MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_004631	T	6	6	677385	677390	0 %	100 %	0 %	0 %	29141109
14502	NC_004631	TTG	2	6	677497	677502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141109
14503	NC_004631	ATA	2	6	677518	677523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141109
14504	NC_004631	GTT	2	6	677637	677642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141109
14505	NC_004631	ACA	2	6	677674	677679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141109
14506	NC_004631	GGT	2	6	677732	677737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141109
14507	NC_004631	AAT	2	6	677745	677750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141109
14508	NC_004631	AT	3	6	677822	677827	50 %	50 %	0 %	0 %	29141110
14509	NC_004631	CAGCG	2	10	677947	677956	20 %	0 %	40 %	40 %	29141110
14510	NC_004631	GCC	2	6	677969	677974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141110
14511	NC_004631	CAT	2	6	677994	677999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141110
14512	NC_004631	ATA	2	6	678025	678030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141110
14513	NC_004631	CCG	2	6	678062	678067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141110
14514	NC_004631	GCT	2	6	678099	678104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141110
14515	NC_004631	GTA	2	6	678117	678122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141110
14516	NC_004631	TCA	2	6	678197	678202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141110
14517	NC_004631	AAGC	2	8	678211	678218	50 %	0 %	25 %	25 %	29141110
14518	NC_004631	GCA	2	6	678327	678332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141110
14519	NC_004631	CG	3	6	678337	678342	0 %	0 %	50 %	50 %	29141110
14520	NC_004631	CGT	2	6	678378	678383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141110
14521	NC_004631	CAG	2	6	678385	678390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141110
14522	NC_004631	GC	3	6	678499	678504	0 %	0 %	50 %	50 %	29141110
14523	NC_004631	TCAT	2	8	678566	678573	25 %	50 %	0 %	25 %	29141110
14524	NC_004631	GTC	2	6	678701	678706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141110
14525	NC_004631	CAG	2	6	678727	678732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141110
14526	NC_004631	TTA	2	6	678791	678796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141110
14527	NC_004631	CAG	2	6	678799	678804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141110
14528	NC_004631	GCA	2	6	678831	678836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141110
14529	NC_004631	GTG	2	6	678989	678994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141110
14530	NC_004631	GGC	2	6	679063	679068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141110
14531	NC_004631	CTG	2	6	679075	679080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141110
14532	NC_004631	TTC	2	6	679082	679087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141110
14533	NC_004631	CTT	2	6	679114	679119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141110
14534	NC_004631	AAT	2	6	679150	679155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141110
14535	NC_004631	TGCG	2	8	679163	679170	0 %	25 %	50 %	25 %	29141110
14536	NC_004631	G	6	6	679170	679175	0 %	0 %	100 %	0 %	29141110
14537	NC_004631	TTA	2	6	679214	679219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141110
14538	NC_004631	TGC	2	6	679244	679249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141110
14539	NC_004631	GAT	2	6	679293	679298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141110
14540	NC_004631	CAG	2	6	679348	679353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141110
14541	NC_004631	GCA	2	6	679362	679367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141110
14542	NC_004631	ATT	2	6	679411	679416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141110
14543	NC_004631	CGC	2	6	679417	679422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141110
14544	NC_004631	TGA	2	6	679457	679462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141110
14545	NC_004631	AACGCC	2	12	679484	679495	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	29141110
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14549	NC_004631	GAG	2	6	679607	679612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141110
14550	NC_004631	CGT	2	6	679681	679686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141110
14551	NC_004631	CGG	2	6	679732	679737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141110
14552	NC_004631	CCA	2	6	679767	679772	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141110
14553	NC_004631	GCCAG	2	10	679833	679842	20 %	0 %	40 %	40 %	29141110
14554	NC_004631	GAG	2	6	679853	679858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141110
14555	NC_004631	CTG	2	6	679888	679893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141110
14556	NC_004631	CGG	2	6	679907	679912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141110
14557	NC_004631	CGA	2	6	679917	679922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141110
14558	NC_004631	AG	3	6	679954	679959	50 %	0 %	50 %	0 %	29141110
14559	NC_004631	GGTAG	2	10	679970	679979	20 %	20 %	60 %	0 %	29141110
14560	NC_004631	ATA	2	6	680152	680157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141110
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14563	NC_004631	CAG	2	6	680362	680367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141110
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14565	NC_004631	GACT	2	8	680444	680451	25 %	25 %	25 %	25 %	29141110
14566	NC_004631	TGAAGG	2	12	680483	680494	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
14567	NC_004631	AATG	2	8	680509	680516	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_004631	CGG	2	6	680565	680570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14569	NC_004631	ACT	2	6	680616	680621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14570	NC_004631	ATT	2	6	680651	680656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_004631	GT	3	6	680739	680744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14572	NC_004631	A	7	7	680757	680763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14573	NC_004631	TAA	2	6	680823	680828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14574	NC_004631	ATG	2	6	680838	680843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14575	NC_004631	TCA	2	6	680905	680910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14577	NC_004631	A	6	6	680987	680992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14578	NC_004631	TA	3	6	681022	681027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_004631	ATT	2	6	681073	681078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14580	NC_004631	A	6	6	681144	681149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14581	NC_004631	TAA	2	6	681175	681180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14582	NC_004631	CCT	2	6	681202	681207	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29141111
