MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_004631	TGG	2	6	698302	698307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141129
15002	NC_004631	GCGG	2	8	698387	698394	0 %	0 %	75 %	25 %	29141129
15003	NC_004631	CGG	2	6	698468	698473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141129
15004	NC_004631	TGC	2	6	698518	698523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141129
15005	NC_004631	ACA	2	6	698542	698547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141129
15006	NC_004631	TGA	2	6	698560	698565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141129
15007	NC_004631	GGC	2	6	698570	698575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141129
15008	NC_004631	CGG	2	6	698582	698587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141129
15009	NC_004631	CGC	2	6	698606	698611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141129
15010	NC_004631	GAG	2	6	698619	698624	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141129
15011	NC_004631	TAC	2	6	698655	698660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141129
15012	NC_004631	G	6	6	698688	698693	0 %	0 %	100 %	0 %	29141129
15013	NC_004631	CTG	2	6	698694	698699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141129
15014	NC_004631	GGGC	2	8	698708	698715	0 %	0 %	75 %	25 %	29141129
15015	NC_004631	CCG	3	9	698741	698749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141129
15016	NC_004631	TTA	2	6	698789	698794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141130
15017	NC_004631	GCT	2	6	698797	698802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141130
15018	NC_004631	CTG	2	6	698810	698815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141130
15019	NC_004631	GCT	2	6	698827	698832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141130
15020	NC_004631	GC	3	6	698843	698848	0 %	0 %	50 %	50 %	29141130
15021	NC_004631	CGA	2	6	698868	698873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141130
15022	NC_004631	TGC	2	6	698982	698987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141130
15023	NC_004631	GTG	2	6	699068	699073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141130
15024	NC_004631	GAC	2	6	699089	699094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141130
15025	NC_004631	GC	3	6	699195	699200	0 %	0 %	50 %	50 %	29141130
15026	NC_004631	GGC	2	6	699316	699321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141130
15027	NC_004631	TGATGC	2	12	699347	699358	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	29141131
15028	NC_004631	ACC	2	6	699391	699396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141131
15029	NC_004631	AGC	2	6	699428	699433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141131
15030	NC_004631	AGC	2	6	699452	699457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141131
15031	NC_004631	AAC	2	6	699478	699483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141131
15032	NC_004631	GAT	2	6	699504	699509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141131
15033	NC_004631	AGG	2	6	699548	699553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141131
15034	NC_004631	GCC	2	6	699560	699565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141131
15035	NC_004631	ATC	2	6	699571	699576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141131
15036	NC_004631	TGG	2	6	699584	699589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141131
15037	NC_004631	CGC	2	6	699620	699625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141131
15038	NC_004631	TGC	2	6	699641	699646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141131
15039	NC_004631	TGC	2	6	699653	699658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141131
15040	NC_004631	GCC	2	6	699664	699669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141131
15041	NC_004631	GGCG	2	8	699675	699682	0 %	0 %	75 %	25 %	29141131
15042	NC_004631	TCG	2	6	699692	699697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141131
15043	NC_004631	CGG	2	6	699709	699714	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141131
15044	NC_004631	TGCGCC	2	12	699716	699727	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	29141131
15045	NC_004631	CGG	2	6	699740	699745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141131
15046	NC_004631	GCG	2	6	699758	699763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141131
15047	NC_004631	CG	4	8	699762	699769	0 %	0 %	50 %	50 %	29141131
15048	NC_004631	GCA	2	6	699867	699872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141131
15049	NC_004631	GCT	2	6	699894	699899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141131
15050	NC_004631	GAG	3	9	699937	699945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141131
15051	NC_004631	ATG	2	6	699986	699991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141131
15052	NC_004631	GGCT	2	8	700006	700013	0 %	25 %	50 %	25 %	29141131
15053	NC_004631	GCG	2	6	700108	700113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141131
15054	NC_004631	GGA	2	6	700152	700157	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141131
15055	NC_004631	CCG	2	6	700161	700166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141131
15056	NC_004631	CGG	2	6	700167	700172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141131
15057	NC_004631	CTG	2	6	700177	700182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141131
15058	NC_004631	AGC	3	9	700250	700258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141131
15059	NC_004631	GGC	2	6	700275	700280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141131
15060	NC_004631	GAT	2	6	700287	700292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141131
15061	NC_004631	GCT	2	6	700299	700304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141131
15062	NC_004631	CGG	2	6	700307	700312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141131
15063	NC_004631	CGG	2	6	700321	700326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141131
15064	NC_004631	GTGGC	2	10	700384	700393	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15065	NC_004631	CGC	2	6	700448	700453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141132
15066	NC_004631	CG	3	6	700456	700461	0 %	0 %	50 %	50 %	29141132
15067	NC_004631	TGTT	2	8	700542	700549	0 %	75 %	25 %	0 %	29141132
15068	NC_004631	GC	3	6	700621	700626	0 %	0 %	50 %	50 %	29141132
15069	NC_004631	TCACGC	2	12	700635	700646	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	29141132
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15071	NC_004631	CAG	2	6	700709	700714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141132
15072	NC_004631	AAT	3	9	700805	700813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141132
15073	NC_004631	CAG	2	6	700886	700891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141132
15074	NC_004631	GATC	2	8	700921	700928	25 %	25 %	25 %	25 %	29141132
15075	NC_004631	TCCAGT	2	12	700974	700985	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29141132
15076	NC_004631	CGC	2	6	701001	701006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141132
