MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
93001	NC_004631	CAA	2	6	4410883	4410888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93002	NC_004631	GTG	2	6	4410904	4410909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93003	NC_004631	GCA	2	6	4410950	4410955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93004	NC_004631	GAC	2	6	4410956	4410961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93005	NC_004631	AGC	2	6	4411117	4411122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93006	NC_004631	AAC	2	6	4411192	4411197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93007	NC_004631	GACTG	2	10	4411201	4411210	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93008	NC_004631	AAT	2	6	4411254	4411259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93009	NC_004631	GTG	2	6	4411264	4411269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93010	NC_004631	CAACG	2	10	4411277	4411286	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
93011	NC_004631	CTG	2	6	4411350	4411355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93012	NC_004631	ACT	2	6	4411479	4411484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93013	NC_004631	ATG	2	6	4411525	4411530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93014	NC_004631	TGG	2	6	4411572	4411577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93015	NC_004631	CGCT	2	8	4411684	4411691	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93016	NC_004631	GCAGG	2	10	4411714	4411723	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
93017	NC_004631	CTG	2	6	4411798	4411803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93018	NC_004631	GAT	2	6	4411822	4411827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93019	NC_004631	GTA	2	6	4411832	4411837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93020	NC_004631	ATT	2	6	4411846	4411851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93021	NC_004631	GAA	2	6	4411970	4411975	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29144500
93022	NC_004631	GGC	2	6	4412116	4412121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144500
93023	NC_004631	CAGC	2	8	4412128	4412135	25 %	0 %	25 %	50 %	29144500
93024	NC_004631	TGA	2	6	4412170	4412175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29144500
93025	NC_004631	ATC	2	6	4412252	4412257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144500
93026	NC_004631	GA	3	6	4412263	4412268	50 %	0 %	50 %	0 %	29144500
93027	NC_004631	TCA	2	6	4412318	4412323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144500
93028	NC_004631	GGTC	2	8	4412353	4412360	0 %	25 %	50 %	25 %	29144500
93029	NC_004631	GGCG	2	8	4412395	4412402	0 %	0 %	75 %	25 %	29144500
93030	NC_004631	TGG	2	6	4412458	4412463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29144500
93031	NC_004631	TGG	2	6	4412471	4412476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29144500
93032	NC_004631	A	7	7	4412546	4412552	100 %	0 %	0 %	0 %	29144500
93033	NC_004631	GC	3	6	4412632	4412637	0 %	0 %	50 %	50 %	29144500
93034	NC_004631	CGG	2	6	4412733	4412738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144500
93035	NC_004631	GGTGT	2	10	4412813	4412822	0 %	40 %	60 %	0 %	29144500
93036	NC_004631	CTC	2	6	4412946	4412951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29144500
93037	NC_004631	A	6	6	4413164	4413169	100 %	0 %	0 %	0 %	29144500
93038	NC_004631	TCA	2	6	4413178	4413183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144500
93039	NC_004631	GTG	2	6	4413184	4413189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93040	NC_004631	TCC	2	6	4413242	4413247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93041	NC_004631	TGCC	2	8	4413271	4413278	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93042	NC_004631	AGC	2	6	4413296	4413301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144501
93043	NC_004631	CGTT	2	8	4413496	4413503	0 %	50 %	25 %	25 %	29144501
93044	NC_004631	C	7	7	4413544	4413550	0 %	0 %	0 %	100 %	29144501
93045	NC_004631	AGTG	2	8	4413578	4413585	25 %	25 %	50 %	0 %	29144501
93046	NC_004631	TGAAGG	2	12	4413676	4413687	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	29144501
93047	NC_004631	GCT	2	6	4413809	4413814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144502
93048	NC_004631	CAGC	2	8	4413821	4413828	25 %	0 %	25 %	50 %	29144502
93049	NC_004631	GCA	2	6	4413848	4413853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144502
93050	NC_004631	GGA	2	6	4413872	4413877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29144502
93051	NC_004631	CAG	2	6	4413945	4413950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144502
93052	NC_004631	A	6	6	4413990	4413995	100 %	0 %	0 %	0 %	29144502
93053	NC_004631	CAG	2	6	4414001	4414006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144502
93054	NC_004631	ACC	2	6	4414074	4414079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29144502
93055	NC_004631	GAA	2	6	4414146	4414151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29144502
93056	NC_004631	GGC	2	6	4414166	4414171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144502
93057	NC_004631	ATC	2	6	4414176	4414181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144502
93058	NC_004631	TG	3	6	4414189	4414194	0 %	50 %	50 %	0 %	29144502
