MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
100001	NC_004631	TCA	2	6	4750636	4750641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144829
100002	NC_004631	CGATA	2	10	4750642	4750651	40 %	20 %	20 %	20 %	29144829
100003	NC_004631	CCG	2	6	4750755	4750760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144829
100004	NC_004631	CGT	2	6	4750825	4750830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144829
100005	NC_004631	CGG	2	6	4750835	4750840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144829
100006	NC_004631	GAT	2	6	4750847	4750852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29144829
100007	NC_004631	GGCT	2	8	4750936	4750943	0 %	25 %	50 %	25 %	29144829
100008	NC_004631	CCG	2	6	4750948	4750953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144829
100009	NC_004631	GC	3	6	4750954	4750959	0 %	0 %	50 %	50 %	29144829
100010	NC_004631	CA	3	6	4750966	4750971	50 %	0 %	0 %	50 %	29144829
100011	NC_004631	TGGC	2	8	4750995	4751002	0 %	25 %	50 %	25 %	29144829
100012	NC_004631	GCG	2	6	4751007	4751012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144829
100013	NC_004631	GCG	2	6	4751062	4751067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144829
100014	NC_004631	CAG	3	9	4751078	4751086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144829
100015	NC_004631	CCA	2	6	4751168	4751173	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29144829
100016	NC_004631	GCT	2	6	4751194	4751199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144829
100017	NC_004631	GAC	2	6	4751206	4751211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144829
100018	NC_004631	CG	3	6	4751232	4751237	0 %	0 %	50 %	50 %	29144829
100019	NC_004631	GCG	2	6	4751254	4751259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144829
100020	NC_004631	ACGC	2	8	4751288	4751295	25 %	0 %	25 %	50 %	29144829
100021	NC_004631	ACG	2	6	4751313	4751318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144829
100022	NC_004631	TCA	2	6	4751356	4751361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144829
100023	NC_004631	AGT	2	6	4751395	4751400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29144829
100024	NC_004631	GGC	2	6	4751473	4751478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144829
100025	NC_004631	GTG	2	6	4751492	4751497	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29144829
100026	NC_004631	CG	3	6	4751513	4751518	0 %	0 %	50 %	50 %	29144829
100027	NC_004631	GGC	2	6	4751522	4751527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144829
100028	NC_004631	GC	3	6	4751537	4751542	0 %	0 %	50 %	50 %	29144829
100029	NC_004631	ATC	2	6	4751594	4751599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144829
100030	NC_004631	GCA	2	6	4751608	4751613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144829
100031	NC_004631	GGC	2	6	4751667	4751672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100032	NC_004631	TAG	2	6	4751678	4751683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100033	NC_004631	CGA	2	6	4751756	4751761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144830
100034	NC_004631	GC	3	6	4751814	4751819	0 %	0 %	50 %	50 %	29144830
100035	NC_004631	TTCCC	2	10	4751839	4751848	0 %	40 %	0 %	60 %	29144830
100036	NC_004631	CG	3	6	4751921	4751926	0 %	0 %	50 %	50 %	29144830
100037	NC_004631	TGC	2	6	4751979	4751984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144830
100038	NC_004631	CGC	2	6	4752027	4752032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144830
100039	NC_004631	ACG	2	6	4752056	4752061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144830
100040	NC_004631	CGG	2	6	4752090	4752095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144830
100041	NC_004631	CGC	2	6	4752100	4752105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144830
100042	NC_004631	CAA	2	6	4752113	4752118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29144830
100043	NC_004631	A	6	6	4752214	4752219	100 %	0 %	0 %	0 %	29144831
100044	NC_004631	CTG	2	6	4752265	4752270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144831
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100046	NC_004631	TGC	2	6	4752376	4752381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144831
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100048	NC_004631	GCC	2	6	4752456	4752461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144831
100049	NC_004631	CGA	2	6	4752496	4752501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144831
100050	NC_004631	CGC	2	6	4752504	4752509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144831
100051	NC_004631	CAT	3	9	4752545	4752553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144831
100052	NC_004631	TAA	2	6	4752573	4752578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29144831
100053	NC_004631	ATG	2	6	4752594	4752599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100054	NC_004631	GCA	2	6	4752785	4752790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409994604
100055	NC_004631	CG	3	6	4752791	4752796	0 %	0 %	50 %	50 %	409994604
100056	NC_004631	GGC	2	6	4752835	4752840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409994604
100057	NC_004631	TTA	2	6	4752853	4752858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409994604
100058	NC_004631	TAT	2	6	4752938	4752943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409994604
100059	NC_004631	ACA	2	6	4752965	4752970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409994604