15077	NC_004631	GTC	2	6	701018	701023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141132
15078	NC_004631	TTA	2	6	701077	701082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15079	NC_004631	ATT	2	6	701088	701093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15080	NC_004631	AGT	2	6	701169	701174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15081	NC_004631	TGT	2	6	701228	701233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15082	NC_004631	GA	3	6	701234	701239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15083	NC_004631	T	6	6	701280	701285	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15084	NC_004631	TTA	2	6	701374	701379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15085	NC_004631	ATT	2	6	701405	701410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15086	NC_004631	ATT	2	6	701416	701421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15087	NC_004631	ATTT	2	8	701430	701437	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15088	NC_004631	TTA	2	6	701444	701449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15089	NC_004631	TTAAA	2	10	701497	701506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15090	NC_004631	AAC	2	6	701629	701634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15091	NC_004631	TGG	3	9	701779	701787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15092	NC_004631	TA	3	6	701809	701814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15093	NC_004631	TAT	2	6	701817	701822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15094	NC_004631	T	7	7	701859	701865	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15095	NC_004631	CAA	2	6	701874	701879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15096	NC_004631	TGC	2	6	701895	701900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15097	NC_004631	AAG	2	6	701913	701918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15098	NC_004631	AGG	2	6	701919	701924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_004631	TA	3	6	701936	701941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_004631	T	6	6	701973	701978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15101	NC_004631	AAT	2	6	701995	702000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15102	NC_004631	AGG	2	6	702009	702014	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15103	NC_004631	GAT	2	6	702034	702039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_004631	TAA	2	6	702069	702074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_004631	TA	3	6	702160	702165	50 %	50 %	0 %	0 %	29141133
15106	NC_004631	GAT	2	6	702181	702186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141133
15107	NC_004631	GCTG	2	8	702375	702382	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15108	NC_004631	TAAT	2	8	702389	702396	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15109	NC_004631	TTACC	2	10	702498	702507	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15110	NC_004631	TAT	2	6	702517	702522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_004631	TGC	2	6	702523	702528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15112	NC_004631	T	6	6	702566	702571	0 %	100 %	0 %	0 %	29141134
15113	NC_004631	A	7	7	702747	702753	100 %	0 %	0 %	0 %	29141134
15114	NC_004631	GCA	2	6	702806	702811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15115	NC_004631	AGC	2	6	702821	702826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15116	NC_004631	CAGC	2	8	702861	702868	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15117	NC_004631	GCG	2	6	702869	702874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15118	NC_004631	CGG	2	6	702894	702899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15119	NC_004631	GCC	2	6	702902	702907	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15120	NC_004631	TCA	2	6	702911	702916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15121	NC_004631	CCAC	2	8	702930	702937	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15122	NC_004631	GCC	2	6	702938	702943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15123	NC_004631	A	6	6	703079	703084	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15124	NC_004631	GGC	2	6	703132	703137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15125	NC_004631	CGC	2	6	703230	703235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15126	NC_004631	ACA	2	6	703259	703264	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15127	NC_004631	TGGT	2	8	703299	703306	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15128	NC_004631	CCA	2	6	703374	703379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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15166	NC_004631	T	7	7	704626	704632	0 %	100 %	0 %	0 %	29141135
15167	NC_004631	GCCG	2	8	704685	704692	0 %	0 %	50 %	50 %	29141135
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15222	NC_004631	TGATG	2	10	707212	707221	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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15227	NC_004631	GGCT	2	8	707474	707481	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15228	NC_004631	TAC	2	6	707588	707593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15246	NC_004631	CCAT	2	8	708448	708455	25 %	25 %	0 %	50 %	29141136
15247	NC_004631	AGC	2	6	708616	708621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141136
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15374	NC_004631	GC	3	6	715548	715553	0 %	0 %	50 %	50 %	29141143
15375	NC_004631	TGG	2	6	715578	715583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141143
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15377	NC_004631	TG	3	6	715607	715612	0 %	50 %	50 %	0 %	29141143
15378	NC_004631	TCG	2	6	715719	715724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141143
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15386	NC_004631	TCC	2	6	715970	715975	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15387	NC_004631	TTTAT	2	10	715982	715991	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15388	NC_004631	CAT	2	6	716018	716023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15391	NC_004631	ATG	2	6	716174	716179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15393	NC_004631	GAAA	2	8	716226	716233	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15394	NC_004631	CGG	2	6	716289	716294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141145
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15484	NC_004631	GCA	2	6	720445	720450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141149
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15495	NC_004631	T	6	6	720977	720982	0 %	100 %	0 %	0 %	29141149
15496	NC_004631	TCG	2	6	721005	721010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141149
15497	NC_004631	GGC	2	6	721028	721033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141149
15498	NC_004631	CCG	2	6	721139	721144	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141149
15499	NC_004631	GCCA	2	8	721176	721183	25 %	0 %	25 %	50 %	29141149
15500	NC_004631	GT	3	6	721186	721191	0 %	50 %	50 %	0 %	29141149

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