MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

< Previous12...2425262728293031323334...201202Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_004631	CTTCA	2	10	654398	654407	20 %	40 %	0 %	40 %	29141094
14002	NC_004631	GCC	2	6	654425	654430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141094
14003	NC_004631	GGC	2	6	654486	654491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141094
14004	NC_004631	GCA	2	6	654499	654504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141094
14005	NC_004631	GC	3	6	654511	654516	0 %	0 %	50 %	50 %	29141094
14006	NC_004631	CGTT	2	8	654525	654532	0 %	50 %	25 %	25 %	29141094
14007	NC_004631	ATG	2	6	654579	654584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141094
14008	NC_004631	CGT	2	6	654619	654624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141094
14009	NC_004631	AGC	2	6	654627	654632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141094
14010	NC_004631	TTC	2	6	654641	654646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141094
14011	NC_004631	CG	3	6	654660	654665	0 %	0 %	50 %	50 %	29141094
14012	NC_004631	CG	3	6	654674	654679	0 %	0 %	50 %	50 %	29141094
14013	NC_004631	CGA	2	6	654811	654816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141094
14014	NC_004631	GCG	2	6	654892	654897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141094
14015	NC_004631	CTG	2	6	654914	654919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141094
14016	NC_004631	GC	3	6	654937	654942	0 %	0 %	50 %	50 %	29141094
14017	NC_004631	GC	3	6	654994	654999	0 %	0 %	50 %	50 %	29141094
14018	NC_004631	GGC	2	6	655030	655035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141094
14019	NC_004631	CGG	2	6	655051	655056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141094
14020	NC_004631	GGA	2	6	655112	655117	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141094
14021	NC_004631	GC	3	6	655126	655131	0 %	0 %	50 %	50 %	29141094
14022	NC_004631	TGC	2	6	655167	655172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141094
14023	NC_004631	CCG	2	6	655206	655211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141094
14024	NC_004631	ATA	2	6	655215	655220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141094
14025	NC_004631	AG	3	6	655359	655364	50 %	0 %	50 %	0 %	29141095
14026	NC_004631	GTC	2	6	655387	655392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141095
14027	NC_004631	CG	3	6	655419	655424	0 %	0 %	50 %	50 %	29141095
14028	NC_004631	CAG	2	6	655485	655490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141095
14029	NC_004631	CCG	2	6	655532	655537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141095
14030	NC_004631	GGC	2	6	655574	655579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141095
14031	NC_004631	CCG	2	6	655622	655627	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141095
14032	NC_004631	GCG	2	6	655637	655642	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141095
14033	NC_004631	CCG	2	6	655709	655714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141095
14034	NC_004631	GTCG	2	8	655755	655762	0 %	25 %	50 %	25 %	29141095
14035	NC_004631	GGTAAT	2	12	655803	655814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141095
14036	NC_004631	AAC	2	6	655849	655854	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141095
14037	NC_004631	CCA	2	6	655901	655906	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141095
14038	NC_004631	GCGG	2	8	655907	655914	0 %	0 %	75 %	25 %	29141095
14039	NC_004631	CG	3	6	655926	655931	0 %	0 %	50 %	50 %	29141095
14040	NC_004631	GCA	2	6	655979	655984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141095
14041	NC_004631	GGT	2	6	656049	656054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141095
14042	NC_004631	ACC	3	9	656239	656247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141095
14043	NC_004631	CGC	2	6	656297	656302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141095
14044	NC_004631	GGC	2	6	656388	656393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141095
14045	NC_004631	GAT	2	6	656469	656474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141095
14046	NC_004631	CTG	2	6	656481	656486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141095
14047	NC_004631	TGCC	2	8	656510	656517	0 %	25 %	25 %	50 %	29141095
14048	NC_004631	TAA	2	6	656573	656578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141095
14049	NC_004631	GGCG	2	8	656606	656613	0 %	0 %	75 %	25 %	29141095
14050	NC_004631	CG	4	8	656648	656655	0 %	0 %	50 %	50 %	29141095
14051	NC_004631	GCA	2	6	656693	656698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141095
14052	NC_004631	CCA	2	6	656744	656749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141095
14053	NC_004631	GC	3	6	656771	656776	0 %	0 %	50 %	50 %	29141095
14054	NC_004631	CTTG	2	8	656830	656837	0 %	50 %	25 %	25 %	29141095
14055	NC_004631	T	6	6	656875	656880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14056	NC_004631	CG	3	6	656919	656924	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14057	NC_004631	AGC	2	6	657018	657023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14058	NC_004631	GTT	2	6	657027	657032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14059	NC_004631	GAAC	2	8	657034	657041	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14060	NC_004631	TAAA	2	8	657057	657064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_004631	GC	3	6	657121	657126	0 %	0 %	50 %	50 %	29141096
14062	NC_004631	GCG	2	6	657133	657138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141096
14063	NC_004631	TAT	2	6	657208	657213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141096
14064	NC_004631	CG	3	6	657362	657367	0 %	0 %	50 %	50 %	29141096
