MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
87001	NC_004631	GATC	2	8	4126915	4126922	25 %	25 %	25 %	25 %	29144252
87002	NC_004631	GC	3	6	4126935	4126940	0 %	0 %	50 %	50 %	29144252
87003	NC_004631	AAG	2	6	4126974	4126979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29144252
87004	NC_004631	ATT	2	6	4127021	4127026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29144252
87005	NC_004631	C	6	6	4127051	4127056	0 %	0 %	0 %	100 %	29144252
87006	NC_004631	TTG	2	6	4127132	4127137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29144252
87007	NC_004631	CGG	2	6	4127461	4127466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144252
87008	NC_004631	GGT	3	9	4127485	4127493	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29144252
87009	NC_004631	GTT	2	6	4127554	4127559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29144252
87010	NC_004631	TAT	2	6	4127620	4127625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29144252
87011	NC_004631	TCG	2	6	4127668	4127673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144252
87012	NC_004631	AGA	2	6	4127686	4127691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29144252
87013	NC_004631	TGC	2	6	4127718	4127723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144252
87014	NC_004631	ATGT	2	8	4127765	4127772	25 %	50 %	25 %	0 %	29144253
87015	NC_004631	CTG	2	6	4127788	4127793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144253
87016	NC_004631	G	6	6	4127800	4127805	0 %	0 %	100 %	0 %	29144253
87017	NC_004631	GCC	2	6	4127924	4127929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144253
87018	NC_004631	GCT	2	6	4127955	4127960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144253
87019	NC_004631	CGC	2	6	4128002	4128007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144253
87020	NC_004631	TGC	2	6	4128071	4128076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144253
87021	NC_004631	GGGT	2	8	4128091	4128098	0 %	25 %	75 %	0 %	29144253
87022	NC_004631	GTG	2	6	4128145	4128150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29144253
87023	NC_004631	GGC	2	6	4128192	4128197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144253
87024	NC_004631	GC	3	6	4128196	4128201	0 %	0 %	50 %	50 %	29144253
87025	NC_004631	CGGC	2	8	4128205	4128212	0 %	0 %	50 %	50 %	29144253
87026	NC_004631	CGG	2	6	4128377	4128382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144253
87027	NC_004631	TATGG	2	10	4128427	4128436	20 %	40 %	40 %	0 %	29144253
87028	NC_004631	GCGTCA	2	12	4128447	4128458	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	29144253
87029	NC_004631	CTG	3	9	4128526	4128534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144253
87030	NC_004631	CG	3	6	4128548	4128553	0 %	0 %	50 %	50 %	29144253
87031	NC_004631	AAAC	2	8	4128576	4128583	75 %	0 %	0 %	25 %	29144253
87032	NC_004631	ACCA	2	8	4128655	4128662	50 %	0 %	0 %	50 %	29144253
87033	NC_004631	GCT	2	6	4128699	4128704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144253
87034	NC_004631	GGC	2	6	4128712	4128717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144253
87035	NC_004631	AGG	2	6	4128755	4128760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29144253
87036	NC_004631	CGG	4	12	4128770	4128781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144253
87037	NC_004631	TCGCA	2	10	4128829	4128838	20 %	20 %	20 %	40 %	29144253
87038	NC_004631	GCG	2	6	4128845	4128850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144253
87039	NC_004631	GCG	2	6	4128936	4128941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144253
87040	NC_004631	G	6	6	4128946	4128951	0 %	0 %	100 %	0 %	29144253
87041	NC_004631	CG	3	6	4129048	4129053	0 %	0 %	50 %	50 %	29144253
87042	NC_004631	TGT	2	6	4129070	4129075	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29144253
87043	NC_004631	GGCGAT	2	12	4129113	4129124	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	29144253
87044	NC_004631	GTT	2	6	4129339	4129344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29144254
87045	NC_004631	TGG	2	6	4129362	4129367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29144254
87046	NC_004631	GCTG	2	8	4129371	4129378	0 %	25 %	50 %	25 %	29144254
87047	NC_004631	TTA	2	6	4129420	4129425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29144254
87048	NC_004631	CT	4	8	4129455	4129462	0 %	50 %	0 %	50 %	29144254
87049	NC_004631	GCT	2	6	4129468	4129473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144254
