MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_004631	TGG	2	6	466712	466717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140918
10002	NC_004631	GGC	2	6	466804	466809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140918
10003	NC_004631	GCA	2	6	466826	466831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140918
10004	NC_004631	GCA	3	9	466907	466915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140918
10005	NC_004631	GCC	2	6	466918	466923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140918
10006	NC_004631	ACG	2	6	466970	466975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140918
10007	NC_004631	GCCTG	2	10	467119	467128	0 %	20 %	40 %	40 %	29140918
10008	NC_004631	TCA	2	6	467155	467160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140919
10009	NC_004631	CTG	2	6	467253	467258	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140919
10010	NC_004631	GTC	2	6	467263	467268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140919
10011	NC_004631	GAT	2	6	467313	467318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140919
10012	NC_004631	CAG	2	6	467325	467330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140919
10013	NC_004631	CTG	2	6	467372	467377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140919
10014	NC_004631	GCC	2	6	467386	467391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140919
10015	NC_004631	GGT	2	6	467396	467401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140919
10016	NC_004631	CGG	2	6	467431	467436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140919
10017	NC_004631	CGCGC	2	10	467475	467484	0 %	0 %	40 %	60 %	29140919
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10019	NC_004631	GGC	2	6	467612	467617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140919
10020	NC_004631	TCG	2	6	467626	467631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140919
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10022	NC_004631	GCCA	2	8	467709	467716	25 %	0 %	25 %	50 %	29140919
10023	NC_004631	GCG	2	6	467727	467732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140919
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10034	NC_004631	CA	3	6	468147	468152	50 %	0 %	0 %	50 %	29140920
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10052	NC_004631	TGG	2	6	468888	468893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140920
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10054	NC_004631	TGAA	2	8	468949	468956	50 %	25 %	25 %	0 %	29140920
10055	NC_004631	GGC	2	6	469142	469147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140921
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10058	NC_004631	GCA	2	6	469272	469277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140921
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10106	NC_004631	GTCG	2	8	470672	470679	0 %	25 %	50 %	25 %	29140922
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10119	NC_004631	CGCC	2	8	471178	471185	0 %	0 %	25 %	75 %	29140923
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10121	NC_004631	GTG	2	6	471234	471239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140923
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10243	NC_004631	CTG	2	6	476969	476974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140927
10244	NC_004631	ACCA	2	8	476979	476986	50 %	0 %	0 %	50 %	29140927
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10333	NC_004631	TAGCT	2	10	480733	480742	20 %	40 %	20 %	20 %	29140932
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10345	NC_004631	TGAAG	2	10	481288	481297	40 %	20 %	40 %	0 %	29140932
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10356	NC_004631	AT	3	6	481783	481788	50 %	50 %	0 %	0 %	29140932
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10358	NC_004631	TACTG	2	10	481948	481957	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10359	NC_004631	GCGG	2	8	481978	481985	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10360	NC_004631	AAAC	2	8	482066	482073	75 %	0 %	0 %	25 %	29140933
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10363	NC_004631	AT	3	6	482267	482272	50 %	50 %	0 %	0 %	29140933
10364	NC_004631	GCAG	2	8	482290	482297	25 %	0 %	50 %	25 %	29140933
10365	NC_004631	TAC	2	6	482345	482350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140933
10366	NC_004631	TTTG	2	8	482361	482368	0 %	75 %	25 %	0 %	29140933
10367	NC_004631	GCG	2	6	482481	482486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140934
10368	NC_004631	CCG	2	6	482516	482521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140934
10369	NC_004631	CGT	2	6	482633	482638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140934
10370	NC_004631	ACCG	2	8	482674	482681	25 %	0 %	25 %	50 %	29140934
10371	NC_004631	A	6	6	482731	482736	100 %	0 %	0 %	0 %	29140934
10372	NC_004631	GCC	2	6	482740	482745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140934
10373	NC_004631	GCT	2	6	482754	482759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140934
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10378	NC_004631	GTA	2	6	482887	482892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140934
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10386	NC_004631	CCG	2	6	483134	483139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140934
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10398	NC_004631	TTG	2	6	483603	483608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140935
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10471	NC_004631	TTA	2	6	487042	487047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10486	NC_004631	TCC	2	6	487909	487914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10487	NC_004631	CGC	2	6	487918	487923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10488	NC_004631	GGGA	2	8	487927	487934	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10489	NC_004631	ATC	2	6	487962	487967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10490	NC_004631	TA	3	6	487974	487979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10491	NC_004631	ATG	2	6	488012	488017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10492	NC_004631	GCA	2	6	488093	488098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140941
10493	NC_004631	GGCAG	2	10	488110	488119	20 %	0 %	60 %	20 %	29140941
10494	NC_004631	GCT	2	6	488134	488139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140941
10495	NC_004631	GCC	2	6	488174	488179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140941
10496	NC_004631	CCG	2	6	488186	488191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140941
10497	NC_004631	CAA	2	6	488198	488203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140941
10498	NC_004631	CGG	2	6	488218	488223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140941
10499	NC_004631	TCA	2	6	488258	488263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140941
10500	NC_004631	CGT	2	6	488302	488307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140941

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