14065	NC_004631	GCA	2	6	657397	657402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141096
14066	NC_004631	TGT	2	6	657407	657412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141096
14067	NC_004631	TGT	2	6	657464	657469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141096
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14069	NC_004631	TGG	2	6	657529	657534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141096
14070	NC_004631	GCG	2	6	657548	657553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141096
14071	NC_004631	CGG	3	9	657588	657596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141096
14072	NC_004631	CTG	2	6	657607	657612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141096
14073	NC_004631	CTG	2	6	657616	657621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141096
14074	NC_004631	GCG	2	6	657649	657654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141096
14075	NC_004631	TGG	2	6	657683	657688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141096
14076	NC_004631	ATG	2	6	657706	657711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141096
14077	NC_004631	CGC	2	6	657719	657724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141096
14078	NC_004631	GCC	2	6	657738	657743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141096
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14080	NC_004631	GTAC	2	8	657828	657835	25 %	25 %	25 %	25 %	29141096
14081	NC_004631	TATCGC	2	12	657858	657869	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29141096
14082	NC_004631	CTG	2	6	657886	657891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141096
14083	NC_004631	ACCT	2	8	657919	657926	25 %	25 %	0 %	50 %	29141096
14084	NC_004631	AAG	2	6	657929	657934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141096
14085	NC_004631	TCC	2	6	657958	657963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29141096
14086	NC_004631	GCT	2	6	658005	658010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141096
14087	NC_004631	GGCA	2	8	658116	658123	25 %	0 %	50 %	25 %	29141096
14088	NC_004631	ATC	2	6	658153	658158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141096
14089	NC_004631	A	6	6	658219	658224	100 %	0 %	0 %	0 %	29141096
14090	NC_004631	GCG	2	6	658225	658230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141096
14091	NC_004631	CGG	3	9	658235	658243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141096
14092	NC_004631	CTT	2	6	658314	658319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141096
14093	NC_004631	GGC	2	6	658330	658335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141096
14094	NC_004631	TGA	2	6	658343	658348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141096
14095	NC_004631	CTG	2	6	658375	658380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141096
14096	NC_004631	TGA	2	6	658388	658393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141096
14097	NC_004631	CAT	2	6	658408	658413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141096
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14099	NC_004631	GCG	2	6	658512	658517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141097
14100	NC_004631	GGC	2	6	658522	658527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141097
14101	NC_004631	GTC	2	6	658535	658540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141097
14102	NC_004631	TGA	2	6	658641	658646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141097
14103	NC_004631	GAC	2	6	658652	658657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141097
14104	NC_004631	GTC	2	6	658664	658669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141097
14105	NC_004631	TGAC	2	8	658695	658702	25 %	25 %	25 %	25 %	29141097
14106	NC_004631	A	6	6	658820	658825	100 %	0 %	0 %	0 %	29141097
14107	NC_004631	CAT	2	6	658973	658978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141097
14108	NC_004631	GAA	2	6	659020	659025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141097
14109	NC_004631	GCTGA	2	10	659078	659087	20 %	20 %	40 %	20 %	29141097
14110	NC_004631	GGAT	2	8	659121	659128	25 %	25 %	50 %	0 %	29141097
14111	NC_004631	CAG	2	6	659174	659179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141097
14112	NC_004631	CGA	2	6	659307	659312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141097
14113	NC_004631	GGCG	2	8	659452	659459	0 %	0 %	75 %	25 %	29141097
14114	NC_004631	A	7	7	659508	659514	100 %	0 %	0 %	0 %	29141097
14115	NC_004631	TAG	2	6	659532	659537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14116	NC_004631	TCA	2	6	659619	659624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14117	NC_004631	GTT	2	6	659631	659636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14118	NC_004631	TAA	2	6	659679	659684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141098
14119	NC_004631	CTTC	2	8	659695	659702	0 %	50 %	0 %	50 %	29141098
14120	NC_004631	CGG	2	6	659706	659711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141098
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14122	NC_004631	ATA	2	6	659911	659916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29141098
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14231	NC_004631	ATG	2	6	665017	665022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141102
14232	NC_004631	CAGG	2	8	665112	665119	25 %	0 %	50 %	25 %	29141102
14233	NC_004631	GC	3	6	665144	665149	0 %	0 %	50 %	50 %	29141102
14234	NC_004631	GCT	2	6	665201	665206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141102
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14239	NC_004631	GA	3	6	665438	665443	50 %	0 %	50 %	0 %	29141102
14240	NC_004631	GCG	2	6	665452	665457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141102
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