MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_004631	GCA	2	6	584472	584477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141025
12502	NC_004631	AC	3	6	584608	584613	50 %	0 %	0 %	50 %	29141025
12503	NC_004631	GAA	2	6	584666	584671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141025
12504	NC_004631	CAT	2	6	584681	584686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141025
12505	NC_004631	CAG	2	6	584715	584720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141025
12506	NC_004631	CGC	2	6	584747	584752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141025
12507	NC_004631	TGG	3	9	584764	584772	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141025
12508	NC_004631	GAA	2	6	584774	584779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29141025
12509	NC_004631	CGTCG	2	10	584798	584807	0 %	20 %	40 %	40 %	29141025
12510	NC_004631	GAC	2	6	584840	584845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141025
12511	NC_004631	ACA	2	6	584914	584919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29141025
12512	NC_004631	GCG	2	6	584952	584957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141025
12513	NC_004631	CGG	2	6	585023	585028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141025
12514	NC_004631	CGG	2	6	585031	585036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141025
12515	NC_004631	TTTGAT	2	12	585174	585185	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	29141025
12516	NC_004631	GCC	2	6	585307	585312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12517	NC_004631	CTT	2	6	585348	585353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_004631	CAC	2	6	585358	585363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12519	NC_004631	AC	3	6	585362	585367	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12520	NC_004631	ACAGG	2	10	585369	585378	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
12521	NC_004631	TGT	2	6	585384	585389	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141026
12522	NC_004631	GTG	2	6	585452	585457	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141026
12523	NC_004631	TCG	2	6	585477	585482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141026
12524	NC_004631	ACC	2	6	585539	585544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141026
12525	NC_004631	TGC	2	6	585576	585581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141026
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12527	NC_004631	AGAT	2	8	585642	585649	50 %	25 %	25 %	0 %	29141026
12528	NC_004631	TGG	2	6	585660	585665	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141026
12529	NC_004631	TAT	2	6	585670	585675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141026
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12531	NC_004631	CGG	2	6	585797	585802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141026
12532	NC_004631	GAT	2	6	585817	585822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141026
12533	NC_004631	GCT	2	6	585889	585894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141026
12534	NC_004631	GTC	2	6	585908	585913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141026
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12544	NC_004631	TCT	2	6	586341	586346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141027
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12555	NC_004631	AAAT	2	8	586795	586802	75 %	25 %	0 %	0 %	29141028
12556	NC_004631	CGG	2	6	586831	586836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141028
12557	NC_004631	TCCGGT	2	12	586904	586915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141028
12558	NC_004631	T	6	6	586924	586929	0 %	100 %	0 %	0 %	29141028
12559	NC_004631	TTG	2	6	587051	587056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141028
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12565	NC_004631	TC	3	6	587242	587247	0 %	50 %	0 %	50 %	29141028
12566	NC_004631	CGG	2	6	587248	587253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141028
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12581	NC_004631	CAG	2	6	587870	587875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141029
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12592	NC_004631	TGA	2	6	588313	588318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141029
12593	NC_004631	CG	3	6	588393	588398	0 %	0 %	50 %	50 %	29141029
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12987	NC_004631	TTC	2	6	605999	606004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141047
12988	NC_004631	TCA	2	6	606021	606026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141047
12989	NC_004631	T	6	6	606091	606096	0 %	100 %	0 %	0 %	29141047
12990	NC_004631	CAT	2	6	606178	606183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141047
12991	NC_004631	GCC	2	6	606224	606229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141047
12992	NC_004631	T	6	6	606240	606245	0 %	100 %	0 %	0 %	29141047
12993	NC_004631	CGC	2	6	606248	606253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141047
12994	NC_004631	GA	3	6	606354	606359	50 %	0 %	50 %	0 %	29141047
12995	NC_004631	A	6	6	606366	606371	100 %	0 %	0 %	0 %	29141047
12996	NC_004631	TGA	2	6	606434	606439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12998	NC_004631	CGGCCA	2	12	606572	606583	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	29141048
12999	NC_004631	CAG	2	6	606605	606610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141048
13000	NC_004631	TCT	2	6	606643	606648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29141048

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