MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 100804

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7501	NC_004631	TGC	2	6	353212	353217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140840
7502	NC_004631	CCT	2	6	353255	353260	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29140841
7503	NC_004631	TAA	2	6	353297	353302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140841
7504	NC_004631	TCG	2	6	353335	353340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140841
7505	NC_004631	GC	3	6	353379	353384	0 %	0 %	50 %	50 %	29140841
7506	NC_004631	CCG	2	6	353455	353460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140841
7507	NC_004631	CGC	2	6	353513	353518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140841
7508	NC_004631	TCA	2	6	353530	353535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140841
7509	NC_004631	GTA	2	6	353581	353586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140841
7510	NC_004631	T	6	6	353657	353662	0 %	100 %	0 %	0 %	29140841
7511	NC_004631	GAC	2	6	353691	353696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140841
7512	NC_004631	CCT	2	6	353738	353743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29140841
7513	NC_004631	CGC	2	6	353760	353765	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140841
7514	NC_004631	GC	3	6	353795	353800	0 %	0 %	50 %	50 %	29140841
7515	NC_004631	GGC	2	6	353820	353825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140841
7516	NC_004631	CAGT	2	8	353833	353840	25 %	25 %	25 %	25 %	29140841
7517	NC_004631	TTA	2	6	353842	353847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140841
7518	NC_004631	TTC	2	6	353883	353888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140841
7519	NC_004631	ACGAA	2	10	353902	353911	60 %	0 %	20 %	20 %	29140841
7520	NC_004631	ATT	2	6	353946	353951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140841
7521	NC_004631	GAT	2	6	354015	354020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140841
7522	NC_004631	GTCT	2	8	354033	354040	0 %	50 %	25 %	25 %	29140841
7523	NC_004631	ATAA	2	8	354165	354172	75 %	25 %	0 %	0 %	29140841
7524	NC_004631	TGT	2	6	354173	354178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140841
7525	NC_004631	CGCC	2	8	354193	354200	0 %	0 %	25 %	75 %	29140841
7526	NC_004631	T	6	6	354234	354239	0 %	100 %	0 %	0 %	29140841
7527	NC_004631	AAAT	2	8	354331	354338	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7528	NC_004631	CCG	2	6	354383	354388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7529	NC_004631	A	6	6	354403	354408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7530	NC_004631	TAA	2	6	354427	354432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7531	NC_004631	AT	3	6	354433	354438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7532	NC_004631	AT	3	6	354458	354463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7533	NC_004631	ATC	2	6	354509	354514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140842
7534	NC_004631	T	6	6	354582	354587	0 %	100 %	0 %	0 %	29140842
7535	NC_004631	GAA	2	6	354660	354665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140842
7536	NC_004631	TCA	2	6	354719	354724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140842
7537	NC_004631	ATC	2	6	354746	354751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140842
7538	NC_004631	GGA	2	6	354763	354768	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140842
7539	NC_004631	CGG	2	6	354858	354863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140842
7540	NC_004631	ATT	2	6	354871	354876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140842
7541	NC_004631	GCC	2	6	354877	354882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140842
7542	NC_004631	CAG	2	6	354895	354900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140842
7543	NC_004631	TAA	2	6	355247	355252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140842
7544	NC_004631	GGT	2	6	355433	355438	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7545	NC_004631	CGG	2	6	355465	355470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7546	NC_004631	CCG	2	6	355485	355490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7547	NC_004631	TCG	2	6	355523	355528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140843
7548	NC_004631	ACG	2	6	355553	355558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140843
7549	NC_004631	CG	3	6	355557	355562	0 %	0 %	50 %	50 %	29140843
7550	NC_004631	TCA	2	6	355587	355592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140843
7551	NC_004631	CCG	2	6	355604	355609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140843
7552	NC_004631	CCGC	2	8	355628	355635	0 %	0 %	25 %	75 %	29140843
7553	NC_004631	CAG	2	6	355645	355650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140843
7554	NC_004631	GCG	2	6	355736	355741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140843
