MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_004631	CGG	2	6	375890	375895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_004631	GCC	2	6	375966	375971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8003	NC_004631	AGA	2	6	376072	376077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_004631	TCG	2	6	376134	376139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8005	NC_004631	GCT	2	6	376160	376165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8006	NC_004631	CAC	2	6	376169	376174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8007	NC_004631	GAT	2	6	376196	376201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_004631	TCA	3	9	376207	376215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_004631	GC	3	6	376245	376250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8010	NC_004631	TGG	2	6	376309	376314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_004631	GGGGC	2	10	376448	376457	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8012	NC_004631	GCG	2	6	376473	376478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_004631	CG	4	8	376486	376493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8014	NC_004631	CGG	2	6	376558	376563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_004631	TGA	2	6	376632	376637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_004631	GAC	2	6	376655	376660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_004631	GGA	2	6	376795	376800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_004631	CTG	2	6	376871	376876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_004631	CT	3	6	376943	376948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8020	NC_004631	GGC	2	6	377008	377013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_004631	GAAT	2	8	377029	377036	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_004631	GC	3	6	377163	377168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8023	NC_004631	ATC	2	6	377208	377213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_004631	TCT	2	6	377244	377249	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_004631	GCA	2	6	377269	377274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_004631	GGA	2	6	377323	377328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_004631	GGAAA	2	10	377367	377376	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_004631	A	6	6	377374	377379	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_004631	GCA	3	9	377425	377433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_004631	CG	3	6	377466	377471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8031	NC_004631	CGG	2	6	377529	377534	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8032	NC_004631	CGC	2	6	377541	377546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8033	NC_004631	ATT	2	6	377549	377554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8034	NC_004631	TGG	2	6	377585	377590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_004631	GGC	2	6	377618	377623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_004631	TGG	2	6	377691	377696	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_004631	CCG	2	6	377731	377736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140859
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8040	NC_004631	GCT	2	6	377777	377782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140859
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8044	NC_004631	TGA	2	6	378210	378215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140859
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8046	NC_004631	CATG	2	8	378331	378338	25 %	25 %	25 %	25 %	29140859
8047	NC_004631	GCT	2	6	378346	378351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140860
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8049	NC_004631	GC	3	6	378440	378445	0 %	0 %	50 %	50 %	29140860
8050	NC_004631	GC	3	6	378447	378452	0 %	0 %	50 %	50 %	29140860
8051	NC_004631	GCT	2	6	378493	378498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140860
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8054	NC_004631	TGC	2	6	378627	378632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140860
8055	NC_004631	CTGG	2	8	378648	378655	0 %	25 %	50 %	25 %	29140860
8056	NC_004631	GCT	2	6	378661	378666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140860
8057	NC_004631	GGC	2	6	378673	378678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140860
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8059	NC_004631	GCA	2	6	378745	378750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140860
8060	NC_004631	TGCGC	2	10	378843	378852	0 %	20 %	40 %	40 %	29140860
8061	NC_004631	TGG	3	9	378855	378863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140860
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8073	NC_004631	CGG	2	6	379163	379168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140861
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8085	NC_004631	GCG	2	6	379814	379819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140861
8086	NC_004631	GCG	2	6	379825	379830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140861
8087	NC_004631	GCTGCG	2	12	379848	379859	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	29140861
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8091	NC_004631	A	7	7	380033	380039	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8099	NC_004631	GC	3	6	380263	380268	0 %	0 %	50 %	50 %	29140862
8100	NC_004631	ACG	2	6	380285	380290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140862
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8113	NC_004631	TGA	2	6	380945	380950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140863
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8500	NC_004631	AT	3	6	398111	398116	50 %	50 %	0 %	0 %	29140872

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