MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_004631	GC	3	6	630308	630313	0 %	0 %	50 %	50 %	29141069
13502	NC_004631	ATGA	2	8	630355	630362	50 %	25 %	25 %	0 %	29141069
13503	NC_004631	GGTCT	2	10	630367	630376	0 %	40 %	40 %	20 %	29141069
13504	NC_004631	GCA	2	6	630378	630383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141069
13505	NC_004631	TGG	2	6	630397	630402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141069
13506	NC_004631	TTC	2	6	630466	630471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141069
13507	NC_004631	GAA	2	6	630517	630522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141069
13508	NC_004631	A	6	6	630526	630531	100 %	0 %	0 %	0 %	29141069
13509	NC_004631	GCA	2	6	630651	630656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141069
13510	NC_004631	GTC	2	6	630667	630672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141069
13511	NC_004631	GGCA	2	8	630713	630720	25 %	0 %	50 %	25 %	29141069
13512	NC_004631	GTC	2	6	630764	630769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141069
13513	NC_004631	CGG	2	6	630836	630841	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141069
13514	NC_004631	GTG	2	6	630855	630860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141069
13515	NC_004631	GGT	2	6	630900	630905	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141069
13516	NC_004631	TGG	2	6	630998	631003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141069
13517	NC_004631	GCCG	2	8	631032	631039	0 %	0 %	50 %	50 %	29141069
13518	NC_004631	GCG	2	6	631096	631101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141069
13519	NC_004631	GC	3	6	631110	631115	0 %	0 %	50 %	50 %	29141069
13520	NC_004631	TCG	2	6	631139	631144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141069
13521	NC_004631	TAC	2	6	631184	631189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141069
13522	NC_004631	CAA	2	6	631224	631229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141069
13523	NC_004631	CGG	2	6	631233	631238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141069
13524	NC_004631	CTG	2	6	631252	631257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141069
13525	NC_004631	CGC	2	6	631262	631267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141069
13526	NC_004631	GCC	2	6	631324	631329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141069
13527	NC_004631	ATC	2	6	631346	631351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141069
13528	NC_004631	GAA	2	6	631366	631371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141069
13529	NC_004631	GCTG	2	8	631383	631390	0 %	25 %	50 %	25 %	29141069
13530	NC_004631	TGG	2	6	631427	631432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141069
13531	NC_004631	GC	3	6	631448	631453	0 %	0 %	50 %	50 %	29141069
13532	NC_004631	GCA	2	6	631461	631466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141069
13533	NC_004631	ATG	2	6	631491	631496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141069
13534	NC_004631	GCA	2	6	631505	631510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141070
13535	NC_004631	CGG	2	6	631664	631669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141070
13536	NC_004631	TCA	2	6	631681	631686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141070
13537	NC_004631	GC	3	6	631694	631699	0 %	0 %	50 %	50 %	29141070
13538	NC_004631	ACA	2	6	631714	631719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141070
13539	NC_004631	TGGT	2	8	631731	631738	0 %	50 %	50 %	0 %	29141070
13540	NC_004631	GGC	2	6	631752	631757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141070
13541	NC_004631	GAT	2	6	631766	631771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141070
13542	NC_004631	TGG	2	6	631807	631812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141070
13543	NC_004631	GC	4	8	631848	631855	0 %	0 %	50 %	50 %	29141070
13544	NC_004631	CAG	2	6	631935	631940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141070
13545	NC_004631	GCA	2	6	631964	631969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141070
13546	NC_004631	AGGC	2	8	631971	631978	25 %	0 %	50 %	25 %	29141070
13547	NC_004631	GCTG	2	8	632015	632022	0 %	25 %	50 %	25 %	29141070
13548	NC_004631	TAT	2	6	632097	632102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141070
13549	NC_004631	GGC	2	6	632150	632155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141070
13550	NC_004631	AC	3	6	632257	632262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13551	NC_004631	TGA	2	6	632275	632280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141071
13552	NC_004631	GAT	2	6	632428	632433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141071
13553	NC_004631	ACG	2	6	632457	632462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141071
13554	NC_004631	ATT	2	6	632477	632482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141071
13555	NC_004631	GCGG	2	8	632513	632520	0 %	0 %	75 %	25 %	29141071
13556	NC_004631	GCG	2	6	632535	632540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141071
13557	NC_004631	CGG	2	6	632545	632550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141071
13558	NC_004631	CGG	2	6	632656	632661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141071
13559	NC_004631	TGC	2	6	632670	632675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141071
13560	NC_004631	ATG	2	6	632678	632683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141071
13561	NC_004631	CGG	2	6	632752	632757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141071
13562	NC_004631	AGA	2	6	632793	632798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141071
13563	NC_004631	GCC	2	6	632823	632828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141071
13564	NC_004631	CGT	2	6	632872	632877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141071
13565	NC_004631	GCG	2	6	632963	632968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141071