7555	NC_004631	GCG	2	6	355750	355755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140843
7556	NC_004631	ATA	2	6	355787	355792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140843
7557	NC_004631	GGT	2	6	355801	355806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140843
7558	NC_004631	CG	4	8	355863	355870	0 %	0 %	50 %	50 %	29140843
7559	NC_004631	GC	3	6	355902	355907	0 %	0 %	50 %	50 %	29140843
7560	NC_004631	TGA	2	6	356022	356027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140843
7561	NC_004631	TGG	2	6	356031	356036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140843
7562	NC_004631	TTC	2	6	356098	356103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140843
7563	NC_004631	ATA	2	6	356108	356113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140843
7564	NC_004631	GT	3	6	356114	356119	0 %	50 %	50 %	0 %	29140843
7565	NC_004631	ATTAC	2	10	356246	356255	40 %	40 %	0 %	20 %	29140843
7566	NC_004631	GC	3	6	356263	356268	0 %	0 %	50 %	50 %	29140843
7567	NC_004631	GC	3	6	356270	356275	0 %	0 %	50 %	50 %	29140843
7568	NC_004631	TC	4	8	356305	356312	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7571	NC_004631	GAA	2	6	356409	356414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7572	NC_004631	TGC	2	6	356421	356426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140844
7573	NC_004631	TGG	2	6	356445	356450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140844
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7575	NC_004631	GGC	2	6	356566	356571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140844
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7578	NC_004631	TGG	2	6	356643	356648	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140844
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7580	NC_004631	CTGG	2	8	356896	356903	0 %	25 %	50 %	25 %	29140844
7581	NC_004631	TGG	2	6	356955	356960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140844
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7583	NC_004631	CGCC	2	8	357073	357080	0 %	0 %	25 %	75 %	29140844
7584	NC_004631	AGC	2	6	357129	357134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140844
7585	NC_004631	AAGCG	2	10	357217	357226	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7586	NC_004631	A	6	6	357352	357357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7587	NC_004631	TAAG	2	8	357383	357390	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7588	NC_004631	CGGGC	2	10	357569	357578	0 %	0 %	60 %	40 %	29140845
7589	NC_004631	CTG	2	6	357588	357593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140845
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7593	NC_004631	CAA	2	6	357755	357760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140845
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7595	NC_004631	TTAA	2	8	357884	357891	50 %	50 %	0 %	0 %	29140845
7596	NC_004631	TCT	2	6	357906	357911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7597	NC_004631	GGC	2	6	357912	357917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7598	NC_004631	GTC	2	6	357938	357943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7599	NC_004631	A	6	6	357959	357964	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7600	NC_004631	ACT	2	6	358090	358095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140846
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7604	NC_004631	CAT	2	6	358355	358360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140846
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7606	NC_004631	CAT	2	6	358457	358462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140846
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7610	NC_004631	AAC	2	6	358527	358532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140846
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7612	NC_004631	CG	5	10	358578	358587	0 %	0 %	50 %	50 %	29140846
7613	NC_004631	ATC	2	6	358590	358595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140846
7614	NC_004631	GC	3	6	358708	358713	0 %	0 %	50 %	50 %	29140846
7615	NC_004631	CGT	2	6	358722	358727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140846
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7621	NC_004631	TGC	2	6	359080	359085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140846
7622	NC_004631	GC	3	6	359084	359089	0 %	0 %	50 %	50 %	29140846
7623	NC_004631	ATGA	2	8	359097	359104	50 %	25 %	25 %	0 %	29140846
7624	NC_004631	GAA	2	6	359154	359159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140846
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7744	NC_004631	CTG	2	6	364495	364500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140853
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7747	NC_004631	AGGCG	2	10	364744	364753	20 %	0 %	60 %	20 %	409994452
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