NC_004631	GTC	2	6	724052	724057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15547	NC_004631	TCA	2	6	724058	724063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15548	NC_004631	TGC	2	6	724080	724085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15549	NC_004631	TGA	2	6	724087	724092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15551	NC_004631	GTTC	2	8	724149	724156	0 %	50 %	25 %	25 %	29141151
15552	NC_004631	CGC	2	6	724173	724178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141151
15553	NC_004631	CTG	2	6	724309	724314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141151
15554	NC_004631	TGC	2	6	724401	724406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141151
15555	NC_004631	TGG	2	6	724575	724580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141151
15556	NC_004631	AT	3	6	724637	724642	50 %	50 %	0 %	0 %	29141151
15557	NC_004631	TGT	2	6	724668	724673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141151
15558	NC_004631	TGA	2	6	724727	724732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_004631	AAT	2	6	724811	724816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15560	NC_004631	TTG	2	6	724853	724858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15561	NC_004631	GCGA	2	8	724867	724874	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15562	NC_004631	T	6	6	724885	724890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15563	NC_004631	AAT	2	6	724985	724990	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15564	NC_004631	ATG	2	6	725002	725007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15565	NC_004631	ATC	2	6	725020	725025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15593	NC_004631	GCG	2	6	726201	726206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141153
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15611	NC_004631	AAC	2	6	726845	726850	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15612	NC_004631	TAA	2	6	726854	726859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15613	NC_004631	AATA	2	8	726977	726984	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_004631	CG	3	6	727036	727041	0 %	0 %	50 %	50 %	29141154
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