13566	NC_004631	GAA	2	6	633044	633049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141071
13567	NC_004631	GC	3	6	633128	633133	0 %	0 %	50 %	50 %	29141072
13568	NC_004631	GGT	2	6	633168	633173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141072
13569	NC_004631	GA	3	6	633248	633253	50 %	0 %	50 %	0 %	29141072
13570	NC_004631	TCAG	2	8	633272	633279	25 %	25 %	25 %	25 %	29141072
13571	NC_004631	GC	3	6	633386	633391	0 %	0 %	50 %	50 %	29141072
13572	NC_004631	ACTG	2	8	633399	633406	25 %	25 %	25 %	25 %	29141072
13573	NC_004631	GGC	2	6	633420	633425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141072
13574	NC_004631	CGCGC	2	10	633433	633442	0 %	0 %	40 %	60 %	29141072
13575	NC_004631	TGG	2	6	633551	633556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141072
13576	NC_004631	TGC	2	6	633563	633568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141072
13577	NC_004631	ATCTGC	2	12	633584	633595	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29141072
13578	NC_004631	CGC	2	6	633620	633625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141072
13579	NC_004631	GAA	2	6	633688	633693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141072
13580	NC_004631	GAT	2	6	633709	633714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141072
13581	NC_004631	GCC	2	6	633871	633876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141072
13582	NC_004631	CGG	2	6	633893	633898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141072
13583	NC_004631	TCA	2	6	633899	633904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141072
13584	NC_004631	TCGA	2	8	633910	633917	25 %	25 %	25 %	25 %	29141072
13585	NC_004631	GCC	2	6	633952	633957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141072
13586	NC_004631	CCTGG	2	10	634025	634034	0 %	20 %	40 %	40 %	29141072
13587	NC_004631	TGA	2	6	634059	634064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141072
13588	NC_004631	GC	3	6	634169	634174	0 %	0 %	50 %	50 %	29141073
13589	NC_004631	GGCG	2	8	634199	634206	0 %	0 %	75 %	25 %	29141073
13590	NC_004631	CTG	2	6	634245	634250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141073
13591	NC_004631	GCG	2	6	634303	634308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141073
13592	NC_004631	CG	3	6	634307	634312	0 %	0 %	50 %	50 %	29141073
13593	NC_004631	GC	3	6	634564	634569	0 %	0 %	50 %	50 %	29141073
13594	NC_004631	GCT	2	6	634613	634618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141073
13595	NC_004631	TAT	2	6	634652	634657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141073
13596	NC_004631	GC	3	6	634680	634685	0 %	0 %	50 %	50 %	29141073
13597	NC_004631	GGC	2	6	634765	634770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141073
13598	NC_004631	GCG	2	6	634785	634790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141073
13599	NC_004631	CGG	2	6	634814	634819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141073
13600	NC_004631	GCT	2	6	634870	634875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141073
13601	NC_004631	GAT	2	6	634938	634943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141073
13602	NC_004631	GC	3	6	634948	634953	0 %	0 %	50 %	50 %	29141073
13603	NC_004631	AG	3	6	634965	634970	50 %	0 %	50 %	0 %	29141073
13604	NC_004631	TCG	2	6	634978	634983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141073
13605	NC_004631	GC	3	6	635000	635005	0 %	0 %	50 %	50 %	29141073
13606	NC_004631	CG	3	6	635080	635085	0 %	0 %	50 %	50 %	29141073
13607	NC_004631	GGC	2	6	635125	635130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141073
13608	NC_004631	GCG	3	9	635149	635157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141073
13609	NC_004631	GGA	2	6	635171	635176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141073
13610	NC_004631	TTA	2	6	635188	635193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141073
13611	NC_004631	CAA	2	6	635211	635216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141073
13612	NC_004631	AGA	2	6	635234	635239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141073
13613	NC_004631	CAG	2	6	635415	635420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141073
13614	NC_004631	GT	3	6	635424	635429	0 %	50 %	50 %	0 %	29141073
13615	NC_004631	TGGT	2	8	635551	635558	0 %	50 %	50 %	0 %	29141074
13616	NC_004631	GCG	2	6	635615	635620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141074
13617	NC_004631	GTATT	2	10	635703	635712	20 %	60 %	20 %	0 %	29141074
13618	NC_004631	CGA	2	6	635766	635771	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141074
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13620	NC_004631	CAG	2	6	635935	635940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141075
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13622	NC_004631	CAT	2	6	636100	636105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141075
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13989	NC_004631	GC	3	6	653840	653845	0 %	0 %	50 %	50 %	29141093
13990	NC_004631	TCCGG	2	10	653872	653881	0 %	20 %	40 %	40 %	29141093
13991	NC_004631	GGT	2	6	653931	653936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141093
13992	NC_004631	GT	3	6	653969	653974	0 %	50 %	50 %	0 %	29141093
13993	NC_004631	CGC	4	12	654043	654054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141094
13994	NC_004631	AGGG	2	8	654129	654136	25 %	0 %	75 %	0 %	29141094
13995	NC_004631	ACG	2	6	654156	654161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141094
13996	NC_004631	CTG	2	6	654167	654172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141094
13997	NC_004631	GAA	2	6	654188	654193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141094
13998	NC_004631	TGT	2	6	654195	654200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141094
13999	NC_004631	CTA	2	6	654288	654293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141094
14000	NC_004631	AAG	2	6	654294	654299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141094

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