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14584	NC_004631	GGCG	2	8	681226	681233	0 %	0 %	75 %	25 %	29141111
14585	NC_004631	TAA	2	6	681256	681261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141111
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14589	NC_004631	GCA	2	6	681444	681449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141111
14590	NC_004631	CCT	2	6	681546	681551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29141111
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14592	NC_004631	GCA	2	6	681607	681612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141111
14593	NC_004631	CTAC	2	8	681630	681637	25 %	25 %	0 %	50 %	29141111
14594	NC_004631	CTT	2	6	681649	681654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141111
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14602	NC_004631	ATCT	2	8	681932	681939	25 %	50 %	0 %	25 %	29141111
14603	NC_004631	GCA	2	6	681993	681998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141111
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14605	NC_004631	CGTC	2	8	682079	682086	0 %	25 %	25 %	50 %	29141111
14606	NC_004631	TAC	2	6	682187	682192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141111
14607	NC_004631	CAA	2	6	682195	682200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141111
14608	NC_004631	CTG	2	6	682235	682240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141111
14609	NC_004631	CGA	2	6	682279	682284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141111
14610	NC_004631	T	6	6	682354	682359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_004631	ACG	2	6	682384	682389	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14612	NC_004631	GT	3	6	682457	682462	0 %	50 %	50 %	0 %	29141112
14613	NC_004631	T	6	6	682474	682479	0 %	100 %	0 %	0 %	29141112
14614	NC_004631	ACA	2	6	682511	682516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141112
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14617	NC_004631	GACG	2	8	682777	682784	25 %	0 %	50 %	25 %	29141112
14618	NC_004631	TC	3	6	682975	682980	0 %	50 %	0 %	50 %	29141112
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14621	NC_004631	AGG	2	6	683031	683036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141112
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14623	NC_004631	CCGA	2	8	683129	683136	25 %	0 %	25 %	50 %	29141112
14624	NC_004631	GGCAT	2	10	683175	683184	20 %	20 %	40 %	20 %	29141112
14625	NC_004631	GCG	2	6	683380	683385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141112
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14629	NC_004631	AAGC	2	8	683536	683543	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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14632	NC_004631	TTAC	2	8	683581	683588	25 %	50 %	0 %	25 %	409994462
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14684	NC_004631	TTA	2	6	685332	685337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14731	NC_004631	AATAA	2	10	687812	687821	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14732	NC_004631	TA	3	6	687830	687835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14733	NC_004631	TA	3	6	687894	687899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14734	NC_004631	TA	3	6	687906	687911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14735	NC_004631	ACT	2	6	688042	688047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14744	NC_004631	GTG	2	6	688732	688737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141118
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14746	NC_004631	GTC	2	6	688867	688872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141119
14747	NC_004631	GCG	2	6	688908	688913	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141119
14748	NC_004631	GCA	2	6	688958	688963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141119
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14750	NC_004631	GT	3	6	689017	689022	0 %	50 %	50 %	0 %	29141119
14751	NC_004631	TGG	2	6	689023	689028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141119
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14807	NC_004631	TCG	2	6	691624	691629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141120
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14832	NC_004631	TGA	2	6	693033	693038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141122
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14852	NC_004631	GAT	2	6	693772	693777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141123
14853	NC_004631	GATA	2	8	693826	693833	50 %	25 %	25 %	0 %	29141123
14854	NC_004631	GGC	2	6	693882	693887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141123
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14856	NC_004631	TGA	2	6	694087	694092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14859	NC_004631	CTG	2	6	694225	694230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141124
14860	NC_004631	CTG	2	6	694234	694239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141124
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14862	NC_004631	CGG	2	6	694260	694265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141124
14863	NC_004631	CTG	2	6	694324	694329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141124
14864	NC_004631	GC	3	6	694406	694411	0 %	0 %	50 %	50 %	29141124
14865	NC_004631	GCA	2	6	694485	694490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141124
14866	NC_004631	CGCGC	2	10	694525	694534	0 %	0 %	40 %	60 %	29141124
14867	NC_004631	CGA	2	6	694545	694550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141124
14868	NC_004631	GC	3	6	694582	694587	0 %	0 %	50 %	50 %	29141124
14869	NC_004631	CGG	2	6	694594	694599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141124
14870	NC_004631	GGC	2	6	694602	694607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141124
