MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
96001	NC_004631	CGC	3	9	4558286	4558294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144654
96002	NC_004631	GACGC	2	10	4558306	4558315	20 %	0 %	40 %	40 %	29144654
96003	NC_004631	CGC	2	6	4558334	4558339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144654
96004	NC_004631	CGAC	2	8	4558342	4558349	25 %	0 %	25 %	50 %	29144654
96005	NC_004631	GTC	2	6	4558370	4558375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144654
96006	NC_004631	CGG	2	6	4558386	4558391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144654
96007	NC_004631	TGGC	2	8	4558421	4558428	0 %	25 %	50 %	25 %	29144654
96008	NC_004631	GGC	2	6	4558431	4558436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144654
96009	NC_004631	CGT	2	6	4558490	4558495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144654
96010	NC_004631	GCCC	2	8	4558504	4558511	0 %	0 %	25 %	75 %	29144654
96011	NC_004631	AG	3	6	4558551	4558556	50 %	0 %	50 %	0 %	29144654
96012	NC_004631	CAG	2	6	4558600	4558605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144654
96013	NC_004631	A	6	6	4558615	4558620	100 %	0 %	0 %	0 %	29144654
96014	NC_004631	GATGCG	2	12	4558663	4558674	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	29144654
96015	NC_004631	CAAT	2	8	4558688	4558695	50 %	25 %	0 %	25 %	29144654
96016	NC_004631	CGC	2	6	4558724	4558729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144654
96017	NC_004631	GGC	2	6	4558740	4558745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144654
96018	NC_004631	ATT	2	6	4558855	4558860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29144654
96019	NC_004631	ACC	2	6	4558871	4558876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29144654
96020	NC_004631	GCG	2	6	4558916	4558921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144654
96021	NC_004631	TGTCC	2	10	4558932	4558941	0 %	40 %	20 %	40 %	29144654
96022	NC_004631	CAT	2	6	4558944	4558949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144654
96023	NC_004631	ATG	2	6	4558982	4558987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29144654
96024	NC_004631	TG	3	6	4558993	4558998	0 %	50 %	50 %	0 %	29144654
96025	NC_004631	TG	3	6	4559002	4559007	0 %	50 %	50 %	0 %	29144654
96026	NC_004631	CGGCG	2	10	4559013	4559022	0 %	0 %	60 %	40 %	29144654
96027	NC_004631	TAC	2	6	4559079	4559084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144654
96028	NC_004631	GCG	2	6	4559088	4559093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144654
96029	NC_004631	ATG	2	6	4559126	4559131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29144654
96030	NC_004631	TTAT	2	8	4559214	4559221	25 %	75 %	0 %	0 %	29144655
96031	NC_004631	ACG	2	6	4559249	4559254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144655
96032	NC_004631	ATG	2	6	4559345	4559350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29144655
96033	NC_004631	GGA	2	6	4559386	4559391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29144655
96034	NC_004631	ATT	2	6	4559415	4559420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29144655
96035	NC_004631	ACG	2	6	4559427	4559432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144655
96036	NC_004631	TGG	2	6	4559442	4559447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29144655
96037	NC_004631	CAA	2	6	4559456	4559461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29144655
96038	NC_004631	GAT	2	6	4559603	4559608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96039	NC_004631	AGC	2	6	4559633	4559638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144656
96040	NC_004631	CTG	2	6	4559646	4559651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144656
96041	NC_004631	GC	3	6	4559653	4559658	0 %	0 %	50 %	50 %	29144656
96042	NC_004631	GGCG	2	8	4559660	4559667	0 %	0 %	75 %	25 %	29144656
96043	NC_004631	TC	3	6	4559675	4559680	0 %	50 %	0 %	50 %	29144656
96044	NC_004631	AGC	2	6	4559704	4559709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144656
96045	NC_004631	GC	3	6	4559712	4559717	0 %	0 %	50 %	50 %	29144656
96046	NC_004631	GCT	2	6	4559894	4559899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144656
96047	NC_004631	CGG	2	6	4559948	4559953	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144656
96048	NC_004631	CCG	3	9	4559991	4559999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144656
96049	NC_004631	GTC	2	6	4560009	4560014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144656
96050	NC_004631	GC	3	6	4560031	4560036	0 %	0 %	50 %	50 %	29144656