87050	NC_004631	GAC	2	6	4129490	4129495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144254
87051	NC_004631	GC	3	6	4129503	4129508	0 %	0 %	50 %	50 %	29144254
87052	NC_004631	CGG	2	6	4129573	4129578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144254
87053	NC_004631	GGC	2	6	4129591	4129596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144254
87054	NC_004631	GGC	2	6	4129692	4129697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144254
87055	NC_004631	CTGG	2	8	4129717	4129724	0 %	25 %	50 %	25 %	29144254
87056	NC_004631	GGCG	2	8	4129781	4129788	0 %	0 %	75 %	25 %	29144254
87057	NC_004631	CAG	2	6	4129793	4129798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144254
87058	NC_004631	A	6	6	4129805	4129810	100 %	0 %	0 %	0 %	29144254
87059	NC_004631	GC	3	6	4129811	4129816	0 %	0 %	50 %	50 %	29144254
87060	NC_004631	GATCA	2	10	4129853	4129862	40 %	20 %	20 %	20 %	29144254
87061	NC_004631	AC	3	6	4129890	4129895	50 %	0 %	0 %	50 %	29144254
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87063	NC_004631	ACT	2	6	4129956	4129961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144254
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87065	NC_004631	CTG	2	6	4130204	4130209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144254
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87068	NC_004631	TCT	2	6	4130262	4130267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29144254
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87070	NC_004631	TGA	2	6	4130286	4130291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29144254
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87077	NC_004631	CGC	2	6	4130640	4130645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144254
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87084	NC_004631	TCAT	2	8	4131006	4131013	25 %	50 %	0 %	25 %	29144254
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87089	NC_004631	GAG	2	6	4131263	4131268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29144254
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87091	NC_004631	TAT	2	6	4131341	4131346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29144254
87092	NC_004631	TCG	2	6	4131526	4131531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29144254
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87101	NC_004631	GC	3	6	4132008	4132013	0 %	0 %	50 %	50 %	29144255
87102	NC_004631	ACG	3	9	4132038	4132046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144255
87103	NC_004631	CGC	2	6	4132053	4132058	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29144255
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87105	NC_004631	ATA	2	6	4132134	4132139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29144255
87106	NC_004631	AGC	2	6	4132210	4132215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144255
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87108	NC_004631	GCG	2	6	4132271	4132276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29144255
87109	NC_004631	TCA	2	6	4132285	4132290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144255
87110	NC_004631	CGGA	2	8	4132299	4132306	25 %	0 %	50 %	25 %	29144255
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87112	NC_004631	TAAT	2	8	4132381	4132388	50 %	50 %	0 %	0 %	29144255
87113	NC_004631	CT	3	6	4132393	4132398	0 %	50 %	0 %	50 %	29144255
87114	NC_004631	TCCA	2	8	4132465	4132472	25 %	25 %	0 %	50 %	29144255
87115	NC_004631	CG	3	6	4132538	4132543	0 %	0 %	50 %	50 %	29144255
87116	NC_004631	ACG	2	6	4132546	4132551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144255
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87476	NC_004631	GAT	2	6	4149587	4149592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29144268
87477	NC_004631	GC	3	6	4149736	4149741	0 %	0 %	50 %	50 %	29144268
87478	NC_004631	GAA	2	6	4149752	4149757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29144268
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87480	NC_004631	GC	4	8	4149788	4149795	0 %	0 %	50 %	50 %	29144268
87481	NC_004631	CAT	2	6	4149815	4149820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144268
87482	NC_004631	TCA	2	6	4149826	4149831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29144268
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87484	NC_004631	AGCCGA	2	12	4149886	4149897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29144268
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