MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_004631	ACT	2	6	560322	560327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29141001
12002	NC_004631	GGC	3	9	560417	560425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141001
12003	NC_004631	CGATG	2	10	560458	560467	20 %	20 %	40 %	20 %	29141001
12004	NC_004631	CCA	2	6	560478	560483	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29141001
12005	NC_004631	ATG	2	6	560520	560525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141001
12006	NC_004631	GTT	2	6	560567	560572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141001
12007	NC_004631	GC	3	6	560597	560602	0 %	0 %	50 %	50 %	29141001
12008	NC_004631	GC	3	6	560604	560609	0 %	0 %	50 %	50 %	29141001
12009	NC_004631	TCG	2	6	560625	560630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141001
12010	NC_004631	TGCA	2	8	560693	560700	25 %	25 %	25 %	25 %	29141001
12011	NC_004631	CT	3	6	560890	560895	0 %	50 %	0 %	50 %	29141001
12012	NC_004631	GGC	2	6	561032	561037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141001
12013	NC_004631	GTA	2	6	561087	561092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12014	NC_004631	CAA	2	6	561094	561099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12015	NC_004631	T	6	6	561125	561130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12016	NC_004631	AAC	2	6	561140	561145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12017	NC_004631	TA	3	6	561161	561166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12018	NC_004631	TG	3	6	561210	561215	0 %	50 %	50 %	0 %	29141002
12019	NC_004631	TTTTTG	2	12	561241	561252	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	29141002
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12021	NC_004631	GCC	2	6	561339	561344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141002
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12023	NC_004631	TAT	2	6	561363	561368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141002
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12025	NC_004631	GGA	2	6	561554	561559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29141002
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12029	NC_004631	T	6	6	561703	561708	0 %	100 %	0 %	0 %	29141002
12030	NC_004631	GTT	2	6	561723	561728	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29141002
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12051	NC_004631	ATA	2	6	562877	562882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12052	NC_004631	TTG	2	6	562901	562906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12053	NC_004631	TAT	2	6	562944	562949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29141005
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12061	NC_004631	AGAA	2	8	563297	563304	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12062	NC_004631	AGA	2	6	563323	563328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12063	NC_004631	TCA	2	6	563341	563346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12065	NC_004631	TA	3	6	563448	563453	50 %	50 %	0 %	0 %	29141006
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12119	NC_004631	TGC	2	6	565951	565956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141008
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12122	NC_004631	AT	3	6	566129	566134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12123	NC_004631	GGC	2	6	566139	566144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12124	NC_004631	TGA	2	6	566214	566219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29141009
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12246	NC_004631	CGG	2	6	571994	571999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141014
12247	NC_004631	GTC	2	6	572012	572017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141014
12248	NC_004631	TGC	2	6	572063	572068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141014
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12251	NC_004631	CGG	2	6	572159	572164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29141014
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12272	NC_004631	TTTA	2	8	573212	573219	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12273	NC_004631	GGAA	2	8	573226	573233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12274	NC_004631	TTTTCT	2	12	573249	573260	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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12280	NC_004631	TCG	2	6	573535	573540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141016
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12297	NC_004631	A	6	6	574691	574696	100 %	0 %	0 %	0 %	29141017
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12351	NC_004631	A	6	6	576951	576956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12352	NC_004631	TGAC	2	8	577030	577037	25 %	25 %	25 %	25 %	29141019
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12491	NC_004631	TGC	2	6	583810	583815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141024
12492	NC_004631	TGG	2	6	583873	583878	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29141024
12493	NC_004631	CCG	2	6	583915	583920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141024
12494	NC_004631	GTC	2	6	583921	583926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29141024
12495	NC_004631	CGC	2	6	583952	583957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29141024
12496	NC_004631	AGC	2	6	583975	583980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29141024
12497	NC_004631	A	6	6	584025	584030	100 %	0 %	0 %	0 %	29141024
12498	NC_004631	GACGG	2	10	584040	584049	20 %	0 %	60 %	20 %	29141024
12499	NC_004631	CGCGC	2	10	584194	584203	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
12500	NC_004631	A	6	6	584421	584426	100 %	0 %	0 %	0 %	29141025

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