96051	NC_004631	CCCG	2	8	4560037	4560044	0 %	0 %	25 %	75 %	29144656
96052	NC_004631	TCT	2	6	4560072	4560077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29144656
96053	NC_004631	GAT	2	6	4560078	4560083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29144656
96054	NC_004631	CAG	2	6	4560101	4560106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144656
96055	NC_004631	GCG	2	6	4560126	4560131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144656
96056	NC_004631	CG	4	8	4560130	4560137	0 %	0 %	50 %	50 %	29144656
96057	NC_004631	GTG	2	6	4560159	4560164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29144656
96058	NC_004631	CG	3	6	4560223	4560228	0 %	0 %	50 %	50 %	29144656
96059	NC_004631	CCATCG	2	12	4560241	4560252	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	29144656
96060	NC_004631	CG	3	6	4560251	4560256	0 %	0 %	50 %	50 %	29144656
96061	NC_004631	TATTT	2	10	4560321	4560330	20 %	80 %	0 %	0 %	29144656
96062	NC_004631	TCG	2	6	4560449	4560454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144656
96063	NC_004631	CG	3	6	4560453	4560458	0 %	0 %	50 %	50 %	29144656
96064	NC_004631	AGC	2	6	4560484	4560489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144656
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96067	NC_004631	GGGTA	2	10	4560601	4560610	20 %	20 %	60 %	0 %	29144656
96068	NC_004631	CGA	2	6	4560619	4560624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144656
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96070	NC_004631	TGG	2	6	4560724	4560729	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29144656
96071	NC_004631	GAA	2	6	4560756	4560761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29144656
96072	NC_004631	GCGA	2	8	4560771	4560778	25 %	0 %	50 %	25 %	29144656
96073	NC_004631	CAG	3	9	4560786	4560794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144656
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96075	NC_004631	ACCA	2	8	4560888	4560895	50 %	0 %	0 %	50 %	29144656
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96078	NC_004631	CGC	2	6	4560974	4560979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144657
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96082	NC_004631	TATTCG	2	12	4561091	4561102	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	29144657
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96084	NC_004631	GAG	2	6	4561128	4561133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29144657
96085	NC_004631	CTGGCG	2	12	4561134	4561145	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	29144657
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96090	NC_004631	CGCC	2	8	4561393	4561400	0 %	0 %	25 %	75 %	29144657
96091	NC_004631	A	6	6	4561423	4561428	100 %	0 %	0 %	0 %	29144657
96092	NC_004631	ATC	2	6	4561452	4561457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144657
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96098	NC_004631	TCA	2	6	4561868	4561873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144657
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96101	NC_004631	GGA	2	6	4561952	4561957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29144657
96102	NC_004631	CGC	2	6	4561997	4562002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144657
96103	NC_004631	CCG	2	6	4562026	4562031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144657
96104	NC_004631	GCG	2	6	4562040	4562045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144657
96105	NC_004631	CG	3	6	4562044	4562049	0 %	0 %	50 %	50 %	29144657
96106	NC_004631	CGG	2	6	4562093	4562098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144657
96107	NC_004631	GGT	2	6	4562112	4562117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29144657
96108	NC_004631	AGC	2	6	4562146	4562151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144657
96109	NC_004631	CGA	3	9	4562185	4562193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144657
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96111	NC_004631	GC	3	6	4562380	4562385	0 %	0 %	50 %	50 %	29144657
96112	NC_004631	TTG	2	6	4562457	4562462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29144657
96113	NC_004631	TCAG	2	8	4562483	4562490	25 %	25 %	25 %	25 %	29144657
96114	NC_004631	GCA	2	6	4562495	4562500	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144657
96115	NC_004631	ACA	2	6	4562534	4562539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29144657
96116	NC_004631	GCT	2	6	4562678	4562683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144657
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