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100061	NC_004631	CG	3	6	4753102	4753107	0 %	0 %	50 %	50 %	409994604
100062	NC_004631	GGC	2	6	4753146	4753151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409994604
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100070	NC_004631	CGC	2	6	4753402	4753407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144833
100071	NC_004631	CAT	2	6	4753416	4753421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144833
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100085	NC_004631	TGA	2	6	4754088	4754093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29144833
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100088	NC_004631	GGCG	2	8	4754412	4754419	0 %	0 %	75 %	25 %	29144833
100089	NC_004631	GAA	2	6	4754434	4754439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29144833
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100096	NC_004631	GC	3	6	4754776	4754781	0 %	0 %	50 %	50 %	29144833
100097	NC_004631	GAA	2	6	4754802	4754807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29144833
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100099	NC_004631	AACCTG	2	12	4754893	4754904	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	29144833
100100	NC_004631	CG	3	6	4754942	4754947	0 %	0 %	50 %	50 %	29144833
100101	NC_004631	CCG	2	6	4754976	4754981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100102	NC_004631	T	6	6	4755039	4755044	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100103	NC_004631	T	6	6	4755059	4755064	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100104	NC_004631	TGA	2	6	4755113	4755118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100105	NC_004631	TAA	2	6	4755196	4755201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100106	NC_004631	CGT	2	6	4755228	4755233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100107	NC_004631	CTG	2	6	4755390	4755395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144834
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100113	NC_004631	GTAAA	2	10	4755832	4755841	60 %	20 %	20 %	0 %	29144834
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100466	NC_004631	CGT	2	6	4774072	4774077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486765
100467	NC_004631	CAC	2	6	4774122	4774127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161486765
100468	NC_004631	TAC	2	6	4774147	4774152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161486765
100469	NC_004631	GCAA	2	8	4774271	4774278	50 %	0 %	25 %	25 %	161486765
100470	NC_004631	CGG	2	6	4774364	4774369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161486765
100471	NC_004631	TAA	2	6	4774416	4774421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161486765
100472	NC_004631	GCAC	2	8	4774435	4774442	25 %	0 %	25 %	50 %	161486765
100473	NC_004631	CGCC	2	8	4774497	4774504	0 %	0 %	25 %	75 %	161486765
100474	NC_004631	TGA	2	6	4774526	4774531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161486765
100475	NC_004631	GCG	2	6	4774689	4774694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161486765
100476	NC_004631	TCG	2	6	4774722	4774727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486765
100477	NC_004631	GAAAGA	2	12	4774767	4774778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161486765
100478	NC_004631	GC	3	6	4775020	4775025	0 %	0 %	50 %	50 %	161486765
100479	NC_004631	GTA	2	6	4775054	4775059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161486765
100480	NC_004631	GC	3	6	4775080	4775085	0 %	0 %	50 %	50 %	161486765
100481	NC_004631	TGG	2	6	4775104	4775109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161486765
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100483	NC_004631	ATC	2	6	4775150	4775155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161486765
100484	NC_004631	GGA	2	6	4775157	4775162	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	161486765
100485	NC_004631	CTG	2	6	4775380	4775385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161486765
100486	NC_004631	CAACAT	2	12	4775397	4775408	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	161486765
100487	NC_004631	CAG	2	6	4775437	4775442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161486765
100488	NC_004631	TAA	2	6	4775448	4775453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	161486765
100489	NC_004631	CGG	2	6	4775468	4775473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161486765
100490	NC_004631	GCCGG	2	10	4775482	4775491	0 %	0 %	60 %	40 %	161486765
100491	NC_004631	CG	3	6	4775573	4775578	0 %	0 %	50 %	50 %	161486765
100492	NC_004631	GTTAT	2	10	4775689	4775698	20 %	60 %	20 %	0 %	161486765
100493	NC_004631	CGG	2	6	4775725	4775730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100494	NC_004631	AAC	2	6	4775774	4775779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29144852
100495	NC_004631	ATCTGC	2	12	4775834	4775845	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29144852
100496	NC_004631	TTA	2	6	4775848	4775853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29144852
100497	NC_004631	CG	3	6	4775894	4775899	0 %	0 %	50 %	50 %	29144852
100498	NC_004631	ATT	2	6	4775905	4775910	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29144852
100499	NC_004631	GAG	2	6	4775911	4775916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29144852
100500	NC_004631	TGC	2	6	4775918	4775923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144852

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