93059	NC_004631	GCCG	2	8	4414218	4414225	0 %	0 %	50 %	50 %	29144502
93060	NC_004631	CAG	2	6	4414303	4414308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144502
93061	NC_004631	GAT	2	6	4414341	4414346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29144502
93062	NC_004631	GAT	2	6	4414433	4414438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29144502
93063	NC_004631	CCA	2	6	4414471	4414476	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29144502
93064	NC_004631	CCG	2	6	4414548	4414553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144502
93065	NC_004631	TAT	2	6	4414586	4414591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29144502
93066	NC_004631	CTGGC	2	10	4414623	4414632	0 %	20 %	40 %	40 %	29144502
93067	NC_004631	GCC	2	6	4414725	4414730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144502
93068	NC_004631	TGG	2	6	4414822	4414827	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29144502
93069	NC_004631	GTT	2	6	4414838	4414843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29144502
93070	NC_004631	CAGC	2	8	4414856	4414863	25 %	0 %	25 %	50 %	29144502
93071	NC_004631	A	6	6	4414911	4414916	100 %	0 %	0 %	0 %	29144502
93072	NC_004631	CAC	2	6	4414925	4414930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29144502
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93074	NC_004631	GAG	2	6	4415007	4415012	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29144502
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93079	NC_004631	G	7	7	4415189	4415195	0 %	0 %	100 %	0 %	29144502
93080	NC_004631	ATT	2	6	4415265	4415270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29144502
93081	NC_004631	TGA	2	6	4415276	4415281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29144502
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93083	NC_004631	TCG	2	6	4415319	4415324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144502
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93085	NC_004631	AG	3	6	4415382	4415387	50 %	0 %	50 %	0 %	29144502
93086	NC_004631	AAG	2	6	4415419	4415424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29144502
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93090	NC_004631	GTT	2	6	4415572	4415577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29144503
93091	NC_004631	TGG	2	6	4415646	4415651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29144503
93092	NC_004631	CACT	2	8	4415667	4415674	25 %	25 %	0 %	50 %	29144503
93093	NC_004631	ACA	2	6	4415676	4415681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29144503
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93099	NC_004631	T	8	8	4415985	4415992	0 %	100 %	0 %	0 %	29144503
93100	NC_004631	GTG	2	6	4416005	4416010	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29144503
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93104	NC_004631	TCA	2	6	4416150	4416155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144503
93105	NC_004631	CTG	2	6	4416167	4416172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144503
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93112	NC_004631	GAT	2	6	4416585	4416590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29144504
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93118	NC_004631	G	6	6	4416951	4416956	0 %	0 %	100 %	0 %	29144504
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93473	NC_004631	A	8	8	4435935	4435942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93474	NC_004631	CTGG	2	8	4435974	4435981	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93475	NC_004631	T	7	7	4436033	4436039	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93476	NC_004631	TGT	2	6	4436056	4436061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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93478	NC_004631	AGA	2	6	4436408	4436413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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93480	NC_004631	GAG	2	6	4436490	4436495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93481	NC_004631	ATG	2	6	4436541	4436546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93482	NC_004631	GCG	2	6	4436547	4436552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93483	NC_004631	GGAC	2	8	4436567	4436574	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93484	NC_004631	GCTG	2	8	4436582	4436589	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
93485	NC_004631	TGC	2	6	4436681	4436686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93486	NC_004631	GCCATG	2	12	4436700	4436711	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93487	NC_004631	TTAA	2	8	4436847	4436854	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93488	NC_004631	TGA	2	6	4436915	4436920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93489	NC_004631	ACG	2	6	4436934	4436939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93490	NC_004631	TGT	2	6	4436947	4436952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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93493	NC_004631	GAG	2	6	4437138	4437143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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93500	NC_004631	GCT	2	6	4437627	4437632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144527

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