MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004631	CGCC	2	8	22660	22667	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
502	NC_004631	GGC	2	6	22686	22691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_004631	AGA	2	6	22706	22711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_004631	CGG	2	6	22748	22753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_004631	T	6	6	22758	22763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_004631	CT	3	6	22800	22805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
507	NC_004631	GGT	2	6	22953	22958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_004631	CTA	2	6	22960	22965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_004631	CGG	2	6	23000	23005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_004631	CTGG	2	8	23006	23013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
511	NC_004631	TAT	2	6	23031	23036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_004631	GCT	2	6	23037	23042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_004631	ATA	2	6	23057	23062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_004631	TTA	2	6	23172	23177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_004631	TCTTAA	2	12	23209	23220	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
516	NC_004631	TTAT	2	8	23271	23278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_004631	A	7	7	23344	23350	100 %	0 %	0 %	0 %	29140564
518	NC_004631	TGA	2	6	23351	23356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140564
519	NC_004631	ACG	2	6	23357	23362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140564
520	NC_004631	ATA	2	6	23375	23380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140564
521	NC_004631	TTA	2	6	23389	23394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140564
522	NC_004631	CTTTT	2	10	23399	23408	0 %	80 %	0 %	20 %	29140564
523	NC_004631	T	6	6	23405	23410	0 %	100 %	0 %	0 %	29140564
524	NC_004631	CAG	2	6	23413	23418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140564
525	NC_004631	TTG	2	6	23458	23463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140564
526	NC_004631	TTTA	2	8	23504	23511	25 %	75 %	0 %	0 %	29140564
527	NC_004631	ATG	2	6	23519	23524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140564
528	NC_004631	TTTC	2	8	23558	23565	0 %	75 %	0 %	25 %	29140564
529	NC_004631	TGA	2	6	23571	23576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140564
530	NC_004631	AT	3	6	23588	23593	50 %	50 %	0 %	0 %	29140564
531	NC_004631	CG	3	6	23658	23663	0 %	0 %	50 %	50 %	29140564
532	NC_004631	ACG	2	6	23759	23764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140564
533	NC_004631	TGA	2	6	23795	23800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140564
534	NC_004631	GC	4	8	23801	23808	0 %	0 %	50 %	50 %	29140564
535	NC_004631	GCT	2	6	23853	23858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140564
536	NC_004631	TCTG	2	8	23961	23968	0 %	50 %	25 %	25 %	29140564
537	NC_004631	A	7	7	23973	23979	100 %	0 %	0 %	0 %	29140564
538	NC_004631	GGC	2	6	24005	24010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140564
539	NC_004631	AT	3	6	24062	24067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_004631	TAA	2	6	24101	24106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_004631	AAG	2	6	24128	24133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
542	NC_004631	ATT	2	6	24134	24139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_004631	ACA	2	6	24201	24206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_004631	GAT	2	6	24238	24243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_004631	TAA	2	6	24265	24270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_004631	TAA	2	6	24272	24277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_004631	ACG	2	6	24312	24317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_004631	AAG	2	6	24359	24364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_004631	T	6	6	24369	24374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_004631	GAA	2	6	24403	24408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_004631	CAG	2	6	24413	24418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_004631	A	6	6	24429	24434	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_004631	TGAA	2	8	24470	24477	50 %	25 %	25 %	0 %	29140565
554	NC_004631	TGT	2	6	24525	24530	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140565
555	NC_004631	TAC	2	6	24547	24552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140565
556	NC_004631	CGGTA	2	10	24565	24574	20 %	20 %	40 %	20 %	29140565
557	NC_004631	CGC	2	6	24598	24603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140565
558	NC_004631	CTGTT	2	10	24604	24613	0 %	60 %	20 %	20 %	29140565
559	NC_004631	GGC	2	6	24685	24690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140565
560	NC_004631	AGA	2	6	24700	24705	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140565
561	NC_004631	CCAG	2	8	24741	24748	25 %	0 %	25 %	50 %	29140565
562	NC_004631	GCG	2	6	24752	24757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140565
563	NC_004631	CAG	2	6	24773	24778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140565
564	NC_004631	CGA	2	6	24828	24833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140565
565	NC_004631	T	7	7	25029	25035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_004631	CG	3	6	25068	25073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_004631	A	8	8	25119	25126	100 %	0 %	0 %	0 %	29140566
568	NC_004631	ATT	2	6	25145	25150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140566
569	NC_004631	CTG	2	6	25155	25160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140566
570	NC_004631	CGG	2	6	25162	25167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140566
571	NC_004631	CCT	2	6	25249	25254	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29140566
572	NC_004631	ATT	2	6	25260	25265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140566
573	NC_004631	TTC	2	6	25268	25273	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140566
574	NC_004631	T	7	7	25285	25291	0 %	100 %	0 %	0 %	29140566
575	NC_004631	CGC	2	6	25348	25353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140566
576	NC_004631	CT	3	6	25354	25359	0 %	50 %	0 %	50 %	29140566
577	NC_004631	A	6	6	25374	25379	100 %	0 %	0 %	0 %	29140566
578	NC_004631	AT	3	6	25384	25389	50 %	50 %	0 %	0 %	29140566