14871	NC_004631	CAC	2	6	694638	694643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141124
14872	NC_004631	CCA	2	6	694644	694649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141124
14873	NC_004631	CCG	2	6	694677	694682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141124
14874	NC_004631	CGG	2	6	694695	694700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141124
14875	NC_004631	G	7	7	694699	694705	0 %	0 %	100 %	0 %	29141124
14876	NC_004631	TCT	2	6	694726	694731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141125
14877	NC_004631	TTC	2	6	694788	694793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141125
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14879	NC_004631	GCCGCA	2	12	694829	694840	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	29141125
14880	NC_004631	GCT	2	6	694841	694846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141125
14881	NC_004631	CAT	2	6	694865	694870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141125
14882	NC_004631	GGC	2	6	694877	694882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141125
14883	NC_004631	GCT	2	6	694883	694888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141125
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14888	NC_004631	CGG	2	6	694978	694983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141125
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14890	NC_004631	TGG	2	6	695050	695055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141125
14891	NC_004631	GCT	3	9	695057	695065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141125
14892	NC_004631	GCT	3	9	695105	695113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141125
14893	NC_004631	CGC	2	6	695138	695143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141125
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14895	NC_004631	GCG	2	6	695171	695176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141125
14896	NC_004631	CGG	2	6	695177	695182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141125
14897	NC_004631	CTG	2	6	695187	695192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141125
14898	NC_004631	TGC	2	6	695203	695208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141125
14899	NC_004631	GCT	2	6	695303	695308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141125
14900	NC_004631	CGG	2	6	695344	695349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141125
14901	NC_004631	ACG	2	6	695382	695387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14902	NC_004631	AGG	2	6	695405	695410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14903	NC_004631	GAC	2	6	695417	695422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14907	NC_004631	TGGC	2	8	695493	695500	0 %	25 %	50 %	25 %	29141126
14908	NC_004631	CAT	2	6	695510	695515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141126
14909	NC_004631	CGG	2	6	695557	695562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141126
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14915	NC_004631	TGG	2	6	695787	695792	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141126
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14917	NC_004631	TGC	2	6	695824	695829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141126
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14922	NC_004631	CGC	2	6	696022	696027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141126
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14927	NC_004631	T	6	6	696212	696217	0 %	100 %	0 %	0 %	29141127
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14932	NC_004631	GCA	2	6	696310	696315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141127
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14951	NC_004631	CG	3	6	696938	696943	0 %	0 %	50 %	50 %	29141129
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14962	NC_004631	TCG	2	6	697204	697209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141129
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14973	NC_004631	GGC	2	6	697551	697556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141129
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14977	NC_004631	CTG	2	6	697617	697622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141129
14978	NC_004631	GC	3	6	697646	697651	0 %	0 %	50 %	50 %	29141129
14979	NC_004631	GCT	2	6	697670	697675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141129
14980	NC_004631	CTG	2	6	697704	697709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141129
14981	NC_004631	GC	3	6	697770	697775	0 %	0 %	50 %	50 %	29141129
14982	NC_004631	CGG	2	6	697811	697816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141129
14983	NC_004631	GCT	3	9	697820	697828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141129
14984	NC_004631	AAC	2	6	697866	697871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141129
14985	NC_004631	GCT	3	9	697892	697900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141129
14986	NC_004631	CAA	2	6	697904	697909	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141129
14987	NC_004631	CTG	2	6	697914	697919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141129
14988	NC_004631	GCC	2	6	697923	697928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141129
14989	NC_004631	TGG	2	6	697933	697938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141129
14990	NC_004631	TGC	2	6	697939	697944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141129
14991	NC_004631	CTG	2	6	697953	697958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141129
14992	NC_004631	GCTGGG	2	12	697976	697987	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	29141129
14993	NC_004631	CTG	3	9	698052	698060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141129
14994	NC_004631	CTG	2	6	698115	698120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141129
14995	NC_004631	GCT	2	6	698168	698173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141129
14996	NC_004631	ATC	2	6	698184	698189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141129
14997	NC_004631	CGG	2	6	698197	698202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141129
14998	NC_004631	GATGGC	2	12	698207	698218	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	29141129
14999	NC_004631	CTG	2	6	698219	698224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141129
15000	NC_004631	CT	3	6	698282	698287	0 %	50 %	0 %	50 %	29141129

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