MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_004631	TTC	2	6	488337	488342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140941
10502	NC_004631	AAC	2	6	488390	488395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140941
10503	NC_004631	GGC	2	6	488542	488547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140941
10504	NC_004631	GCG	2	6	488555	488560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140941
10505	NC_004631	CGG	2	6	488572	488577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140941
10506	NC_004631	CGG	2	6	488641	488646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140941
10507	NC_004631	AAC	2	6	488717	488722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140941
10508	NC_004631	GTG	2	6	488756	488761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140941
10509	NC_004631	GCC	2	6	488840	488845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140941
10510	NC_004631	CAT	2	6	488887	488892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140941
10511	NC_004631	TAC	3	9	488900	488908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140941
10512	NC_004631	GCAA	2	8	488934	488941	50 %	0 %	25 %	25 %	29140941
10513	NC_004631	TGA	2	6	489006	489011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140941
10514	NC_004631	GCG	3	9	489027	489035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140941
10515	NC_004631	GGC	2	6	489052	489057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140941
10516	NC_004631	GTAA	2	8	489063	489070	50 %	25 %	25 %	0 %	29140941
10517	NC_004631	TTC	2	6	489081	489086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140942
10518	NC_004631	TGC	2	6	489095	489100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140942
10519	NC_004631	CTG	2	6	489151	489156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140942
10520	NC_004631	GC	3	6	489167	489172	0 %	0 %	50 %	50 %	29140942
10521	NC_004631	GGT	2	6	489234	489239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140942
10522	NC_004631	GCT	2	6	489241	489246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140942
10523	NC_004631	GCT	2	6	489258	489263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140942
10524	NC_004631	GGC	2	6	489264	489269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140942
10525	NC_004631	CTG	2	6	489304	489309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140942
10526	NC_004631	GAA	2	6	489580	489585	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140942
10527	NC_004631	TGC	2	6	489635	489640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140942
10528	NC_004631	CT	3	6	489676	489681	0 %	50 %	0 %	50 %	29140942
10529	NC_004631	TGA	2	6	489761	489766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140942
10530	NC_004631	CTG	4	12	489838	489849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140942
10531	NC_004631	ACG	2	6	489931	489936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140943
10532	NC_004631	CTG	2	6	490002	490007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140943
10533	NC_004631	GAT	2	6	490013	490018	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140943
10534	NC_004631	TGC	2	6	490087	490092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140943
10535	NC_004631	CTG	2	6	490158	490163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140943
10536	NC_004631	CTG	2	6	490206	490211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140943
10537	NC_004631	CTG	2	6	490215	490220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140943
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10539	NC_004631	TGT	2	6	490267	490272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140943
10540	NC_004631	GGCT	2	8	490299	490306	0 %	25 %	50 %	25 %	29140943
10541	NC_004631	ATG	2	6	490326	490331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140943
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10545	NC_004631	GGT	2	6	490568	490573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140943
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10551	NC_004631	AGG	2	6	490756	490761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140943
10552	NC_004631	TTCC	2	8	490841	490848	0 %	50 %	0 %	50 %	29140944
10553	NC_004631	TTG	2	6	490864	490869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140944
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10555	NC_004631	CTG	2	6	490897	490902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140944
10556	NC_004631	ATT	2	6	490906	490911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140944
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10559	NC_004631	ACA	2	6	491045	491050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140944
10560	NC_004631	TGC	2	6	491069	491074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140944
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10572	NC_004631	GC	3	6	491531	491536	0 %	0 %	50 %	50 %	29140944
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10592	NC_004631	GCA	2	6	492590	492595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140945
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10594	NC_004631	AT	3	6	492627	492632	50 %	50 %	0 %	0 %	29140945
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10602	NC_004631	TCG	2	6	492906	492911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10603	NC_004631	GT	3	6	492922	492927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10604	NC_004631	GAC	4	12	493030	493041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140946
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10606	NC_004631	GC	3	6	493203	493208	0 %	0 %	50 %	50 %	29140946
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10610	NC_004631	TTC	2	6	493279	493284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140946
10611	NC_004631	AAT	2	6	493307	493312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10612	NC_004631	TAA	2	6	493339	493344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10613	NC_004631	TCAT	2	8	493415	493422	25 %	50 %	0 %	25 %	29140947
10614	NC_004631	CTG	2	6	493423	493428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140947
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10619	NC_004631	CAC	2	6	493819	493824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140947
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10991	NC_004631	TGG	2	6	511686	511691	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140964
10992	NC_004631	ATG	2	6	511705	511710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140964
10993	NC_004631	CGG	2	6	511750	511755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10994	NC_004631	GTC	2	6	511757	511762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10995	NC_004631	AGCGC	2	10	511776	511785	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10996	NC_004631	A	6	6	511840	511845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10997	NC_004631	T	6	6	511861	511866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10998	NC_004631	TGG	2	6	511871	511876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10999	NC_004631	GTG	2	6	511950	511955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11000	NC_004631	TGA	2	6	511958	511963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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