579	NC_004631	TAT	2	6	25394	25399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140566
580	NC_004631	ACCG	2	8	25418	25425	25 %	0 %	25 %	50 %	29140566
581	NC_004631	TTTA	2	8	25441	25448	25 %	75 %	0 %	0 %	29140566
582	NC_004631	TAC	2	6	25635	25640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140566
583	NC_004631	A	6	6	25671	25676	100 %	0 %	0 %	0 %	29140566
584	NC_004631	CCG	2	6	25695	25700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140566
585	NC_004631	ACG	2	6	25770	25775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140566
586	NC_004631	ATG	2	6	25799	25804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140566
587	NC_004631	GCGCCT	2	12	25891	25902	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
588	NC_004631	TCTG	2	8	25935	25942	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
589	NC_004631	GGC	2	6	25992	25997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_004631	GAC	2	6	26073	26078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_004631	GC	3	6	26087	26092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
592	NC_004631	GCCT	2	8	26116	26123	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
593	NC_004631	GGC	3	9	26184	26192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_004631	GCC	2	6	26227	26232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_004631	GCA	2	6	26253	26258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_004631	GGC	2	6	26283	26288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_004631	GGC	2	6	26401	26406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_004631	ACT	2	6	26474	26479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_004631	GCG	2	6	26498	26503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_004631	AGCGAC	2	12	26512	26523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_004631	GCA	2	6	26526	26531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_004631	ATT	2	6	26610	26615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_004631	CCTT	2	8	26622	26629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
604	NC_004631	GAC	2	6	26653	26658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_004631	CAT	2	6	26751	26756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_004631	GCC	2	6	26772	26777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_004631	CCG	2	6	26810	26815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_004631	GCG	2	6	26819	26824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_004631	CCG	2	6	26885	26890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_004631	GGC	2	6	26912	26917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_004631	GCG	2	6	26926	26931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_004631	TAG	2	6	26955	26960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
613	NC_004631	TCAG	2	8	26981	26988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
614	NC_004631	GCG	2	6	27077	27082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_004631	ATA	2	6	27146	27151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_004631	GAT	2	6	27265	27270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_004631	ATT	2	6	27347	27352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_004631	TAT	2	6	27361	27366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_004631	AGG	2	6	27370	27375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
620	NC_004631	ATCA	2	8	27394	27401	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
621	NC_004631	TTA	2	6	27428	27433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_004631	TGA	2	6	27462	27467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_004631	TTG	2	6	27478	27483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_004631	ACA	2	6	27533	27538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_004631	ATG	3	9	27620	27628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_004631	ACT	2	6	27720	27725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_004631	ACA	2	6	27746	27751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_004631	GCG	2	6	27788	27793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_004631	CAG	2	6	27868	27873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_004631	GCG	2	6	27890	27895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_004631	TGG	2	6	27899	27904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
632	NC_004631	AGCC	2	8	27928	27935	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
633	NC_004631	CG	3	6	28017	28022	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_004631	GGT	2	6	28032	28037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_004631	CGA	2	6	28046	28051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_004631	TGA	2	6	28095	28100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_004631	TGA	2	6	28110	28115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
638	NC_004631	CCGA	2	8	28135	28142	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
639	NC_004631	GC	3	6	28145	28150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
640	NC_004631	GCGT	2	8	28181	28188	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
641	NC_004631	ACGGTG	2	12	28237	28248	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
642	NC_004631	TTG	2	6	28271	28276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
643	NC_004631	GCGTC	2	10	28361	28370	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
644	NC_004631	ATC	2	6	28373	28378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_004631	TC	3	6	28377	28382	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
646	NC_004631	TCC	2	6	28384	28389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
647	NC_004631	CTG	2	6	28453	28458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140567
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649	NC_004631	ATTA	2	8	28528	28535	50 %	50 %	0 %	0 %	29140567
650	NC_004631	A	6	6	28595	28600	100 %	0 %	0 %	0 %	29140567
651	NC_004631	GT	3	6	28624	28629	0 %	50 %	50 %	0 %	29140567
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653	NC_004631	TTC	2	6	28764	28769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140567
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903	NC_004631	TGAAA	2	10	40124	40133	60 %	20 %	20 %	0 %	29140579
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